MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_014554	TGATTT	2	12	2162473	2162484	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	308181196
42502	NC_014554	ACC	2	6	2162565	2162570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181197
42503	NC_014554	TTC	2	6	2162616	2162621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181197
42504	NC_014554	ATA	2	6	2162754	2162759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181197
42505	NC_014554	CG	3	6	2162888	2162893	0 %	0 %	50 %	50 %	308181197
42506	NC_014554	TCA	2	6	2162998	2163003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181197
42507	NC_014554	GTA	2	6	2163010	2163015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181197
42508	NC_014554	CGA	2	6	2163022	2163027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42509	NC_014554	CCGT	2	8	2163155	2163162	0 %	25 %	25 %	50 %	308181197
42510	NC_014554	GAT	2	6	2163192	2163197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181197
42511	NC_014554	TTCA	2	8	2163252	2163259	25 %	50 %	0 %	25 %	308181197
42512	NC_014554	CATT	2	8	2163355	2163362	25 %	50 %	0 %	25 %	308181197
42513	NC_014554	AGT	2	6	2163383	2163388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181197
42514	NC_014554	AATC	2	8	2163402	2163409	50 %	25 %	0 %	25 %	308181197
42515	NC_014554	GCT	2	6	2163423	2163428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42516	NC_014554	TCACGC	2	12	2163463	2163474	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	308181197
42517	NC_014554	CTG	2	6	2163486	2163491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42518	NC_014554	GTCG	2	8	2163512	2163519	0 %	25 %	50 %	25 %	308181197
42519	NC_014554	AGT	2	6	2163554	2163559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181197
42520	NC_014554	GAA	2	6	2163734	2163739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181197
42521	NC_014554	CTT	2	6	2163794	2163799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181197
42522	NC_014554	TCTCAA	2	12	2163830	2163841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181197
42523	NC_014554	GATA	2	8	2163925	2163932	50 %	25 %	25 %	0 %	308181197
42524	NC_014554	CTT	2	6	2163945	2163950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181197
42525	NC_014554	GACT	2	8	2164007	2164014	25 %	25 %	25 %	25 %	308181197
42526	NC_014554	TGC	2	6	2164030	2164035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42527	NC_014554	CGT	2	6	2164047	2164052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42528	NC_014554	TA	3	6	2164076	2164081	50 %	50 %	0 %	0 %	308181197
42529	NC_014554	GCA	2	6	2164156	2164161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181197
42530	NC_014554	TAACT	2	10	2164204	2164213	40 %	40 %	0 %	20 %	308181197
42531	NC_014554	TCCA	2	8	2164293	2164300	25 %	25 %	0 %	50 %	308181198
42532	NC_014554	CAC	3	9	2164391	2164399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181199
42533	NC_014554	TAA	2	6	2164445	2164450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181199
42534	NC_014554	CA	3	6	2164456	2164461	50 %	0 %	0 %	50 %	308181199
42535	NC_014554	TCAA	2	8	2164485	2164492	50 %	25 %	0 %	25 %	308181199
42536	NC_014554	CCA	2	6	2164506	2164511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181199
42537	NC_014554	CAG	2	6	2164570	2164575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181199
42538	NC_014554	ATC	2	6	2164671	2164676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181200
42539	NC_014554	CCT	2	6	2164685	2164690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181200
42540	NC_014554	CGC	2	6	2164709	2164714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181200
42541	NC_014554	CTG	2	6	2164725	2164730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181200
42542	NC_014554	TTTTCC	2	12	2164744	2164755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181200
42543	NC_014554	ACC	2	6	2164802	2164807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181200
42544	NC_014554	ACTG	2	8	2164921	2164928	25 %	25 %	25 %	25 %	308181200
42545	NC_014554	GCT	2	6	2164994	2164999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181200
42546	NC_014554	TCAT	2	8	2165077	2165084	25 %	50 %	0 %	25 %	308181200
42547	NC_014554	TGA	2	6	2165104	2165109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181200
42548	NC_014554	TTA	2	6	2165392	2165397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181200
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42550	NC_014554	TTGC	2	8	2165449	2165456	0 %	50 %	25 %	25 %	308181200
42551	NC_014554	AAT	2	6	2165502	2165507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181200
42552	NC_014554	CTT	2	6	2165562	2165567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181200
42553	NC_014554	GTA	2	6	2165574	2165579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181200
42554	NC_014554	CA	3	6	2165625	2165630	50 %	0 %	0 %	50 %	308181200
42555	NC_014554	CG	3	6	2165633	2165638	0 %	0 %	50 %	50 %	308181200
42556	NC_014554	T	6	6	2165645	2165650	0 %	100 %	0 %	0 %	308181200
42557	NC_014554	AGC	2	6	2165695	2165700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181200
42558	NC_014554	TAT	2	6	2165744	2165749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181200
42559	NC_014554	GCC	2	6	2165914	2165919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181200
42560	NC_014554	TAG	2	6	2165959	2165964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181200
42561	NC_014554	TGT	2	6	2165998	2166003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181200
