MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014554	TCG	2	6	333643	333648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_014554	ATTA	2	8	333670	333677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_014554	TGCT	2	8	333715	333722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_014554	ATTTA	2	10	333784	333793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_014554	ATC	2	6	333836	333841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_014554	AC	3	6	333885	333890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_014554	TGTCT	2	10	334056	334065	0 %	60 %	20 %	20 %	308179502
6508	NC_014554	AAC	2	6	334143	334148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179502
6509	NC_014554	TGATT	2	10	334254	334263	20 %	60 %	20 %	0 %	308179502
6510	NC_014554	CGAT	2	8	334382	334389	25 %	25 %	25 %	25 %	308179502
6511	NC_014554	CCAC	2	8	334421	334428	25 %	0 %	0 %	75 %	308179502
6512	NC_014554	ATT	2	6	334436	334441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179502
6513	NC_014554	GAC	2	6	334489	334494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179502
6514	NC_014554	ATT	2	6	334506	334511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179502
6515	NC_014554	GCG	2	6	334522	334527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179502
6516	NC_014554	CAA	2	6	334627	334632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179502
6517	NC_014554	GAA	2	6	334674	334679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179502
6518	NC_014554	TGA	2	6	334706	334711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179502
6519	NC_014554	ATA	2	6	334739	334744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179502
6520	NC_014554	TAC	2	6	334786	334791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179502
6521	NC_014554	GCG	2	6	334885	334890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179502
6522	NC_014554	CG	3	6	334889	334894	0 %	0 %	50 %	50 %	308179502
6523	NC_014554	AATGAA	2	12	334903	334914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	308179502
6524	NC_014554	TTA	2	6	335018	335023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179502
6525	NC_014554	GAA	2	6	335076	335081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179502
6526	NC_014554	GCT	2	6	335125	335130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179502
6527	NC_014554	GCT	2	6	335188	335193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179502
6528	NC_014554	GCC	2	6	335218	335223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179502
6529	NC_014554	GAA	2	6	335263	335268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179502
6530	NC_014554	GGCA	2	8	335348	335355	25 %	0 %	50 %	25 %	308179502
6531	NC_014554	AGG	2	6	335410	335415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_014554	ACA	3	9	335416	335424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179503
6533	NC_014554	ACG	2	6	335439	335444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6534	NC_014554	CAA	2	6	335448	335453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179503
6535	NC_014554	GGT	2	6	335499	335504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6536	NC_014554	CCGGTG	2	12	335512	335523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	308179503
6537	NC_014554	TCAA	2	8	335531	335538	50 %	25 %	0 %	25 %	308179503
6538	NC_014554	TCA	2	6	335595	335600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179503
6539	NC_014554	CGA	2	6	335605	335610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6540	NC_014554	GTC	2	6	335688	335693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6541	NC_014554	CA	3	6	335707	335712	50 %	0 %	0 %	50 %	308179503
6542	NC_014554	TTA	2	6	335733	335738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179503
6543	NC_014554	ATG	2	6	335746	335751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6544	NC_014554	TGG	2	6	335906	335911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6545	NC_014554	AAT	2	6	335934	335939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179503
6546	NC_014554	GC	3	6	335943	335948	0 %	0 %	50 %	50 %	308179503
6547	NC_014554	AAG	2	6	335967	335972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179503
6548	NC_014554	TGG	2	6	335984	335989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6549	NC_014554	ATG	4	12	336028	336039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6550	NC_014554	TCA	2	6	336109	336114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179503
6551	NC_014554	CCAA	2	8	336186	336193	50 %	0 %	0 %	50 %	308179503
6552	NC_014554	CAAC	2	8	336237	336244	50 %	0 %	0 %	50 %	308179503
6553	NC_014554	GAT	2	6	336275	336280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6554	NC_014554	GTG	2	6	336285	336290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6555	NC_014554	AAG	2	6	336367	336372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179503
6556	NC_014554	TTG	2	6	336384	336389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179503
6557	NC_014554	CGT	2	6	336402	336407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6558	NC_014554	GAT	2	6	336432	336437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6559	NC_014554	CGC	2	6	336473	336478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308179503
6560	NC_014554	GGT	2	6	336501	336506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6561	NC_014554	GTT	2	6	336552	336557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179503
