MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_014554	GTT	2	6	2110888	2110893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181145
41502	NC_014554	CGC	2	6	2110926	2110931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181145
41503	NC_014554	CAT	2	6	2110960	2110965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181145
41504	NC_014554	TTG	2	6	2110973	2110978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181145
41505	NC_014554	CAA	2	6	2111065	2111070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181145
41506	NC_014554	TAT	2	6	2111080	2111085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181145
41507	NC_014554	CAA	2	6	2111095	2111100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181145
41508	NC_014554	ACC	2	6	2111102	2111107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181145
41509	NC_014554	CCT	2	6	2111328	2111333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181146
41510	NC_014554	CGT	2	6	2111367	2111372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181146
41511	NC_014554	TCT	2	6	2111399	2111404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181146
41512	NC_014554	TCA	2	6	2111411	2111416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181146
41513	NC_014554	GAA	2	6	2111506	2111511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181146
41514	NC_014554	AAG	2	6	2111522	2111527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181146
41515	NC_014554	CCG	2	6	2111536	2111541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181146
41516	NC_014554	TTC	2	6	2111563	2111568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181146
41517	NC_014554	CATC	2	8	2111580	2111587	25 %	25 %	0 %	50 %	308181146
41518	NC_014554	ATA	2	6	2111600	2111605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181146
41519	NC_014554	TTC	2	6	2111665	2111670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181146
41520	NC_014554	GAA	3	9	2111699	2111707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181146
41521	NC_014554	GTC	2	6	2111765	2111770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181146
41522	NC_014554	ATC	2	6	2111815	2111820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181146
41523	NC_014554	CTT	2	6	2111860	2111865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181146
41524	NC_014554	GGTT	2	8	2111911	2111918	0 %	50 %	50 %	0 %	308181146
41525	NC_014554	AAC	2	6	2112005	2112010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181146
41526	NC_014554	GGT	2	6	2112086	2112091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181146
41527	NC_014554	TTC	2	6	2112122	2112127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181146
41528	NC_014554	AATT	2	8	2112235	2112242	50 %	50 %	0 %	0 %	308181146
41529	NC_014554	CAC	2	6	2112273	2112278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181146
41530	NC_014554	AAC	2	6	2112281	2112286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181146
41531	NC_014554	ACC	2	6	2112295	2112300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181146
41532	NC_014554	TCA	2	6	2112371	2112376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181146
41533	NC_014554	ACC	2	6	2112433	2112438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181146
41534	NC_014554	GAA	2	6	2112506	2112511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181146
41535	NC_014554	CCAT	2	8	2112554	2112561	25 %	25 %	0 %	50 %	308181146
41536	NC_014554	AAC	2	6	2112574	2112579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181146
41537	NC_014554	TTA	2	6	2112650	2112655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181146
41538	NC_014554	AG	3	6	2112677	2112682	50 %	0 %	50 %	0 %	308181146
41539	NC_014554	CAA	2	6	2112693	2112698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181146
41540	NC_014554	TCC	2	6	2112747	2112752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41541	NC_014554	AACCA	2	10	2112772	2112781	60 %	0 %	0 %	40 %	308181147
41542	NC_014554	AGC	2	6	2112811	2112816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181147
41543	NC_014554	ATTTA	2	10	2112841	2112850	40 %	60 %	0 %	0 %	308181147
41544	NC_014554	GAC	2	6	2112896	2112901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181147
41545	NC_014554	CAG	2	6	2112912	2112917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181147
41546	NC_014554	CTT	2	6	2112987	2112992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181147
41547	NC_014554	AGA	2	6	2113117	2113122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181147
41548	NC_014554	TAA	2	6	2113131	2113136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181147
41549	NC_014554	AGA	2	6	2113146	2113151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181147
41550	NC_014554	TCA	2	6	2113160	2113165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181147
41551	NC_014554	CGC	2	6	2113242	2113247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181147
41552	NC_014554	CCA	2	6	2113301	2113306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181147
41553	NC_014554	TGT	2	6	2113383	2113388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181147
41554	NC_014554	TGA	2	6	2113646	2113651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181147
41555	NC_014554	TCT	2	6	2113653	2113658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181147
41556	NC_014554	TTG	2	6	2113659	2113664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181147
41557	NC_014554	ACT	2	6	2113707	2113712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41558	NC_014554	ACT	2	6	2113733	2113738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181148
41559	NC_014554	GCAGCG	2	12	2113741	2113752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	308181148
41560	NC_014554	CTT	2	6	2113815	2113820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181148
41561	NC_014554	TGA	2	6	2113849	2113854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181148
41562	NC_014554	ATC	2	6	2113899	2113904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181148
41563	NC_014554	TTC	2	6	2113959	2113964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181148
41564	NC_014554	TGAA	2	8	2113977	2113984	50 %	25 %	25 %	0 %	308181148
41565	NC_014554	GTT	2	6	2113988	2113993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181148
41566	NC_014554	GCA	2	6	2114041	2114046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181148
41567	NC_014554	AAG	2	6	2114090	2114095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181148
41568	NC_014554	CCA	2	6	2114152	2114157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181148
41569	NC_014554	GAAT	2	8	2114208	2114215	50 %	25 %	25 %	0 %	308181148
41570	NC_014554	AAG	2	6	2114224	2114229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181148
41571	NC_014554	AGA	2	6	2114381	2114386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181148
