MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_014554	CTTTGT	2	12	2265008	2265019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44502	NC_014554	AC	3	6	2265035	2265040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44503	NC_014554	CCA	2	6	2265072	2265077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44504	NC_014554	CAAC	2	8	2265119	2265126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44505	NC_014554	TAC	2	6	2265132	2265137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44506	NC_014554	A	6	6	2265183	2265188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44507	NC_014554	A	6	6	2265245	2265250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44508	NC_014554	CAA	2	6	2265309	2265314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44509	NC_014554	ATC	2	6	2265361	2265366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181305
44510	NC_014554	GCCCT	2	10	2265528	2265537	0 %	20 %	20 %	60 %	308181305
44511	NC_014554	CGC	2	6	2265540	2265545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181305
44512	NC_014554	ATC	2	6	2265627	2265632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181305
44513	NC_014554	TGT	2	6	2265694	2265699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181305
44514	NC_014554	CCG	2	6	2265717	2265722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181305
44515	NC_014554	TGA	2	6	2265747	2265752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181305
44516	NC_014554	TTC	2	6	2265797	2265802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181305
44517	NC_014554	CGAAA	2	10	2265851	2265860	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44518	NC_014554	ATGTT	2	10	2265900	2265909	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44519	NC_014554	TGA	2	6	2265919	2265924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44520	NC_014554	T	7	7	2266015	2266021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44521	NC_014554	CTA	2	6	2266024	2266029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44522	NC_014554	TCT	2	6	2266031	2266036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44523	NC_014554	ACG	2	6	2266135	2266140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181306
44524	NC_014554	GTCA	2	8	2266306	2266313	25 %	25 %	25 %	25 %	308181306
44525	NC_014554	ATT	2	6	2266375	2266380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181306
44526	NC_014554	TTC	2	6	2266400	2266405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181306
44527	NC_014554	AC	3	6	2266421	2266426	50 %	0 %	0 %	50 %	308181306
44528	NC_014554	AC	3	6	2266440	2266445	50 %	0 %	0 %	50 %	308181306
44529	NC_014554	ACT	2	6	2266521	2266526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181306
44530	NC_014554	ATG	2	6	2266589	2266594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181306
44531	NC_014554	ATC	2	6	2266616	2266621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181306
44532	NC_014554	CAA	2	6	2266756	2266761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181306
44533	NC_014554	TAAA	2	8	2266808	2266815	75 %	25 %	0 %	0 %	308181306
44534	NC_014554	CAACT	2	10	2266827	2266836	40 %	20 %	0 %	40 %	308181306
44535	NC_014554	CCA	2	6	2266857	2266862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181306
44536	NC_014554	ATA	2	6	2266958	2266963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181306
44537	NC_014554	ATT	2	6	2267003	2267008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181306
44538	NC_014554	CCG	2	6	2267012	2267017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181306
44539	NC_014554	TTCAG	2	10	2267166	2267175	20 %	40 %	20 %	20 %	308181306
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44541	NC_014554	ACG	2	6	2267260	2267265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181306
44542	NC_014554	TTA	2	6	2267374	2267379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181306
44543	NC_014554	GAT	2	6	2267388	2267393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181306
44544	NC_014554	GACC	2	8	2267640	2267647	25 %	0 %	25 %	50 %	308181306
44545	NC_014554	TCT	2	6	2267648	2267653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181306
44546	NC_014554	ACA	2	6	2267658	2267663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181306
44547	NC_014554	TGA	4	12	2267760	2267771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181306
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44549	NC_014554	AGA	2	6	2267801	2267806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181306
44550	NC_014554	CT	3	6	2267827	2267832	0 %	50 %	0 %	50 %	308181306
44551	NC_014554	AATTAC	2	12	2267902	2267913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308181306
44552	NC_014554	AAAT	2	8	2267946	2267953	75 %	25 %	0 %	0 %	308181306
44553	NC_014554	GAA	2	6	2267982	2267987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181306
44554	NC_014554	TAA	2	6	2267991	2267996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181306
44555	NC_014554	CGAC	2	8	2268017	2268024	25 %	0 %	25 %	50 %	308181306
44556	NC_014554	AAG	2	6	2268043	2268048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181306
44557	NC_014554	TGA	2	6	2268081	2268086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181306
44558	NC_014554	CAA	2	6	2268127	2268132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44559	NC_014554	ATTT	2	8	2268165	2268172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44560	NC_014554	CATC	2	8	2268218	2268225	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44561	NC_014554	GAT	2	6	2268283	2268288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44562	NC_014554	TCA	2	6	2268321	2268326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44563	NC_014554	CG	3	6	2268333	2268338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44564	NC_014554	ATT	2	6	2268412	2268417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44565	NC_014554	TAAC	2	8	2268428	2268435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44566	NC_014554	TAA	2	6	2268458	2268463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44567	NC_014554	GAG	2	6	2268493	2268498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44568	NC_014554	CAC	2	6	2268500	2268505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44569	NC_014554	TGG	2	6	2268526	2268531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181307
44570	NC_014554	CCG	2	6	2268540	2268545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181307
44571	NC_014554	T	7	7	2268621	2268627	0 %	100 %	0 %	0 %	308181307
44572	NC_014554	GTA	2	6	2268692	2268697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181307
44573	NC_014554	TTA	2	6	2268698	2268703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
44574	NC_014554	ACCA	2	8	2268707	2268714	50 %	0 %	0 %	50 %	308181307
44575	NC_014554	TGG	2	6	2268731	2268736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181307
44576	NC_014554	TTA	2	6	2268742	2268747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
44577	NC_014554	ATT	3	9	2268751	2268759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
44578	NC_014554	TAT	2	6	2268795	2268800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
44579	NC_014554	CG	3	6	2268832	2268837	0 %	0 %	50 %	50 %	308181307
44580	NC_014554	ACA	2	6	2268943	2268948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181307