6562	NC_014554	TAG	2	6	336680	336685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6563	NC_014554	TGG	2	6	336710	336715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6564	NC_014554	GAA	2	6	336815	336820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179503
6565	NC_014554	TGG	2	6	336833	336838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179503
6566	NC_014554	ATG	2	6	336913	336918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179503
6567	NC_014554	TGC	2	6	336953	336958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6568	NC_014554	GAA	2	6	337044	337049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179503
6569	NC_014554	ACT	2	6	337069	337074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179503
6570	NC_014554	TGC	2	6	337075	337080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179503
6571	NC_014554	TTGG	2	8	337162	337169	0 %	50 %	50 %	0 %	308179503
6572	NC_014554	ATT	2	6	337199	337204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179503
6573	NC_014554	ATG	2	6	337268	337273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179504
6574	NC_014554	TTG	2	6	337295	337300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179504
6575	NC_014554	CGG	2	6	337479	337484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179504
6576	NC_014554	TGG	2	6	337558	337563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179504
6577	NC_014554	TGG	2	6	337570	337575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179504
6578	NC_014554	TGGTT	2	10	337581	337590	0 %	60 %	40 %	0 %	308179504
6579	NC_014554	ACT	2	6	337593	337598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179504
6580	NC_014554	GCAA	2	8	337609	337616	50 %	0 %	25 %	25 %	308179504
6581	NC_014554	CGG	2	6	337667	337672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179504
6582	NC_014554	AGTGA	2	10	337691	337700	40 %	20 %	40 %	0 %	308179504
6583	NC_014554	CGG	2	6	337755	337760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179504
6584	NC_014554	TTG	2	6	337773	337778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179504
6585	NC_014554	CCCGG	2	10	337840	337849	0 %	0 %	40 %	60 %	308179504
6586	NC_014554	TTGG	2	8	337943	337950	0 %	50 %	50 %	0 %	308179504
6587	NC_014554	TGT	2	6	337968	337973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179504
6588	NC_014554	ACA	2	6	338035	338040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_014554	AATG	2	8	338074	338081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_014554	A	6	6	338177	338182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_014554	ATTA	2	8	338217	338224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_014554	GAA	2	6	338291	338296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_014554	T	6	6	338484	338489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014554	AGT	2	6	338516	338521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_014554	TA	3	6	338539	338544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014554	CAT	2	6	338597	338602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179505
6597	NC_014554	GTT	2	6	338623	338628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179505
6598	NC_014554	GTC	2	6	338639	338644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179505
6599	NC_014554	GT	3	6	338658	338663	0 %	50 %	50 %	0 %	308179505
6600	NC_014554	TGG	2	6	338676	338681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179505
6601	NC_014554	TCA	2	6	338690	338695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179505
6602	NC_014554	TCA	2	6	338751	338756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179505
6603	NC_014554	AAT	2	6	338789	338794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179505
6604	NC_014554	CATA	2	8	338845	338852	50 %	25 %	0 %	25 %	308179505
6605	NC_014554	ACG	2	6	338955	338960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179505
6606	NC_014554	TTC	2	6	339025	339030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179505
6607	NC_014554	TTA	2	6	339079	339084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179505
6608	NC_014554	CTTA	2	8	339186	339193	25 %	50 %	0 %	25 %	308179505
6609	NC_014554	GGA	2	6	339257	339262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179505
6610	NC_014554	GAC	2	6	339370	339375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179505
6611	NC_014554	CGCC	2	8	339441	339448	0 %	0 %	25 %	75 %	308179505
6612	NC_014554	CA	3	6	339472	339477	50 %	0 %	0 %	50 %	308179505
6613	NC_014554	ACA	2	6	339520	339525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179505
6614	NC_014554	ATG	2	6	339630	339635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179505
6615	NC_014554	ATG	2	6	339675	339680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179505
6616	NC_014554	A	6	6	339681	339686	100 %	0 %	0 %	0 %	308179505
6617	NC_014554	GACG	2	8	339709	339716	25 %	0 %	50 %	25 %	308179505
6618	NC_014554	TGA	2	6	339781	339786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179505
6619	NC_014554	TGA	2	6	339790	339795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179505
6620	NC_014554	CAT	2	6	339899	339904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179505
6621	NC_014554	TGA	2	6	339937	339942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179505
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6999	NC_014554	GAT	2	6	357371	357376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179523
7000	NC_014554	CAT	2	6	357437	357442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179523

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