MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_014554	CTG	2	6	2211124	2211129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43502	NC_014554	TTG	2	6	2211194	2211199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43503	NC_014554	A	6	6	2211299	2211304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43504	NC_014554	TAA	2	6	2211305	2211310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43505	NC_014554	TAA	2	6	2211333	2211338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181250
43506	NC_014554	TCC	2	6	2211353	2211358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181250
43507	NC_014554	ATG	2	6	2211488	2211493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181250
43508	NC_014554	ATT	2	6	2211573	2211578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181250
43509	NC_014554	TAA	2	6	2211595	2211600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_014554	T	7	7	2211655	2211661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43511	NC_014554	T	7	7	2211721	2211727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43512	NC_014554	ATA	2	6	2211732	2211737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43513	NC_014554	AAT	2	6	2211773	2211778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43514	NC_014554	ATA	2	6	2211831	2211836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43515	NC_014554	ATG	2	6	2211946	2211951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181251
43516	NC_014554	GCT	2	6	2211976	2211981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181251
43517	NC_014554	CCA	2	6	2212028	2212033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181251
43518	NC_014554	AAT	2	6	2212173	2212178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181251
43519	NC_014554	AAT	2	6	2212185	2212190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181251
43520	NC_014554	CAAGC	2	10	2212233	2212242	40 %	0 %	20 %	40 %	308181251
43521	NC_014554	GCC	2	6	2212328	2212333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181251
43522	NC_014554	CAA	2	6	2212334	2212339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181251
43523	NC_014554	GGC	2	6	2212386	2212391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181251
43524	NC_014554	T	6	6	2212414	2212419	0 %	100 %	0 %	0 %	308181251
43525	NC_014554	T	7	7	2212518	2212524	0 %	100 %	0 %	0 %	308181252
43526	NC_014554	AAT	2	6	2212539	2212544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181252
43527	NC_014554	ACTT	2	8	2212569	2212576	25 %	50 %	0 %	25 %	308181252
43528	NC_014554	AGC	2	6	2212602	2212607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181252
43529	NC_014554	TGA	2	6	2212624	2212629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181252
43530	NC_014554	ATA	2	6	2212638	2212643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181252
43531	NC_014554	CAC	2	6	2212685	2212690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181252
43532	NC_014554	CGA	2	6	2212705	2212710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181252
43533	NC_014554	CAACA	2	10	2212731	2212740	60 %	0 %	0 %	40 %	308181252
43534	NC_014554	T	7	7	2212832	2212838	0 %	100 %	0 %	0 %	308181252
43535	NC_014554	CTC	2	6	2212842	2212847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43536	NC_014554	TCA	2	6	2212906	2212911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43537	NC_014554	A	6	6	2212933	2212938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43538	NC_014554	TAT	2	6	2212939	2212944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43539	NC_014554	AATTCA	2	12	2212956	2212967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43540	NC_014554	TCCAT	2	10	2212990	2212999	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43541	NC_014554	ATTTA	2	10	2213020	2213029	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_014554	ATC	2	6	2213049	2213054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181253
43543	NC_014554	CAC	2	6	2213312	2213317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181253
43544	NC_014554	ATC	2	6	2213326	2213331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181253
43545	NC_014554	ATT	2	6	2213337	2213342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181253
43546	NC_014554	GAC	2	6	2213367	2213372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181253
43547	NC_014554	GAC	2	6	2213412	2213417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181253
43548	NC_014554	ATA	2	6	2213439	2213444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181253
43549	NC_014554	TCA	2	6	2213465	2213470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181253
43550	NC_014554	TCG	2	6	2213598	2213603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181253
43551	NC_014554	CCT	2	6	2213666	2213671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181253
43552	NC_014554	CCAA	2	8	2213745	2213752	50 %	0 %	0 %	50 %	308181253
43553	NC_014554	TG	3	6	2213753	2213758	0 %	50 %	50 %	0 %	308181253
43554	NC_014554	TGC	2	6	2213784	2213789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181253
43555	NC_014554	CCAA	2	8	2213793	2213800	50 %	0 %	0 %	50 %	308181253
43556	NC_014554	GCA	2	6	2213875	2213880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181253
43557	NC_014554	C	6	6	2213893	2213898	0 %	0 %	0 %	100 %	308181253
43558	NC_014554	CAA	2	6	2213913	2213918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181253
43559	NC_014554	ATC	2	6	2214055	2214060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181253
