MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_014554	CAGC	2	8	2499903	2499910	25 %	0 %	25 %	50 %	308181512
49002	NC_014554	ATC	2	6	2499939	2499944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181512
49003	NC_014554	CCT	2	6	2499950	2499955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181512
49004	NC_014554	ATT	2	6	2499978	2499983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181512
49005	NC_014554	TCACG	2	10	2499984	2499993	20 %	20 %	20 %	40 %	308181512
49006	NC_014554	AAC	2	6	2500118	2500123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181512
49007	NC_014554	GTT	2	6	2500148	2500153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49008	NC_014554	A	6	6	2500180	2500185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49009	NC_014554	AAC	2	6	2500227	2500232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181513
49010	NC_014554	TCA	2	6	2500258	2500263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49011	NC_014554	ACT	2	6	2500275	2500280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49012	NC_014554	GTTG	2	8	2500352	2500359	0 %	50 %	50 %	0 %	308181513
49013	NC_014554	CGG	2	6	2500568	2500573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181513
49014	NC_014554	CAC	2	6	2500619	2500624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181513
49015	NC_014554	AAT	2	6	2500731	2500736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181513
49016	NC_014554	AAC	2	6	2500794	2500799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181513
49017	NC_014554	ACC	2	6	2500836	2500841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181513
49018	NC_014554	TGT	2	6	2500867	2500872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181513
49019	NC_014554	T	6	6	2501001	2501006	0 %	100 %	0 %	0 %	308181513
49020	NC_014554	GCC	2	6	2501008	2501013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181513
49021	NC_014554	CAC	2	6	2501025	2501030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181513
49022	NC_014554	AGC	2	6	2501040	2501045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181513
49023	NC_014554	GTT	2	6	2501070	2501075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181513
49024	NC_014554	TCA	2	6	2501077	2501082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49025	NC_014554	GTTCA	2	10	2501091	2501100	20 %	40 %	20 %	20 %	308181513
49026	NC_014554	AAG	2	6	2501104	2501109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181513
49027	NC_014554	AGT	3	9	2501138	2501146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181513
49028	NC_014554	ATT	2	6	2501196	2501201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181513
49029	NC_014554	ATA	2	6	2501211	2501216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181513
49030	NC_014554	GAA	2	6	2501283	2501288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181513
49031	NC_014554	TCA	2	6	2501290	2501295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49032	NC_014554	TCA	2	6	2501314	2501319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49033	NC_014554	ATT	2	6	2501340	2501345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181513
49034	NC_014554	TGA	2	6	2501498	2501503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181513
49035	NC_014554	A	6	6	2501532	2501537	100 %	0 %	0 %	0 %	308181513
49036	NC_014554	ATC	2	6	2501559	2501564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181513
49037	NC_014554	TGA	2	6	2501638	2501643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181513
49038	NC_014554	AAC	2	6	2501650	2501655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181513
49039	NC_014554	A	7	7	2501718	2501724	100 %	0 %	0 %	0 %	308181513
49040	NC_014554	ATC	2	6	2501883	2501888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181514
49041	NC_014554	TCA	2	6	2501907	2501912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181514
49042	NC_014554	AAT	2	6	2501948	2501953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181514
49043	NC_014554	CAT	2	6	2501974	2501979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181514
49044	NC_014554	CAAG	2	8	2502013	2502020	50 %	0 %	25 %	25 %	308181514
49045	NC_014554	CAT	2	6	2502067	2502072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181514
49046	NC_014554	GTT	2	6	2502154	2502159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181514
49047	NC_014554	TTG	2	6	2502251	2502256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181514
49048	NC_014554	TTC	2	6	2502260	2502265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181514
49049	NC_014554	AAT	2	6	2502284	2502289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181514
49050	NC_014554	CGG	2	6	2502373	2502378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181514
49051	NC_014554	CAG	2	6	2502406	2502411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181514
49052	NC_014554	TTG	2	6	2502413	2502418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181514
49053	NC_014554	CCATT	2	10	2502438	2502447	20 %	40 %	0 %	40 %	308181514
49054	NC_014554	GCG	2	6	2502573	2502578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181514
49055	NC_014554	GCG	2	6	2502619	2502624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181514
49056	NC_014554	TCC	2	6	2502625	2502630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181514
49057	NC_014554	TAAT	2	8	2502699	2502706	50 %	50 %	0 %	0 %	308181514
49058	NC_014554	GAC	2	6	2502767	2502772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181514
49059	NC_014554	ATA	2	6	2502896	2502901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181514
49060	NC_014554	GTT	2	6	2502916	2502921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181514
