MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_014554	GAT	2	6	1570694	1570699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180632
31002	NC_014554	AAGT	2	8	1570742	1570749	50 %	25 %	25 %	0 %	308180632
31003	NC_014554	CGA	2	6	1570780	1570785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180632
31004	NC_014554	CCT	2	6	1570788	1570793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308180632
31005	NC_014554	ACG	2	6	1570835	1570840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180632
31006	NC_014554	GGC	2	6	1570886	1570891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180632
31007	NC_014554	GAC	2	6	1570937	1570942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180632
31008	NC_014554	GAA	2	6	1570949	1570954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180632
31009	NC_014554	GTT	2	6	1570974	1570979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180632
31010	NC_014554	TAA	2	6	1571028	1571033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180633
31011	NC_014554	A	6	6	1571056	1571061	100 %	0 %	0 %	0 %	308180633
31012	NC_014554	T	6	6	1571085	1571090	0 %	100 %	0 %	0 %	308180633
31013	NC_014554	CGG	2	6	1571119	1571124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180633
31014	NC_014554	ATT	2	6	1571125	1571130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180633
31015	NC_014554	AATG	2	8	1571140	1571147	50 %	25 %	25 %	0 %	308180633
31016	NC_014554	A	6	6	1571154	1571159	100 %	0 %	0 %	0 %	308180633
31017	NC_014554	ATT	2	6	1571177	1571182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180633
31018	NC_014554	GAT	2	6	1571262	1571267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180634
31019	NC_014554	TGG	2	6	1571274	1571279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180634
31020	NC_014554	TTG	2	6	1571344	1571349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180634
31021	NC_014554	TCT	2	6	1571369	1571374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180634
31022	NC_014554	TGA	2	6	1571381	1571386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180634
31023	NC_014554	TAT	2	6	1571405	1571410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180634
31024	NC_014554	CTG	2	6	1571502	1571507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180634
31025	NC_014554	TGACT	2	10	1571526	1571535	20 %	40 %	20 %	20 %	308180634
31026	NC_014554	TAA	2	6	1571594	1571599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180634
31027	NC_014554	TTA	2	6	1571611	1571616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180634
31028	NC_014554	GAT	2	6	1571670	1571675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180634
31029	NC_014554	GTG	2	6	1571680	1571685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180634
31030	NC_014554	GTCA	2	8	1571773	1571780	25 %	25 %	25 %	25 %	308180634
31031	NC_014554	CTT	2	6	1571787	1571792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180634
31032	NC_014554	CTT	2	6	1571811	1571816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180634
31033	NC_014554	TTC	2	6	1571944	1571949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180634
31034	NC_014554	GATCA	2	10	1571992	1572001	40 %	20 %	20 %	20 %	308180634
31035	NC_014554	CAGT	2	8	1572006	1572013	25 %	25 %	25 %	25 %	308180634
31036	NC_014554	ATGG	2	8	1572171	1572178	25 %	25 %	50 %	0 %	308180634
31037	NC_014554	CCCG	2	8	1572202	1572209	0 %	0 %	25 %	75 %	308180634
31038	NC_014554	TCA	2	6	1572223	1572228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180634
31039	NC_014554	CAA	2	6	1572302	1572307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180634
31040	NC_014554	TCA	2	6	1572314	1572319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180634
31041	NC_014554	TTG	2	6	1572334	1572339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180634
31042	NC_014554	CTT	2	6	1572432	1572437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180634
31043	NC_014554	GTC	2	6	1572451	1572456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180634
31044	NC_014554	TTA	2	6	1572517	1572522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180634
31045	NC_014554	CGAA	2	8	1572528	1572535	50 %	0 %	25 %	25 %	308180634
31046	NC_014554	TGA	2	6	1572579	1572584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31047	NC_014554	T	7	7	1572624	1572630	0 %	100 %	0 %	0 %	308180635
31048	NC_014554	GATTTT	2	12	1572632	1572643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	308180635
31049	NC_014554	ATAA	2	8	1572662	1572669	75 %	25 %	0 %	0 %	308180635
31050	NC_014554	TGA	2	6	1572775	1572780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180635
31051	NC_014554	TGC	2	6	1572851	1572856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180635
31052	NC_014554	AAT	2	6	1573051	1573056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180635
31053	NC_014554	AAT	2	6	1573264	1573269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180635
31054	NC_014554	AAG	2	6	1573278	1573283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180635
31055	NC_014554	ATG	2	6	1573323	1573328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180635
31056	NC_014554	TCG	2	6	1573386	1573391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180635
31057	NC_014554	TGA	2	6	1573563	1573568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180635
31058	NC_014554	T	6	6	1573571	1573576	0 %	100 %	0 %	0 %	308180635
31059	NC_014554	GTT	2	6	1573590	1573595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180635
31060	NC_014554	ACT	2	6	1573598	1573603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180635
31061	NC_014554	GCT	2	6	1573630	1573635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180635
31062	NC_014554	TTAAG	2	10	1573639	1573648	40 %	40 %	20 %	0 %	308180635
