MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_014554	ATT	2	6	2445385	2445390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181473
48002	NC_014554	AAC	2	6	2445559	2445564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181473
48003	NC_014554	GTC	2	6	2445593	2445598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181473
48004	NC_014554	TGA	2	6	2445673	2445678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181473
48005	NC_014554	GTC	2	6	2445684	2445689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181473
48006	NC_014554	ATG	2	6	2445708	2445713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181473
48007	NC_014554	CG	3	6	2445749	2445754	0 %	0 %	50 %	50 %	308181473
48008	NC_014554	ACGC	2	8	2445911	2445918	25 %	0 %	25 %	50 %	308181473
48009	NC_014554	ACC	2	6	2445950	2445955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181473
48010	NC_014554	AC	3	6	2445979	2445984	50 %	0 %	0 %	50 %	308181473
48011	NC_014554	CAA	2	6	2446025	2446030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181473
48012	NC_014554	GAG	2	6	2446099	2446104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48013	NC_014554	AGTC	2	8	2446120	2446127	25 %	25 %	25 %	25 %	308181474
48014	NC_014554	TCTT	2	8	2446143	2446150	0 %	75 %	0 %	25 %	308181474
48015	NC_014554	AC	3	6	2446353	2446358	50 %	0 %	0 %	50 %	308181474
48016	NC_014554	GTTCA	2	10	2446376	2446385	20 %	40 %	20 %	20 %	308181474
48017	NC_014554	ATT	2	6	2446517	2446522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181474
48018	NC_014554	ACT	2	6	2446528	2446533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181474
48019	NC_014554	ACCA	2	8	2446645	2446652	50 %	0 %	0 %	50 %	308181474
48020	NC_014554	ACT	2	6	2446654	2446659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181474
48021	NC_014554	TGT	2	6	2446698	2446703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181474
48022	NC_014554	TGT	2	6	2446789	2446794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181474
48023	NC_014554	TTC	2	6	2446823	2446828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181474
48024	NC_014554	AT	3	6	2446843	2446848	50 %	50 %	0 %	0 %	308181474
48025	NC_014554	CTA	2	6	2446868	2446873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181474
48026	NC_014554	CAT	2	6	2446900	2446905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181474
48027	NC_014554	GGT	2	6	2446909	2446914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181474
48028	NC_014554	ATT	2	6	2446964	2446969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181474
48029	NC_014554	AT	3	6	2447129	2447134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48030	NC_014554	TAA	2	6	2447140	2447145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181475
48031	NC_014554	CGC	2	6	2447208	2447213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181475
48032	NC_014554	GGT	2	6	2447300	2447305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181475
48033	NC_014554	TGA	3	9	2447356	2447364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181475
48034	NC_014554	GTA	2	6	2447386	2447391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181475
48035	NC_014554	CCG	2	6	2447396	2447401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181475
48036	NC_014554	CTG	2	6	2447442	2447447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181475
48037	NC_014554	AAT	2	6	2447449	2447454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181475
48038	NC_014554	ATG	2	6	2447469	2447474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181475
48039	NC_014554	GTT	2	6	2447476	2447481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181475
48040	NC_014554	AT	3	6	2447661	2447666	50 %	50 %	0 %	0 %	308181475
48041	NC_014554	CAA	2	6	2447667	2447672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181475
48042	NC_014554	GTC	2	6	2447695	2447700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181475
48043	NC_014554	ACC	3	9	2447830	2447838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181475
48044	NC_014554	AAT	2	6	2447867	2447872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181475
48045	NC_014554	TTGG	2	8	2447911	2447918	0 %	50 %	50 %	0 %	308181475
48046	NC_014554	TAA	2	6	2447937	2447942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181475
48047	NC_014554	GAT	2	6	2447945	2447950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181475
48048	NC_014554	GCC	2	6	2447983	2447988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181475
48049	NC_014554	CCG	3	9	2447993	2448001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181475
48050	NC_014554	TTA	2	6	2448093	2448098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48051	NC_014554	T	6	6	2448212	2448217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_014554	CTG	2	6	2448256	2448261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48053	NC_014554	CAA	2	6	2448282	2448287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48054	NC_014554	A	6	6	2448286	2448291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48055	NC_014554	TAAC	2	8	2448332	2448339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48056	NC_014554	ATT	2	6	2448364	2448369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181476
