MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_014554	CAT	2	6	761330	761335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179887
15003	NC_014554	TGA	2	6	761383	761388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179887
15004	NC_014554	GTT	2	6	761412	761417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179887
15005	NC_014554	AGTC	2	8	761423	761430	25 %	25 %	25 %	25 %	308179887
15006	NC_014554	TTAGC	2	10	761439	761448	20 %	40 %	20 %	20 %	308179887
15007	NC_014554	GTT	2	6	761468	761473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_014554	T	6	6	761497	761502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_014554	TA	3	6	761568	761573	50 %	50 %	0 %	0 %	308179888
15010	NC_014554	ATAA	2	8	761591	761598	75 %	25 %	0 %	0 %	308179888
15011	NC_014554	TAA	3	9	761596	761604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179888
15012	NC_014554	GTG	2	6	761665	761670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179888
15013	NC_014554	CAC	2	6	761851	761856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179888
15014	NC_014554	GCC	2	6	761864	761869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179888
15015	NC_014554	AAG	2	6	761901	761906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179888
15016	NC_014554	GTTT	2	8	761937	761944	0 %	75 %	25 %	0 %	308179888
15017	NC_014554	A	7	7	761988	761994	100 %	0 %	0 %	0 %	308179888
15018	NC_014554	GTT	2	6	762019	762024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179888
15019	NC_014554	CGA	2	6	762052	762057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179888
15020	NC_014554	AAT	2	6	762077	762082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179888
15021	NC_014554	CGA	2	6	762160	762165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_014554	GCA	2	6	762234	762239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_014554	CCT	2	6	762240	762245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15024	NC_014554	CCA	2	6	762246	762251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15025	NC_014554	AGG	2	6	762398	762403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_014554	GT	3	6	762404	762409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_014554	CTG	2	6	762453	762458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179889
15028	NC_014554	CG	3	6	762475	762480	0 %	0 %	50 %	50 %	308179889
15029	NC_014554	TTA	2	6	762609	762614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179889
15030	NC_014554	GCA	3	9	762653	762661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179889
15031	NC_014554	TTA	2	6	762716	762721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179889
15032	NC_014554	CAA	2	6	762779	762784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179889
15033	NC_014554	ATG	2	6	762970	762975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179889
15034	NC_014554	A	6	6	763031	763036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_014554	CAC	2	6	763097	763102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179890
15036	NC_014554	TAAG	2	8	763202	763209	50 %	25 %	25 %	0 %	308179890
15037	NC_014554	ACT	2	6	763212	763217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
15038	NC_014554	CAT	2	6	763222	763227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
15039	NC_014554	TAA	2	6	763238	763243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179890
15040	NC_014554	GTT	2	6	763245	763250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179890
15041	NC_014554	TCA	2	6	763311	763316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
15042	NC_014554	ATC	2	6	763337	763342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
15043	NC_014554	CAT	2	6	763448	763453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
15044	NC_014554	ACT	2	6	763794	763799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179890
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15046	NC_014554	CCA	3	9	763914	763922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179890
15047	NC_014554	CTG	2	6	763937	763942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179890
15048	NC_014554	TCGT	2	8	763963	763970	0 %	50 %	25 %	25 %	308179890
15049	NC_014554	GAT	2	6	764075	764080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179890
15050	NC_014554	TGA	2	6	764137	764142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179890
15051	NC_014554	GGC	2	6	764162	764167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179890
15052	NC_014554	CTT	2	6	764173	764178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179890
15053	NC_014554	GAA	2	6	764204	764209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179890
15054	NC_014554	GGGTT	2	10	764217	764226	0 %	40 %	60 %	0 %	308179890
15055	NC_014554	ATT	2	6	764264	764269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179890
15056	NC_014554	ATG	2	6	764340	764345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179890
15057	NC_014554	CTT	2	6	764347	764352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179890
15058	NC_014554	ACTC	2	8	764383	764390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15059	NC_014554	GGA	2	6	764456	764461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_014554	GCG	2	6	764489	764494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179891
15061	NC_014554	TAG	2	6	764515	764520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179891
15062	NC_014554	GA	3	6	764626	764631	50 %	0 %	50 %	0 %	308179891
15063	NC_014554	AGA	2	6	764663	764668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179891
