MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_014554	A	6	6	2341805	2341810	100 %	0 %	0 %	0 %	308181380
46002	NC_014554	CGA	2	6	2341822	2341827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181380
46003	NC_014554	AGT	2	6	2341837	2341842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181380
46004	NC_014554	AAC	2	6	2341883	2341888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181380
46005	NC_014554	ATTA	2	8	2341947	2341954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46006	NC_014554	CAT	2	6	2342004	2342009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46007	NC_014554	A	6	6	2342025	2342030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46008	NC_014554	TAA	2	6	2342097	2342102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181381
46009	NC_014554	GC	3	6	2342116	2342121	0 %	0 %	50 %	50 %	308181381
46010	NC_014554	TAA	2	6	2342165	2342170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181381
46011	NC_014554	CCA	2	6	2342195	2342200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181381
46012	NC_014554	TGT	2	6	2342249	2342254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181381
46013	NC_014554	ATC	2	6	2342280	2342285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181381
46014	NC_014554	GCC	2	6	2342287	2342292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181381
46015	NC_014554	ATC	2	6	2342295	2342300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181381
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46017	NC_014554	ATA	3	9	2342359	2342367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181381
46018	NC_014554	TCGT	2	8	2342457	2342464	0 %	50 %	25 %	25 %	308181381
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46020	NC_014554	CGG	2	6	2342533	2342538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181381
46021	NC_014554	ATC	2	6	2342614	2342619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181381
46022	NC_014554	ATC	2	6	2342626	2342631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181381
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46031	NC_014554	AAT	2	6	2343114	2343119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181381
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46033	NC_014554	GTT	2	6	2343166	2343171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181381
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46037	NC_014554	CGC	2	6	2343313	2343318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46038	NC_014554	TACC	2	8	2343330	2343337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46039	NC_014554	AGT	2	6	2343360	2343365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46041	NC_014554	TTA	2	6	2343672	2343677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181382
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46046	NC_014554	AAG	2	6	2344030	2344035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46047	NC_014554	TGA	2	6	2344127	2344132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181383
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46052	NC_014554	TTA	2	6	2344457	2344462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181383
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46067	NC_014554	ATTTA	2	10	2345145	2345154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46068	NC_014554	AAC	2	6	2345185	2345190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46109	NC_014554	ATT	2	6	2347306	2347311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181385
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46120	NC_014554	AAC	2	6	2347770	2347775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181386
46121	NC_014554	AGC	2	6	2347863	2347868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181386
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46124	NC_014554	TTG	2	6	2347926	2347931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181386
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46148	NC_014554	TTG	2	6	2348989	2348994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46149	NC_014554	TAT	2	6	2348997	2349002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46150	NC_014554	ATG	2	6	2349034	2349039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181387
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46153	NC_014554	A	7	7	2349168	2349174	100 %	0 %	0 %	0 %	308181387
46154	NC_014554	AC	3	6	2349205	2349210	50 %	0 %	0 %	50 %	308181387
46155	NC_014554	TGC	2	6	2349246	2349251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181387
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46195	NC_014554	AAT	2	6	2351043	2351048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46196	NC_014554	GTG	2	6	2351056	2351061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46222	NC_014554	TC	3	6	2352232	2352237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46223	NC_014554	TAA	2	6	2352290	2352295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46224	NC_014554	ATA	2	6	2352302	2352307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46225	NC_014554	GCT	2	6	2352443	2352448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181391
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46228	NC_014554	CAC	2	6	2352601	2352606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181391
46229	NC_014554	GCC	2	6	2352631	2352636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181391
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46231	NC_014554	A	6	6	2352745	2352750	100 %	0 %	0 %	0 %	308181391
46232	NC_014554	ACG	2	6	2352815	2352820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181391
46233	NC_014554	TTG	2	6	2352843	2352848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181391
46234	NC_014554	CAAC	2	8	2352870	2352877	50 %	0 %	0 %	50 %	308181391
46235	NC_014554	TTCAG	2	10	2352885	2352894	20 %	40 %	20 %	20 %	308181391
46236	NC_014554	TCA	2	6	2352904	2352909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181391
46237	NC_014554	TCA	2	6	2352967	2352972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181391
46238	NC_014554	CGG	2	6	2353083	2353088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181391
46239	NC_014554	GCT	2	6	2353205	2353210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181391
46240	NC_014554	TTG	2	6	2353405	2353410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181392
46241	NC_014554	ACCG	2	8	2353459	2353466	25 %	0 %	25 %	50 %	308181392
46242	NC_014554	GT	3	6	2353475	2353480	0 %	50 %	50 %	0 %	308181392
46243	NC_014554	CAT	2	6	2353506	2353511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181392
46244	NC_014554	CAT	2	6	2353566	2353571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181392
46245	NC_014554	T	6	6	2353619	2353624	0 %	100 %	0 %	0 %	308181392
46246	NC_014554	ATA	2	6	2353639	2353644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181392
46247	NC_014554	GTA	2	6	2353654	2353659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181392
46248	NC_014554	TAA	2	6	2353710	2353715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181392
