MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_014554	AAT	2	6	1831369	1831374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36002	NC_014554	ATT	2	6	1831383	1831388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36003	NC_014554	T	7	7	1831387	1831393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36004	NC_014554	T	6	6	1831400	1831405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36005	NC_014554	ATT	2	6	1831430	1831435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36006	NC_014554	ATT	3	9	1831457	1831465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36007	NC_014554	TTC	2	6	1831495	1831500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36008	NC_014554	GAA	2	6	1831511	1831516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36009	NC_014554	TAA	2	6	1831518	1831523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36010	NC_014554	AT	3	6	1831624	1831629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36011	NC_014554	AAATGA	2	12	1831630	1831641	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36012	NC_014554	GCT	2	6	1831673	1831678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36013	NC_014554	AAT	2	6	1831762	1831767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36014	NC_014554	ATA	2	6	1831791	1831796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36015	NC_014554	TTTA	2	8	1831807	1831814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36016	NC_014554	ACCAA	2	10	1831847	1831856	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36017	NC_014554	GTT	2	6	1831887	1831892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36018	NC_014554	TCC	2	6	1831931	1831936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36019	NC_014554	TGAAT	2	10	1831940	1831949	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36020	NC_014554	CAT	2	6	1831950	1831955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36021	NC_014554	TGA	2	6	1831987	1831992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180880
36022	NC_014554	CTG	2	6	1832012	1832017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180880
36023	NC_014554	TCT	3	9	1832035	1832043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180880
36024	NC_014554	CTT	2	6	1832057	1832062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180880
36025	NC_014554	ATC	2	6	1832131	1832136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180880
36026	NC_014554	CTG	2	6	1832151	1832156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180880
36027	NC_014554	TAA	2	6	1832281	1832286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36028	NC_014554	ATG	2	6	1832317	1832322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180881
36029	NC_014554	TCG	2	6	1832363	1832368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180881
36030	NC_014554	AATT	2	8	1832420	1832427	50 %	50 %	0 %	0 %	308180881
36031	NC_014554	TAA	2	6	1832497	1832502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180881
36032	NC_014554	ATC	2	6	1832675	1832680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180882
36033	NC_014554	ATG	2	6	1832730	1832735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180882
36034	NC_014554	TTG	2	6	1832749	1832754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180882
36035	NC_014554	T	6	6	1832809	1832814	0 %	100 %	0 %	0 %	308180882
36036	NC_014554	CTT	2	6	1832818	1832823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180882
36037	NC_014554	T	6	6	1832847	1832852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36038	NC_014554	GCTG	2	8	1832860	1832867	0 %	25 %	50 %	25 %	308180883
36039	NC_014554	CTTG	2	8	1833047	1833054	0 %	50 %	25 %	25 %	308180883
36040	NC_014554	TTG	2	6	1833082	1833087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180883
36041	NC_014554	TTG	2	6	1833145	1833150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180883
36042	NC_014554	GCTG	2	8	1833218	1833225	0 %	25 %	50 %	25 %	308180883
36043	NC_014554	GTCA	2	8	1833288	1833295	25 %	25 %	25 %	25 %	308180883
36044	NC_014554	TGA	2	6	1833410	1833415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180883
36045	NC_014554	TCA	2	6	1833460	1833465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180883
36046	NC_014554	ATA	2	6	1833541	1833546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180883
36047	NC_014554	GTAC	2	8	1833562	1833569	25 %	25 %	25 %	25 %	308180883
36048	NC_014554	TCC	2	6	1833615	1833620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36049	NC_014554	T	6	6	1833633	1833638	0 %	100 %	0 %	0 %	308180884
36050	NC_014554	TGT	2	6	1833684	1833689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180884
36051	NC_014554	TGAT	2	8	1833722	1833729	25 %	50 %	25 %	0 %	308180884
36052	NC_014554	T	6	6	1833729	1833734	0 %	100 %	0 %	0 %	308180884
36053	NC_014554	GAT	2	6	1833773	1833778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180884
36054	NC_014554	GCCA	2	8	1833781	1833788	25 %	0 %	25 %	50 %	308180884
36055	NC_014554	TTGT	2	8	1833811	1833818	0 %	75 %	25 %	0 %	308180884
