MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_014554	ATG	2	6	712675	712680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179844
14003	NC_014554	CGG	2	6	712683	712688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179844
14004	NC_014554	CAA	2	6	712767	712772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179844
14005	NC_014554	GAT	2	6	712785	712790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179844
14006	NC_014554	CAA	2	6	712791	712796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179844
14007	NC_014554	T	7	7	712874	712880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_014554	CAGC	2	8	712897	712904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14009	NC_014554	TCT	2	6	712929	712934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_014554	CGC	2	6	713118	713123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179845
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14012	NC_014554	GTT	2	6	713333	713338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_014554	TAT	2	6	713343	713348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_014554	AAC	2	6	713355	713360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_014554	AGC	2	6	713433	713438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_014554	CGTTG	2	10	713556	713565	0 %	40 %	40 %	20 %	308179846
14017	NC_014554	CGT	2	6	713573	713578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179846
14018	NC_014554	TGT	2	6	713608	713613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179846
14019	NC_014554	TGA	2	6	713689	713694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179846
14020	NC_014554	AGCCC	2	10	713750	713759	20 %	0 %	20 %	60 %	308179846
14021	NC_014554	TGGC	2	8	713907	713914	0 %	25 %	50 %	25 %	308179846
14022	NC_014554	AAC	2	6	713936	713941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179846
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14025	NC_014554	AGA	2	6	714049	714054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_014554	TGAT	2	8	714121	714128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14030	NC_014554	TGT	2	6	714326	714331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14033	NC_014554	CCGA	2	8	714461	714468	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_014554	GA	3	6	714467	714472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_014554	TGAA	2	8	714692	714699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_014554	TGAA	2	8	714701	714708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_014554	TAA	2	6	714823	714828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_014554	CAG	2	6	714892	714897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14040	NC_014554	GTG	2	6	714951	714956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_014554	ATA	2	6	715041	715046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_014554	GCC	2	6	715060	715065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_014554	TAG	2	6	715219	715224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14045	NC_014554	TAA	2	6	715290	715295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14047	NC_014554	TAA	2	6	715332	715337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_014554	GTG	2	6	715370	715375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14050	NC_014554	TTGGG	2	10	715504	715513	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_014554	GTT	2	6	715523	715528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_014554	ACG	2	6	715581	715586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14055	NC_014554	TTA	2	6	715652	715657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_014554	TAC	2	6	715675	715680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14058	NC_014554	GA	3	6	715783	715788	50 %	0 %	50 %	0 %	308179847
14059	NC_014554	ATC	2	6	715791	715796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179847
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14064	NC_014554	ACC	2	6	716030	716035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179847
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14102	NC_014554	TCA	3	9	718415	718423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179848
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14106	NC_014554	TGTAT	2	10	718525	718534	20 %	60 %	20 %	0 %	308179848
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14111	NC_014554	TG	3	6	718685	718690	0 %	50 %	50 %	0 %	308179848
14112	NC_014554	TCA	2	6	718742	718747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179848
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14123	NC_014554	TAA	2	6	719044	719049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179849
14124	NC_014554	GTT	2	6	719052	719057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179849
14125	NC_014554	GC	3	6	719103	719108	0 %	0 %	50 %	50 %	308179849
14126	NC_014554	GTAA	2	8	719196	719203	50 %	25 %	25 %	0 %	308179849
14127	NC_014554	CGT	2	6	719232	719237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179849
14128	NC_014554	GTG	2	6	719284	719289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179849
14129	NC_014554	GCT	2	6	719384	719389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179849
14130	NC_014554	CTT	2	6	719439	719444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179849
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14132	NC_014554	GTA	2	6	719508	719513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179849
14133	NC_014554	TAA	2	6	719520	719525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179849
14134	NC_014554	GTA	2	6	719526	719531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179849
14135	NC_014554	TCT	2	6	719555	719560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179849
14136	NC_014554	TCA	2	6	719561	719566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179849
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14143	NC_014554	AGGT	2	8	720005	720012	25 %	25 %	50 %	0 %	308179849
14144	NC_014554	ACT	2	6	720019	720024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179849
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14146	NC_014554	GAAC	2	8	720248	720255	50 %	0 %	25 %	25 %	308179849
14147	NC_014554	ATC	2	6	720317	720322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179849
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14150	NC_014554	GTTA	2	8	720430	720437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14151	NC_014554	TAG	2	6	720449	720454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_014554	CAT	2	6	720511	720516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14154	NC_014554	TGATG	2	10	720549	720558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14155	NC_014554	CTAAC	2	10	720587	720596	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14156	NC_014554	TGG	2	6	720736	720741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179850
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14165	NC_014554	TGG	2	6	721274	721279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179850
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14168	NC_014554	GTCTC	2	10	721484	721493	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14172	NC_014554	GGA	2	6	721553	721558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14173	NC_014554	ATT	2	6	721685	721690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179851
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14183	NC_014554	CTT	2	6	722194	722199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14184	NC_014554	AAG	2	6	722219	722224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14191	NC_014554	GCTG	2	8	722842	722849	0 %	25 %	50 %	25 %	308179853
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14222	NC_014554	TGA	2	6	724214	724219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14223	NC_014554	TCA	2	6	724329	724334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14224	NC_014554	TAA	2	6	724433	724438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14225	NC_014554	GGT	2	6	724459	724464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14226	NC_014554	GGT	2	6	724468	724473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14227	NC_014554	ATA	2	6	724489	724494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14228	NC_014554	A	7	7	724511	724517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14229	NC_014554	T	9	9	724522	724530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14230	NC_014554	A	6	6	724531	724536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14231	NC_014554	CGT	2	6	724556	724561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14232	NC_014554	GATA	2	8	724603	724610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14233	NC_014554	A	6	6	724640	724645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_014554	AT	3	6	724683	724688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_014554	AGG	2	6	724692	724697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_014554	GAA	2	6	724860	724865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179854
14237	NC_014554	CTA	2	6	725020	725025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179854
14238	NC_014554	CTT	2	6	725042	725047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179854
14239	NC_014554	AATG	2	8	725054	725061	50 %	25 %	25 %	0 %	308179854
14240	NC_014554	CTG	2	6	725110	725115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179854
14241	NC_014554	GAT	2	6	725126	725131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179854
14242	NC_014554	TGA	2	6	725135	725140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179854
14243	NC_014554	TTGG	2	8	725200	725207	0 %	50 %	50 %	0 %	308179854
14244	NC_014554	AACG	2	8	725231	725238	50 %	0 %	25 %	25 %	308179854
14245	NC_014554	GCT	2	6	725310	725315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179854
14246	NC_014554	TTGGCG	2	12	725335	725346	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	308179854
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