MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014724	ATC	2	6	1915691	1915696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039147
41002	NC_014724	ACG	2	6	1915757	1915762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039147
41003	NC_014724	AAT	2	6	1915772	1915777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039147
41004	NC_014724	AAC	2	6	1915805	1915810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039147
41005	NC_014724	TTGA	2	8	1915857	1915864	25 %	50 %	25 %	0 %	315039147
41006	NC_014724	ACG	2	6	1915880	1915885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039147
41007	NC_014724	TTTG	2	8	1915933	1915940	0 %	75 %	25 %	0 %	315039147
41008	NC_014724	CTT	2	6	1915951	1915956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039147
41009	NC_014724	CAT	2	6	1915957	1915962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039147
41010	NC_014724	AAT	2	6	1915977	1915982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039147
41011	NC_014724	ATA	2	6	1915986	1915991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039147
41012	NC_014724	CCT	2	6	1915995	1916000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41013	NC_014724	CGC	2	6	1916020	1916025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039148
41014	NC_014724	ACTTT	2	10	1916063	1916072	20 %	60 %	0 %	20 %	315039148
41015	NC_014724	TC	3	6	1916091	1916096	0 %	50 %	0 %	50 %	315039148
41016	NC_014724	TTC	2	6	1916097	1916102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039148
41017	NC_014724	TGA	2	6	1916132	1916137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039148
41018	NC_014724	GCC	2	6	1916142	1916147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039148
41019	NC_014724	CTT	2	6	1916226	1916231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039148
41020	NC_014724	AGGC	2	8	1916238	1916245	25 %	0 %	50 %	25 %	315039148
41021	NC_014724	AG	3	6	1916416	1916421	50 %	0 %	50 %	0 %	315039148
41022	NC_014724	CAA	2	6	1916423	1916428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039148
41023	NC_014724	GCACCA	2	12	1916482	1916493	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315039148
41024	NC_014724	TCT	2	6	1916584	1916589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039148
41025	NC_014724	TGC	2	6	1916656	1916661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039148
41026	NC_014724	A	7	7	1916881	1916887	100 %	0 %	0 %	0 %	315039149
41027	NC_014724	CTTA	2	8	1916912	1916919	25 %	50 %	0 %	25 %	315039149
41028	NC_014724	AC	3	6	1917041	1917046	50 %	0 %	0 %	50 %	315039149
41029	NC_014724	GCAAC	2	10	1917071	1917080	40 %	0 %	20 %	40 %	315039149
41030	NC_014724	CG	3	6	1917102	1917107	0 %	0 %	50 %	50 %	315039149
41031	NC_014724	TCG	2	6	1917110	1917115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039149
41032	NC_014724	TTC	2	6	1917118	1917123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039149
41033	NC_014724	TTG	2	6	1917134	1917139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039149
41034	NC_014724	GCA	2	6	1917206	1917211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039149
41035	NC_014724	CAA	2	6	1917316	1917321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039149
41036	NC_014724	GATT	2	8	1917324	1917331	25 %	50 %	25 %	0 %	315039149
41037	NC_014724	ACA	2	6	1917356	1917361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039149
41038	NC_014724	CAA	2	6	1917387	1917392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039149
41039	NC_014724	ATA	2	6	1917420	1917425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039149
41040	NC_014724	A	7	7	1917429	1917435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41041	NC_014724	T	7	7	1917461	1917467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41042	NC_014724	TTTA	2	8	1917470	1917477	25 %	75 %	0 %	0 %	315039150
41043	NC_014724	TCG	2	6	1917502	1917507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039150
41044	NC_014724	ATC	2	6	1917540	1917545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039150
41045	NC_014724	GATC	2	8	1917671	1917678	25 %	25 %	25 %	25 %	315039150
41046	NC_014724	GTG	2	6	1917681	1917686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315039150
41047	NC_014724	ACC	2	6	1917703	1917708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039150
41048	NC_014724	CT	3	6	1917827	1917832	0 %	50 %	0 %	50 %	315039150
41049	NC_014724	CAAG	2	8	1917848	1917855	50 %	0 %	25 %	25 %	315039150
41050	NC_014724	GCC	2	6	1917861	1917866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039150
41051	NC_014724	TGA	2	6	1917872	1917877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039150
41052	NC_014724	GCCA	2	8	1917898	1917905	25 %	0 %	25 %	50 %	315039150
41053	NC_014724	TTTGAT	2	12	1917989	1918000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315039150
41054	NC_014724	AAC	2	6	1918008	1918013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039150
41055	NC_014724	TC	3	6	1918038	1918043	0 %	50 %	0 %	50 %	315039150
41056	NC_014724	AAC	2	6	1918101	1918106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039150
41057	NC_014724	T	6	6	1918145	1918150	0 %	100 %	0 %	0 %	315039150
41058	NC_014724	TGAT	2	8	1918216	1918223	25 %	50 %	25 %	0 %	315039150
41059	NC_014724	TAA	2	6	1918257	1918262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039150
