MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_014554	TTG	2	6	1880480	1880485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180933
37002	NC_014554	CCA	2	6	1880491	1880496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180933
37003	NC_014554	GCC	2	6	1880565	1880570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180933
37004	NC_014554	CGG	2	6	1880602	1880607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180933
37005	NC_014554	TCC	2	6	1880640	1880645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37006	NC_014554	A	6	6	1880660	1880665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37007	NC_014554	T	6	6	1880685	1880690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37008	NC_014554	CTT	2	6	1880737	1880742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180934
37009	NC_014554	GAT	2	6	1880751	1880756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180934
37010	NC_014554	ATA	2	6	1880771	1880776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180934
37011	NC_014554	TGGTC	2	10	1880802	1880811	0 %	40 %	40 %	20 %	308180934
37012	NC_014554	ATAA	2	8	1880814	1880821	75 %	25 %	0 %	0 %	308180934
37013	NC_014554	TAT	2	6	1880874	1880879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180934
37014	NC_014554	CGT	2	6	1880896	1880901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180934
37015	NC_014554	CT	3	6	1880918	1880923	0 %	50 %	0 %	50 %	308180934
37016	NC_014554	AAT	2	6	1880986	1880991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180934
37017	NC_014554	CTT	3	9	1880992	1881000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180934
37018	NC_014554	ATC	2	6	1881104	1881109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180934
37019	NC_014554	GTC	2	6	1881196	1881201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180934
37020	NC_014554	TCA	2	6	1881285	1881290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180934
37021	NC_014554	ATC	2	6	1881296	1881301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180934
37022	NC_014554	GGA	2	6	1881331	1881336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308180934
37023	NC_014554	TTCAT	2	10	1881338	1881347	20 %	60 %	0 %	20 %	308180934
37024	NC_014554	GTA	2	6	1881434	1881439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180934
37025	NC_014554	TTA	2	6	1881485	1881490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180934
37026	NC_014554	GAT	2	6	1881759	1881764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180934
37027	NC_014554	ACCGTG	2	12	1882025	1882036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	308180934
37028	NC_014554	TCT	2	6	1882053	1882058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180934
37029	NC_014554	ATG	2	6	1882064	1882069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180934
37030	NC_014554	CGA	2	6	1882227	1882232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180934
37031	NC_014554	TAA	2	6	1882288	1882293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180934
37032	NC_014554	AAATAT	2	12	1882326	1882337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180934
37033	NC_014554	CCA	2	6	1882385	1882390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180934
37034	NC_014554	ACT	2	6	1882411	1882416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180934
37035	NC_014554	ATT	2	6	1882419	1882424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180934
37036	NC_014554	TTC	2	6	1882434	1882439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180935
37037	NC_014554	CACC	2	8	1882510	1882517	25 %	0 %	0 %	75 %	308180935
37038	NC_014554	TGGCGA	2	12	1882550	1882561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308180935
37039	NC_014554	CAC	2	6	1882705	1882710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180935
37040	NC_014554	TCG	2	6	1882804	1882809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180935
37041	NC_014554	AAT	2	6	1882826	1882831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180935
37042	NC_014554	CCCGG	2	10	1882885	1882894	0 %	0 %	40 %	60 %	308180935
37043	NC_014554	ATA	2	6	1882905	1882910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180935
37044	NC_014554	TTG	2	6	1882974	1882979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180935
37045	NC_014554	TAG	2	6	1882980	1882985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180935
37046	NC_014554	ACC	2	6	1882989	1882994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180935
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37048	NC_014554	AGC	2	6	1883051	1883056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180935
37049	NC_014554	GCT	2	6	1883112	1883117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180935
37050	NC_014554	CCCA	2	8	1883174	1883181	25 %	0 %	0 %	75 %	308180935
37051	NC_014554	TCAA	2	8	1883217	1883224	50 %	25 %	0 %	25 %	308180935
37052	NC_014554	TTG	2	6	1883249	1883254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180935
37053	NC_014554	ATC	2	6	1883258	1883263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180935
37054	NC_014554	TCA	2	6	1883284	1883289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180935
37055	NC_014554	CTC	2	6	1883322	1883327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37056	NC_014554	TAAAG	2	10	1883394	1883403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37057	NC_014554	CCA	2	6	1883522	1883527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180936
37058	NC_014554	CAA	2	6	1883533	1883538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180936
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37060	NC_014554	AC	3	6	1883599	1883604	50 %	0 %	0 %	50 %	308180936
37061	NC_014554	TCA	2	6	1883638	1883643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180936
37062	NC_014554	CAA	2	6	1883732	1883737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180936
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37064	NC_014554	A	7	7	1883760	1883766	100 %	0 %	0 %	0 %	308180936
37065	NC_014554	GCC	2	6	1883850	1883855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180936
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37067	NC_014554	GTG	2	6	1883929	1883934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180936
