MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_014554	TTG	2	6	2084365	2084370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181120
41002	NC_014554	TAA	2	6	2084405	2084410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181120
41003	NC_014554	CAA	2	6	2084426	2084431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181120
41004	NC_014554	TACC	2	8	2084482	2084489	25 %	25 %	0 %	50 %	308181120
41005	NC_014554	ACC	2	6	2084517	2084522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181120
41006	NC_014554	CAA	2	6	2084539	2084544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181120
41007	NC_014554	TAA	2	6	2084605	2084610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181120
41008	NC_014554	A	6	6	2084662	2084667	100 %	0 %	0 %	0 %	308181120
41009	NC_014554	CTG	2	6	2084824	2084829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181120
41010	NC_014554	TAA	2	6	2084910	2084915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181120
41011	NC_014554	CTT	2	6	2084935	2084940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181120
41012	NC_014554	TCA	3	9	2084952	2084960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181120
41013	NC_014554	CGA	2	6	2085069	2085074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181120
41014	NC_014554	T	6	6	2085077	2085082	0 %	100 %	0 %	0 %	308181120
41015	NC_014554	GTT	2	6	2085093	2085098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181120
41016	NC_014554	TCA	2	6	2085109	2085114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181120
41017	NC_014554	TTG	2	6	2085149	2085154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181121
41018	NC_014554	TGAC	2	8	2085160	2085167	25 %	25 %	25 %	25 %	308181121
41019	NC_014554	AAG	2	6	2085184	2085189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181121
41020	NC_014554	GCA	2	6	2085202	2085207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181121
41021	NC_014554	CAA	2	6	2085266	2085271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181121
41022	NC_014554	ACA	2	6	2085403	2085408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181121
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41024	NC_014554	ACG	2	6	2085486	2085491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181121
41025	NC_014554	GAT	2	6	2085552	2085557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181121
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41027	NC_014554	TTG	2	6	2085665	2085670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181121
41028	NC_014554	CAC	2	6	2085695	2085700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181121
41029	NC_014554	GCG	2	6	2085706	2085711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181121
41030	NC_014554	CAT	2	6	2085720	2085725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181121
41031	NC_014554	AACAA	2	10	2085859	2085868	80 %	0 %	0 %	20 %	308181121
41032	NC_014554	ATT	2	6	2085901	2085906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181121
41033	NC_014554	TCC	2	6	2085910	2085915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41034	NC_014554	TTC	2	6	2085935	2085940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181122
41035	NC_014554	ACG	2	6	2086004	2086009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181122
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41038	NC_014554	ATA	2	6	2086209	2086214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181122
41039	NC_014554	GGCT	2	8	2086229	2086236	0 %	25 %	50 %	25 %	308181122
41040	NC_014554	TCA	3	9	2086281	2086289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181122
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41042	NC_014554	TAAT	2	8	2086387	2086394	50 %	50 %	0 %	0 %	308181122
41043	NC_014554	TCC	2	6	2086395	2086400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41044	NC_014554	ATT	2	6	2086421	2086426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41045	NC_014554	CT	3	6	2086454	2086459	0 %	50 %	0 %	50 %	308181123
41046	NC_014554	TAA	2	6	2086460	2086465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181123
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41053	NC_014554	A	6	6	2086939	2086944	100 %	0 %	0 %	0 %	308181123
41054	NC_014554	CGAA	2	8	2086977	2086984	50 %	0 %	25 %	25 %	308181123
41055	NC_014554	TCTTTT	2	12	2086996	2087007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	308181123
41056	NC_014554	TTG	2	6	2087103	2087108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181123
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41058	NC_014554	CGGC	2	8	2087297	2087304	0 %	0 %	50 %	50 %	308181123
41059	NC_014554	TGC	2	6	2087331	2087336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181123
41060	NC_014554	CCT	2	6	2087454	2087459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41061	NC_014554	ACT	2	6	2087467	2087472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41062	NC_014554	TTC	2	6	2087473	2087478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41063	NC_014554	TCA	2	6	2087481	2087486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41064	NC_014554	T	6	6	2087517	2087522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41065	NC_014554	TGT	2	6	2087543	2087548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41066	NC_014554	ATTT	2	8	2087549	2087556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41067	NC_014554	A	6	6	2087603	2087608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41068	NC_014554	T	6	6	2087640	2087645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41069	NC_014554	AATC	2	8	2087674	2087681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41070	NC_014554	CAA	2	6	2087714	2087719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181124
