MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 44191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_014724	AAC	2	6	1404202	1404207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038615
30003	NC_014724	AGC	2	6	1404220	1404225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038615
30004	NC_014724	GCT	2	6	1404269	1404274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038615
30005	NC_014724	TCC	2	6	1404343	1404348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30006	NC_014724	AAT	2	6	1404375	1404380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_014724	T	6	6	1404446	1404451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30008	NC_014724	GTTA	2	8	1404454	1404461	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30009	NC_014724	ATT	2	6	1404495	1404500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30010	NC_014724	GTT	3	9	1404580	1404588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038616
30011	NC_014724	TTG	2	6	1404620	1404625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038616
30012	NC_014724	TGG	2	6	1404698	1404703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315038616
30013	NC_014724	TTG	2	6	1404764	1404769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038616
30014	NC_014724	GAA	2	6	1404865	1404870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038616
30015	NC_014724	ACC	2	6	1404931	1404936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038616
30016	NC_014724	TTG	2	6	1404970	1404975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038616
30017	NC_014724	AGT	2	6	1404978	1404983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038616
30018	NC_014724	TAG	2	6	1405020	1405025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038616
30019	NC_014724	CTT	3	9	1405075	1405083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038616
30020	NC_014724	AGCC	2	8	1405086	1405093	25 %	0 %	25 %	50 %	315038616
30021	NC_014724	AAT	2	6	1405100	1405105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038616
30022	NC_014724	CTT	2	6	1405114	1405119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038616
30023	NC_014724	TTGTAG	2	12	1405124	1405135	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315038616
30024	NC_014724	TGC	2	6	1405143	1405148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038616
30025	NC_014724	TTG	2	6	1405271	1405276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038616
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30028	NC_014724	AGT	2	6	1405659	1405664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038616
30029	NC_014724	TTTG	2	8	1405725	1405732	0 %	75 %	25 %	0 %	315038616
30030	NC_014724	GCCTT	2	10	1405796	1405805	0 %	40 %	20 %	40 %	315038616
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30032	NC_014724	CTT	2	6	1405945	1405950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038616
30033	NC_014724	ATC	2	6	1406026	1406031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038616
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30035	NC_014724	TTC	2	6	1406047	1406052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038616
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30038	NC_014724	TTA	2	6	1406219	1406224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038616
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30040	NC_014724	ACT	2	6	1406273	1406278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038616
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30042	NC_014724	TAA	2	6	1406352	1406357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30043	NC_014724	TGA	2	6	1406372	1406377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_014724	ATA	2	6	1406382	1406387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_014724	ATT	2	6	1406422	1406427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30046	NC_014724	TTTTA	2	10	1406434	1406443	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_014724	TAT	3	9	1406461	1406469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30048	NC_014724	AT	3	6	1406512	1406517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30049	NC_014724	TTA	2	6	1406518	1406523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_014724	ATT	2	6	1406525	1406530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038617
30051	NC_014724	TAG	2	6	1406615	1406620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038617
30052	NC_014724	TAA	2	6	1406645	1406650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038617
30053	NC_014724	TCA	2	6	1406662	1406667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038617
30054	NC_014724	AAGA	2	8	1406722	1406729	75 %	0 %	25 %	0 %	315038617
30055	NC_014724	AAC	2	6	1406769	1406774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038617
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30057	NC_014724	GAAT	2	8	1406888	1406895	50 %	25 %	25 %	0 %	315038617
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30059	NC_014724	CGT	3	9	1406913	1406921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038617
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30070	NC_014724	ACC	2	6	1407285	1407290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038617
30071	NC_014724	T	6	6	1407414	1407419	0 %	100 %	0 %	0 %	315038617
30072	NC_014724	CTTT	2	8	1407425	1407432	0 %	75 %	0 %	25 %	315038617
30073	NC_014724	TCTT	2	8	1407442	1407449	0 %	75 %	0 %	25 %	315038617
30074	NC_014724	TCT	2	6	1407463	1407468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30075	NC_014724	CTC	2	6	1407469	1407474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30086	NC_014724	TAAAG	2	10	1407959	1407968	60 %	20 %	20 %	0 %	315038618
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30089	NC_014724	TAG	2	6	1408117	1408122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038618
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30094	NC_014724	TTGA	2	8	1408317	1408324	25 %	50 %	25 %	0 %	315038618
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30102	NC_014724	TTC	2	6	1408618	1408623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038619
30103	NC_014724	AAG	2	6	1408657	1408662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038619
