MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20002	NC_014554	ATT	2	6	1012436	1012441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180116
20003	NC_014554	AAATT	2	10	1012580	1012589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20004	NC_014554	TTA	2	6	1012596	1012601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20005	NC_014554	GCT	2	6	1012602	1012607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20006	NC_014554	CTT	2	6	1012642	1012647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20007	NC_014554	ATC	2	6	1012740	1012745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180117
20008	NC_014554	ATC	2	6	1012882	1012887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180117
20009	NC_014554	TGA	2	6	1012921	1012926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20011	NC_014554	AGT	2	6	1013008	1013013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20012	NC_014554	ATA	2	6	1013048	1013053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20013	NC_014554	CGC	2	6	1013062	1013067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20014	NC_014554	CTT	2	6	1013082	1013087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20015	NC_014554	TAA	2	6	1013140	1013145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20016	NC_014554	TTA	2	6	1013154	1013159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20017	NC_014554	T	7	7	1013232	1013238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20018	NC_014554	AATT	2	8	1013240	1013247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20019	NC_014554	GT	3	6	1013276	1013281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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20021	NC_014554	TAA	2	6	1013363	1013368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20022	NC_014554	GTTA	2	8	1013374	1013381	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20023	NC_014554	TTTTTA	2	12	1013383	1013394	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20024	NC_014554	AGG	2	6	1013401	1013406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20034	NC_014554	CCA	2	6	1013755	1013760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20035	NC_014554	GAG	2	6	1013789	1013794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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20042	NC_014554	TAT	2	6	1014152	1014157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180119
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20052	NC_014554	GGC	2	6	1014713	1014718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180119
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20054	NC_014554	TAT	2	6	1014743	1014748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180119
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20087	NC_014554	GCA	2	6	1016828	1016833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180121
20088	NC_014554	ACC	2	6	1016885	1016890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20089	NC_014554	TAT	2	6	1016979	1016984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20093	NC_014554	TAT	2	6	1017191	1017196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180122
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20103	NC_014554	CCA	2	6	1017529	1017534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180122
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20119	NC_014554	TGG	2	6	1018329	1018334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180123
20120	NC_014554	CTT	2	6	1018341	1018346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180123
20121	NC_014554	GGCC	2	8	1018375	1018382	0 %	0 %	50 %	50 %	308180123
20122	NC_014554	TTA	2	6	1018447	1018452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180123
20123	NC_014554	GGAA	2	8	1018510	1018517	50 %	0 %	50 %	0 %	308180123
20124	NC_014554	A	6	6	1018524	1018529	100 %	0 %	0 %	0 %	308180123
20125	NC_014554	TGC	2	6	1018589	1018594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180123
20126	NC_014554	TAATGA	2	12	1018595	1018606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	308180123
20127	NC_014554	AAT	2	6	1018632	1018637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180123
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20129	NC_014554	TGG	2	6	1018748	1018753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180123
20130	NC_014554	TACT	2	8	1019115	1019122	25 %	50 %	0 %	25 %	308180123
20131	NC_014554	A	7	7	1019152	1019158	100 %	0 %	0 %	0 %	308180123
20132	NC_014554	TG	3	6	1019187	1019192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20133	NC_014554	CTG	2	6	1019202	1019207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20134	NC_014554	ACA	2	6	1019213	1019218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20135	NC_014554	T	6	6	1019306	1019311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20136	NC_014554	ATG	3	9	1019333	1019341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20137	NC_014554	TG	3	6	1019350	1019355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20138	NC_014554	AGT	2	6	1019374	1019379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20139	NC_014554	C	6	6	1019540	1019545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20140	NC_014554	ATT	2	6	1019642	1019647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20141	NC_014554	TGG	2	6	1019695	1019700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20142	NC_014554	AT	3	6	1019706	1019711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20143	NC_014554	AAG	2	6	1019856	1019861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180124