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48061	NC_014554	TGC	2	6	2448648	2448653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181476
48062	NC_014554	AAC	2	6	2448686	2448691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181476
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48066	NC_014554	CT	3	6	2448950	2448955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48067	NC_014554	TAAT	2	8	2448963	2448970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48068	NC_014554	GTC	2	6	2449040	2449045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48069	NC_014554	CCTG	2	8	2449121	2449128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48070	NC_014554	AATT	2	8	2449198	2449205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48071	NC_014554	ATC	2	6	2449235	2449240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48072	NC_014554	ATTA	2	8	2449270	2449277	50 %	50 %	0 %	0 %	308181477
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48082	NC_014554	TA	3	6	2449723	2449728	50 %	50 %	0 %	0 %	308181477
48083	NC_014554	CAT	2	6	2449744	2449749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181477
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48102	NC_014554	GCG	2	6	2450658	2450663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181477
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48107	NC_014554	TGA	2	6	2450948	2450953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181477
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48112	NC_014554	GC	3	6	2451155	2451160	0 %	0 %	50 %	50 %	308181477
48113	NC_014554	T	6	6	2451161	2451166	0 %	100 %	0 %	0 %	308181477
48114	NC_014554	GCTTCG	2	12	2451258	2451269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181477
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48117	NC_014554	T	6	6	2451398	2451403	0 %	100 %	0 %	0 %	308181477
48118	NC_014554	T	6	6	2451405	2451410	0 %	100 %	0 %	0 %	308181477
48119	NC_014554	CTC	2	6	2451427	2451432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48146	NC_014554	CCT	2	6	2453048	2453053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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48157	NC_014554	T	6	6	2453966	2453971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48230	NC_014554	TAAA	2	8	2458447	2458454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48231	NC_014554	CAT	2	6	2458493	2458498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48234	NC_014554	CAT	2	6	2458713	2458718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48235	NC_014554	A	6	6	2458778	2458783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48236	NC_014554	C	6	6	2458861	2458866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48237	NC_014554	TAG	2	6	2458881	2458886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48349	NC_014554	CGCT	2	8	2465409	2465416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48350	NC_014554	CTAAT	2	10	2465420	2465429	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48351	NC_014554	GTTC	2	8	2465464	2465471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48352	NC_014554	TCTTAA	2	12	2465475	2465486	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48353	NC_014554	TGA	2	6	2465502	2465507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48355	NC_014554	ATC	2	6	2465548	2465553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48357	NC_014554	A	8	8	2465707	2465714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48358	NC_014554	ACT	2	6	2465781	2465786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48482	NC_014554	GAC	2	6	2472333	2472338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181488
48483	NC_014554	ATC	2	6	2472345	2472350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181488
48484	NC_014554	CAG	2	6	2472419	2472424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181488
48485	NC_014554	CAA	2	6	2472453	2472458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181488
48486	NC_014554	CCA	2	6	2472553	2472558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181488
48487	NC_014554	AAG	2	6	2472595	2472600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181488
48488	NC_014554	CAA	2	6	2472665	2472670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181488
48489	NC_014554	AAC	2	6	2472700	2472705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181488
48490	NC_014554	AAC	2	6	2472793	2472798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181488
48491	NC_014554	CAC	2	6	2472905	2472910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181488
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48493	NC_014554	TTG	2	6	2473071	2473076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181488
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48496	NC_014554	TCC	2	6	2473124	2473129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48497	NC_014554	A	7	7	2473148	2473154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48498	NC_014554	TCA	2	6	2473165	2473170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48499	NC_014554	ACC	2	6	2473195	2473200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48500	NC_014554	ATC	2	6	2473244	2473249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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