MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015214	TGATA	2	10	515759	515768	40 %	40 %	20 %	0 %	325956205
11002	NC_015214	TCT	2	6	515770	515775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956205
11003	NC_015214	A	6	6	515776	515781	100 %	0 %	0 %	0 %	325956205
11004	NC_015214	ACT	2	6	515821	515826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956205
11005	NC_015214	TAC	2	6	515928	515933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956205
11006	NC_015214	ATA	2	6	515974	515979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956205
11007	NC_015214	TCA	2	6	515987	515992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956205
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11009	NC_015214	AAG	2	6	516305	516310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_015214	TGAAG	2	10	516345	516354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_015214	TAA	2	6	516366	516371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_015214	TG	3	6	516405	516410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_015214	GAA	2	6	516417	516422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_015214	GAT	2	6	516450	516455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_015214	TCA	2	6	516467	516472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_015214	CAT	2	6	516512	516517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956206
11017	NC_015214	TAAG	2	8	516572	516579	50 %	25 %	25 %	0 %	325956206
11018	NC_015214	CCA	2	6	516630	516635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956206
11019	NC_015214	TTC	2	6	516719	516724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956206
11020	NC_015214	CA	3	6	516779	516784	50 %	0 %	0 %	50 %	325956206
11021	NC_015214	CAT	2	6	516804	516809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956206
11022	NC_015214	TA	3	6	516902	516907	50 %	50 %	0 %	0 %	325956206
11023	NC_015214	TCG	2	6	516924	516929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_015214	A	6	6	516962	516967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_015214	A	7	7	516973	516979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_015214	TTA	2	6	517008	517013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956207
11027	NC_015214	GAT	3	9	517029	517037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956207
11028	NC_015214	TTC	2	6	517119	517124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956207
11029	NC_015214	TTGA	2	8	517151	517158	25 %	50 %	25 %	0 %	325956207
11030	NC_015214	CAT	2	6	517215	517220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956207
11031	NC_015214	CTT	2	6	517226	517231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_015214	CA	3	6	517234	517239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_015214	TAT	2	6	517242	517247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_015214	TAA	2	6	517310	517315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_015214	A	6	6	517314	517319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_015214	ATA	2	6	517331	517336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_015214	CAA	2	6	517357	517362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_015214	GAT	2	6	517393	517398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956208
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11040	NC_015214	ATT	2	6	517531	517536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956208
11041	NC_015214	GAA	2	6	517620	517625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_015214	TTAA	2	8	517631	517638	50 %	50 %	0 %	0 %	325956209
11043	NC_015214	GAA	2	6	517640	517645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956209
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11050	NC_015214	CAA	2	6	517803	517808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956209
11051	NC_015214	GGC	2	6	517862	517867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956209
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11057	NC_015214	AAGC	2	8	518024	518031	50 %	0 %	25 %	25 %	325956209
11058	NC_015214	CAA	2	6	518069	518074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956209
11059	NC_015214	ATG	2	6	518118	518123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956209
11060	NC_015214	GATG	2	8	518288	518295	25 %	25 %	50 %	0 %	325956209
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11063	NC_015214	CAT	2	6	518375	518380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956209
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11066	NC_015214	TTGT	2	8	518440	518447	0 %	75 %	25 %	0 %	325956209
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11070	NC_015214	AT	3	6	518514	518519	50 %	50 %	0 %	0 %	325956209
11071	NC_015214	TAT	2	6	518546	518551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956209
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11073	NC_015214	AGA	2	6	518568	518573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_015214	ATT	2	6	518595	518600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956210
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11084	NC_015214	TAT	2	6	518961	518966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956210
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11088	NC_015214	TAAA	2	8	519151	519158	75 %	25 %	0 %	0 %	325956210
11089	NC_015214	ATA	2	6	519169	519174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956210
11090	NC_015214	AAG	2	6	519180	519185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956210
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11096	NC_015214	CGT	2	6	519401	519406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956210
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11099	NC_015214	A	7	7	519454	519460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_015214	T	6	6	519518	519523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_015214	A	6	6	519537	519542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_015214	TTA	2	6	519545	519550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956211
11103	NC_015214	TCT	2	6	519630	519635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956211