15064	NC_014554	GGTG	2	8	764681	764688	0 %	25 %	75 %	0 %	308179891
15065	NC_014554	ATT	2	6	764751	764756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179891
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15069	NC_014554	GAG	2	6	765033	765038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_014554	ATTT	2	8	765057	765064	25 %	75 %	0 %	0 %	308179892
15071	NC_014554	ATT	2	6	765066	765071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179892
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15073	NC_014554	GAT	2	6	765101	765106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179892
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15078	NC_014554	TTG	2	6	765262	765267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179892
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15081	NC_014554	G	7	7	765367	765373	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15084	NC_014554	CTT	2	6	765506	765511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_014554	ACA	2	6	765639	765644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_014554	AAG	2	6	765653	765658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_014554	TGA	3	9	765666	765674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179893
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15089	NC_014554	TGT	2	6	765787	765792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179893
15090	NC_014554	AAG	2	6	765836	765841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179893
15091	NC_014554	TGCT	2	8	765846	765853	0 %	50 %	25 %	25 %	308179893
15092	NC_014554	T	6	6	765853	765858	0 %	100 %	0 %	0 %	308179893
15093	NC_014554	A	6	6	765860	765865	100 %	0 %	0 %	0 %	308179893
15094	NC_014554	TTC	2	6	765894	765899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_014554	CAT	2	6	765931	765936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_014554	CAA	2	6	766105	766110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_014554	CAGT	2	8	766147	766154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15098	NC_014554	TGA	2	6	766173	766178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_014554	TTGA	2	8	766194	766201	25 %	50 %	25 %	0 %	308179894
15100	NC_014554	CGA	2	6	766232	766237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179894
15101	NC_014554	TCGATG	2	12	766255	766266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308179894
15102	NC_014554	GTG	2	6	766383	766388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179894
15103	NC_014554	AGT	2	6	766397	766402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179894
15104	NC_014554	AAG	2	6	766509	766514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179894
15105	NC_014554	GGC	2	6	766541	766546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179894
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15107	NC_014554	CGC	2	6	766647	766652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179894
15108	NC_014554	TGAGC	2	10	766661	766670	20 %	20 %	40 %	20 %	308179894
15109	NC_014554	CTG	2	6	766696	766701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179894
15110	NC_014554	TAG	3	9	766702	766710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179894
15111	NC_014554	GACC	2	8	766736	766743	25 %	0 %	25 %	50 %	308179894
15112	NC_014554	TA	3	6	766805	766810	50 %	50 %	0 %	0 %	308179894
15113	NC_014554	A	6	6	766816	766821	100 %	0 %	0 %	0 %	308179894
15114	NC_014554	AGT	2	6	766903	766908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179895
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15117	NC_014554	CGT	2	6	767047	767052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179895
15118	NC_014554	ACGTA	2	10	767063	767072	40 %	20 %	20 %	20 %	308179895
15119	NC_014554	CTT	2	6	767137	767142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179895
15120	NC_014554	AAT	2	6	767180	767185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179895
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15122	NC_014554	TCA	2	6	767244	767249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179895
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15484	NC_014554	GAT	2	6	787141	787146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15485	NC_014554	GCAT	2	8	787266	787273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15486	NC_014554	GTT	2	6	787309	787314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15487	NC_014554	T	6	6	787355	787360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15488	NC_014554	CTT	2	6	787384	787389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15489	NC_014554	ACAGAT	2	12	787488	787499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15490	NC_014554	CCCAA	2	10	787512	787521	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15491	NC_014554	T	6	6	787522	787527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_014554	T	6	6	787554	787559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15493	NC_014554	TAG	2	6	787577	787582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_014554	T	6	6	787611	787616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_014554	ATA	2	6	787652	787657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_014554	TCT	2	6	787678	787683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15497	NC_014554	TG	3	6	787701	787706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15498	NC_014554	CAT	2	6	787714	787719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15499	NC_014554	TAG	2	6	787765	787770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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