MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014554	TCT	2	6	659385	659390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_014554	TAAAA	2	10	659408	659417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_014554	AGG	2	6	659435	659440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_014554	CGT	2	6	659505	659510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13005	NC_014554	GTT	2	6	659547	659552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179802
13006	NC_014554	TTG	2	6	659580	659585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179802
13007	NC_014554	ACTCA	2	10	659605	659614	40 %	20 %	0 %	40 %	308179802
13008	NC_014554	CGA	2	6	659645	659650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13009	NC_014554	GTT	2	6	659658	659663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179802
13010	NC_014554	ACG	2	6	659725	659730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13011	NC_014554	CTG	2	6	659830	659835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13012	NC_014554	CTG	2	6	659905	659910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13013	NC_014554	TAC	2	6	659918	659923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179802
13014	NC_014554	ACT	2	6	659988	659993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179802
13015	NC_014554	GTG	2	6	660040	660045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179802
13016	NC_014554	TGC	2	6	660056	660061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13017	NC_014554	TGC	2	6	660065	660070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13018	NC_014554	TGC	2	6	660101	660106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13019	NC_014554	GTGTTG	2	12	660166	660177	0 %	50 %	50 %	0 %	308179802
13020	NC_014554	CTG	2	6	660226	660231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179802
13021	NC_014554	CGC	2	6	660242	660247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179802
13022	NC_014554	AAG	2	6	660252	660257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179802
13023	NC_014554	TAC	2	6	660323	660328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179802
13024	NC_014554	GTAC	2	8	660441	660448	25 %	25 %	25 %	25 %	308179802
13025	NC_014554	CT	3	6	660466	660471	0 %	50 %	0 %	50 %	308179802
13026	NC_014554	CGG	2	6	660520	660525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_014554	G	6	6	660524	660529	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_014554	CTC	2	6	660538	660543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_014554	T	7	7	660550	660556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_014554	CAG	2	6	660562	660567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_014554	AGG	2	6	660579	660584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_014554	A	6	6	660633	660638	100 %	0 %	0 %	0 %	308179803
13033	NC_014554	GAC	2	6	660690	660695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13034	NC_014554	TCG	2	6	660703	660708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13035	NC_014554	ATG	2	6	660742	660747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179803
13036	NC_014554	GAC	2	6	660792	660797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13037	NC_014554	AAG	2	6	660798	660803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179803
13038	NC_014554	TTA	2	6	660843	660848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179803
13039	NC_014554	AAC	2	6	660886	660891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179803
13040	NC_014554	CAA	2	6	660905	660910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179803
13041	NC_014554	ACG	2	6	660916	660921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13042	NC_014554	GTT	2	6	660933	660938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13043	NC_014554	GTT	2	6	660960	660965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13044	NC_014554	GGT	2	6	661203	661208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179803
13045	NC_014554	ATC	3	9	661266	661274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179803
13046	NC_014554	GGT	2	6	661275	661280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179803
13047	NC_014554	TGC	2	6	661301	661306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13048	NC_014554	TTG	2	6	661333	661338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13049	NC_014554	ATC	2	6	661368	661373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179803
13050	NC_014554	GTT	2	6	661452	661457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13051	NC_014554	GAA	2	6	661512	661517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179803
13052	NC_014554	GTT	2	6	661548	661553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13053	NC_014554	TTG	2	6	661651	661656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179803
13054	NC_014554	GTG	2	6	661657	661662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179803
13055	NC_014554	TTGGCG	2	12	661690	661701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	308179803
13056	NC_014554	TGG	2	6	661724	661729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179803
13057	NC_014554	TGC	2	6	661775	661780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179803
13058	NC_014554	AAT	2	6	661792	661797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179803
13059	NC_014554	AAGG	2	8	661809	661816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_014554	TAT	2	6	661834	661839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179804
13061	NC_014554	AGCTTT	2	12	661876	661887	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308179804
13062	NC_014554	TGC	2	6	661942	661947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179804
13063	NC_014554	TGC	2	6	662005	662010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179804
13064	NC_014554	GTT	2	6	662093	662098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179804
13065	NC_014554	AAC	2	6	662217	662222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179804
13066	NC_014554	GCT	2	6	662267	662272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179804
13067	NC_014554	AAGT	2	8	662295	662302	50 %	25 %	25 %	0 %	308179804
13068	NC_014554	GAA	2	6	662372	662377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179804
13069	NC_014554	GTT	2	6	662387	662392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179804
