MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015214	TAC	2	6	24526	24531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955745
502	NC_015214	GTAG	2	8	24537	24544	25 %	25 %	50 %	0 %	325955745
503	NC_015214	TTG	2	6	24555	24560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955745
504	NC_015214	TTA	2	6	24594	24599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955745
505	NC_015214	TCT	2	6	24668	24673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955745
506	NC_015214	CTT	2	6	24700	24705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955745
507	NC_015214	A	6	6	24721	24726	100 %	0 %	0 %	0 %	325955745
508	NC_015214	TAATT	2	10	24794	24803	40 %	60 %	0 %	0 %	325955745
509	NC_015214	GTTC	2	8	24831	24838	0 %	50 %	25 %	25 %	325955745
510	NC_015214	T	6	6	24845	24850	0 %	100 %	0 %	0 %	325955745
511	NC_015214	A	6	6	24857	24862	100 %	0 %	0 %	0 %	325955745
512	NC_015214	CTTT	2	8	24885	24892	0 %	75 %	0 %	25 %	325955745
513	NC_015214	AGT	2	6	24927	24932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955745
514	NC_015214	CTG	2	6	24967	24972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955745
515	NC_015214	TAA	2	6	24987	24992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955745
516	NC_015214	ATG	2	6	25074	25079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955745
517	NC_015214	ATT	2	6	25115	25120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955745
518	NC_015214	CTG	2	6	25134	25139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955745
519	NC_015214	TAA	2	6	25158	25163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955745
520	NC_015214	ATT	2	6	25196	25201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955745
521	NC_015214	T	6	6	25207	25212	0 %	100 %	0 %	0 %	325955745
522	NC_015214	TGT	2	6	25280	25285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015214	AGC	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015214	ATT	2	6	25311	25316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015214	TAAA	2	8	25338	25345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015214	AAT	2	6	25351	25356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015214	AGG	2	6	25400	25405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015214	ACA	2	6	25423	25428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955746
529	NC_015214	A	6	6	25441	25446	100 %	0 %	0 %	0 %	325955746
530	NC_015214	CTA	2	6	25448	25453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955746
531	NC_015214	GAA	2	6	25638	25643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955746
532	NC_015214	TGG	2	6	25651	25656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955746
533	NC_015214	CAC	2	6	25710	25715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955746
534	NC_015214	GAA	2	6	25765	25770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955746
535	NC_015214	AT	3	6	25794	25799	50 %	50 %	0 %	0 %	325955746
536	NC_015214	CCA	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955746
537	NC_015214	TGA	2	6	25950	25955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955746
538	NC_015214	TGC	2	6	25965	25970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955746
539	NC_015214	GACTTT	2	12	25993	26004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	325955746
540	NC_015214	CGA	2	6	26010	26015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955746
541	NC_015214	GAT	2	6	26043	26048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955746
542	NC_015214	ATT	2	6	26057	26062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955746
543	NC_015214	ATC	2	6	26072	26077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955746
544	NC_015214	ACA	2	6	26138	26143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955746
545	NC_015214	GTT	2	6	26169	26174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955746
546	NC_015214	A	6	6	26223	26228	100 %	0 %	0 %	0 %	325955746
547	NC_015214	AC	3	6	26286	26291	50 %	0 %	0 %	50 %	325955746
548	NC_015214	AAC	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955746
549	NC_015214	A	6	6	26408	26413	100 %	0 %	0 %	0 %	325955746
550	NC_015214	TAC	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955746
551	NC_015214	ACA	2	6	26563	26568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955746
552	NC_015214	GCT	2	6	26632	26637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955746
553	NC_015214	GTC	2	6	26639	26644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955746
554	NC_015214	AAG	2	6	26666	26671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955746
555	NC_015214	A	6	6	26814	26819	100 %	0 %	0 %	0 %	325955746
556	NC_015214	AAAG	2	8	26822	26829	75 %	0 %	25 %	0 %	325955746
557	NC_015214	ATTTT	2	10	26913	26922	20 %	80 %	0 %	0 %	325955746
558	NC_015214	A	6	6	27015	27020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015214	TA	3	6	27093	27098	50 %	50 %	0 %	0 %	325955747
560	NC_015214	TTAA	2	8	27110	27117	50 %	50 %	0 %	0 %	325955747
561	NC_015214	TAA	2	6	27133	27138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955747
562	NC_015214	CTT	2	6	27163	27168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955747
563	NC_015214	AGA	2	6	27184	27189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955747
564	NC_015214	TAA	2	6	27206	27211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955747
565	NC_015214	GTT	2	6	27388	27393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955747
