MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_014554	TGAC	2	8	558307	558314	25 %	25 %	25 %	25 %	308179710
11002	NC_014554	ACTG	2	8	558400	558407	25 %	25 %	25 %	25 %	308179710
11003	NC_014554	CTTT	2	8	558490	558497	0 %	75 %	0 %	25 %	308179710
11004	NC_014554	GTC	2	6	558526	558531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179710
11005	NC_014554	TTG	2	6	558580	558585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179710
11006	NC_014554	AGC	2	6	558732	558737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179710
11007	NC_014554	TTG	2	6	558771	558776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179710
11008	NC_014554	CTGATT	2	12	558822	558833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308179710
11009	NC_014554	TTG	2	6	558846	558851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179710
11010	NC_014554	TTGG	2	8	558910	558917	0 %	50 %	50 %	0 %	308179710
11011	NC_014554	TGT	2	6	558921	558926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179710
11012	NC_014554	GCTT	2	8	558940	558947	0 %	50 %	25 %	25 %	308179710
11013	NC_014554	TGT	2	6	558973	558978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179710
11014	NC_014554	ACT	2	6	558981	558986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179710
11015	NC_014554	T	6	6	558993	558998	0 %	100 %	0 %	0 %	308179710
11016	NC_014554	GCT	2	6	559014	559019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179710
11017	NC_014554	ATT	2	6	559065	559070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179710
11018	NC_014554	TCA	2	6	559129	559134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179710
11019	NC_014554	GGCC	2	8	559176	559183	0 %	0 %	50 %	50 %	308179710
11020	NC_014554	GCC	2	6	559190	559195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179710
11021	NC_014554	ATA	2	6	559253	559258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179710
11022	NC_014554	TCC	2	6	559288	559293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308179711
11023	NC_014554	CGC	2	6	559326	559331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179711
11024	NC_014554	CGGTAT	2	12	559442	559453	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	308179711
11025	NC_014554	ATT	2	6	559464	559469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179711
11026	NC_014554	AGTTTG	2	12	559494	559505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	308179711
11027	NC_014554	AGC	2	6	559515	559520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11028	NC_014554	CTG	2	6	559528	559533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11029	NC_014554	GCTT	2	8	559543	559550	0 %	50 %	25 %	25 %	308179711
11030	NC_014554	AGC	2	6	559626	559631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11031	NC_014554	GGC	2	6	559638	559643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179711
11032	NC_014554	TGA	2	6	559662	559667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179711
11033	NC_014554	CGT	2	6	559676	559681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11034	NC_014554	GTT	2	6	559697	559702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179711
11035	NC_014554	GGC	2	6	559812	559817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179711
11036	NC_014554	AGC	2	6	559824	559829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11037	NC_014554	GGC	2	6	559878	559883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179711
11038	NC_014554	TTG	2	6	559884	559889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179711
11039	NC_014554	ACG	2	6	559936	559941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179711
11040	NC_014554	T	6	6	559945	559950	0 %	100 %	0 %	0 %	308179711
11041	NC_014554	TCC	2	6	559969	559974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_014554	ACT	2	6	560101	560106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_014554	TAG	3	9	560127	560135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_014554	TTA	2	6	560187	560192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_014554	ATA	2	6	560231	560236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_014554	AACA	2	8	560238	560245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11047	NC_014554	T	7	7	560260	560266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_014554	ATC	2	6	560316	560321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179712
11049	NC_014554	ATT	2	6	560327	560332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11050	NC_014554	GAAG	2	8	560381	560388	50 %	0 %	50 %	0 %	308179712
11051	NC_014554	GC	3	6	560395	560400	0 %	0 %	50 %	50 %	308179712
11052	NC_014554	GCTT	2	8	560414	560421	0 %	50 %	25 %	25 %	308179712
11053	NC_014554	TGG	2	6	560430	560435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179712
11054	NC_014554	TAT	2	6	560462	560467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11055	NC_014554	TGGA	2	8	560552	560559	25 %	25 %	50 %	0 %	308179712
11056	NC_014554	GGT	2	6	560583	560588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179712
11057	NC_014554	TCG	2	6	560782	560787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11058	NC_014554	GTG	2	6	560788	560793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179712
11059	NC_014554	TTC	2	6	560844	560849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179712
11060	NC_014554	CGT	2	6	560870	560875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11061	NC_014554	TG	3	6	560913	560918	0 %	50 %	50 %	0 %	308179712
11062	NC_014554	TTC	2	6	560922	560927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179712
11063	NC_014554	TTA	2	6	560928	560933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11064	NC_014554	GGT	2	6	561027	561032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179712
11065	NC_014554	CTA	2	6	561128	561133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179712
11066	NC_014554	TAT	2	6	561134	561139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
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11069	NC_014554	TTA	2	6	561361	561366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11070	NC_014554	CAG	2	6	561374	561379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11071	NC_014554	TAT	3	9	561380	561388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11072	NC_014554	CTT	2	6	561392	561397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179712
