MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014554	TCG	2	6	308695	308700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179476
6002	NC_014554	CAA	2	6	308894	308899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179476
6003	NC_014554	GTT	2	6	308958	308963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179476
6004	NC_014554	CGT	2	6	308978	308983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179476
6005	NC_014554	ATGG	2	8	309018	309025	25 %	25 %	50 %	0 %	308179476
6006	NC_014554	AGC	2	6	309084	309089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179476
6007	NC_014554	GTT	2	6	309111	309116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179476
6008	NC_014554	TTG	2	6	309168	309173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179476
6009	NC_014554	GACCT	2	10	309174	309183	20 %	20 %	20 %	40 %	308179476
6010	NC_014554	AAT	2	6	309188	309193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179476
6011	NC_014554	TAG	2	6	309213	309218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179476
6012	NC_014554	TGA	2	6	309226	309231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179476
6013	NC_014554	GGTT	2	8	309291	309298	0 %	50 %	50 %	0 %	308179476
6014	NC_014554	AGT	2	6	309321	309326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179476
6015	NC_014554	TCA	2	6	309368	309373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179476
6016	NC_014554	TCA	2	6	309382	309387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179476
6017	NC_014554	CGT	2	6	309392	309397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179476
6018	NC_014554	CAT	2	6	309431	309436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179476
6019	NC_014554	TGA	2	6	309521	309526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179476
6020	NC_014554	TGT	2	6	309535	309540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179476
6021	NC_014554	AAT	2	6	309561	309566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179476
6022	NC_014554	TCA	2	6	309605	309610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014554	ATT	2	6	309646	309651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014554	GT	3	6	309667	309672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014554	GTAA	2	8	309682	309689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014554	CTCAT	2	10	309717	309726	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6027	NC_014554	TG	3	6	309811	309816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014554	CAACA	2	10	309817	309826	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6029	NC_014554	A	6	6	309848	309853	100 %	0 %	0 %	0 %	308179477
6030	NC_014554	GAT	2	6	309863	309868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179477
6031	NC_014554	ATG	2	6	309911	309916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179477
6032	NC_014554	T	7	7	309940	309946	0 %	100 %	0 %	0 %	308179477
6033	NC_014554	CTTT	2	8	309968	309975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6034	NC_014554	ATA	2	6	310015	310020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014554	TAA	2	6	310031	310036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014554	A	6	6	310035	310040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014554	ACAT	2	8	310148	310155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_014554	ATT	2	6	310218	310223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179478
6039	NC_014554	ATG	2	6	310240	310245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179478
6040	NC_014554	TTA	2	6	310319	310324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179478
6041	NC_014554	ATGG	2	8	310385	310392	25 %	25 %	50 %	0 %	308179478
6042	NC_014554	ACG	2	6	310428	310433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179478
6043	NC_014554	TCT	2	6	310443	310448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179478
6044	NC_014554	TA	3	6	310531	310536	50 %	50 %	0 %	0 %	308179478
6045	NC_014554	GAT	2	6	310547	310552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179478
6046	NC_014554	CTA	2	6	310619	310624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179478
6047	NC_014554	CTA	2	6	310797	310802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179478
6048	NC_014554	CTA	2	6	310817	310822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179478
6049	NC_014554	GATTT	2	10	310974	310983	20 %	60 %	20 %	0 %	308179478
6050	NC_014554	AGG	2	6	310984	310989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308179478
6051	NC_014554	GTA	2	6	311056	311061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179479
6052	NC_014554	T	6	6	311082	311087	0 %	100 %	0 %	0 %	308179479
6053	NC_014554	TAT	2	6	311168	311173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179479
6054	NC_014554	ATT	2	6	311271	311276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179479
6055	NC_014554	TGA	2	6	311312	311317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179479
6056	NC_014554	TGA	2	6	311378	311383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179479