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30117	NC_014724	TTG	2	6	1409147	1409152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038619
30118	NC_014724	TTGC	2	8	1409171	1409178	0 %	50 %	25 %	25 %	315038619
30119	NC_014724	CAA	2	6	1409235	1409240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038619
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30122	NC_014724	TAC	2	6	1409426	1409431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038620
30123	NC_014724	TGC	2	6	1409440	1409445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038620
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30129	NC_014724	GT	3	6	1409806	1409811	0 %	50 %	50 %	0 %	315038620
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30145	NC_014724	TATT	2	8	1410509	1410516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30146	NC_014724	T	7	7	1410564	1410570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30147	NC_014724	TGA	2	6	1410584	1410589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038621
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30218	NC_014724	A	7	7	1413620	1413626	100 %	0 %	0 %	0 %	315038623
30219	NC_014724	CTT	2	6	1413677	1413682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038623
30220	NC_014724	CCAT	2	8	1413744	1413751	25 %	25 %	0 %	50 %	315038623
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30222	NC_014724	CAT	2	6	1413956	1413961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
30223	NC_014724	ATC	2	6	1413978	1413983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
30224	NC_014724	TTC	2	6	1413990	1413995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30225	NC_014724	CTT	2	6	1414010	1414015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30226	NC_014724	CTT	3	9	1414019	1414027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30227	NC_014724	ATG	2	6	1414048	1414053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038624
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30229	NC_014724	GTA	2	6	1414099	1414104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038624
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30231	NC_014724	CGT	2	6	1414181	1414186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038624
30232	NC_014724	TCT	2	6	1414243	1414248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30233	NC_014724	ATC	2	6	1414266	1414271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038624
30234	NC_014724	CTTG	2	8	1414326	1414333	0 %	50 %	25 %	25 %	315038624
30235	NC_014724	GCTT	2	8	1414369	1414376	0 %	50 %	25 %	25 %	315038624
30236	NC_014724	AGC	2	6	1414377	1414382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038624
30237	NC_014724	GTT	2	6	1414398	1414403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038624
30238	NC_014724	CTT	2	6	1414419	1414424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30239	NC_014724	CTT	2	6	1414434	1414439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30240	NC_014724	ACC	2	6	1414482	1414487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038624
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30242	NC_014724	TTG	2	6	1414578	1414583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038624
30243	NC_014724	TTC	2	6	1414584	1414589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30244	NC_014724	TGT	2	6	1414625	1414630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038624
30245	NC_014724	GATCTT	2	12	1414632	1414643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315038624
30246	NC_014724	GTGAAC	2	12	1414698	1414709	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315038624
30247	NC_014724	TTC	2	6	1414776	1414781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30248	NC_014724	TCT	2	6	1414793	1414798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038624
30249	NC_014724	CAGTA	2	10	1414835	1414844	40 %	20 %	20 %	20 %	315038624
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30252	NC_014724	AAG	2	6	1414965	1414970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315038624
30253	NC_014724	ACC	2	6	1415010	1415015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315038624
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30256	NC_014724	CAA	2	6	1415090	1415095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038624
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30263	NC_014724	TGC	2	6	1415387	1415392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038624
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30272	NC_014724	TCC	2	6	1415966	1415971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30273	NC_014724	TAT	2	6	1415995	1416000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30274	NC_014724	TACT	2	8	1416011	1416018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30275	NC_014724	CAAT	2	8	1416019	1416026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30276	NC_014724	A	7	7	1416043	1416049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30277	NC_014724	AGG	2	6	1416114	1416119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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30282	NC_014724	A	6	6	1416318	1416323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30283	NC_014724	T	7	7	1416353	1416359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30284	NC_014724	T	6	6	1416364	1416369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30285	NC_014724	TGT	2	6	1416423	1416428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315038627
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30290	NC_014724	TTTCTT	2	12	1416730	1416741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30291	NC_014724	TGA	2	6	1416864	1416869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038628
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30297	NC_014724	TGTTT	2	10	1417025	1417034	0 %	80 %	20 %	0 %	315038628
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30312	NC_014724	TCT	2	6	1417810	1417815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038629