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37081	NC_014554	TAA	2	6	1884689	1884694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37082	NC_014554	T	6	6	1884717	1884722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37083	NC_014554	A	7	7	1884727	1884733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37084	NC_014554	ACC	2	6	1884736	1884741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37085	NC_014554	GCAG	2	8	1884743	1884750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37086	NC_014554	ACG	2	6	1884771	1884776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180937
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37088	NC_014554	ACG	2	6	1884846	1884851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180937
37089	NC_014554	TCA	2	6	1884866	1884871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180937
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37094	NC_014554	ACC	2	6	1885046	1885051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37095	NC_014554	AAT	2	6	1885057	1885062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37096	NC_014554	TGG	2	6	1885085	1885090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37097	NC_014554	A	6	6	1885242	1885247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37098	NC_014554	ACAA	2	8	1885301	1885308	75 %	0 %	0 %	25 %	308180938
37099	NC_014554	CTG	2	6	1885353	1885358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180938
37100	NC_014554	A	6	6	1885361	1885366	100 %	0 %	0 %	0 %	308180938
37101	NC_014554	GCT	2	6	1885373	1885378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180938
37102	NC_014554	CTG	2	6	1885383	1885388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180938
37103	NC_014554	CGA	2	6	1885402	1885407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180938
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37105	NC_014554	GCT	2	6	1885442	1885447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180938
37106	NC_014554	CAA	2	6	1885468	1885473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180938
37107	NC_014554	T	7	7	1885551	1885557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37108	NC_014554	T	7	7	1885617	1885623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37109	NC_014554	CAA	2	6	1885682	1885687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37110	NC_014554	ATAA	2	8	1885751	1885758	75 %	25 %	0 %	0 %	308180939
37111	NC_014554	CGC	2	6	1885828	1885833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180939
37112	NC_014554	GCTA	2	8	1885909	1885916	25 %	25 %	25 %	25 %	308180939
37113	NC_014554	CAA	2	6	1885963	1885968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180939
37114	NC_014554	TAA	2	6	1885981	1885986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180939
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37116	NC_014554	ATC	2	6	1886168	1886173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180939
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37118	NC_014554	GCGTT	2	10	1886290	1886299	0 %	40 %	40 %	20 %	308180939
37119	NC_014554	CGT	2	6	1886329	1886334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180939
37120	NC_014554	T	7	7	1886341	1886347	0 %	100 %	0 %	0 %	308180939
37121	NC_014554	GTT	2	6	1886424	1886429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180939
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37125	NC_014554	CAT	2	6	1886553	1886558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180939
37126	NC_014554	CGT	2	6	1886578	1886583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180939
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37130	NC_014554	CCTT	2	8	1886757	1886764	0 %	50 %	0 %	50 %	308180939
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37148	NC_014554	AGACTA	2	12	1887573	1887584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	308180940
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37209	NC_014554	GT	3	6	1890374	1890379	0 %	50 %	50 %	0 %	308180943
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37218	NC_014554	GTC	3	9	1890750	1890758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180943
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37221	NC_014554	TGG	2	6	1890930	1890935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180943
37222	NC_014554	GCG	2	6	1891201	1891206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180943
37223	NC_014554	TGA	2	6	1891251	1891256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180943
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37226	NC_014554	TTAA	2	8	1891504	1891511	50 %	50 %	0 %	0 %	308180944
37227	NC_014554	GAA	2	6	1891516	1891521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180944
37228	NC_014554	TCA	2	6	1891729	1891734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180944
37229	NC_014554	ATC	2	6	1891738	1891743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180944
37230	NC_014554	CTG	2	6	1891886	1891891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180944
37231	NC_014554	TTG	2	6	1891956	1891961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180945
37232	NC_014554	GGGT	2	8	1892100	1892107	0 %	25 %	75 %	0 %	308180945
37233	NC_014554	ATCA	2	8	1892253	1892260	50 %	25 %	0 %	25 %	308180945
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37235	NC_014554	AAT	2	6	1892358	1892363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180945
37236	NC_014554	CTT	2	6	1892375	1892380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180945
37237	NC_014554	CGT	2	6	1892391	1892396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180945
37238	NC_014554	ACC	2	6	1892436	1892441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180945
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37240	NC_014554	TCA	2	6	1892497	1892502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180946
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37463	NC_014554	CTC	2	6	1904086	1904091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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37473	NC_014554	TTA	2	6	1904701	1904706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180953
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37498	NC_014554	AT	3	6	1906075	1906080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37499	NC_014554	CCG	2	6	1906090	1906095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37500	NC_014554	ACG	2	6	1906134	1906139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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