MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_014724	T	6	6	2010839	2010844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43002	NC_014724	TTAG	2	8	2010856	2010863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43003	NC_014724	GAA	2	6	2010908	2010913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039235
43004	NC_014724	AAG	2	6	2010960	2010965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039235
43005	NC_014724	AGATAA	2	12	2011030	2011041	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315039235
43006	NC_014724	AGT	2	6	2011045	2011050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039235
43007	NC_014724	ATAAA	2	10	2011161	2011170	80 %	20 %	0 %	0 %	315039235
43008	NC_014724	TTG	2	6	2011173	2011178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039235
43009	NC_014724	CGT	2	6	2011231	2011236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039235
43010	NC_014724	GAT	2	6	2011238	2011243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039235
43011	NC_014724	TCT	2	6	2011261	2011266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039235
43012	NC_014724	CA	3	6	2011307	2011312	50 %	0 %	0 %	50 %	315039235
43013	NC_014724	A	6	6	2011335	2011340	100 %	0 %	0 %	0 %	315039235
43014	NC_014724	T	6	6	2011383	2011388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43015	NC_014724	TAA	2	6	2011392	2011397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43016	NC_014724	TAA	2	6	2011402	2011407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43017	NC_014724	AGAA	2	8	2011430	2011437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43018	NC_014724	GTAA	2	8	2011450	2011457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43019	NC_014724	CTG	2	6	2011465	2011470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43020	NC_014724	TAA	2	6	2011533	2011538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039236
43021	NC_014724	T	6	6	2011544	2011549	0 %	100 %	0 %	0 %	315039236
43022	NC_014724	TAC	2	6	2011579	2011584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43023	NC_014724	ATT	2	6	2011619	2011624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039236
43024	NC_014724	CTA	2	6	2011734	2011739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43025	NC_014724	CAA	2	6	2011747	2011752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039236
43026	NC_014724	GAT	2	6	2011768	2011773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039236
43027	NC_014724	TGG	2	6	2011789	2011794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315039236
43028	NC_014724	CAA	2	6	2011873	2011878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039236
43029	NC_014724	CAA	2	6	2011955	2011960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039236
43030	NC_014724	ATC	2	6	2011979	2011984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43031	NC_014724	AAG	2	6	2012112	2012117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039236
43032	NC_014724	TCA	2	6	2012159	2012164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43033	NC_014724	TCATT	2	10	2012223	2012232	20 %	60 %	0 %	20 %	315039236
43034	NC_014724	ATT	2	6	2012234	2012239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039236
43035	NC_014724	CTA	2	6	2012271	2012276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43036	NC_014724	ATT	2	6	2012375	2012380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039236
43037	NC_014724	CTTTTG	2	12	2012424	2012435	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	315039236
43038	NC_014724	AGA	2	6	2012491	2012496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039236
43039	NC_014724	GCT	2	6	2012528	2012533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039236
43040	NC_014724	AAC	2	6	2012541	2012546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039236
43041	NC_014724	CTA	2	6	2012583	2012588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43042	NC_014724	ACT	2	6	2012627	2012632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43043	NC_014724	CTG	2	6	2012730	2012735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039236
43044	NC_014724	ATG	2	6	2012849	2012854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039236
43045	NC_014724	CCG	2	6	2013027	2013032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039236
43046	NC_014724	CTG	2	6	2013069	2013074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039236
43047	NC_014724	ATG	2	6	2013126	2013131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039236
43048	NC_014724	ATC	2	6	2013200	2013205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43049	NC_014724	AATT	2	8	2013210	2013217	50 %	50 %	0 %	0 %	315039236
43050	NC_014724	CTT	2	6	2013296	2013301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039236
43051	NC_014724	ACT	2	6	2013308	2013313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039236
43052	NC_014724	A	8	8	2013360	2013367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43053	NC_014724	ATTT	2	8	2013392	2013399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43054	NC_014724	CTT	2	6	2013442	2013447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43055	NC_014724	AAG	2	6	2013454	2013459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_014724	T	6	6	2013470	2013475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_014724	AATT	2	8	2013517	2013524	50 %	50 %	0 %	0 %	315039237
43058	NC_014724	GAC	2	6	2013536	2013541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039237
43059	NC_014724	ATT	2	6	2013557	2013562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039237
43060	NC_014724	CAG	2	6	2013580	2013585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039237
43061	NC_014724	TTA	2	6	2013612	2013617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039237
43062	NC_014724	GACTTG	2	12	2013717	2013728	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315039237
43063	NC_014724	TAGC	2	8	2013760	2013767	25 %	25 %	25 %	25 %	315039237
43064	NC_014724	GTT	2	6	2013786	2013791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039237
43065	NC_014724	CTT	2	6	2013812	2013817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039237
43066	NC_014724	TGA	2	6	2013956	2013961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039237
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43068	NC_014724	TAAC	2	8	2014027	2014034	50 %	25 %	0 %	25 %	315039237
43069	NC_014724	TTC	2	6	2014038	2014043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039237
43070	NC_014724	TCG	2	6	2014072	2014077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039237
