MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015214	TTTAA	2	10	468050	468059	40 %	60 %	0 %	0 %	325956174
10002	NC_015214	ATT	3	9	468195	468203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956174
10003	NC_015214	TTC	2	6	468231	468236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956174
10004	NC_015214	TTC	2	6	468243	468248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956174
10005	NC_015214	GTTC	2	8	468272	468279	0 %	50 %	25 %	25 %	325956174
10006	NC_015214	A	6	6	468280	468285	100 %	0 %	0 %	0 %	325956174
10007	NC_015214	TG	3	6	468318	468323	0 %	50 %	50 %	0 %	325956174
10008	NC_015214	AATC	2	8	468352	468359	50 %	25 %	0 %	25 %	325956174
10009	NC_015214	TCA	2	6	468390	468395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956174
10010	NC_015214	CTAG	2	8	468422	468429	25 %	25 %	25 %	25 %	325956174
10011	NC_015214	ATC	2	6	468444	468449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956174
10012	NC_015214	CTT	2	6	468468	468473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956174
10013	NC_015214	A	6	6	468518	468523	100 %	0 %	0 %	0 %	325956174
10014	NC_015214	AAT	2	6	468586	468591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956174
10015	NC_015214	ATATCA	2	12	468622	468633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	325956174
10016	NC_015214	TGT	2	6	468653	468658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956174
10017	NC_015214	CGA	2	6	468665	468670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956174
10018	NC_015214	CA	3	6	468706	468711	50 %	0 %	0 %	50 %	325956174
10019	NC_015214	CTG	2	6	468716	468721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956174
10020	NC_015214	TTTA	2	8	468732	468739	25 %	75 %	0 %	0 %	325956174
10021	NC_015214	GAA	2	6	468756	468761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956174
10022	NC_015214	TAG	2	6	468789	468794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956174
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10025	NC_015214	AATAA	2	10	468885	468894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015214	TCA	2	6	468918	468923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_015214	CTTAA	2	10	468937	468946	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10029	NC_015214	T	6	6	468972	468977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_015214	A	7	7	468988	468994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_015214	A	6	6	468997	469002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_015214	CGAA	2	8	469146	469153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10033	NC_015214	AAG	2	6	469167	469172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_015214	TAA	2	6	469191	469196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_015214	GA	3	6	469206	469211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_015214	AAG	2	6	469229	469234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_015214	A	6	6	469263	469268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_015214	GAA	2	6	469285	469290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_015214	GTC	2	6	469310	469315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_015214	A	6	6	469360	469365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_015214	CGGA	2	8	469420	469427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_015214	GTA	2	6	469429	469434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_015214	CAAA	2	8	469484	469491	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_015214	GCAA	2	8	469507	469514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10045	NC_015214	AAT	2	6	469537	469542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_015214	GGC	2	6	469605	469610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10048	NC_015214	AGCG	2	8	469676	469683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_015214	ATA	2	6	469759	469764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015214	GGC	2	6	469793	469798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_015214	GGTAA	2	10	469843	469852	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_015214	CGA	2	6	469866	469871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_015214	GA	3	6	469886	469891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_015214	GCA	2	6	469940	469945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_015214	CGC	2	6	469987	469992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_015214	GTGA	2	8	469993	470000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_015214	TGT	2	6	470026	470031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015214	GAA	2	6	470036	470041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_015214	GTA	2	6	470050	470055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10062	NC_015214	AGA	2	6	470249	470254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10065	NC_015214	GGC	2	6	470319	470324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_015214	TGC	2	6	470444	470449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10068	NC_015214	GGT	2	6	470637	470642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10077	NC_015214	AC	3	6	470983	470988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_015214	GGCAG	2	10	471059	471068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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10092	NC_015214	GT	3	6	471885	471890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_015214	AGT	2	6	471896	471901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10095	NC_015214	AGTT	2	8	472023	472030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_015214	TC	3	6	472179	472184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_015214	AT	3	6	472291	472296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10101	NC_015214	CCG	2	6	472657	472662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_015214	AAGGC	2	10	472716	472725	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10104	NC_015214	AGC	2	6	472838	472843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_015214	TGA	2	6	472889	472894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_015214	AG	3	6	472954	472959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_015214	GA	3	6	473017	473022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_015214	GAA	2	6	473064	473069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_015214	AAC	2	6	473114	473119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_015214	TTGAA	2	10	473226	473235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_015214	CGG	2	6	473247	473252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_015214	GA	3	6	473345	473350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_015214	TAGG	2	8	473463	473470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_015214	AGG	2	6	473500	473505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_015214	TAC	2	6	473517	473522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_015214	GCCAG	2	10	473558	473567	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10117	NC_015214	CCT	2	6	473605	473610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_015214	GA	4	8	473696	473703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_015214	TGG	2	6	473740	473745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_015214	TCG	2	6	473856	473861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_015214	CGT	2	6	473936	473941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_015214	CGT	2	6	473962	473967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_015214	GAG	2	6	473985	473990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_015214	GTT	2	6	474039	474044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_015214	C	6	6	474112	474117	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10126	NC_015214	GAA	2	6	474198	474203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_015214	AGCGA	2	10	474243	474252	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10128	NC_015214	T	7	7	474262	474268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_015214	GTA	2	6	474295	474300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_015214	CTT	2	6	474369	474374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10132	NC_015214	AGT	2	6	474384	474389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10405	NC_015214	ACA	2	6	485766	485771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956184
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10498	NC_015214	TAGT	2	8	490537	490544	25 %	50 %	25 %	0 %	325956186
10499	NC_015214	TGC	2	6	490549	490554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956186
10500	NC_015214	TTAC	2	8	490583	490590	25 %	50 %	0 %	25 %	325956186

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