41071	NC_014554	ATC	2	6	2087850	2087855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181124
41072	NC_014554	TAA	2	6	2087984	2087989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181124
41073	NC_014554	CAA	2	6	2088163	2088168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181124
41074	NC_014554	TTCG	2	8	2088181	2088188	0 %	50 %	25 %	25 %	308181124
41075	NC_014554	TTGC	2	8	2088193	2088200	0 %	50 %	25 %	25 %	308181124
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41078	NC_014554	CCA	2	6	2088375	2088380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181124
41079	NC_014554	TTTG	2	8	2088472	2088479	0 %	75 %	25 %	0 %	308181124
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41082	NC_014554	CTG	2	6	2088635	2088640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
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41084	NC_014554	CGT	2	6	2088917	2088922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41085	NC_014554	CAT	2	6	2089004	2089009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181124
41086	NC_014554	CAA	2	6	2089025	2089030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181124
41087	NC_014554	ATA	2	6	2089106	2089111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181124
41088	NC_014554	CAT	2	6	2089127	2089132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181124
41089	NC_014554	AGCT	2	8	2089133	2089140	25 %	25 %	25 %	25 %	308181124
41090	NC_014554	ACA	2	6	2089186	2089191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181124
41091	NC_014554	CTG	2	6	2089193	2089198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41092	NC_014554	GCC	2	6	2089209	2089214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181124
41093	NC_014554	ACT	2	6	2089292	2089297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181124
41094	NC_014554	GAC	2	6	2089306	2089311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41095	NC_014554	GTA	2	6	2089314	2089319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181124
41096	NC_014554	GTG	2	6	2089336	2089341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181124
41097	NC_014554	AAAT	2	8	2089349	2089356	75 %	25 %	0 %	0 %	308181124
41098	NC_014554	ATTGC	2	10	2089407	2089416	20 %	40 %	20 %	20 %	308181124
41099	NC_014554	CTG	2	6	2089439	2089444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41100	NC_014554	TA	3	6	2089459	2089464	50 %	50 %	0 %	0 %	308181124
41101	NC_014554	TTCA	2	8	2089481	2089488	25 %	50 %	0 %	25 %	308181124
41102	NC_014554	GTC	2	6	2089512	2089517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41103	NC_014554	CGA	2	6	2089554	2089559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41104	NC_014554	CGTT	2	8	2089597	2089604	0 %	50 %	25 %	25 %	308181124
41105	NC_014554	ATC	2	6	2089607	2089612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181124
41106	NC_014554	TCGT	2	8	2089646	2089653	0 %	50 %	25 %	25 %	308181124
41107	NC_014554	CCG	2	6	2089667	2089672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181124
41108	NC_014554	TGC	2	6	2089673	2089678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41109	NC_014554	ACG	2	6	2089721	2089726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41110	NC_014554	GTA	2	6	2089734	2089739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181124
41111	NC_014554	TGA	2	6	2089776	2089781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181124
41112	NC_014554	TTG	2	6	2089784	2089789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181124
41113	NC_014554	GTC	2	6	2089818	2089823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41114	NC_014554	GTC	2	6	2089838	2089843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181124
41115	NC_014554	TGA	2	6	2089881	2089886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181124
41116	NC_014554	ATT	2	6	2089961	2089966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41117	NC_014554	ATT	2	6	2089982	2089987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41238	NC_014554	CATG	2	8	2096078	2096085	25 %	25 %	25 %	25 %	308181130
41239	NC_014554	AAT	2	6	2096217	2096222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181130
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41241	NC_014554	TGG	2	6	2096238	2096243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181130
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41250	NC_014554	T	7	7	2096525	2096531	0 %	100 %	0 %	0 %	308181130
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41265	NC_014554	GGC	2	6	2097062	2097067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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41268	NC_014554	TCA	2	6	2097169	2097174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181131
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41304	NC_014554	GATTG	2	10	2099216	2099225	20 %	40 %	40 %	0 %	308181132