36056	NC_014554	CCT	2	6	1833844	1833849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36057	NC_014554	AAGA	2	8	1833863	1833870	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36058	NC_014554	AT	3	6	1833898	1833903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36059	NC_014554	TTAT	2	8	1833931	1833938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36060	NC_014554	CGCC	2	8	1833939	1833946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36061	NC_014554	GAT	2	6	1833949	1833954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36062	NC_014554	TAA	2	6	1833955	1833960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36063	NC_014554	ACA	2	6	1834014	1834019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36064	NC_014554	T	6	6	1834041	1834046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36065	NC_014554	GGA	2	6	1834079	1834084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36066	NC_014554	A	6	6	1834198	1834203	100 %	0 %	0 %	0 %	308180885
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36073	NC_014554	ATG	2	6	1834622	1834627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180886
36074	NC_014554	ATATT	2	10	1834633	1834642	40 %	60 %	0 %	0 %	308180886
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36078	NC_014554	TG	3	6	1834911	1834916	0 %	50 %	50 %	0 %	308180887
36079	NC_014554	CTT	2	6	1834937	1834942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180887
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36082	NC_014554	AG	3	6	1835124	1835129	50 %	0 %	50 %	0 %	308180887
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36092	NC_014554	AAT	2	6	1835540	1835545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180887
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36094	NC_014554	AC	3	6	1835587	1835592	50 %	0 %	0 %	50 %	308180887
36095	NC_014554	TGG	2	6	1835597	1835602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180887
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36101	NC_014554	ACT	2	6	1835800	1835805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180888
36102	NC_014554	AAT	2	6	1835806	1835811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180888
36103	NC_014554	ATATT	2	10	1835951	1835960	40 %	60 %	0 %	0 %	308180888
36104	NC_014554	GTA	2	6	1836082	1836087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180889
36105	NC_014554	GC	3	6	1836185	1836190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36106	NC_014554	TTCT	2	8	1836232	1836239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36107	NC_014554	ACT	2	6	1836243	1836248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36108	NC_014554	CGCT	2	8	1836268	1836275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36109	NC_014554	TC	3	6	1836283	1836288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36110	NC_014554	AT	3	6	1836325	1836330	50 %	50 %	0 %	0 %	308180890
36111	NC_014554	TAT	2	6	1836402	1836407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180890
36112	NC_014554	C	6	6	1836450	1836455	0 %	0 %	0 %	100 %	308180890
36113	NC_014554	TAAA	2	8	1836461	1836468	75 %	25 %	0 %	0 %	308180890
36114	NC_014554	ACA	2	6	1836530	1836535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180890
36115	NC_014554	AATT	2	8	1836541	1836548	50 %	50 %	0 %	0 %	308180890
36116	NC_014554	TC	4	8	1836634	1836641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36117	NC_014554	TAT	2	6	1836650	1836655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36118	NC_014554	AAT	2	6	1836697	1836702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36119	NC_014554	AC	3	6	1836783	1836788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36120	NC_014554	AAAT	2	8	1836795	1836802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36121	NC_014554	CAT	2	6	1836853	1836858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36122	NC_014554	ATT	2	6	1836865	1836870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36123	NC_014554	ACA	2	6	1836891	1836896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36124	NC_014554	ATT	2	6	1836945	1836950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36125	NC_014554	A	6	6	1837013	1837018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36126	NC_014554	AAG	2	6	1837021	1837026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36231	NC_014554	TCAAA	2	10	1841989	1841998	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36232	NC_014554	CTAC	2	8	1842022	1842029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36233	NC_014554	TAC	2	6	1842054	1842059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36236	NC_014554	TTG	2	6	1842198	1842203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36238	NC_014554	TTA	2	6	1842236	1842241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36239	NC_014554	AAT	2	6	1842257	1842262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36240	NC_014554	CAA	2	6	1842272	1842277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36241	NC_014554	ATCA	2	8	1842279	1842286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36242	NC_014554	A	6	6	1842308	1842313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36243	NC_014554	GAAC	2	8	1842381	1842388	50 %	0 %	25 %	25 %	308180896
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36365	NC_014554	GTT	2	6	1848796	1848801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180902
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36482	NC_014554	GTG	2	6	1854289	1854294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180910
36483	NC_014554	CA	3	6	1854335	1854340	50 %	0 %	0 %	50 %	308180910
36484	NC_014554	CCAAC	2	10	1854399	1854408	40 %	0 %	0 %	60 %	308180910
36485	NC_014554	GAA	2	6	1854535	1854540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180910
36486	NC_014554	GTC	2	6	1854634	1854639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180910
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