46249	NC_014554	TCATA	2	10	2353791	2353800	40 %	40 %	0 %	20 %	308181392
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46252	NC_014554	AACT	2	8	2353978	2353985	50 %	25 %	0 %	25 %	308181392
46253	NC_014554	A	6	6	2354092	2354097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46254	NC_014554	AGT	2	6	2354163	2354168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46255	NC_014554	AT	3	6	2354185	2354190	50 %	50 %	0 %	0 %	308181393
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46263	NC_014554	ATG	2	6	2354418	2354423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181393
46264	NC_014554	ACC	2	6	2354445	2354450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181393
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46267	NC_014554	CTGA	2	8	2354504	2354511	25 %	25 %	25 %	25 %	308181393
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46272	NC_014554	CAA	2	6	2354764	2354769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46274	NC_014554	A	7	7	2354860	2354866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46275	NC_014554	ATT	2	6	2354930	2354935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181394
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46306	NC_014554	CGT	2	6	2357041	2357046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
46307	NC_014554	GTT	2	6	2357073	2357078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181395
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46311	NC_014554	CGT	4	12	2357281	2357292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
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46317	NC_014554	GC	3	6	2357735	2357740	0 %	0 %	50 %	50 %	308181395
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46319	NC_014554	AATCCC	2	12	2357821	2357832	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	308181395
46320	NC_014554	GC	3	6	2357850	2357855	0 %	0 %	50 %	50 %	308181395
46321	NC_014554	TATCCA	2	12	2357886	2357897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46322	NC_014554	ACGA	2	8	2358025	2358032	50 %	0 %	25 %	25 %	308181395
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46324	NC_014554	GTTC	2	8	2358152	2358159	0 %	50 %	25 %	25 %	308181395
46325	NC_014554	CGT	2	6	2358194	2358199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
46326	NC_014554	TCAG	2	8	2358215	2358222	25 %	25 %	25 %	25 %	308181395
46327	NC_014554	AAG	2	6	2358230	2358235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181395
46328	NC_014554	ATG	2	6	2358292	2358297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181395
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46330	NC_014554	ATA	2	6	2358434	2358439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
46331	NC_014554	AGT	2	6	2358443	2358448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181395
46332	NC_014554	CAT	2	6	2358451	2358456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46333	NC_014554	AAT	2	6	2358480	2358485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
46334	NC_014554	CAT	2	6	2358492	2358497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46335	NC_014554	AAT	2	6	2358535	2358540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
46336	NC_014554	ATC	2	6	2358694	2358699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46337	NC_014554	TCT	2	6	2358731	2358736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181395
46338	NC_014554	TCG	2	6	2358774	2358779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
46339	NC_014554	TCA	2	6	2358833	2358838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46340	NC_014554	ACCG	2	8	2358911	2358918	25 %	0 %	25 %	50 %	308181395
46341	NC_014554	ATA	2	6	2358990	2358995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
46342	NC_014554	CCA	2	6	2359041	2359046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181395
46343	NC_014554	CTGG	2	8	2359059	2359066	0 %	25 %	50 %	25 %	308181395
46344	NC_014554	CG	3	6	2359068	2359073	0 %	0 %	50 %	50 %	308181395
46345	NC_014554	TCA	2	6	2359121	2359126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181395
46346	NC_014554	CTT	2	6	2359134	2359139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181395
46347	NC_014554	CGC	2	6	2359244	2359249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181395
46348	NC_014554	ATA	2	6	2359328	2359333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
46349	NC_014554	TGC	2	6	2359343	2359348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
46350	NC_014554	CAA	2	6	2359404	2359409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181395
46351	NC_014554	TCT	2	6	2359437	2359442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181395
46352	NC_014554	T	7	7	2359461	2359467	0 %	100 %	0 %	0 %	308181395
46353	NC_014554	CGT	2	6	2359543	2359548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181395
46354	NC_014554	T	6	6	2359554	2359559	0 %	100 %	0 %	0 %	308181395
46355	NC_014554	TAA	2	6	2359672	2359677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181395
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46453	NC_014554	CTG	2	6	2365685	2365690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181398
46454	NC_014554	GCC	2	6	2365705	2365710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181398
46455	NC_014554	AC	3	6	2365715	2365720	50 %	0 %	0 %	50 %	308181398
46456	NC_014554	ATC	2	6	2365740	2365745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181398
46457	NC_014554	TGA	2	6	2365928	2365933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181398
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46460	NC_014554	CAA	2	6	2366073	2366078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181398
46461	NC_014554	TGC	2	6	2366094	2366099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181398
46462	NC_014554	ATA	2	6	2366132	2366137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181399
46463	NC_014554	GCC	2	6	2366178	2366183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181399
46464	NC_014554	AGC	2	6	2366212	2366217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181399
46465	NC_014554	TCA	2	6	2366229	2366234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181399
46466	NC_014554	CTT	2	6	2366328	2366333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181399
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46470	NC_014554	CGT	2	6	2366569	2366574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181399
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46491	NC_014554	C	6	6	2367619	2367624	0 %	0 %	0 %	100 %	308181400
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46495	NC_014554	CAT	2	6	2367902	2367907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181401
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46499	NC_014554	CAA	2	6	2368260	2368265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181401
46500	NC_014554	TGAAAA	2	12	2368287	2368298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308181401

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