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41306	NC_014554	CTTC	2	8	2099365	2099372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41307	NC_014554	TCA	2	6	2099397	2099402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181133
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41323	NC_014554	CTG	3	9	2100023	2100031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181133
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41335	NC_014554	CTTGC	2	10	2100829	2100838	0 %	40 %	20 %	40 %	308181134
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41338	NC_014554	AAG	2	6	2101020	2101025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181134
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41340	NC_014554	ATA	2	6	2101104	2101109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181134
41341	NC_014554	AAT	2	6	2101276	2101281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181134
41342	NC_014554	AAT	2	6	2101289	2101294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181134
41343	NC_014554	CGT	2	6	2101324	2101329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181134
41344	NC_014554	TCA	2	6	2101386	2101391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181134
41345	NC_014554	TTG	2	6	2101400	2101405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181134
41346	NC_014554	TGC	2	6	2101468	2101473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181134
41347	NC_014554	TTTA	2	8	2101490	2101497	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41348	NC_014554	TAC	2	6	2101569	2101574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41349	NC_014554	ATA	2	6	2101579	2101584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41350	NC_014554	A	6	6	2101641	2101646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41351	NC_014554	AGCT	2	8	2101669	2101676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41352	NC_014554	CAAT	3	12	2101677	2101688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41353	NC_014554	CTT	2	6	2101747	2101752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181135
41354	NC_014554	CTT	2	6	2101888	2101893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181135
41355	NC_014554	TAA	2	6	2101929	2101934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181135
41356	NC_014554	TTG	2	6	2102015	2102020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181135
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41358	NC_014554	TGC	2	6	2102127	2102132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181135
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41362	NC_014554	CCTT	2	8	2102366	2102373	0 %	50 %	0 %	50 %	308181135
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41369	NC_014554	TCC	2	6	2102545	2102550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41370	NC_014554	TTAA	2	8	2102561	2102568	50 %	50 %	0 %	0 %	308181136
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41401	NC_014554	A	7	7	2104299	2104305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41402	NC_014554	CTC	2	6	2104307	2104312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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41413	NC_014554	CAT	2	6	2105029	2105034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181139
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41454	NC_014554	TGA	2	6	2107876	2107881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41456	NC_014554	ATC	2	6	2107943	2107948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181143
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41463	NC_014554	TAA	2	6	2108485	2108490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181143
41464	NC_014554	TCC	2	6	2108501	2108506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41465	NC_014554	A	6	6	2108541	2108546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41466	NC_014554	ATTT	2	8	2108590	2108597	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41467	NC_014554	TTCG	2	8	2108614	2108621	0 %	50 %	25 %	25 %	308181144
41468	NC_014554	CATA	2	8	2108847	2108854	50 %	25 %	0 %	25 %	308181144
41469	NC_014554	TCA	2	6	2108903	2108908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181144
41470	NC_014554	TAA	2	6	2108944	2108949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181144
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41472	NC_014554	TTC	2	6	2109082	2109087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181144
41473	NC_014554	TTA	2	6	2109131	2109136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181144
41474	NC_014554	GCA	2	6	2109182	2109187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181144
41475	NC_014554	TCG	2	6	2109366	2109371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181144
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41485	NC_014554	CG	3	6	2110075	2110080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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41493	NC_014554	GTT	2	6	2110522	2110527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41497	NC_014554	TTC	2	6	2110670	2110675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41499	NC_014554	A	7	7	2110842	2110848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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