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30319	NC_014724	TCC	2	6	1418103	1418108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30320	NC_014724	AAT	2	6	1418163	1418168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038630
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30324	NC_014724	TAG	2	6	1418397	1418402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038630
30325	NC_014724	TGA	2	6	1418447	1418452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038630
30326	NC_014724	TCT	2	6	1418456	1418461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038630
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30332	NC_014724	AAGAA	2	10	1418691	1418700	80 %	0 %	20 %	0 %	315038630
30333	NC_014724	TAA	2	6	1418716	1418721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038630
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30335	NC_014724	CTG	2	6	1418877	1418882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038630
30336	NC_014724	T	7	7	1418891	1418897	0 %	100 %	0 %	0 %	315038630
30337	NC_014724	ATA	2	6	1418953	1418958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038630
30338	NC_014724	ATTT	2	8	1418999	1419006	25 %	75 %	0 %	0 %	315038630
30339	NC_014724	TTCA	2	8	1419016	1419023	25 %	50 %	0 %	25 %	315038631
30340	NC_014724	ACT	2	6	1419044	1419049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038631
30341	NC_014724	AGT	2	6	1419138	1419143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038631
30342	NC_014724	TCG	2	6	1419146	1419151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038631
30343	NC_014724	TAG	2	6	1419183	1419188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038631
30344	NC_014724	ACTTG	2	10	1419190	1419199	20 %	40 %	20 %	20 %	315038631
30345	NC_014724	TAT	3	9	1419222	1419230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038631
30346	NC_014724	GTC	2	6	1419247	1419252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038631
30347	NC_014724	TTC	2	6	1419304	1419309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038631
30348	NC_014724	CAT	2	6	1419405	1419410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038631
30349	NC_014724	CTT	2	6	1419515	1419520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038631
30350	NC_014724	GCA	2	6	1419590	1419595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038631
30351	NC_014724	ATG	2	6	1419608	1419613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038631
30352	NC_014724	CTTG	2	8	1419628	1419635	0 %	50 %	25 %	25 %	315038631
30353	NC_014724	TCT	2	6	1419644	1419649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038631
30354	NC_014724	ATC	2	6	1419700	1419705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038631
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30464	NC_014724	T	6	6	1425749	1425754	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
30465	NC_014724	GCT	2	6	1425856	1425861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315038635
30466	NC_014724	TAT	2	6	1425889	1425894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315038635
30467	NC_014724	TTC	2	6	1425908	1425913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038635
30468	NC_014724	CTTTTT	2	12	1425944	1425955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	315038635
30469	NC_014724	ACA	2	6	1425969	1425974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038635
30470	NC_014724	CAT	3	9	1425988	1425996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
30471	NC_014724	T	6	6	1425996	1426001	0 %	100 %	0 %	0 %	315038635
30472	NC_014724	TTATT	2	10	1426039	1426048	20 %	80 %	0 %	0 %	315038635
30473	NC_014724	A	6	6	1426070	1426075	100 %	0 %	0 %	0 %	315038635
30474	NC_014724	GCA	2	6	1426144	1426149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038635
30475	NC_014724	AATA	2	8	1426177	1426184	75 %	25 %	0 %	0 %	315038635
30476	NC_014724	GGC	2	6	1426230	1426235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315038635
30477	NC_014724	TCA	2	6	1426239	1426244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
30478	NC_014724	CAA	2	6	1426253	1426258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038635
30479	NC_014724	ACT	3	9	1426338	1426346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
30480	NC_014724	CGC	2	6	1426418	1426423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315038635
30481	NC_014724	ATC	2	6	1426446	1426451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038635
30482	NC_014724	A	6	6	1426463	1426468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30483	NC_014724	TCAA	2	8	1426493	1426500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30484	NC_014724	CAG	2	6	1426551	1426556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038636
30485	NC_014724	TTC	2	6	1426561	1426566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038636
30486	NC_014724	CT	3	6	1426641	1426646	0 %	50 %	0 %	50 %	315038636
30487	NC_014724	AGC	2	6	1426648	1426653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315038636
30488	NC_014724	AAT	2	6	1426691	1426696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315038636
30489	NC_014724	GTAA	2	8	1426711	1426718	50 %	25 %	25 %	0 %	315038636
30490	NC_014724	TAAT	2	8	1426725	1426732	50 %	50 %	0 %	0 %	315038636
30491	NC_014724	CCT	2	6	1426733	1426738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315038637
30492	NC_014724	TCA	2	6	1426756	1426761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038637
30493	NC_014724	CAA	2	6	1426793	1426798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315038637
30494	NC_014724	ACT	2	6	1426840	1426845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315038637
30495	NC_014724	ATTTC	2	10	1426873	1426882	20 %	60 %	0 %	20 %	315038637
30496	NC_014724	GCTT	2	8	1426885	1426892	0 %	50 %	25 %	25 %	315038637
30497	NC_014724	CTT	2	6	1426910	1426915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038637
30498	NC_014724	TCT	2	6	1427069	1427074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038637
30499	NC_014724	ATG	2	6	1427100	1427105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315038637
30500	NC_014724	CTT	2	6	1427150	1427155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315038637

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