43071	NC_014724	TTG	2	6	2014204	2014209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039237
43072	NC_014724	CCG	2	6	2014216	2014221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039237
43073	NC_014724	TTC	2	6	2014233	2014238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039237
43074	NC_014724	GGT	2	6	2014239	2014244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315039237
43075	NC_014724	AAG	2	6	2014273	2014278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039237
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43078	NC_014724	CTT	2	6	2014364	2014369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039237
43079	NC_014724	TCA	2	6	2014384	2014389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039237
43080	NC_014724	GTG	2	6	2014504	2014509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315039237
43081	NC_014724	T	6	6	2014696	2014701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43082	NC_014724	A	6	6	2014750	2014755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43083	NC_014724	GCG	2	6	2014762	2014767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43084	NC_014724	T	6	6	2014798	2014803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43085	NC_014724	GTCT	2	8	2014843	2014850	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43086	NC_014724	A	7	7	2014942	2014948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43087	NC_014724	GCT	2	6	2014951	2014956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43088	NC_014724	TTAT	2	8	2014978	2014985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_014724	A	6	6	2014994	2014999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43090	NC_014724	GGAT	2	8	2015045	2015052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43091	NC_014724	T	7	7	2015079	2015085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43092	NC_014724	ATCTA	2	10	2015133	2015142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43093	NC_014724	GAG	2	6	2015144	2015149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43094	NC_014724	ATC	2	6	2015234	2015239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039238
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43096	NC_014724	ACT	2	6	2015316	2015321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039238
43097	NC_014724	TAA	2	6	2015368	2015373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039238
43098	NC_014724	AGA	2	6	2015392	2015397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039238
43099	NC_014724	AGT	2	6	2015398	2015403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039238
43100	NC_014724	AAC	2	6	2015525	2015530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039238
43101	NC_014724	A	6	6	2015567	2015572	100 %	0 %	0 %	0 %	315039238
43102	NC_014724	GCTT	2	8	2015730	2015737	0 %	50 %	25 %	25 %	315039238
43103	NC_014724	A	6	6	2015773	2015778	100 %	0 %	0 %	0 %	315039238
43104	NC_014724	TGA	2	6	2015785	2015790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039238
43105	NC_014724	AAG	2	6	2015951	2015956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039238
43106	NC_014724	GCAG	2	8	2015985	2015992	25 %	0 %	50 %	25 %	315039238
43107	NC_014724	A	6	6	2016002	2016007	100 %	0 %	0 %	0 %	315039238
43108	NC_014724	A	6	6	2016031	2016036	100 %	0 %	0 %	0 %	315039238
43109	NC_014724	AGA	2	6	2016083	2016088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039238
43110	NC_014724	TAG	2	6	2016144	2016149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039238
43111	NC_014724	AGAAAC	2	12	2016164	2016175	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315039238
43112	NC_014724	CAAT	2	8	2016200	2016207	50 %	25 %	0 %	25 %	315039238
43113	NC_014724	TAC	2	6	2016298	2016303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039238
43114	NC_014724	TAT	2	6	2016328	2016333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039238
43115	NC_014724	TAAAA	2	10	2016469	2016478	80 %	20 %	0 %	0 %	315039238
43116	NC_014724	A	7	7	2016475	2016481	100 %	0 %	0 %	0 %	315039238
43117	NC_014724	GAC	2	6	2016542	2016547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43118	NC_014724	AAGTC	2	10	2016582	2016591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43119	NC_014724	GTC	2	6	2016675	2016680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43121	NC_014724	CAAT	2	8	2016764	2016771	50 %	25 %	0 %	25 %	315039239
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43230	NC_014724	TTTC	2	8	2022350	2022357	0 %	75 %	0 %	25 %	315039246
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43239	NC_014724	CAT	2	6	2023032	2023037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039246
43240	NC_014724	GTT	2	6	2023102	2023107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039246
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43245	NC_014724	CAA	2	6	2023526	2023531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039246
43246	NC_014724	ATA	2	6	2023628	2023633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039246
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43341	NC_014724	AAG	2	6	2028023	2028028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315039250
43342	NC_014724	AAAG	2	8	2028052	2028059	75 %	0 %	25 %	0 %	315039250
43343	NC_014724	TGA	2	6	2028151	2028156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039250
43344	NC_014724	A	6	6	2028211	2028216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43345	NC_014724	T	6	6	2028239	2028244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43346	NC_014724	T	6	6	2028257	2028262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43347	NC_014724	AT	3	6	2028270	2028275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43348	NC_014724	A	7	7	2028301	2028307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43349	NC_014724	CAC	2	6	2028314	2028319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43350	NC_014724	AT	3	6	2028354	2028359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43351	NC_014724	AGAA	2	8	2028363	2028370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43352	NC_014724	TAC	2	6	2028501	2028506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039251
43353	NC_014724	TACT	2	8	2028543	2028550	25 %	50 %	0 %	25 %	315039251
43354	NC_014724	ACC	2	6	2028553	2028558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039251
43355	NC_014724	TTC	2	6	2028633	2028638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039251
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