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44582	NC_014554	GCTG	2	8	2269041	2269048	0 %	25 %	50 %	25 %	308181307
44583	NC_014554	CAA	2	6	2269135	2269140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181307
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44586	NC_014554	ATT	3	9	2269318	2269326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
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44588	NC_014554	ATT	2	6	2269357	2269362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181307
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44591	NC_014554	CAC	2	6	2269421	2269426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181307
44592	NC_014554	TAACGG	2	12	2269563	2269574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308181307
44593	NC_014554	CATG	2	8	2269674	2269681	25 %	25 %	25 %	25 %	308181307
44594	NC_014554	AAC	2	6	2269739	2269744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181307
44595	NC_014554	A	6	6	2269748	2269753	100 %	0 %	0 %	0 %	308181307
44596	NC_014554	CAT	2	6	2269825	2269830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181307
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44598	NC_014554	ATCG	2	8	2269894	2269901	25 %	25 %	25 %	25 %	308181307
44599	NC_014554	TCA	2	6	2269923	2269928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181307
44600	NC_014554	GTTA	2	8	2269996	2270003	25 %	50 %	25 %	0 %	308181307
44601	NC_014554	CAC	2	6	2270064	2270069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181307
44602	NC_014554	ATA	2	6	2270135	2270140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181307
44603	NC_014554	ATG	2	6	2270158	2270163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181307
44604	NC_014554	GCA	2	6	2270208	2270213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181307
44605	NC_014554	ATGA	2	8	2270269	2270276	50 %	25 %	25 %	0 %	308181307
44606	NC_014554	ATT	2	6	2270307	2270312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44607	NC_014554	ATG	2	6	2270369	2270374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44608	NC_014554	TGA	2	6	2270401	2270406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44609	NC_014554	TAG	2	6	2270447	2270452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44610	NC_014554	A	6	6	2270478	2270483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44611	NC_014554	TGA	2	6	2270643	2270648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44612	NC_014554	CAACA	2	10	2270750	2270759	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44613	NC_014554	TAA	2	6	2270852	2270857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44614	NC_014554	ACC	2	6	2270861	2270866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44615	NC_014554	A	8	8	2270874	2270881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44616	NC_014554	T	6	6	2270909	2270914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44617	NC_014554	ATC	2	6	2270990	2270995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44618	NC_014554	AC	3	6	2271003	2271008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44619	NC_014554	AAT	2	6	2271013	2271018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44620	NC_014554	ATC	2	6	2271041	2271046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44621	NC_014554	AAC	2	6	2271064	2271069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44622	NC_014554	AAC	2	6	2271095	2271100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44623	NC_014554	T	7	7	2271143	2271149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44624	NC_014554	GTT	2	6	2271191	2271196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44625	NC_014554	T	7	7	2271195	2271201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44626	NC_014554	AC	3	6	2271210	2271215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44627	NC_014554	A	8	8	2271232	2271239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44628	NC_014554	ACA	2	6	2271266	2271271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44629	NC_014554	GCC	2	6	2271273	2271278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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44632	NC_014554	TCA	2	6	2271445	2271450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181308
44633	NC_014554	TGA	2	6	2271580	2271585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181308
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44646	NC_014554	CT	3	6	2272392	2272397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44647	NC_014554	CGA	2	6	2272508	2272513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44648	NC_014554	ATT	2	6	2272520	2272525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44649	NC_014554	ATT	2	6	2272538	2272543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44650	NC_014554	TCG	2	6	2272641	2272646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44651	NC_014554	CG	4	8	2272657	2272664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44652	NC_014554	TGA	2	6	2272710	2272715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181309
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44669	NC_014554	GTTA	2	8	2273450	2273457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44670	NC_014554	GGT	2	6	2273499	2273504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44671	NC_014554	A	6	6	2273545	2273550	100 %	0 %	0 %	0 %	308181310
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44695	NC_014554	TGC	2	6	2275297	2275302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44722	NC_014554	TCA	2	6	2276788	2276793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181312
44723	NC_014554	CCTT	2	8	2276800	2276807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44724	NC_014554	TTAAT	2	10	2276889	2276898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44725	NC_014554	CGC	2	6	2276900	2276905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44726	NC_014554	GGA	2	6	2276977	2276982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44727	NC_014554	TTAGAC	2	12	2277012	2277023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	308181313
44728	NC_014554	GAC	2	6	2277033	2277038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181313
44729	NC_014554	GGC	2	6	2277125	2277130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181313
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44733	NC_014554	CTT	2	6	2277323	2277328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181313
44734	NC_014554	GTG	2	6	2277457	2277462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181313
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44736	NC_014554	GTCA	2	8	2277483	2277490	25 %	25 %	25 %	25 %	308181313
44737	NC_014554	ATT	2	6	2277593	2277598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181313
44738	NC_014554	ACA	2	6	2277614	2277619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181313
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44740	NC_014554	CAC	2	6	2277770	2277775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181313
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44742	NC_014554	GAC	2	6	2277923	2277928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181313
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