MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014554	TGC	2	6	912871	912876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180021
18002	NC_014554	TTA	2	6	912879	912884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180021
18003	NC_014554	TGA	2	6	912889	912894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180021
18004	NC_014554	CA	3	6	912996	913001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18005	NC_014554	AGG	2	6	913011	913016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_014554	AAG	2	6	913083	913088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180022
18007	NC_014554	GTT	2	6	913127	913132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180022
18008	NC_014554	AACG	2	8	913168	913175	50 %	0 %	25 %	25 %	308180022
18009	NC_014554	CAAC	2	8	913248	913255	50 %	0 %	0 %	50 %	308180022
18010	NC_014554	TCG	2	6	913276	913281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180022
18011	NC_014554	GACT	2	8	913340	913347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18012	NC_014554	AGG	2	6	913351	913356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18013	NC_014554	GAA	2	6	913533	913538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180023
18014	NC_014554	GTAT	2	8	913654	913661	25 %	50 %	25 %	0 %	308180023
18015	NC_014554	CTT	2	6	913664	913669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180023
18016	NC_014554	TGA	2	6	913856	913861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180023
18017	NC_014554	GTT	2	6	913874	913879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180023
18018	NC_014554	A	6	6	913937	913942	100 %	0 %	0 %	0 %	308180024
18019	NC_014554	GTC	2	6	914013	914018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180024
18020	NC_014554	AAAC	2	8	914117	914124	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18021	NC_014554	AGG	2	6	914134	914139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_014554	ATG	2	6	914150	914155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180025
18023	NC_014554	GAT	2	6	914303	914308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180025
18024	NC_014554	CAT	2	6	914320	914325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180025
18025	NC_014554	TCT	2	6	914331	914336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308180025
18026	NC_014554	AACG	2	8	914354	914361	50 %	0 %	25 %	25 %	308180025
18027	NC_014554	ATC	2	6	914459	914464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180025
18028	NC_014554	AAG	2	6	914493	914498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180025
18029	NC_014554	AAG	2	6	914507	914512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180025
18030	NC_014554	GGC	2	6	914516	914521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180025
18031	NC_014554	ATTA	2	8	914548	914555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_014554	AAGT	2	8	914569	914576	50 %	25 %	25 %	0 %	308180026
18033	NC_014554	CTG	2	6	914609	914614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180026
18034	NC_014554	TGA	2	6	914742	914747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180026
18035	NC_014554	TAC	2	6	914772	914777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180026
18036	NC_014554	AAC	2	6	914791	914796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180026
18037	NC_014554	GCAAG	2	10	914868	914877	40 %	0 %	40 %	20 %	308180026
18038	NC_014554	AAGC	2	8	914986	914993	50 %	0 %	25 %	25 %	308180026
18039	NC_014554	TGC	2	6	915006	915011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180026
18040	NC_014554	CGTT	2	8	915024	915031	0 %	50 %	25 %	25 %	308180026
18041	NC_014554	TCG	2	6	915081	915086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180026
18042	NC_014554	AAGG	2	8	915088	915095	50 %	0 %	50 %	0 %	308180026
18043	NC_014554	AAT	2	6	915107	915112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180026
18044	NC_014554	AT	3	6	915136	915141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_014554	AAAAC	2	10	915174	915183	80 %	0 %	0 %	20 %	308180027
18046	NC_014554	CGT	2	6	915191	915196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180027
18047	NC_014554	CACG	2	8	915197	915204	25 %	0 %	25 %	50 %	308180027
18048	NC_014554	CTG	2	6	915228	915233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180027
18049	NC_014554	CAAA	2	8	915261	915268	75 %	0 %	0 %	25 %	308180027
18050	NC_014554	TGA	2	6	915289	915294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180027
18051	NC_014554	AAC	2	6	915350	915355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180027
18052	NC_014554	GTT	2	6	915386	915391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180027
18053	NC_014554	GC	3	6	915397	915402	0 %	0 %	50 %	50 %	308180027
18054	NC_014554	GAAAA	2	10	915407	915416	80 %	0 %	20 %	0 %	308180027
18055	NC_014554	CGT	2	6	915424	915429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180027
18056	NC_014554	AGG	2	6	915515	915520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_014554	AAT	2	6	915521	915526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_014554	TGT	2	6	915573	915578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180028
18059	NC_014554	GTT	2	6	915601	915606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180028
18060	NC_014554	GGT	2	6	915610	915615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180028
18061	NC_014554	TGC	2	6	915630	915635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180028
18062	NC_014554	AAG	2	6	915692	915697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180028
18063	NC_014554	GCT	2	6	915727	915732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180028
18064	NC_014554	TGGT	2	8	915758	915765	0 %	50 %	50 %	0 %	308180028
18065	NC_014554	ACC	2	6	915766	915771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180028
18066	NC_014554	GGT	2	6	915799	915804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180028
18067	NC_014554	CAT	2	6	915810	915815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180028
18068	NC_014554	AGCC	2	8	915821	915828	25 %	0 %	25 %	50 %	308180028
18069	NC_014554	TGG	2	6	915852	915857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180028
18070	NC_014554	GAT	2	6	915892	915897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180028
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18072	NC_014554	CTG	2	6	915977	915982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180028
18073	NC_014554	GCT	2	6	915991	915996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180028
18074	NC_014554	ACAA	2	8	916038	916045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18075	NC_014554	TGC	2	6	916079	916084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180029
18076	NC_014554	GTT	2	6	916149	916154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180029
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18079	NC_014554	ATC	2	6	916218	916223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180029
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18081	NC_014554	CTA	2	6	916254	916259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_014554	CGT	2	6	916306	916311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180030
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18088	NC_014554	TGGTAA	2	12	916587	916598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180030
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18094	NC_014554	GTG	2	6	916872	916877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180031