6057	NC_014554	TTG	2	6	311386	311391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179479
6058	NC_014554	CAT	2	6	311495	311500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179479
6059	NC_014554	ATT	2	6	311502	311507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179479
6060	NC_014554	TGA	2	6	311528	311533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179479
6061	NC_014554	TG	3	6	311550	311555	0 %	50 %	50 %	0 %	308179479
6062	NC_014554	AAG	2	6	311574	311579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179479
6063	NC_014554	CGG	2	6	311740	311745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308179479
6064	NC_014554	AAG	2	6	311754	311759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179479
6065	NC_014554	AAG	3	9	311772	311780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179479
6066	NC_014554	GAA	2	6	311826	311831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179479
6067	NC_014554	GCAG	2	8	311858	311865	25 %	0 %	50 %	25 %	308179479
6068	NC_014554	CCA	2	6	311926	311931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308179479
6069	NC_014554	TCT	2	6	311965	311970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179479
6070	NC_014554	AGTC	3	12	312060	312071	25 %	25 %	25 %	25 %	308179479
6071	NC_014554	CGG	2	6	312090	312095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014554	ATTAA	2	10	312111	312120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014554	T	6	6	312159	312164	0 %	100 %	0 %	0 %	308179480
6074	NC_014554	TTGG	2	8	312184	312191	0 %	50 %	50 %	0 %	308179480
6075	NC_014554	TACAA	2	10	312199	312208	60 %	20 %	0 %	20 %	308179480
6076	NC_014554	ATT	2	6	312217	312222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179480
6077	NC_014554	TAC	2	6	312276	312281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014554	T	6	6	312353	312358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014554	ATT	2	6	312401	312406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_014554	TGG	2	6	312426	312431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_014554	TGT	2	6	312491	312496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179481
6082	NC_014554	AT	3	6	312527	312532	50 %	50 %	0 %	0 %	308179481
6083	NC_014554	CAAATT	2	12	312533	312544	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308179481
6084	NC_014554	TTTC	2	8	312566	312573	0 %	75 %	0 %	25 %	308179481
6085	NC_014554	GTG	2	6	312584	312589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179481
6086	NC_014554	CCGCA	2	10	312631	312640	20 %	0 %	20 %	60 %	308179481
6087	NC_014554	CTT	2	6	312704	312709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308179481
6088	NC_014554	A	6	6	312720	312725	100 %	0 %	0 %	0 %	308179481
6089	NC_014554	TGA	2	6	312738	312743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179481
6090	NC_014554	GAT	2	6	312767	312772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014554	GTC	2	6	312773	312778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_014554	T	7	7	312792	312798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014554	A	6	6	312892	312897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014554	AT	3	6	312916	312921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014554	AT	4	8	312929	312936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_014554	ATC	2	6	313001	313006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179482
6097	NC_014554	GAA	2	6	313114	313119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308179482
6098	NC_014554	TAA	2	6	313146	313151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308179482
6099	NC_014554	CGCA	2	8	313189	313196	25 %	0 %	25 %	50 %	308179482
6100	NC_014554	AGTT	2	8	313205	313212	25 %	50 %	25 %	0 %	308179482
6101	NC_014554	T	6	6	313269	313274	0 %	100 %	0 %	0 %	308179482
6102	NC_014554	TTA	2	6	313279	313284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179482
6103	NC_014554	CAG	2	6	313294	313299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179482
6104	NC_014554	TTG	2	6	313309	313314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179482
6105	NC_014554	GCA	2	6	313359	313364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179482
6106	NC_014554	TGA	2	6	313373	313378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179482
6107	NC_014554	TGG	2	6	313554	313559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179483
6108	NC_014554	TTTA	2	8	313577	313584	25 %	75 %	0 %	0 %	308179483
6109	NC_014554	TTGCC	2	10	313621	313630	0 %	40 %	20 %	40 %	308179483
6110	NC_014554	GTC	2	6	313677	313682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179483
6111	NC_014554	ATTT	2	8	313686	313693	25 %	75 %	0 %	0 %	308179483
6112	NC_014554	GTTATT	2	12	313709	313720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	308179483
6113	NC_014554	ATT	2	6	313785	313790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179483
6114	NC_014554	AAC	2	6	313884	313889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179483
6115	NC_014554	ATT	2	6	313893	313898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179483