566	NC_015214	GAGC	2	8	27489	27496	25 %	0 %	50 %	25 %	325955747
567	NC_015214	GC	3	6	27650	27655	0 %	0 %	50 %	50 %	325955747
568	NC_015214	AAG	2	6	27683	27688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955747
569	NC_015214	GAT	2	6	27691	27696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955747
570	NC_015214	CTT	2	6	27702	27707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955747
571	NC_015214	AGT	2	6	27756	27761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955747
572	NC_015214	CTTTG	2	10	27903	27912	0 %	60 %	20 %	20 %	325955747
573	NC_015214	TCTT	2	8	28008	28015	0 %	75 %	0 %	25 %	325955747
574	NC_015214	TCA	2	6	28032	28037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955747
575	NC_015214	TCT	2	6	28078	28083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955747
576	NC_015214	TCA	2	6	28187	28192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955747
577	NC_015214	GCT	2	6	28234	28239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955747
578	NC_015214	CAT	2	6	28418	28423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015214	ACT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015214	ATC	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015214	TGTTT	2	10	28529	28538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015214	A	7	7	28561	28567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015214	TAA	2	6	28596	28601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015214	AG	3	6	28679	28684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015214	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015214	TGTGCA	2	12	28704	28715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325955748
587	NC_015214	AGA	2	6	28732	28737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
588	NC_015214	TGA	2	6	28760	28765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955748
589	NC_015214	GGT	2	6	28786	28791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955748
590	NC_015214	ATA	2	6	28817	28822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955748
591	NC_015214	TGT	2	6	28872	28877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955748
592	NC_015214	GTA	2	6	29032	29037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955748
593	NC_015214	AAT	2	6	29044	29049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955748
594	NC_015214	AGA	2	6	29055	29060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
595	NC_015214	A	6	6	29130	29135	100 %	0 %	0 %	0 %	325955748
596	NC_015214	AAT	2	6	29266	29271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955748
597	NC_015214	A	6	6	29293	29298	100 %	0 %	0 %	0 %	325955748
598	NC_015214	TGC	2	6	29346	29351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955748
599	NC_015214	AAC	2	6	29400	29405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955748
600	NC_015214	GGA	2	6	29422	29427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325955748
601	NC_015214	AGA	2	6	29492	29497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
602	NC_015214	TGG	2	6	29564	29569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955748
603	NC_015214	GAA	2	6	29585	29590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
604	NC_015214	GAA	2	6	29593	29598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
605	NC_015214	GAT	3	9	29755	29763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955748
606	NC_015214	AAG	2	6	29768	29773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955748
607	NC_015214	CTT	2	6	29810	29815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955748
608	NC_015214	ATC	2	6	29863	29868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955748
609	NC_015214	A	6	6	29910	29915	100 %	0 %	0 %	0 %	325955748
610	NC_015214	TAA	2	6	29931	29936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015214	CT	3	6	29963	29968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_015214	TTA	2	6	29974	29979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015214	AT	3	6	29983	29988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015214	ATT	2	6	30040	30045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955749
615	NC_015214	T	6	6	30052	30057	0 %	100 %	0 %	0 %	325955749
616	NC_015214	AT	3	6	30091	30096	50 %	50 %	0 %	0 %	325955749
617	NC_015214	ATC	2	6	30110	30115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
618	NC_015214	TTTG	2	8	30135	30142	0 %	75 %	25 %	0 %	325955749
619	NC_015214	TAC	2	6	30174	30179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
620	NC_015214	TCT	2	6	30215	30220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955749
621	NC_015214	TCG	2	6	30230	30235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955749
622	NC_015214	CTA	2	6	30388	30393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955749
623	NC_015214	TGGT	2	8	30453	30460	0 %	50 %	50 %	0 %	325955749
624	NC_015214	ACG	2	6	30662	30667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955749
625	NC_015214	AAAG	2	8	30762	30769	75 %	0 %	25 %	0 %	325955749
626	NC_015214	CAAA	2	8	30794	30801	75 %	0 %	0 %	25 %	325955749
627	NC_015214	GCT	2	6	30808	30813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955749
628	NC_015214	T	6	6	30830	30835	0 %	100 %	0 %	0 %	325955750
629	NC_015214	T	7	7	30850	30856	0 %	100 %	0 %	0 %	325955750
630	NC_015214	CCA	2	6	31060	31065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955750
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