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18102	NC_014554	TTGT	2	8	917339	917346	0 %	75 %	25 %	0 %	308180031
18103	NC_014554	CTTG	2	8	917359	917366	0 %	50 %	25 %	25 %	308180031
18104	NC_014554	ATC	2	6	917372	917377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180031
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18107	NC_014554	TACC	2	8	917465	917472	25 %	25 %	0 %	50 %	308180031
18108	NC_014554	CGA	2	6	917619	917624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180031
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18111	NC_014554	CGGT	2	8	917802	917809	0 %	25 %	50 %	25 %	308180031
18112	NC_014554	ATT	2	6	917842	917847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308180031
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18117	NC_014554	A	6	6	918037	918042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_014554	CAA	2	6	918048	918053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180032
18119	NC_014554	AGA	2	6	918105	918110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180032
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18121	NC_014554	AAG	2	6	918200	918205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180032
18122	NC_014554	GAA	2	6	918353	918358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180032
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18124	NC_014554	TTG	2	6	918411	918416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180032
18125	NC_014554	CGGT	2	8	918427	918434	0 %	25 %	50 %	25 %	308180032
18126	NC_014554	ACA	2	6	918474	918479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180032
18127	NC_014554	TG	4	8	918505	918512	0 %	50 %	50 %	0 %	308180032
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18133	NC_014554	T	7	7	918788	918794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18134	NC_014554	ATA	2	6	918858	918863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18136	NC_014554	TACC	2	8	919078	919085	25 %	25 %	0 %	50 %	308180033
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18138	NC_014554	A	6	6	919124	919129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18142	NC_014554	TAATT	2	10	919250	919259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18143	NC_014554	AGA	2	6	919371	919376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180034
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18244	NC_014554	CGG	2	6	923588	923593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180040
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18363	NC_014554	GCG	2	6	929181	929186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180045
18364	NC_014554	GTC	2	6	929239	929244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180045
18365	NC_014554	GAC	2	6	929255	929260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180045
18366	NC_014554	TTAA	2	8	929415	929422	50 %	50 %	0 %	0 %	308180045
18367	NC_014554	AGC	2	6	929459	929464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180045
18368	NC_014554	TTAC	2	8	929559	929566	25 %	50 %	0 %	25 %	308180046
18369	NC_014554	ACG	2	6	929750	929755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308180046
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18372	NC_014554	GAA	2	6	929828	929833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180046
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18374	NC_014554	GCG	2	6	929983	929988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308180046
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18377	NC_014554	ATA	2	6	930171	930176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308180046
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18382	NC_014554	TTTTA	2	10	930495	930504	20 %	80 %	0 %	0 %	308180047
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18402	NC_014554	CGGT	2	8	931598	931605	0 %	25 %	50 %	25 %	308180048
18403	NC_014554	T	6	6	931860	931865	0 %	100 %	0 %	0 %	308180048
18404	NC_014554	TGG	2	6	931886	931891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180048
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18409	NC_014554	GGA	2	6	932157	932162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18434	NC_014554	T	7	7	933091	933097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18435	NC_014554	GTT	2	6	933098	933103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18436	NC_014554	A	6	6	933111	933116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18437	NC_014554	CTGG	2	8	933177	933184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18438	NC_014554	AGA	2	6	933343	933348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308180051
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18459	NC_014554	GGC	2	6	934234	934239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18463	NC_014554	AGC	2	6	934320	934325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18465	NC_014554	GTA	2	6	934414	934419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18474	NC_014554	TGGG	2	8	934768	934775	0 %	25 %	75 %	0 %	308180052
18475	NC_014554	GGT	2	6	934877	934882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180052
18476	NC_014554	AGT	2	6	934932	934937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180052
18477	NC_014554	GGTCG	2	10	934997	935006	0 %	20 %	60 %	20 %	308180052
18478	NC_014554	TGG	2	6	935082	935087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180052
18479	NC_014554	ACC	2	6	935105	935110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308180052
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18481	NC_014554	GGT	2	6	935213	935218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180052
18482	NC_014554	AAC	2	6	935240	935245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308180052
18483	NC_014554	ATC	2	6	935256	935261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308180052
18484	NC_014554	GTC	3	9	935265	935273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180052
18485	NC_014554	GTT	2	6	935278	935283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308180052
18486	NC_014554	TGG	2	6	935329	935334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308180052
18487	NC_014554	A	6	6	935422	935427	100 %	0 %	0 %	0 %	308180052
18488	NC_014554	TGGT	2	8	935455	935462	0 %	50 %	50 %	0 %	308180052
18489	NC_014554	GTCG	2	8	935475	935482	0 %	25 %	50 %	25 %	308180052
18490	NC_014554	CTAG	2	8	935490	935497	25 %	25 %	25 %	25 %	308180052
18491	NC_014554	CCG	2	6	935499	935504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308180052
18492	NC_014554	CTC	2	6	935582	935587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18493	NC_014554	GTTA	2	8	935646	935653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18494	NC_014554	GAAA	2	8	935656	935663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_014554	GCTG	2	8	935829	935836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18496	NC_014554	GGA	2	6	935845	935850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18497	NC_014554	CTG	2	6	935942	935947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308180053
18498	NC_014554	GGCT	2	8	936003	936010	0 %	25 %	50 %	25 %	308180053
18499	NC_014554	GAT	2	6	936022	936027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308180053
18500	NC_014554	TGAA	2	8	936069	936076	50 %	25 %	25 %	0 %	308180053

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