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11105	NC_015214	TGC	2	6	519723	519728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_015214	T	6	6	519753	519758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_015214	A	6	6	519759	519764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_015214	TA	3	6	519810	519815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_015214	AAT	2	6	519822	519827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_015214	T	6	6	519840	519845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_015214	GTA	2	6	519846	519851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_015214	ATT	2	6	519864	519869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_015214	AACA	2	8	519909	519916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11114	NC_015214	GCT	2	6	519930	519935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_015214	ATT	2	6	520013	520018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_015214	CAG	2	6	520072	520077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_015214	CCAA	2	8	520177	520184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11118	NC_015214	TAT	2	6	520211	520216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_015214	TAT	2	6	520250	520255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_015214	GTA	2	6	520303	520308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_015214	CGG	2	6	520347	520352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_015214	ATT	2	6	520357	520362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_015214	GTG	3	9	520397	520405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_015214	CCA	2	6	520406	520411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11125	NC_015214	AACC	2	8	520520	520527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11126	NC_015214	GTTTG	2	10	520530	520539	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_015214	GTT	2	6	520543	520548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_015214	ATT	2	6	520564	520569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_015214	TAC	2	6	520602	520607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_015214	TTA	2	6	520655	520660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_015214	CCA	2	6	520672	520677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11132	NC_015214	GTA	2	6	520703	520708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11134	NC_015214	AAT	2	6	520817	520822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956212
11135	NC_015214	ATTA	2	8	520832	520839	50 %	50 %	0 %	0 %	325956212
11136	NC_015214	AAGCA	2	10	520884	520893	60 %	0 %	20 %	20 %	325956212
11137	NC_015214	GTA	2	6	520932	520937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956212
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11142	NC_015214	TGA	2	6	521354	521359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956212
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11147	NC_015214	ATT	2	6	521721	521726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11148	NC_015214	T	7	7	521762	521768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11149	NC_015214	AAC	2	6	521867	521872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11152	NC_015214	TAA	2	6	521947	521952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11153	NC_015214	GTA	2	6	521993	521998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11155	NC_015214	TTA	2	6	522048	522053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11156	NC_015214	GA	3	6	522074	522079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11157	NC_015214	T	7	7	522081	522087	0 %	100 %	0 %	0 %	325956213
11158	NC_015214	ATCT	2	8	522097	522104	25 %	50 %	0 %	25 %	325956213
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11207	NC_015214	CACT	2	8	524209	524216	25 %	25 %	0 %	50 %	325956215
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11230	NC_015214	AGA	2	6	525300	525305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_015214	AT	3	6	525371	525376	50 %	50 %	0 %	0 %	325956217
11232	NC_015214	AGA	2	6	525416	525421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956217
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11246	NC_015214	AATG	2	8	525795	525802	50 %	25 %	25 %	0 %	325956217
11247	NC_015214	TTG	2	6	525808	525813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956217
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11372	NC_015214	ATT	2	6	531824	531829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956222
11373	NC_015214	GCT	2	6	531887	531892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956222
11374	NC_015214	TCT	2	6	531924	531929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956222
11375	NC_015214	TGGT	2	8	531934	531941	0 %	50 %	50 %	0 %	325956222
11376	NC_015214	CAA	2	6	532010	532015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956222
11377	NC_015214	TTC	2	6	532018	532023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956222
11378	NC_015214	TAC	2	6	532174	532179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956222
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11380	NC_015214	AGAAA	2	10	532253	532262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11381	NC_015214	CAA	2	6	532279	532284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11382	NC_015214	T	6	6	532323	532328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11383	NC_015214	GTA	2	6	532334	532339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11384	NC_015214	T	7	7	532344	532350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11385	NC_015214	A	6	6	532372	532377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11386	NC_015214	ATT	2	6	532386	532391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11387	NC_015214	AATTT	2	10	532425	532434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11388	NC_015214	TCA	2	6	532450	532455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11392	NC_015214	GGA	2	6	532533	532538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956223
11393	NC_015214	GAAA	2	8	532589	532596	75 %	0 %	25 %	0 %	325956223
11394	NC_015214	TAT	2	6	532611	532616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956223
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11400	NC_015214	CAA	2	6	532876	532881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956223
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11409	NC_015214	ATG	2	6	533369	533374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956223
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