41572	NC_014554	GGA	2	6	2114413	2114418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308181148
41573	NC_014554	GGA	2	6	2114423	2114428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308181148
41574	NC_014554	TTGC	2	8	2114453	2114460	0 %	50 %	25 %	25 %	308181148
41575	NC_014554	TCA	2	6	2114470	2114475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181148
41576	NC_014554	TCA	2	6	2114501	2114506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181148
41577	NC_014554	TTC	2	6	2114511	2114516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181148
41578	NC_014554	CAG	2	6	2114567	2114572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181148
41579	NC_014554	CTT	2	6	2114613	2114618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181148
41580	NC_014554	ATA	2	6	2114845	2114850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181148
41581	NC_014554	ATG	2	6	2114971	2114976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181148
41582	NC_014554	AAC	2	6	2115030	2115035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181148
41583	NC_014554	TTG	2	6	2115210	2115215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181148
41584	NC_014554	TTC	2	6	2115234	2115239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181148
41585	NC_014554	TTG	2	6	2115281	2115286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181149
41586	NC_014554	AACGC	2	10	2115317	2115326	40 %	0 %	20 %	40 %	308181149
41587	NC_014554	ATT	2	6	2115343	2115348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181149
41588	NC_014554	AAC	2	6	2115400	2115405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181149
41589	NC_014554	CAA	2	6	2115537	2115542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181149
41590	NC_014554	ACA	2	6	2115576	2115581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181149
41591	NC_014554	GTCA	2	8	2115616	2115623	25 %	25 %	25 %	25 %	308181149
41592	NC_014554	AATT	2	8	2115847	2115854	50 %	50 %	0 %	0 %	308181150
41593	NC_014554	CTT	2	6	2115884	2115889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181150
41594	NC_014554	AAT	2	6	2115890	2115895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181150
41595	NC_014554	TTC	2	6	2115942	2115947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181150
41596	NC_014554	CTT	2	6	2116138	2116143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181150
41597	NC_014554	CAT	2	6	2116199	2116204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181150
41598	NC_014554	CAA	2	6	2116225	2116230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181150
41599	NC_014554	ACA	2	6	2116273	2116278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181150
41600	NC_014554	CCT	2	6	2116337	2116342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41601	NC_014554	TTTCAT	2	12	2116345	2116356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41602	NC_014554	CAA	2	6	2116404	2116409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181151
41603	NC_014554	GCA	2	6	2116577	2116582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181151
41604	NC_014554	TCC	2	6	2116604	2116609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41605	NC_014554	TTAAAA	2	12	2116610	2116621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41606	NC_014554	A	6	6	2116618	2116623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41607	NC_014554	ATT	2	6	2116630	2116635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181152
41608	NC_014554	TCG	2	6	2116638	2116643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181152
41609	NC_014554	ACGAAC	2	12	2116680	2116691	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	308181152
41610	NC_014554	CAAC	2	8	2116763	2116770	50 %	0 %	0 %	50 %	308181152
41611	NC_014554	TAA	2	6	2116882	2116887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181152
41612	NC_014554	TG	3	6	2116908	2116913	0 %	50 %	50 %	0 %	308181152
41613	NC_014554	ACC	2	6	2116928	2116933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181152
41614	NC_014554	GCA	2	6	2116956	2116961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181152
41615	NC_014554	ATCGG	2	10	2117004	2117013	20 %	20 %	40 %	20 %	308181152
41616	NC_014554	TGAA	2	8	2117055	2117062	50 %	25 %	25 %	0 %	308181152
41617	NC_014554	A	7	7	2117238	2117244	100 %	0 %	0 %	0 %	308181152
41618	NC_014554	TAACCT	2	12	2117382	2117393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41620	NC_014554	ACC	3	9	2117475	2117483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41621	NC_014554	A	6	6	2117488	2117493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41622	NC_014554	AAT	2	6	2117499	2117504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41623	NC_014554	TCAA	2	8	2117517	2117524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41624	NC_014554	CAA	2	6	2117533	2117538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41625	NC_014554	ATT	2	6	2117578	2117583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41626	NC_014554	CCG	2	6	2117636	2117641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181153
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41654	NC_014554	AAAAG	2	10	2118930	2118939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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41724	NC_014554	ATA	2	6	2123128	2123133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41725	NC_014554	TAT	2	6	2123139	2123144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41726	NC_014554	CGA	2	6	2123263	2123268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41728	NC_014554	GAGTCA	2	12	2123379	2123390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308181159
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41854	NC_014554	TTA	2	6	2130577	2130582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41885	NC_014554	T	7	7	2132313	2132319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41971	NC_014554	TCA	2	6	2136190	2136195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181171
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41991	NC_014554	TTC	2	6	2137246	2137251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181171
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41993	NC_014554	TGA	2	6	2137263	2137268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181171
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41997	NC_014554	TTCA	2	8	2137516	2137523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41998	NC_014554	TTA	2	6	2137524	2137529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41999	NC_014554	ATA	2	6	2137531	2137536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42000	NC_014554	CTAA	2	8	2137552	2137559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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