43560	NC_014554	GTG	2	6	2214070	2214075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181253
43561	NC_014554	ACTG	2	8	2214081	2214088	25 %	25 %	25 %	25 %	308181253
43562	NC_014554	CTTT	2	8	2214118	2214125	0 %	75 %	0 %	25 %	308181253
43563	NC_014554	ATA	2	6	2214197	2214202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181253
43564	NC_014554	T	6	6	2214282	2214287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43565	NC_014554	ACT	2	6	2214338	2214343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181254
43566	NC_014554	AGA	2	6	2214372	2214377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181254
43567	NC_014554	TAAA	2	8	2214404	2214411	75 %	25 %	0 %	0 %	308181254
43568	NC_014554	GCC	2	6	2214461	2214466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181254
43569	NC_014554	GC	3	6	2214486	2214491	0 %	0 %	50 %	50 %	308181254
43570	NC_014554	TAA	2	6	2214522	2214527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181254
43571	NC_014554	CGG	2	6	2214596	2214601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181254
43572	NC_014554	AAC	2	6	2214604	2214609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181254
43573	NC_014554	ATC	2	6	2214690	2214695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181254
43574	NC_014554	CG	3	6	2214734	2214739	0 %	0 %	50 %	50 %	308181254
43575	NC_014554	CGT	2	6	2214939	2214944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181254
43576	NC_014554	CAG	2	6	2214999	2215004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181254
43577	NC_014554	TCC	2	6	2215091	2215096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43578	NC_014554	GTT	2	6	2215129	2215134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43579	NC_014554	T	6	6	2215137	2215142	0 %	100 %	0 %	0 %	308181255
43580	NC_014554	AAT	2	6	2215195	2215200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181255
43581	NC_014554	T	7	7	2215204	2215210	0 %	100 %	0 %	0 %	308181255
43582	NC_014554	AAT	2	6	2215343	2215348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43583	NC_014554	AATT	2	8	2215387	2215394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43584	NC_014554	CTTT	2	8	2215493	2215500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43585	NC_014554	AATTTA	2	12	2215506	2215517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43586	NC_014554	TAA	2	6	2215522	2215527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43587	NC_014554	GTT	2	6	2215639	2215644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43588	NC_014554	ACC	2	6	2215670	2215675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43589	NC_014554	TATTC	2	10	2215692	2215701	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43590	NC_014554	ATC	2	6	2215742	2215747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43591	NC_014554	CTGAC	2	10	2215760	2215769	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43592	NC_014554	TTTGAT	2	12	2215788	2215799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43593	NC_014554	TGAC	2	8	2215815	2215822	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43594	NC_014554	ATC	2	6	2215866	2215871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181256
43595	NC_014554	TGC	2	6	2215931	2215936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181256
43596	NC_014554	AATA	2	8	2215988	2215995	75 %	25 %	0 %	0 %	308181256
43597	NC_014554	AAT	2	6	2216114	2216119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181256
43598	NC_014554	CAT	2	6	2216181	2216186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181256
43599	NC_014554	ACC	2	6	2216195	2216200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181256
43600	NC_014554	GTC	2	6	2216249	2216254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181256
43601	NC_014554	TCA	2	6	2216265	2216270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181256
43602	NC_014554	CGA	2	6	2216307	2216312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181256
43603	NC_014554	TAT	2	6	2216313	2216318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181256
43604	NC_014554	TGT	2	6	2216336	2216341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181256
43605	NC_014554	AGCC	2	8	2216362	2216369	25 %	0 %	25 %	50 %	308181256
43606	NC_014554	CCA	2	6	2216490	2216495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181256
43607	NC_014554	TGAGCA	2	12	2216504	2216515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308181256
43608	NC_014554	T	7	7	2216616	2216622	0 %	100 %	0 %	0 %	308181256
43609	NC_014554	GCC	2	6	2216630	2216635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181256
43610	NC_014554	CGTTG	2	10	2216636	2216645	0 %	40 %	40 %	20 %	308181256
43611	NC_014554	TTG	2	6	2216647	2216652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181256
43612	NC_014554	TAA	2	6	2216692	2216697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181256
43613	NC_014554	CCA	2	6	2216703	2216708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181256
43614	NC_014554	CCA	2	6	2216710	2216715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181256
43615	NC_014554	TTAA	2	8	2216767	2216774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43616	NC_014554	TGCT	2	8	2216841	2216848	0 %	50 %	25 %	25 %	308181257
43617	NC_014554	AGCC	2	8	2216894	2216901	25 %	0 %	25 %	50 %	308181257
43618	NC_014554	GTG	2	6	2216923	2216928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181257
43619	NC_014554	CTTG	2	8	2217006	2217013	0 %	50 %	25 %	25 %	308181257
43620	NC_014554	CG	3	6	2217030	2217035	0 %	0 %	50 %	50 %	308181257