31063	NC_014554	TAG	2	6	1573786	1573791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180635
31064	NC_014554	CTT	2	6	1573792	1573797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180635
31065	NC_014554	AAC	2	6	1573799	1573804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180635
31066	NC_014554	TAG	2	6	1573846	1573851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180635
31067	NC_014554	TGT	2	6	1573932	1573937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_014554	TCA	2	6	1574019	1574024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31069	NC_014554	AAT	2	6	1574081	1574086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31070	NC_014554	ATTCT	2	10	1574102	1574111	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31071	NC_014554	CAT	2	6	1574126	1574131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31072	NC_014554	GAC	2	6	1574142	1574147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31073	NC_014554	ATT	2	6	1574168	1574173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31074	NC_014554	GGGGA	2	10	1574174	1574183	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
31075	NC_014554	TTG	2	6	1574228	1574233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180636
31076	NC_014554	TCA	2	6	1574243	1574248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180636
31077	NC_014554	AC	3	6	1574252	1574257	50 %	0 %	0 %	50 %	308180636
31078	NC_014554	GAC	2	6	1574278	1574283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31079	NC_014554	CAG	2	6	1574305	1574310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31080	NC_014554	AGA	2	6	1574319	1574324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180636
31081	NC_014554	AGT	2	6	1574336	1574341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180636
31082	NC_014554	TAG	2	6	1574344	1574349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180636
31083	NC_014554	GCT	2	6	1574405	1574410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31084	NC_014554	GCA	2	6	1574450	1574455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31085	NC_014554	CAA	2	6	1574462	1574467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180636
31086	NC_014554	CCAT	2	8	1574574	1574581	25 %	25 %	0 %	50 %	308180636
31087	NC_014554	CAG	2	6	1574594	1574599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31088	NC_014554	GTG	2	6	1574624	1574629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180636
31089	NC_014554	GAC	2	6	1574659	1574664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31090	NC_014554	CAG	2	6	1574690	1574695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31091	NC_014554	ATA	2	6	1574709	1574714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180636
31092	NC_014554	CAG	2	6	1574721	1574726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180636
31093	NC_014554	TCA	2	6	1574749	1574754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180636
31094	NC_014554	AT	3	6	1574791	1574796	50 %	50 %	0 %	0 %	308180636
31095	NC_014554	ATG	2	6	1574840	1574845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180636
31096	NC_014554	CAC	2	6	1574913	1574918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180636
31097	NC_014554	GTCG	2	8	1574920	1574927	0 %	25 %	50 %	25 %	308180636
31098	NC_014554	TCAAG	2	10	1575010	1575019	40 %	20 %	20 %	20 %	308180636
31099	NC_014554	AAT	2	6	1575063	1575068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180636
31100	NC_014554	ACAA	2	8	1575111	1575118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31101	NC_014554	AGC	2	6	1575123	1575128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31102	NC_014554	TTG	2	6	1575164	1575169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_014554	GTT	3	9	1575244	1575252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180637
31104	NC_014554	GAT	2	6	1575299	1575304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180637
31105	NC_014554	GGT	2	6	1575307	1575312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180637
31106	NC_014554	ACC	2	6	1575360	1575365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180637
31107	NC_014554	CAA	2	6	1575366	1575371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180637
31108	NC_014554	GC	3	6	1575487	1575492	0 %	0 %	50 %	50 %	308180637
31109	NC_014554	CCT	2	6	1575576	1575581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31110	NC_014554	CTA	2	6	1575688	1575693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180638
31111	NC_014554	TAG	2	6	1575701	1575706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180638
31112	NC_014554	GTA	2	6	1575748	1575753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180638
31113	NC_014554	CTT	2	6	1575775	1575780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180638
31114	NC_014554	CGA	2	6	1575853	1575858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180638
31115	NC_014554	TAC	2	6	1575949	1575954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180638
31116	NC_014554	ATG	2	6	1575993	1575998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180638
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31351	NC_014554	GAT	2	6	1588734	1588739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180649
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31410	NC_014554	AATT	2	8	1591728	1591735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31424	NC_014554	TGCA	2	8	1592213	1592220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31425	NC_014554	TAAC	2	8	1592238	1592245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31469	NC_014554	TTA	2	6	1594367	1594372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31470	NC_014554	ATT	2	6	1594378	1594383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180654
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