13070	NC_014554	AAG	2	6	662421	662426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179804
13071	NC_014554	GGT	2	6	662453	662458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179804
13072	NC_014554	GAT	2	6	662498	662503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179804
13073	NC_014554	GGT	2	6	662510	662515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179804
13074	NC_014554	GGT	2	6	662522	662527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179804
13075	NC_014554	ATTC	2	8	662544	662551	25 %	50 %	0 %	25 %	308179804
13076	NC_014554	TAA	2	6	662579	662584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179804
13077	NC_014554	TTGA	2	8	662598	662605	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_014554	GA	3	6	662652	662657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_014554	TAT	2	6	662668	662673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179805
13080	NC_014554	GTTGAA	2	12	662723	662734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179805
13081	NC_014554	TTG	2	6	662898	662903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179805
13082	NC_014554	TGC	3	9	663022	663030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179805
13083	NC_014554	ATG	2	6	663098	663103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179805
13084	NC_014554	TGG	2	6	663115	663120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179805
13085	NC_014554	CAA	2	6	663130	663135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179805
13086	NC_014554	CTT	2	6	663177	663182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179805
13087	NC_014554	AAG	2	6	663189	663194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13088	NC_014554	GAAC	2	8	663241	663248	50 %	0 %	25 %	25 %	308179805
13089	NC_014554	CTG	2	6	663261	663266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179805
13090	NC_014554	GGT	2	6	663278	663283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179805
13091	NC_014554	GAA	2	6	663298	663303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13092	NC_014554	GAA	2	6	663308	663313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13093	NC_014554	ATTGCC	2	12	663371	663382	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308179805
13094	NC_014554	GAA	2	6	663413	663418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13095	NC_014554	GAA	2	6	663473	663478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13096	NC_014554	TTG	2	6	663501	663506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179805
13097	NC_014554	AAC	2	6	663548	663553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179805
13098	NC_014554	GAC	2	6	663611	663616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179805
13099	NC_014554	AAG	2	6	663741	663746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179805
13100	NC_014554	CAAT	2	8	663880	663887	50 %	25 %	0 %	25 %	308179805
13101	NC_014554	CGT	2	6	664011	664016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_014554	TAT	2	6	664036	664041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_014554	GACG	2	8	664082	664089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_014554	TAGAA	2	10	664098	664107	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_014554	GAGC	2	8	664128	664135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13106	NC_014554	CAA	2	6	664154	664159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_014554	A	6	6	664224	664229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_014554	GCC	2	6	664286	664291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179806
13109	NC_014554	ACCC	2	8	664306	664313	25 %	0 %	0 %	75 %	308179806
13110	NC_014554	TAT	2	6	664361	664366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179806
13111	NC_014554	CTA	2	6	664462	664467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179806
13112	NC_014554	TTG	2	6	664650	664655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179806
13113	NC_014554	AC	3	6	664681	664686	50 %	0 %	0 %	50 %	308179806
13114	NC_014554	GTG	2	6	664746	664751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179806
13115	NC_014554	GCC	2	6	664775	664780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179806
13116	NC_014554	AAAC	2	8	664793	664800	75 %	0 %	0 %	25 %	308179806
13117	NC_014554	ATG	2	6	664833	664838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179806
13118	NC_014554	GAC	2	6	664880	664885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179806
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13120	NC_014554	TTA	2	6	664913	664918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179806
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13241	NC_014554	TGG	2	6	670753	670758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_014554	GGAC	2	8	670770	670777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13243	NC_014554	AT	3	6	670788	670793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13362	NC_014554	CTG	2	6	678682	678687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179812
13363	NC_014554	AC	3	6	678688	678693	50 %	0 %	0 %	50 %	308179812
13364	NC_014554	CAA	2	6	678726	678731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179812
13365	NC_014554	GTA	2	6	678738	678743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179812
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13368	NC_014554	CTG	3	9	678905	678913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13369	NC_014554	TGA	2	6	678942	678947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13370	NC_014554	TCA	2	6	679022	679027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13372	NC_014554	TGA	2	6	679077	679082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13374	NC_014554	A	6	6	679107	679112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13375	NC_014554	A	6	6	679117	679122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13377	NC_014554	TCG	2	6	679196	679201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13378	NC_014554	TGT	2	6	679230	679235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179813
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13473	NC_014554	AATC	2	8	685028	685035	50 %	25 %	0 %	25 %	308179819
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13480	NC_014554	CTG	2	6	685519	685524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179820
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