43621	NC_014554	TTC	2	6	2217136	2217141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181257
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43625	NC_014554	CTA	2	6	2217266	2217271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181257
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43635	NC_014554	C	6	6	2217784	2217789	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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43735	NC_014554	AAACG	2	10	2223512	2223521	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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43738	NC_014554	GCTG	2	8	2223920	2223927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43739	NC_014554	TGA	2	6	2223978	2223983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181264
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43854	NC_014554	T	6	6	2230165	2230170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43855	NC_014554	CTGT	2	8	2230180	2230187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43856	NC_014554	ATC	2	6	2230198	2230203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43857	NC_014554	GTC	2	6	2230259	2230264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181269
43858	NC_014554	CTG	2	6	2230362	2230367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181269
43859	NC_014554	TCGC	2	8	2230385	2230392	0 %	25 %	25 %	50 %	308181269
43860	NC_014554	TGA	2	6	2230425	2230430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181269
43861	NC_014554	TCA	2	6	2230458	2230463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181269
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43863	NC_014554	TAA	2	6	2230557	2230562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181269
43864	NC_014554	ACT	2	6	2230597	2230602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181269
43865	NC_014554	CGT	3	9	2230660	2230668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181269
43866	NC_014554	GCC	2	6	2230670	2230675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181269
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43870	NC_014554	ACT	2	6	2230858	2230863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181269
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43875	NC_014554	CTC	2	6	2231138	2231143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43876	NC_014554	GTCA	2	8	2231149	2231156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43877	NC_014554	A	7	7	2231235	2231241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43878	NC_014554	CGCA	2	8	2231377	2231384	25 %	0 %	25 %	50 %	308181270
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43883	NC_014554	GCCA	2	8	2231826	2231833	25 %	0 %	25 %	50 %	308181270
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43885	NC_014554	AAAGC	2	10	2231918	2231927	60 %	0 %	20 %	20 %	308181270
43886	NC_014554	ATC	2	6	2231936	2231941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181270
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43938	NC_014554	TGT	2	6	2234691	2234696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181272
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43942	NC_014554	A	8	8	2234807	2234814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43943	NC_014554	CCAT	2	8	2234819	2234826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43944	NC_014554	ACC	2	6	2234872	2234877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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43948	NC_014554	CAT	2	6	2234984	2234989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43949	NC_014554	TC	3	6	2235026	2235031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43950	NC_014554	CT	3	6	2235044	2235049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43951	NC_014554	CTCTT	2	10	2235070	2235079	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43952	NC_014554	TTTAA	2	10	2235097	2235106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43953	NC_014554	T	6	6	2235152	2235157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43954	NC_014554	AGC	2	6	2235212	2235217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43956	NC_014554	TCG	2	6	2235375	2235380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43957	NC_014554	TCAA	2	8	2235406	2235413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43958	NC_014554	GTA	2	6	2235463	2235468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181273
43959	NC_014554	TC	3	6	2235477	2235482	0 %	50 %	0 %	50 %	308181273
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43962	NC_014554	TGCT	2	8	2235624	2235631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43963	NC_014554	CCCCG	2	10	2235772	2235781	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43964	NC_014554	GAAC	2	8	2235794	2235801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43965	NC_014554	CGA	2	6	2235808	2235813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43968	NC_014554	GCCG	2	8	2235978	2235985	0 %	0 %	50 %	50 %	308181274
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43971	NC_014554	T	6	6	2236136	2236141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43972	NC_014554	T	6	6	2236173	2236178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43973	NC_014554	CATT	2	8	2236207	2236214	25 %	50 %	0 %	25 %	308181275
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43975	NC_014554	GAC	2	6	2236277	2236282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181275
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