MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_014554	A	6	6	1440986	1440991	100 %	0 %	0 %	0 %	308180496
28502	NC_014554	CAG	2	6	1441141	1441146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180496
28503	NC_014554	ACT	2	6	1441333	1441338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180496
28504	NC_014554	GC	3	6	1441388	1441393	0 %	0 %	50 %	50 %	308180496
28505	NC_014554	TGG	2	6	1441452	1441457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180496
28506	NC_014554	ATGA	2	8	1441525	1441532	50 %	25 %	25 %	0 %	308180496
28507	NC_014554	TTG	2	6	1441562	1441567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180496
28508	NC_014554	AAC	2	6	1441610	1441615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180496
28509	NC_014554	ATT	2	6	1441666	1441671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180496
28510	NC_014554	GTC	2	6	1441719	1441724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180497
28511	NC_014554	TGC	2	6	1441768	1441773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180497
28512	NC_014554	CAA	2	6	1441859	1441864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180497
28513	NC_014554	TCA	2	6	1441994	1441999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180497
28514	NC_014554	GC	3	6	1442033	1442038	0 %	0 %	50 %	50 %	308180497
28515	NC_014554	GAT	2	6	1442102	1442107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180497
28516	NC_014554	AATC	2	8	1442169	1442176	50 %	25 %	0 %	25 %	308180497
28517	NC_014554	GCC	2	6	1442186	1442191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180497
28518	NC_014554	T	6	6	1442215	1442220	0 %	100 %	0 %	0 %	308180497
28519	NC_014554	GGA	2	6	1442249	1442254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28520	NC_014554	CAA	2	6	1442321	1442326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180498
28521	NC_014554	GCA	2	6	1442429	1442434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180498
28522	NC_014554	CGA	2	6	1442532	1442537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180498
28523	NC_014554	CGC	2	6	1442554	1442559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180498
28524	NC_014554	GCG	2	6	1442594	1442599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180498
28525	NC_014554	GTG	2	6	1442610	1442615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180498
28526	NC_014554	CGG	2	6	1442616	1442621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180498
28527	NC_014554	TATG	2	8	1442704	1442711	25 %	50 %	25 %	0 %	308180498
28528	NC_014554	CG	3	6	1442712	1442717	0 %	0 %	50 %	50 %	308180498
28529	NC_014554	ATC	2	6	1442721	1442726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180498
28530	NC_014554	GCGAT	2	10	1442729	1442738	20 %	20 %	40 %	20 %	308180498
28531	NC_014554	TCG	2	6	1442739	1442744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180498
28532	NC_014554	CAA	2	6	1442756	1442761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180498
28533	NC_014554	ACT	2	6	1442827	1442832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180498
28534	NC_014554	TAAT	2	8	1442967	1442974	50 %	50 %	0 %	0 %	308180498
28535	NC_014554	GCA	2	6	1442980	1442985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180498
28536	NC_014554	TGG	2	6	1443049	1443054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180498
28537	NC_014554	GCC	2	6	1443071	1443076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180498
28538	NC_014554	GTG	2	6	1443122	1443127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180498
28539	NC_014554	TGA	2	6	1443129	1443134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180498
28540	NC_014554	GCC	2	6	1443137	1443142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180498
28541	NC_014554	GCG	2	6	1443143	1443148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180498
28542	NC_014554	AATT	2	8	1443243	1443250	50 %	50 %	0 %	0 %	308180498
28543	NC_014554	AGT	2	6	1443254	1443259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180498
28544	NC_014554	CAA	2	6	1443355	1443360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180499
28545	NC_014554	ACC	2	6	1443373	1443378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180499
28546	NC_014554	TGC	2	6	1443510	1443515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180499
28547	NC_014554	CTTA	2	8	1443572	1443579	25 %	50 %	0 %	25 %	308180499
28548	NC_014554	GCT	2	6	1443634	1443639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180499
28549	NC_014554	ATTG	2	8	1443684	1443691	25 %	50 %	25 %	0 %	308180499
28550	NC_014554	AAGC	2	8	1443790	1443797	50 %	0 %	25 %	25 %	308180499
28551	NC_014554	GGC	2	6	1443801	1443806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180499
28552	NC_014554	ATT	2	6	1443817	1443822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180499
28553	NC_014554	TAA	2	6	1443828	1443833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180499
28554	NC_014554	GGC	2	6	1443957	1443962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180499
28555	NC_014554	TGCG	2	8	1444001	1444008	0 %	25 %	50 %	25 %	308180499
28556	NC_014554	AGC	2	6	1444016	1444021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180499
28557	NC_014554	GCGG	2	8	1444038	1444045	0 %	0 %	75 %	25 %	308180499
28558	NC_014554	CGA	3	9	1444155	1444163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180500
28559	NC_014554	CG	3	6	1444181	1444186	0 %	0 %	50 %	50 %	308180500
28560	NC_014554	ATT	2	6	1444281	1444286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180500
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28562	NC_014554	GAT	2	6	1444314	1444319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180500
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28566	NC_014554	CGTCC	2	10	1444473	1444482	0 %	20 %	20 %	60 %	308180500
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28582	NC_014554	GGCA	2	8	1444970	1444977	25 %	0 %	50 %	25 %	308180501
28583	NC_014554	AGA	2	6	1444988	1444993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180501
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28585	NC_014554	GCAACT	2	12	1445044	1445055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308180501
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28587	NC_014554	AAGA	2	8	1445098	1445105	75 %	0 %	25 %	0 %	308180501
28588	NC_014554	TGA	2	6	1445235	1445240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180501
28589	NC_014554	ATG	2	6	1445287	1445292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180501
