MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 44283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_015214	GAA	2	6	303492	303497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6503	NC_015214	CAT	2	6	303575	303580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6504	NC_015214	GGT	2	6	303699	303704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956001
6505	NC_015214	GAA	2	6	303747	303752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6506	NC_015214	TGG	2	6	303785	303790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956001
6507	NC_015214	TGT	2	6	303791	303796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956001
6508	NC_015214	ATTC	2	8	303806	303813	25 %	50 %	0 %	25 %	325956001
6509	NC_015214	AAG	2	6	303835	303840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6510	NC_015214	GAA	2	6	303845	303850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6511	NC_015214	TCA	2	6	303924	303929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6512	NC_015214	TGC	2	6	303947	303952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956001
6513	NC_015214	GAA	2	6	303965	303970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6514	NC_015214	GCT	2	6	303972	303977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956001
6515	NC_015214	ACT	2	6	304026	304031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6516	NC_015214	AGA	2	6	304034	304039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6517	NC_015214	TCG	2	6	304073	304078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956001
6518	NC_015214	ACT	2	6	304164	304169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6519	NC_015214	TCA	2	6	304176	304181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6520	NC_015214	ACT	2	6	304219	304224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6521	NC_015214	ATC	2	6	304254	304259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956001
6522	NC_015214	AAG	2	6	304260	304265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956001
6523	NC_015214	GGC	2	6	304269	304274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956001
6524	NC_015214	AAT	2	6	304282	304287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956001
6525	NC_015214	A	6	6	304295	304300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_015214	TACA	2	8	304333	304340	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_015214	A	6	6	304340	304345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_015214	T	7	7	304373	304379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_015214	A	7	7	304381	304387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_015214	TTG	2	6	304484	304489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_015214	AGA	2	6	304579	304584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_015214	AGG	2	6	304590	304595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_015214	GCT	2	6	304666	304671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956002
6534	NC_015214	AGAA	2	8	304734	304741	75 %	0 %	25 %	0 %	325956002
6535	NC_015214	TTC	2	6	304754	304759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956002
6536	NC_015214	CAC	2	6	304763	304768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325956002
6537	NC_015214	GCG	2	6	304883	304888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956002
6538	NC_015214	ATA	2	6	304917	304922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_015214	GAA	2	6	304957	304962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956003
6540	NC_015214	TGT	2	6	305015	305020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
6541	NC_015214	GTT	2	6	305037	305042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
6542	NC_015214	CAA	2	6	305120	305125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956003
6543	NC_015214	AAGG	2	8	305244	305251	50 %	0 %	50 %	0 %	325956003
6544	NC_015214	CAT	2	6	305381	305386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956003
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6546	NC_015214	GTT	2	6	305469	305474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956003
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6548	NC_015214	AGGA	2	8	305575	305582	50 %	0 %	50 %	0 %	325956003
6549	NC_015214	CGT	2	6	305683	305688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
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6551	NC_015214	CTG	2	6	305754	305759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
6552	NC_015214	CGG	2	6	305764	305769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325956004
6553	NC_015214	AAG	2	6	305774	305779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956004
6554	NC_015214	TGGCG	2	10	305837	305846	0 %	20 %	60 %	20 %	325956004
6555	NC_015214	CGT	2	6	305906	305911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956004
6556	NC_015214	TTGA	2	8	305942	305949	25 %	50 %	25 %	0 %	325956004
6557	NC_015214	TGA	2	6	306058	306063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956004
6558	NC_015214	AAG	2	6	306182	306187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956004
6559	NC_015214	GAG	2	6	306191	306196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325956004
6560	NC_015214	GAT	2	6	306268	306273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956005
6561	NC_015214	AAG	2	6	306274	306279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956005
6562	NC_015214	GAA	2	6	306334	306339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956005
6563	NC_015214	TAAAG	2	10	306351	306360	60 %	20 %	20 %	0 %	325956005
6564	NC_015214	TCG	2	6	306426	306431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956005
6565	NC_015214	TTG	2	6	306443	306448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956005
