MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_014554	TCA	2	6	2394885	2394890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181421
47002	NC_014554	GGT	2	6	2394908	2394913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181421
47003	NC_014554	CGC	2	6	2394959	2394964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181421
47004	NC_014554	ATC	2	6	2395076	2395081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181421
47005	NC_014554	AAC	2	6	2395184	2395189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181421
47006	NC_014554	ATT	2	6	2395310	2395315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181421
47007	NC_014554	TCGCTT	2	12	2395420	2395431	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	308181421
47008	NC_014554	AAAGC	2	10	2395441	2395450	60 %	0 %	20 %	20 %	308181421
47009	NC_014554	ATT	3	9	2395473	2395481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181421
47010	NC_014554	ACG	2	6	2395503	2395508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181422
47011	NC_014554	TGC	2	6	2395513	2395518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181422
47012	NC_014554	GCC	2	6	2395574	2395579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181422
47013	NC_014554	CAAC	2	8	2395614	2395621	50 %	0 %	0 %	50 %	308181422
47014	NC_014554	TCA	2	6	2395643	2395648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47015	NC_014554	GTG	2	6	2395785	2395790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181422
47016	NC_014554	TAA	2	6	2395804	2395809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181422
47017	NC_014554	ATC	2	6	2395813	2395818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47018	NC_014554	CGC	2	6	2395848	2395853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181422
47019	NC_014554	TG	3	6	2395939	2395944	0 %	50 %	50 %	0 %	308181422
47020	NC_014554	ATG	2	6	2395951	2395956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181422
47021	NC_014554	AAC	2	6	2395990	2395995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181422
47022	NC_014554	CAG	2	6	2395998	2396003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181422
47023	NC_014554	CAT	2	6	2396017	2396022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47024	NC_014554	CAC	2	6	2396098	2396103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181422
47025	NC_014554	GCC	2	6	2396147	2396152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181422
47026	NC_014554	GAA	2	6	2396253	2396258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181422
47027	NC_014554	AGTGC	2	10	2396297	2396306	20 %	20 %	40 %	20 %	308181422
47028	NC_014554	GCA	2	6	2396333	2396338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181422
47029	NC_014554	TCA	2	6	2396351	2396356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47030	NC_014554	GC	3	6	2396392	2396397	0 %	0 %	50 %	50 %	308181422
47031	NC_014554	GCC	2	6	2396411	2396416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181422
47032	NC_014554	ATC	2	6	2396419	2396424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47033	NC_014554	CAA	2	6	2396433	2396438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181422
47034	NC_014554	TCA	2	6	2396526	2396531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181422
47035	NC_014554	CCA	2	6	2396549	2396554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181422
47036	NC_014554	GGT	2	6	2396573	2396578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181422
47037	NC_014554	CCT	2	6	2396617	2396622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47038	NC_014554	TGT	2	6	2396655	2396660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47039	NC_014554	GGC	2	6	2396690	2396695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47040	NC_014554	TCG	2	6	2396737	2396742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47041	NC_014554	AGT	2	6	2396835	2396840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47042	NC_014554	C	6	6	2396877	2396882	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47043	NC_014554	AAT	2	6	2396891	2396896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47044	NC_014554	GCT	2	6	2396916	2396921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47045	NC_014554	CAT	2	6	2397071	2397076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47046	NC_014554	ATTA	2	8	2397153	2397160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47047	NC_014554	ATA	2	6	2397292	2397297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47048	NC_014554	TTA	2	6	2397298	2397303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47049	NC_014554	TCA	2	6	2397328	2397333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47050	NC_014554	CAA	2	6	2397372	2397377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47051	NC_014554	CAA	2	6	2397419	2397424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47052	NC_014554	ACTG	2	8	2397507	2397514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47053	NC_014554	CAA	2	6	2397535	2397540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47054	NC_014554	A	7	7	2397595	2397601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_014554	T	6	6	2397628	2397633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47056	NC_014554	ATT	2	6	2397643	2397648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181423
47057	NC_014554	TTGG	2	8	2397693	2397700	0 %	50 %	50 %	0 %	308181423
47058	NC_014554	CAT	2	6	2397742	2397747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181423
47059	NC_014554	GCA	2	6	2397759	2397764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181423
47060	NC_014554	CCTTCG	2	12	2397778	2397789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	308181423
47061	NC_014554	CGTC	2	8	2397808	2397815	0 %	25 %	25 %	50 %	308181423
47062	NC_014554	ATA	2	6	2397941	2397946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181423
47063	NC_014554	TTA	2	6	2397960	2397965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181423
47064	NC_014554	CGCT	2	8	2398025	2398032	0 %	25 %	25 %	50 %	308181423
47065	NC_014554	CCAT	2	8	2398119	2398126	25 %	25 %	0 %	50 %	308181423
47066	NC_014554	GTT	2	6	2398151	2398156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181423