28590	NC_014554	TCA	2	6	1445312	1445317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180501
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28594	NC_014554	TGA	2	6	1445427	1445432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180501
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28596	NC_014554	GGCTG	2	10	1445595	1445604	0 %	20 %	60 %	20 %	308180501
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28598	NC_014554	TAT	2	6	1445802	1445807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180501
28599	NC_014554	GGC	2	6	1445841	1445846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180501
28600	NC_014554	TGA	2	6	1445874	1445879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180501
28601	NC_014554	AAC	2	6	1445887	1445892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180502
28602	NC_014554	GTT	2	6	1445969	1445974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180502
28603	NC_014554	TGG	3	9	1446111	1446119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180502
28604	NC_014554	GA	3	6	1446126	1446131	50 %	0 %	50 %	0 %	308180502
28605	NC_014554	TGC	2	6	1446190	1446195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180502
28606	NC_014554	CAG	2	6	1446203	1446208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180502
28607	NC_014554	ATT	2	6	1446236	1446241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180502
28608	NC_014554	ATTG	2	8	1446313	1446320	25 %	50 %	25 %	0 %	308180502
28609	NC_014554	TGA	2	6	1446331	1446336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180502
28610	NC_014554	CAG	2	6	1446359	1446364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180502
28611	NC_014554	ATC	2	6	1446388	1446393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180502
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28613	NC_014554	CAGGCC	2	12	1446512	1446523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	308180502
28614	NC_014554	ACCA	2	8	1446585	1446592	50 %	0 %	0 %	50 %	308180502
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28616	NC_014554	GCG	2	6	1446628	1446633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180502
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28843	NC_014554	AT	3	6	1458345	1458350	50 %	50 %	0 %	0 %	308180515
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28852	NC_014554	ATT	2	6	1458799	1458804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180515
28853	NC_014554	CAAA	2	8	1458840	1458847	75 %	0 %	0 %	25 %	308180515
28854	NC_014554	ATT	2	6	1458899	1458904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180515
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28857	NC_014554	TCA	2	6	1459030	1459035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180516
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28861	NC_014554	TTA	2	6	1459208	1459213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180516
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28863	NC_014554	CAGCGA	2	12	1459304	1459315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180516
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28884	NC_014554	GTT	2	6	1460629	1460634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180517
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28954	NC_014554	ATGG	2	8	1463896	1463903	25 %	25 %	50 %	0 %	308180521
28955	NC_014554	ATT	2	6	1463951	1463956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180521
28956	NC_014554	TCA	2	6	1463975	1463980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180521
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28958	NC_014554	TTGA	2	8	1464052	1464059	25 %	50 %	25 %	0 %	308180522
28959	NC_014554	T	7	7	1464075	1464081	0 %	100 %	0 %	0 %	308180522
28960	NC_014554	GAT	2	6	1464109	1464114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180522
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28962	NC_014554	ATT	2	6	1464163	1464168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180522
28963	NC_014554	TGTT	2	8	1464370	1464377	0 %	75 %	25 %	0 %	308180522
28964	NC_014554	TTG	2	6	1464416	1464421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180522
28965	NC_014554	GTG	3	9	1464434	1464442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180522
28966	NC_014554	TACT	2	8	1464489	1464496	25 %	50 %	0 %	25 %	308180522
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28968	NC_014554	A	6	6	1464566	1464571	100 %	0 %	0 %	0 %	308180522
28969	NC_014554	ATT	2	6	1464591	1464596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180522
28970	NC_014554	ATT	2	6	1464607	1464612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180522
28971	NC_014554	ATT	2	6	1464619	1464624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180522
28972	NC_014554	GCA	2	6	1464640	1464645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180522
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28975	NC_014554	TGA	3	9	1464968	1464976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180523
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28980	NC_014554	ATT	2	6	1465382	1465387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180523
28981	NC_014554	TTA	2	6	1465461	1465466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180523
28982	NC_014554	TC	3	6	1465472	1465477	0 %	50 %	0 %	50 %	308180523
28983	NC_014554	A	7	7	1465592	1465598	100 %	0 %	0 %	0 %	308180524
28984	NC_014554	AATT	2	8	1465632	1465639	50 %	50 %	0 %	0 %	308180524
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28988	NC_014554	ATG	2	6	1465800	1465805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180524
28989	NC_014554	CGG	2	6	1465833	1465838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180524
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28992	NC_014554	T	6	6	1466120	1466125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28993	NC_014554	TAT	2	6	1466155	1466160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28994	NC_014554	AAT	2	6	1466268	1466273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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28997	NC_014554	CGG	2	6	1466352	1466357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180525
28998	NC_014554	AAT	2	6	1466377	1466382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180525
28999	NC_014554	ACC	2	6	1466410	1466415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180525
29000	NC_014554	GAT	2	6	1466494	1466499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180525

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