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6568	NC_015214	AGG	2	6	306515	306520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_015214	GTC	3	9	306563	306571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956006
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6571	NC_015214	AATCAC	2	12	306632	306643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325956006
6572	NC_015214	AC	3	6	306642	306647	50 %	0 %	0 %	50 %	325956006
6573	NC_015214	GTG	3	9	306689	306697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956006
6574	NC_015214	CAAA	2	8	306702	306709	75 %	0 %	0 %	25 %	325956006
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6581	NC_015214	GATTA	2	10	307047	307056	40 %	40 %	20 %	0 %	325956006
6582	NC_015214	ATC	2	6	307083	307088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956006
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6585	NC_015214	AAC	2	6	307121	307126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956006
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6588	NC_015214	AAG	2	6	307282	307287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956006
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6592	NC_015214	TTAA	2	8	307377	307384	50 %	50 %	0 %	0 %	325956007
6593	NC_015214	GTA	2	6	307391	307396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956007
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6597	NC_015214	GCAGAT	2	12	307450	307461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325956007
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6599	NC_015214	CGT	2	6	307489	307494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956007
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6601	NC_015214	TGGT	2	8	307580	307587	0 %	50 %	50 %	0 %	325956007
6602	NC_015214	CAA	2	6	307610	307615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956007
6603	NC_015214	TGA	2	6	307641	307646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956007
6604	NC_015214	CACAA	2	10	307653	307662	60 %	0 %	0 %	40 %	325956007
6605	NC_015214	AGGA	2	8	307669	307676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_015214	GCT	2	6	307826	307831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325956008
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6609	NC_015214	TTG	2	6	308359	308364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325956009
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6612	NC_015214	CA	3	6	308553	308558	50 %	0 %	0 %	50 %	325956009
6613	NC_015214	ACT	2	6	308622	308627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956009
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6622	NC_015214	TGA	2	6	309058	309063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956010
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6867	NC_015214	AGC	2	6	320193	320198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325956033
6868	NC_015214	CAA	2	6	320207	320212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325956033
6869	NC_015214	ATT	2	6	320286	320291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956033
6870	NC_015214	TGG	2	6	320323	320328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325956033
6871	NC_015214	GTTA	2	8	320352	320359	25 %	50 %	25 %	0 %	325956033
6872	NC_015214	TTA	2	6	320375	320380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956033
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6877	NC_015214	ATG	2	6	320603	320608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956033
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6881	NC_015214	ATT	2	6	320781	320786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956033
6882	NC_015214	ATG	2	6	320869	320874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956034
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6893	NC_015214	AAG	2	6	321529	321534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956034
6894	NC_015214	CAAG	2	8	321549	321556	50 %	0 %	25 %	25 %	325956034
6895	NC_015214	ATGAT	2	10	321624	321633	40 %	40 %	20 %	0 %	325956034
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6899	NC_015214	TAT	2	6	321819	321824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325956035
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6908	NC_015214	T	6	6	322287	322292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6909	NC_015214	A	6	6	322294	322299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6931	NC_015214	GAA	2	6	323197	323202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956037
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6988	NC_015214	TTC	2	6	325595	325600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956040
6989	NC_015214	AACA	2	8	325631	325638	75 %	0 %	0 %	25 %	325956040
6990	NC_015214	A	6	6	325766	325771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6991	NC_015214	TAA	2	6	325820	325825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956041
6992	NC_015214	TAA	2	6	325843	325848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956041
6993	NC_015214	AT	3	6	325900	325905	50 %	50 %	0 %	0 %	325956041
6994	NC_015214	AAT	2	6	325909	325914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325956041
6995	NC_015214	ACAT	2	8	325970	325977	50 %	25 %	0 %	25 %	325956041
6996	NC_015214	TGA	2	6	325986	325991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325956041
6997	NC_015214	ATC	2	6	325995	326000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325956041
6998	NC_015214	T	6	6	326049	326054	0 %	100 %	0 %	0 %	325956041
6999	NC_015214	TTC	2	6	326112	326117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325956041
7000	NC_015214	GAA	2	6	326133	326138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325956041

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