42562	NC_014554	TGAT	2	8	2166004	2166011	25 %	50 %	25 %	0 %	308181200
42563	NC_014554	GCCA	2	8	2166051	2166058	25 %	0 %	25 %	50 %	308181200
42564	NC_014554	CTT	2	6	2166090	2166095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181200
42565	NC_014554	CCT	2	6	2166121	2166126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42566	NC_014554	CTT	2	6	2166146	2166151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42567	NC_014554	GT	4	8	2166176	2166183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42568	NC_014554	AAG	2	6	2166279	2166284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42569	NC_014554	CTT	2	6	2166295	2166300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42570	NC_014554	A	6	6	2166308	2166313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42571	NC_014554	T	6	6	2166365	2166370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42572	NC_014554	AATC	2	8	2166496	2166503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42573	NC_014554	TTC	2	6	2166524	2166529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42574	NC_014554	ATC	2	6	2166554	2166559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42575	NC_014554	ACA	2	6	2166567	2166572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42576	NC_014554	TAAGT	2	10	2166615	2166624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42577	NC_014554	CTG	2	6	2166625	2166630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42578	NC_014554	AAT	2	6	2166647	2166652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42579	NC_014554	TTA	2	6	2166663	2166668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42580	NC_014554	TAT	2	6	2166787	2166792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42581	NC_014554	ATC	2	6	2166833	2166838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42582	NC_014554	AGT	2	6	2166862	2166867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42583	NC_014554	AAT	2	6	2166896	2166901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42584	NC_014554	GTT	2	6	2167130	2167135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42585	NC_014554	CTTG	2	8	2167145	2167152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42586	NC_014554	CGC	2	6	2167215	2167220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42587	NC_014554	AAG	2	6	2167230	2167235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42588	NC_014554	AGT	2	6	2167287	2167292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42589	NC_014554	GTCC	2	8	2167298	2167305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42590	NC_014554	TA	3	6	2167342	2167347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42591	NC_014554	CAC	2	6	2167370	2167375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181201
42592	NC_014554	TGT	2	6	2167498	2167503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181201
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42599	NC_014554	T	6	6	2167816	2167821	0 %	100 %	0 %	0 %	308181201
42600	NC_014554	TCG	2	6	2167837	2167842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181201
42601	NC_014554	CTG	2	6	2167851	2167856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181201
42602	NC_014554	ACC	2	6	2167886	2167891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42603	NC_014554	CCT	2	6	2167895	2167900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42604	NC_014554	TTA	2	6	2167905	2167910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42605	NC_014554	AAAC	2	8	2167978	2167985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42606	NC_014554	AT	3	6	2167986	2167991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42607	NC_014554	GGT	2	6	2168059	2168064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42608	NC_014554	ATATT	2	10	2168082	2168091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42609	NC_014554	TTTA	2	8	2168186	2168193	25 %	75 %	0 %	0 %	308181202
42610	NC_014554	ACG	2	6	2168231	2168236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181202
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42612	NC_014554	GGC	2	6	2168289	2168294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181202
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42614	NC_014554	TTTA	2	8	2168424	2168431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42615	NC_014554	GGA	2	6	2168432	2168437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42616	NC_014554	ATA	2	6	2168455	2168460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181203
42617	NC_014554	GAA	2	6	2168466	2168471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181203
42618	NC_014554	AAT	2	6	2168570	2168575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181203
42619	NC_014554	GAT	2	6	2168610	2168615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181203
42620	NC_014554	GAT	2	6	2168679	2168684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181203
42621	NC_014554	CT	3	6	2168740	2168745	0 %	50 %	0 %	50 %	308181203
42622	NC_014554	TGA	2	6	2168780	2168785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181203
42623	NC_014554	A	6	6	2168787	2168792	100 %	0 %	0 %	0 %	308181203
42624	NC_014554	ATT	2	6	2168794	2168799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181203
42625	NC_014554	A	7	7	2168801	2168807	100 %	0 %	0 %	0 %	308181203
42626	NC_014554	TTA	2	6	2168823	2168828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181203
42627	NC_014554	TACT	2	8	2168865	2168872	25 %	50 %	0 %	25 %	308181203
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42631	NC_014554	AT	3	6	2169141	2169146	50 %	50 %	0 %	0 %	308181203