49061	NC_014554	TAA	2	6	2502953	2502958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181514
49062	NC_014554	TGAA	2	8	2503071	2503078	50 %	25 %	25 %	0 %	308181514
49063	NC_014554	GCT	2	6	2503116	2503121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181514
49064	NC_014554	A	7	7	2503147	2503153	100 %	0 %	0 %	0 %	308181514
49065	NC_014554	T	6	6	2503232	2503237	0 %	100 %	0 %	0 %	308181514
49066	NC_014554	ATA	2	6	2503262	2503267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181514
49067	NC_014554	ATT	2	6	2503269	2503274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181514
49068	NC_014554	ACG	2	6	2503289	2503294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49069	NC_014554	TAA	2	6	2503335	2503340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49070	NC_014554	T	6	6	2503366	2503371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49071	NC_014554	TGA	2	6	2503401	2503406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49072	NC_014554	ATG	2	6	2503422	2503427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49073	NC_014554	TTA	2	6	2503457	2503462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49074	NC_014554	TTAT	2	8	2503488	2503495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49075	NC_014554	CGGT	2	8	2503510	2503517	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49076	NC_014554	AAC	2	6	2503543	2503548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49077	NC_014554	TAC	2	6	2503638	2503643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181515
49078	NC_014554	GAC	2	6	2503713	2503718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181515
49079	NC_014554	TAC	2	6	2503818	2503823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181515
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49083	NC_014554	CAG	2	6	2503946	2503951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181515
49084	NC_014554	AGT	2	6	2503993	2503998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181515
49085	NC_014554	TCA	2	6	2504008	2504013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181515
49086	NC_014554	TGC	2	6	2504022	2504027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181515
49087	NC_014554	AGT	2	6	2504071	2504076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181515
49088	NC_014554	GCC	2	6	2504077	2504082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181515
49089	NC_014554	GCC	2	6	2504200	2504205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181515
49090	NC_014554	CAGC	2	8	2504219	2504226	25 %	0 %	25 %	50 %	308181515
49091	NC_014554	AGT	2	6	2504227	2504232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181515
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49093	NC_014554	AGC	2	6	2504266	2504271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181515
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49097	NC_014554	TAT	2	6	2504374	2504379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181515
49098	NC_014554	ACT	2	6	2504417	2504422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181515
49099	NC_014554	TTA	2	6	2504514	2504519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181515
49100	NC_014554	C	6	6	2504632	2504637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49101	NC_014554	TCA	2	6	2504662	2504667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49102	NC_014554	CTG	2	6	2504685	2504690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49103	NC_014554	C	6	6	2504758	2504763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49104	NC_014554	AC	3	6	2504802	2504807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49105	NC_014554	ATTGC	2	10	2504819	2504828	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49106	NC_014554	ATG	2	6	2504938	2504943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49107	NC_014554	TAT	3	9	2505007	2505015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181516
49108	NC_014554	CAA	2	6	2505025	2505030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181516
49109	NC_014554	CTG	2	6	2505055	2505060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181516
49110	NC_014554	AAC	2	6	2505125	2505130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181516
49111	NC_014554	GCC	2	6	2505135	2505140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181516
49112	NC_014554	GAA	2	6	2505161	2505166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181516
49113	NC_014554	AACA	2	8	2505204	2505211	75 %	0 %	0 %	25 %	308181516
49114	NC_014554	CCA	2	6	2505235	2505240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181516
49115	NC_014554	ACG	2	6	2505261	2505266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181516
49116	NC_014554	GCC	2	6	2505282	2505287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181516
49117	NC_014554	CTA	2	6	2505298	2505303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181516
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49231	NC_014554	TCC	2	6	2511012	2511017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49232	NC_014554	ACT	2	6	2511025	2511030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49233	NC_014554	TCA	3	9	2511057	2511065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181522
49234	NC_014554	TTG	2	6	2511127	2511132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181522
49235	NC_014554	CAC	2	6	2511226	2511231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181522
49236	NC_014554	ATG	2	6	2511260	2511265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181522
49237	NC_014554	ATT	2	6	2511275	2511280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181522
49238	NC_014554	TCA	2	6	2511330	2511335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181522
49239	NC_014554	TTG	2	6	2511374	2511379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181522