41060	NC_014724	ATCA	2	8	1918275	1918282	50 %	25 %	0 %	25 %	315039150
41061	NC_014724	ATG	3	9	1918356	1918364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039150
41062	NC_014724	ACT	2	6	1918369	1918374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039150
41063	NC_014724	TCT	2	6	1918462	1918467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039151
41064	NC_014724	CCA	2	6	1918488	1918493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315039151
41065	NC_014724	ATG	2	6	1918516	1918521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039151
41066	NC_014724	ATC	2	6	1918698	1918703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039151
41067	NC_014724	AAC	2	6	1918820	1918825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039151
41068	NC_014724	CA	3	6	1918843	1918848	50 %	0 %	0 %	50 %	315039151
41069	NC_014724	CTT	2	6	1918907	1918912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039151
41070	NC_014724	GCC	2	6	1918913	1918918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315039151
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41073	NC_014724	ATTT	2	8	1919217	1919224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41074	NC_014724	T	7	7	1919222	1919228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41075	NC_014724	A	7	7	1919233	1919239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41076	NC_014724	ATT	2	6	1919293	1919298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315039152
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41078	NC_014724	CAT	2	6	1919333	1919338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039152
41079	NC_014724	TCA	2	6	1919364	1919369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039152
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41083	NC_014724	TCT	2	6	1919481	1919486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039152
41084	NC_014724	ACT	2	6	1919526	1919531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039152
41085	NC_014724	GCT	2	6	1919532	1919537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315039152
41086	NC_014724	CTTCAT	2	12	1919540	1919551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	315039152
41087	NC_014724	AGC	2	6	1919600	1919605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315039152
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41089	NC_014724	TTC	2	6	1919696	1919701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039152
41090	NC_014724	TCA	2	6	1919724	1919729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039152
41091	NC_014724	A	6	6	1919787	1919792	100 %	0 %	0 %	0 %	315039152
41092	NC_014724	TAA	2	6	1919831	1919836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315039152
41093	NC_014724	TCA	2	6	1919881	1919886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039153
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41100	NC_014724	TAC	2	6	1920090	1920095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039153
41101	NC_014724	GTT	3	9	1920170	1920178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039153
41102	NC_014724	CTT	2	6	1920257	1920262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039153
41103	NC_014724	TTC	2	6	1920319	1920324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315039153
41104	NC_014724	ACC	2	6	1920400	1920405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41105	NC_014724	ATA	2	6	1920422	1920427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41106	NC_014724	AAAG	2	8	1920448	1920455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41107	NC_014724	T	6	6	1920466	1920471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41108	NC_014724	AAAAGA	2	12	1920475	1920486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41109	NC_014724	TCT	2	6	1920506	1920511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41110	NC_014724	GCG	2	6	1920582	1920587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315039154
41111	NC_014724	AGCAT	2	10	1920627	1920636	40 %	20 %	20 %	20 %	315039154
41112	NC_014724	TTTGGT	2	12	1920667	1920678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315039154
41113	NC_014724	AGT	2	6	1920719	1920724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315039154
41114	NC_014724	ACA	2	6	1920741	1920746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039154
41115	NC_014724	TCTTG	2	10	1920757	1920766	0 %	60 %	20 %	20 %	315039154
41116	NC_014724	CAA	2	6	1920859	1920864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315039154
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41118	NC_014724	TCAA	2	8	1920924	1920931	50 %	25 %	0 %	25 %	315039154
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41238	NC_014724	GGC	2	6	1926675	1926680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315039161
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41350	NC_014724	ACT	2	6	1932297	1932302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315039167
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41353	NC_014724	CCT	2	6	1932550	1932555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41354	NC_014724	TAGAT	2	10	1932558	1932567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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