MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63501	NC_014554	TA	3	6	3228515	3228520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63502	NC_014554	TCC	2	6	3228563	3228568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63503	NC_014554	AAAC	2	8	3228574	3228581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63504	NC_014554	A	6	6	3228622	3228627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63505	NC_014554	TCA	2	6	3228636	3228641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63506	NC_014554	AAT	2	6	3228708	3228713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182165
63507	NC_014554	TCG	2	6	3228790	3228795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182165
63508	NC_014554	CTT	2	6	3228813	3228818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182165
63509	NC_014554	TGAG	2	8	3228858	3228865	25 %	25 %	50 %	0 %	308182165
63510	NC_014554	CTTT	2	8	3228892	3228899	0 %	75 %	0 %	25 %	308182165
63511	NC_014554	TTC	2	6	3228903	3228908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182165
63512	NC_014554	TAT	2	6	3228968	3228973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182165
63513	NC_014554	AACG	2	8	3229022	3229029	50 %	0 %	25 %	25 %	308182165
63514	NC_014554	TCT	2	6	3229166	3229171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182165
63515	NC_014554	CAT	2	6	3229190	3229195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182165
63516	NC_014554	AAG	2	6	3229196	3229201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182165
63517	NC_014554	CGT	2	6	3229323	3229328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182165
63518	NC_014554	CAA	2	6	3229346	3229351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182165
63519	NC_014554	TAA	2	6	3229430	3229435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182165
63520	NC_014554	AAG	2	6	3229561	3229566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182165
63521	NC_014554	AGA	2	6	3229586	3229591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182165
63522	NC_014554	GCG	2	6	3229606	3229611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182165
63523	NC_014554	ACC	3	9	3229623	3229631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63524	NC_014554	GGTTC	2	10	3229703	3229712	0 %	40 %	40 %	20 %	308182165
63525	NC_014554	CCG	2	6	3229763	3229768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182165
63526	NC_014554	CTT	2	6	3229824	3229829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182165
63527	NC_014554	TTA	2	6	3229909	3229914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182165
63528	NC_014554	CCA	2	6	3229981	3229986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63529	NC_014554	CCA	2	6	3230044	3230049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63530	NC_014554	CAT	2	6	3230117	3230122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182165
63531	NC_014554	CAG	2	6	3230138	3230143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182165
63532	NC_014554	CCA	2	6	3230155	3230160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63533	NC_014554	CGC	2	6	3230190	3230195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182165
63534	NC_014554	AGCC	2	8	3230321	3230328	25 %	0 %	25 %	50 %	308182165
63535	NC_014554	TG	3	6	3230376	3230381	0 %	50 %	50 %	0 %	308182165
63536	NC_014554	GTA	2	6	3230436	3230441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182165
63537	NC_014554	ATC	2	6	3230521	3230526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182165
63538	NC_014554	T	6	6	3230585	3230590	0 %	100 %	0 %	0 %	308182165
63539	NC_014554	TGA	2	6	3230640	3230645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182165
63540	NC_014554	ACC	2	6	3230670	3230675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63541	NC_014554	TCG	2	6	3230687	3230692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182165
63542	NC_014554	ACC	2	6	3230769	3230774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182165
63543	NC_014554	AGC	2	6	3230775	3230780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182165
63544	NC_014554	CATCA	2	10	3230796	3230805	40 %	20 %	0 %	40 %	308182165
63545	NC_014554	GTT	2	6	3230896	3230901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182165
63546	NC_014554	TCT	2	6	3230980	3230985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182165
63547	NC_014554	AT	3	6	3231028	3231033	50 %	50 %	0 %	0 %	308182165
63548	NC_014554	CAA	2	6	3231068	3231073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182165
63549	NC_014554	GCAACC	2	12	3231133	3231144	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	308182165
63550	NC_014554	ATC	2	6	3231156	3231161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182165
63551	NC_014554	T	7	7	3231256	3231262	0 %	100 %	0 %	0 %	308182165