49240	NC_014554	TAT	2	6	2511418	2511423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181522
49241	NC_014554	GTT	2	6	2511426	2511431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181522
49242	NC_014554	ATT	2	6	2511454	2511459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49243	NC_014554	TGAT	2	8	2511471	2511478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49244	NC_014554	CAA	2	6	2511513	2511518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49245	NC_014554	ACT	2	6	2511618	2511623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181523
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49250	NC_014554	GC	3	6	2511836	2511841	0 %	0 %	50 %	50 %	308181523
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49254	NC_014554	CAT	2	6	2511927	2511932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181523
49255	NC_014554	AATT	2	8	2511953	2511960	50 %	50 %	0 %	0 %	308181523
49256	NC_014554	GAA	2	6	2511966	2511971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181523
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49259	NC_014554	A	7	7	2512113	2512119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49260	NC_014554	T	7	7	2512162	2512168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49261	NC_014554	T	6	6	2512238	2512243	0 %	100 %	0 %	0 %	308181524
49262	NC_014554	CATA	2	8	2512265	2512272	50 %	25 %	0 %	25 %	308181524
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49267	NC_014554	TGCAT	2	10	2512521	2512530	20 %	40 %	20 %	20 %	308181524
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49289	NC_014554	TTAA	2	8	2513491	2513498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49290	NC_014554	CAAT	2	8	2513506	2513513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49291	NC_014554	CAT	2	6	2513612	2513617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181525
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49332	NC_014554	GTCTGC	2	12	2516276	2516287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181526
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49341	NC_014554	CCA	2	6	2516646	2516651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181526
49342	NC_014554	CAC	2	6	2516715	2516720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181526
49343	NC_014554	CTG	2	6	2516821	2516826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181526
49344	NC_014554	CCT	2	6	2516852	2516857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49345	NC_014554	TAT	2	6	2516874	2516879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49346	NC_014554	ACA	2	6	2516955	2516960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49347	NC_014554	CACTGA	2	12	2516963	2516974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49348	NC_014554	GAG	2	6	2517002	2517007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49349	NC_014554	TACT	2	8	2517072	2517079	25 %	50 %	0 %	25 %	308181527
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49469	NC_014554	TCA	2	6	2522522	2522527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49470	NC_014554	TAT	2	6	2522539	2522544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49471	NC_014554	AT	3	6	2522555	2522560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49472	NC_014554	AGCCA	2	10	2522614	2522623	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49473	NC_014554	TAG	2	6	2522680	2522685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181536
49474	NC_014554	TTC	3	9	2522722	2522730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181536
49475	NC_014554	CATCTG	2	12	2522739	2522750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181536
49476	NC_014554	ACC	3	9	2522769	2522777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181536
49477	NC_014554	CTTG	2	8	2522785	2522792	0 %	50 %	25 %	25 %	308181536
49478	NC_014554	TCT	2	6	2522854	2522859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181536
49479	NC_014554	TTC	2	6	2522880	2522885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181536
49480	NC_014554	TCA	2	6	2523010	2523015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181536
49481	NC_014554	TAA	2	6	2523026	2523031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181536
49482	NC_014554	CTTT	2	8	2523061	2523068	0 %	75 %	0 %	25 %	308181536
49483	NC_014554	TCAT	2	8	2523126	2523133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49484	NC_014554	GTTT	2	8	2523153	2523160	0 %	75 %	25 %	0 %	308181537
49485	NC_014554	AAT	2	6	2523162	2523167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
49486	NC_014554	ATA	2	6	2523185	2523190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
49487	NC_014554	ATT	2	6	2523197	2523202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181537
49488	NC_014554	TGAT	2	8	2523303	2523310	25 %	50 %	25 %	0 %	308181537
49489	NC_014554	ATA	2	6	2523404	2523409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
49490	NC_014554	CTC	2	6	2523410	2523415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181537
49491	NC_014554	AAT	2	6	2523440	2523445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
49492	NC_014554	T	6	6	2523484	2523489	0 %	100 %	0 %	0 %	308181537
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49494	NC_014554	CTGT	2	8	2523610	2523617	0 %	50 %	25 %	25 %	308181537
49495	NC_014554	AAT	2	6	2523618	2523623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181537
49496	NC_014554	TTC	2	6	2523632	2523637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181537
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49500	NC_014554	CTT	2	6	2523726	2523731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181537

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