6116	NC_014554	GGT	2	6	313989	313994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179483
6117	NC_014554	GAT	2	6	314060	314065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179483
6118	NC_014554	ACG	3	9	314097	314105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179483
6119	NC_014554	CAA	2	6	314106	314111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308179483
6120	NC_014554	CGGGG	2	10	314126	314135	0 %	0 %	80 %	20 %	308179483
6121	NC_014554	GT	3	6	314170	314175	0 %	50 %	50 %	0 %	308179483
6122	NC_014554	ATT	2	6	314247	314252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179483
6123	NC_014554	GCT	2	6	314285	314290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179483
6124	NC_014554	ATT	2	6	314300	314305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179483
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6130	NC_014554	TCG	2	6	314608	314613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179483
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6138	NC_014554	TCG	2	6	315132	315137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6238	NC_014554	A	7	7	320242	320248	100 %	0 %	0 %	0 %	308179489
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6242	NC_014554	CA	3	6	320287	320292	50 %	0 %	0 %	50 %	308179489
6243	NC_014554	ACGGAT	2	12	320378	320389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	308179489
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6248	NC_014554	GTTACC	2	12	320767	320778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308179489
6249	NC_014554	GAT	2	6	320795	320800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
6250	NC_014554	GAT	2	6	320834	320839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
6251	NC_014554	GTTA	2	8	320896	320903	25 %	50 %	25 %	0 %	308179489
6252	NC_014554	GAC	2	6	320932	320937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179489
6253	NC_014554	TGGA	2	8	320961	320968	25 %	25 %	50 %	0 %	308179489
6254	NC_014554	TGG	2	6	321034	321039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308179489
6255	NC_014554	TGA	3	9	321072	321080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
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6257	NC_014554	GAT	2	6	321155	321160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
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6260	NC_014554	TGA	2	6	321238	321243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
6261	NC_014554	AACACC	2	12	321244	321255	50 %	0 %	0 %	50 %	308179489
6262	NC_014554	GATG	2	8	321280	321287	25 %	25 %	50 %	0 %	308179489
6263	NC_014554	GGAT	2	8	321288	321295	25 %	25 %	50 %	0 %	308179489
6264	NC_014554	ATG	2	6	321462	321467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
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6268	NC_014554	ATG	2	6	321608	321613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179489
6269	NC_014554	TGA	2	6	321764	321769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_014554	AAGT	2	8	321928	321935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6271	NC_014554	A	6	6	321988	321993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6272	NC_014554	GCA	2	6	322016	322021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308179490
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6274	NC_014554	ATT	2	6	322153	322158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308179490
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6277	NC_014554	TG	3	6	322268	322273	0 %	50 %	50 %	0 %	308179490
6278	NC_014554	GTA	2	6	322293	322298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308179490
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6280	NC_014554	TCG	2	6	322317	322322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179490
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6282	NC_014554	A	6	6	322414	322419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_014554	GTT	2	6	322452	322457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6284	NC_014554	CGT	2	6	322506	322511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308179491
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6321	NC_014554	TAGAA	2	10	324297	324306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6357	NC_014554	TTAA	2	8	326095	326102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6358	NC_014554	TTTA	2	8	326119	326126	25 %	75 %	0 %	0 %	308179496
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6494	NC_014554	ACT	2	6	333323	333328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308179501
6495	NC_014554	GTT	2	6	333333	333338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308179501
6496	NC_014554	TG	3	6	333427	333432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_014554	T	7	7	333515	333521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_014554	ATG	2	6	333558	333563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_014554	GTC	2	6	333577	333582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6500	NC_014554	A	6	6	333622	333627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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