47067	NC_014554	GTC	2	6	2398247	2398252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181423
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47069	NC_014554	GCAT	2	8	2398302	2398309	25 %	25 %	25 %	25 %	308181423
47070	NC_014554	TTC	2	6	2398362	2398367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181423
47071	NC_014554	ATC	2	6	2398370	2398375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181423
47072	NC_014554	CATC	2	8	2398390	2398397	25 %	25 %	0 %	50 %	308181423
47073	NC_014554	CGA	2	6	2398592	2398597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181423
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47077	NC_014554	ATC	2	6	2398793	2398798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181423
47078	NC_014554	TCG	3	9	2398939	2398947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181423
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47084	NC_014554	TCG	2	6	2399070	2399075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181424
47085	NC_014554	TCA	2	6	2399105	2399110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181424
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47087	NC_014554	AAT	2	6	2399242	2399247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181424
47088	NC_014554	TAA	2	6	2399346	2399351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181424
47089	NC_014554	TTGC	2	8	2399385	2399392	0 %	50 %	25 %	25 %	308181424
47090	NC_014554	AT	3	6	2399492	2399497	50 %	50 %	0 %	0 %	308181424
47091	NC_014554	CAA	2	6	2399500	2399505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181424
47092	NC_014554	AAC	2	6	2399567	2399572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47093	NC_014554	TA	3	6	2399600	2399605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47094	NC_014554	AAAG	2	8	2399644	2399651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47095	NC_014554	AAC	2	6	2399688	2399693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47096	NC_014554	T	6	6	2399780	2399785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47097	NC_014554	ACG	2	6	2399795	2399800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47098	NC_014554	ATCAA	2	10	2399806	2399815	60 %	20 %	0 %	20 %	308181425
47099	NC_014554	CCG	2	6	2399822	2399827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181425
47100	NC_014554	ACG	2	6	2399920	2399925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47101	NC_014554	GAA	2	6	2399946	2399951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181425
47102	NC_014554	CCA	2	6	2399987	2399992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181425
47103	NC_014554	GCT	2	6	2400035	2400040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47104	NC_014554	TGAC	2	8	2400057	2400064	25 %	25 %	25 %	25 %	308181425
47105	NC_014554	AATCC	2	10	2400069	2400078	40 %	20 %	0 %	40 %	308181425
47106	NC_014554	TTG	2	6	2400093	2400098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181425
47107	NC_014554	TGC	2	6	2400105	2400110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47108	NC_014554	TCGG	2	8	2400301	2400308	0 %	25 %	50 %	25 %	308181425
47109	NC_014554	CAT	2	6	2400344	2400349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181425
47110	NC_014554	CTT	2	6	2400411	2400416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181425
47111	NC_014554	ATCA	2	8	2400420	2400427	50 %	25 %	0 %	25 %	308181425
47112	NC_014554	TCG	2	6	2400449	2400454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47113	NC_014554	CGT	2	6	2400530	2400535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181425
47114	NC_014554	TAA	2	6	2400542	2400547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181425
47115	NC_014554	TCA	2	6	2400571	2400576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181425
47116	NC_014554	CCA	3	9	2400586	2400594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181425
47117	NC_014554	CGC	2	6	2400601	2400606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181425
47118	NC_014554	AATGT	2	10	2400610	2400619	40 %	40 %	20 %	0 %	308181425
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47137	NC_014554	A	6	6	2401865	2401870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47237	NC_014554	CAA	2	6	2407112	2407117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181431
47238	NC_014554	GCTA	2	8	2407283	2407290	25 %	25 %	25 %	25 %	308181431
47239	NC_014554	TCTG	2	8	2407310	2407317	0 %	50 %	25 %	25 %	308181431
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47245	NC_014554	GTC	3	9	2407685	2407693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181432
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47304	NC_014554	TA	3	6	2410620	2410625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47305	NC_014554	AACT	2	8	2410626	2410633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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47339	NC_014554	T	6	6	2412191	2412196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47340	NC_014554	AATTA	2	10	2412208	2412217	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47341	NC_014554	TGA	2	6	2412274	2412279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181440
47342	NC_014554	CTA	2	6	2412315	2412320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181440
47343	NC_014554	ACCA	2	8	2412321	2412328	50 %	0 %	0 %	50 %	308181440
47344	NC_014554	CTA	2	6	2412339	2412344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181440
47345	NC_014554	CAA	2	6	2412396	2412401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181440
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47347	NC_014554	CCA	2	6	2412526	2412531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181440
47348	NC_014554	ACA	2	6	2412608	2412613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47349	NC_014554	AGG	2	6	2412741	2412746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47350	NC_014554	T	7	7	2412790	2412796	0 %	100 %	0 %	0 %	308181441
47351	NC_014554	CCG	2	6	2412820	2412825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181441
47352	NC_014554	TCA	2	6	2412826	2412831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181441
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