11073	NC_014554	CTG	2	6	561421	561426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11074	NC_014554	A	6	6	561435	561440	100 %	0 %	0 %	0 %	308179712
11075	NC_014554	CTG	2	6	561465	561470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11076	NC_014554	TCG	2	6	561499	561504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11077	NC_014554	ATG	2	6	561508	561513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179712
11078	NC_014554	TTA	2	6	561581	561586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11079	NC_014554	TCA	2	6	561695	561700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179712
11080	NC_014554	TTC	2	6	561726	561731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179712
11081	NC_014554	ATT	2	6	561792	561797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11082	NC_014554	GATG	2	8	561845	561852	25 %	25 %	50 %	0 %	308179712
11083	NC_014554	GGC	2	6	561885	561890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179712
11084	NC_014554	ATT	2	6	561999	562004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179712
11085	NC_014554	GAA	2	6	562164	562169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179712
11086	NC_014554	T	6	6	562368	562373	0 %	100 %	0 %	0 %	308179712
11087	NC_014554	ACC	2	6	562423	562428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179712
11088	NC_014554	ATC	2	6	562465	562470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179712
11089	NC_014554	GAC	2	6	562472	562477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179712
11090	NC_014554	A	6	6	562642	562647	100 %	0 %	0 %	0 %	308179712
11091	NC_014554	ATTTA	2	10	562654	562663	40 %	60 %	0 %	0 %	308179712
11092	NC_014554	GTT	2	6	562847	562852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179712
11093	NC_014554	AGTA	2	8	562887	562894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_014554	ATG	2	6	562937	562942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_014554	ATG	2	6	562952	562957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_014554	ATG	2	6	562981	562986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_014554	ATT	2	6	563038	563043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179713
11098	NC_014554	TCA	2	6	563101	563106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179713
11099	NC_014554	CGG	2	6	563162	563167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179713
11100	NC_014554	TCG	2	6	563191	563196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179713
11101	NC_014554	TGT	2	6	563210	563215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179713
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11103	NC_014554	CCA	2	6	563440	563445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179713
11104	NC_014554	A	6	6	563591	563596	100 %	0 %	0 %	0 %	308179713
11105	NC_014554	GAA	2	6	563784	563789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179714
11106	NC_014554	GAC	2	6	563826	563831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179714
11107	NC_014554	TCA	2	6	563882	563887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179714
11108	NC_014554	TTG	2	6	563893	563898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179714
11109	NC_014554	TCA	2	6	563926	563931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179714
11110	NC_014554	ACCA	2	8	563933	563940	50 %	0 %	0 %	50 %	308179714
11111	NC_014554	AATG	2	8	563957	563964	50 %	25 %	25 %	0 %	308179714
11112	NC_014554	TTC	2	6	563970	563975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179714
11113	NC_014554	CTGC	2	8	564023	564030	0 %	25 %	25 %	50 %	308179714
11114	NC_014554	ATTG	2	8	564140	564147	25 %	50 %	25 %	0 %	308179714
11115	NC_014554	AGT	2	6	564155	564160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179714
11116	NC_014554	TCG	2	6	564238	564243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179714
11117	NC_014554	TTGC	2	8	564278	564285	0 %	50 %	25 %	25 %	308179714
11118	NC_014554	TTC	2	6	564291	564296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179714
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11120	NC_014554	GCG	2	6	564438	564443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179714
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11244	NC_014554	GAT	2	6	570062	570067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179718
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11249	NC_014554	AGCT	2	8	570201	570208	25 %	25 %	25 %	25 %	308179718
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11349	NC_014554	T	6	6	574800	574805	0 %	100 %	0 %	0 %	308179725
11350	NC_014554	GTGAAC	2	12	574824	574835	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308179725
11351	NC_014554	AGT	2	6	574859	574864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11482	NC_014554	ATG	2	6	582014	582019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179733
11483	NC_014554	ATC	2	6	582089	582094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179733
11484	NC_014554	TGAT	2	8	582105	582112	25 %	50 %	25 %	0 %	308179733
11485	NC_014554	GTT	2	6	582126	582131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179733
11486	NC_014554	GAT	2	6	582152	582157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179733
11487	NC_014554	CTA	2	6	582299	582304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179734
11488	NC_014554	CAT	2	6	582375	582380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179734
11489	NC_014554	AGA	2	6	582404	582409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179734
11490	NC_014554	TTTTG	2	10	582413	582422	0 %	80 %	20 %	0 %	308179734
11491	NC_014554	TCT	2	6	582455	582460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179734
11492	NC_014554	ATC	2	6	582465	582470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179734
11493	NC_014554	TTG	2	6	582507	582512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179734
11494	NC_014554	CAT	2	6	582519	582524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179734
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11497	NC_014554	TGA	2	6	582709	582714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179734
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