42632	NC_014554	ATG	2	6	2169240	2169245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42633	NC_014554	CAT	2	6	2169273	2169278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42634	NC_014554	T	6	6	2169278	2169283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42635	NC_014554	AGT	2	6	2169305	2169310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42636	NC_014554	CTG	2	6	2169335	2169340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42637	NC_014554	ACA	2	6	2169370	2169375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42639	NC_014554	TCC	2	6	2169419	2169424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42640	NC_014554	TAA	2	6	2169455	2169460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42641	NC_014554	AGG	2	6	2169502	2169507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42642	NC_014554	GTG	2	6	2169600	2169605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42643	NC_014554	AATG	2	8	2169652	2169659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42644	NC_014554	TCA	2	6	2169690	2169695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42645	NC_014554	CAT	2	6	2169698	2169703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42646	NC_014554	CTG	2	6	2169744	2169749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181204
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42648	NC_014554	ATT	2	6	2169887	2169892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181204
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42650	NC_014554	AAT	3	9	2169990	2169998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42651	NC_014554	ATA	2	6	2170049	2170054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42652	NC_014554	ACC	2	6	2170062	2170067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42653	NC_014554	TCT	2	6	2170152	2170157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181205
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42663	NC_014554	GGC	2	6	2170706	2170711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42665	NC_014554	CTT	2	6	2170771	2170776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42667	NC_014554	TCC	2	6	2170797	2170802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181206
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42684	NC_014554	CAAA	2	8	2172152	2172159	75 %	0 %	0 %	25 %	308181208
42685	NC_014554	ATC	2	6	2172195	2172200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181208
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42693	NC_014554	TCC	2	6	2172497	2172502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181210
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42703	NC_014554	TCA	3	9	2172935	2172943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181210
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42714	NC_014554	GTC	2	6	2173489	2173494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181211
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42721	NC_014554	TTCT	2	8	2173786	2173793	0 %	75 %	0 %	25 %	308181211
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42728	NC_014554	ATA	2	6	2174251	2174256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42729	NC_014554	ATT	2	6	2174257	2174262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181212
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42732	NC_014554	TCG	2	6	2174497	2174502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181212
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42734	NC_014554	CTT	2	6	2174618	2174623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181212
42735	NC_014554	T	6	6	2174657	2174662	0 %	100 %	0 %	0 %	308181212
42736	NC_014554	ACC	2	6	2174766	2174771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181212
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42738	NC_014554	GTC	2	6	2174804	2174809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181212
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42754	NC_014554	TGC	2	6	2175624	2175629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42757	NC_014554	TTCG	2	8	2175705	2175712	0 %	50 %	25 %	25 %	308181214
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42856	NC_014554	GCGA	2	8	2180086	2180093	25 %	0 %	50 %	25 %	308181223
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42859	NC_014554	ACT	2	6	2180140	2180145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181223
42860	NC_014554	GCT	2	6	2180146	2180151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181223
42861	NC_014554	TAC	2	6	2180185	2180190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181223
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42866	NC_014554	A	7	7	2180424	2180430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42867	NC_014554	CAC	2	6	2180443	2180448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42869	NC_014554	TCAA	2	8	2180638	2180645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42870	NC_014554	T	6	6	2180683	2180688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42871	NC_014554	TAT	2	6	2180724	2180729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42873	NC_014554	CTT	2	6	2180830	2180835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42879	NC_014554	AAAC	2	8	2181058	2181065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42880	NC_014554	CTA	2	6	2181074	2181079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42962	NC_014554	GGA	2	6	2184773	2184778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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