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20146	NC_014554	TGG	2	6	1019968	1019973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180124
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20152	NC_014554	CAT	2	6	1020122	1020127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180124
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20157	NC_014554	TAA	2	6	1020262	1020267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20158	NC_014554	ATT	2	6	1020340	1020345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20159	NC_014554	CA	3	6	1020403	1020408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20160	NC_014554	GTG	2	6	1020458	1020463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20161	NC_014554	A	6	6	1020524	1020529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20162	NC_014554	TGA	2	6	1020542	1020547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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20172	NC_014554	T	7	7	1021221	1021227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20219	NC_014554	AAT	2	6	1023899	1023904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180128
20220	NC_014554	CTA	2	6	1023913	1023918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180128
20221	NC_014554	TGG	2	6	1023976	1023981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180128
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20223	NC_014554	GGT	2	6	1024096	1024101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20224	NC_014554	CCGT	2	8	1024114	1024121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20225	NC_014554	ATG	2	6	1024161	1024166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20226	NC_014554	ACG	2	6	1024172	1024177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20227	NC_014554	TAAC	2	8	1024178	1024185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20228	NC_014554	ATG	2	6	1024189	1024194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20229	NC_014554	ATG	2	6	1024209	1024214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20230	NC_014554	GTTGCA	2	12	1024299	1024310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308180129
20231	NC_014554	GGT	2	6	1024338	1024343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180129
20232	NC_014554	ACG	2	6	1024531	1024536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180129
20233	NC_014554	ATC	2	6	1024562	1024567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180129
20234	NC_014554	ACCG	2	8	1024680	1024687	25 %	0 %	25 %	50 %	308180129
20235	NC_014554	TTGAT	2	10	1024808	1024817	20 %	60 %	20 %	0 %	308180129
20236	NC_014554	GAT	2	6	1024833	1024838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180129
20237	NC_014554	GGC	2	6	1025052	1025057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180129
20238	NC_014554	GC	3	6	1025056	1025061	0 %	0 %	50 %	50 %	308180129
20239	NC_014554	GGGTG	2	10	1025085	1025094	0 %	20 %	80 %	0 %	308180129
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20478	NC_014554	AAC	2	6	1036078	1036083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180139
20479	NC_014554	TGA	2	6	1036099	1036104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180139
20480	NC_014554	GATT	2	8	1036116	1036123	25 %	50 %	25 %	0 %	308180139
20481	NC_014554	GTTT	2	8	1036141	1036148	0 %	75 %	25 %	0 %	308180139
20482	NC_014554	TTAA	2	8	1036154	1036161	50 %	50 %	0 %	0 %	308180139
20483	NC_014554	CGT	2	6	1036171	1036176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180139
20484	NC_014554	TGA	2	6	1036216	1036221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180139
20485	NC_014554	TTA	2	6	1036354	1036359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180139
20486	NC_014554	CGT	2	6	1036391	1036396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180139
20487	NC_014554	A	8	8	1036398	1036405	100 %	0 %	0 %	0 %	308180139
20488	NC_014554	CT	6	12	1036436	1036447	0 %	50 %	0 %	50 %	308180139
20489	NC_014554	AAATT	2	10	1036533	1036542	60 %	40 %	0 %	0 %	308180139
20490	NC_014554	TGG	2	6	1036581	1036586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20491	NC_014554	ATT	2	6	1036638	1036643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180140
20492	NC_014554	TA	3	6	1036644	1036649	50 %	50 %	0 %	0 %	308180140
20493	NC_014554	CTG	2	6	1036685	1036690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180140
20494	NC_014554	CGA	2	6	1036743	1036748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180140
20495	NC_014554	AAAT	2	8	1036834	1036841	75 %	25 %	0 %	0 %	308180140
20496	NC_014554	AAC	2	6	1036885	1036890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180140
20497	NC_014554	AT	3	6	1036949	1036954	50 %	50 %	0 %	0 %	308180140
20498	NC_014554	T	6	6	1036954	1036959	0 %	100 %	0 %	0 %	308180140
20499	NC_014554	AT	3	6	1036995	1037000	50 %	50 %	0 %	0 %	308180140
20500	NC_014554	AGA	2	6	1037020	1037025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180140

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