63552	NC_014554	TCC	2	6	3231284	3231289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63553	NC_014554	AATT	2	8	3231306	3231313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63554	NC_014554	TAT	2	6	3231323	3231328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63555	NC_014554	CAA	2	6	3231349	3231354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63556	NC_014554	ATT	2	6	3231366	3231371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63557	NC_014554	ATC	2	6	3231376	3231381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63558	NC_014554	A	7	7	3231429	3231435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63559	NC_014554	AAC	2	6	3231475	3231480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63560	NC_014554	CTC	2	6	3231487	3231492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63561	NC_014554	ATG	2	6	3231500	3231505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63562	NC_014554	GTT	2	6	3231514	3231519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63563	NC_014554	TCA	2	6	3231526	3231531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63564	NC_014554	AAC	2	6	3231570	3231575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182166
63565	NC_014554	GTT	2	6	3231764	3231769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182166
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63567	NC_014554	CAT	2	6	3231899	3231904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182166
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63570	NC_014554	T	6	6	3232010	3232015	0 %	100 %	0 %	0 %	308182166
63571	NC_014554	CGC	2	6	3232140	3232145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63572	NC_014554	AAT	2	6	3232150	3232155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63573	NC_014554	CCA	2	6	3232186	3232191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63574	NC_014554	GCA	2	6	3232201	3232206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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63579	NC_014554	TGT	2	6	3232355	3232360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182167
63580	NC_014554	TG	3	6	3232378	3232383	0 %	50 %	50 %	0 %	308182167
63581	NC_014554	TAG	2	6	3232411	3232416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182167
63582	NC_014554	AAAT	2	8	3232455	3232462	75 %	25 %	0 %	0 %	308182167
63583	NC_014554	TTC	2	6	3232603	3232608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182167
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63585	NC_014554	TTAG	2	8	3232682	3232689	25 %	50 %	25 %	0 %	308182167
63586	NC_014554	TAA	2	6	3232717	3232722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182167
63587	NC_014554	AAT	2	6	3232729	3232734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182167
63588	NC_014554	T	7	7	3232748	3232754	0 %	100 %	0 %	0 %	308182167
63589	NC_014554	TCC	2	6	3232769	3232774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63590	NC_014554	TTG	2	6	3232808	3232813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63591	NC_014554	TAA	2	6	3232825	3232830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63592	NC_014554	AAGG	2	8	3232861	3232868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63593	NC_014554	TGA	2	6	3232900	3232905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182168
63594	NC_014554	CA	3	6	3232915	3232920	50 %	0 %	0 %	50 %	308182168
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63598	NC_014554	TTAC	2	8	3233286	3233293	25 %	50 %	0 %	25 %	308182168
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63600	NC_014554	CATT	2	8	3233497	3233504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63601	NC_014554	ATT	2	6	3233565	3233570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63602	NC_014554	TGG	2	6	3233653	3233658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182169
63603	NC_014554	CGA	2	6	3233674	3233679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182169
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63606	NC_014554	T	6	6	3233991	3233996	0 %	100 %	0 %	0 %	308182169
63607	NC_014554	GGT	2	6	3234019	3234024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182169
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63609	NC_014554	CGA	2	6	3234063	3234068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182169
63610	NC_014554	TGGT	2	8	3234099	3234106	0 %	50 %	50 %	0 %	308182169
63611	NC_014554	GCC	2	6	3234107	3234112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182169
63612	NC_014554	GCG	2	6	3234144	3234149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182169
63613	NC_014554	CCA	2	6	3234203	3234208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182169
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63616	NC_014554	TGT	2	6	3234332	3234337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63617	NC_014554	GTTTCT	2	12	3234347	3234358	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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63619	NC_014554	ATT	2	6	3234491	3234496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63741	NC_014554	ATC	2	6	3240382	3240387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
63742	NC_014554	T	7	7	3240471	3240477	0 %	100 %	0 %	0 %	308182175
63743	NC_014554	CAC	2	6	3240510	3240515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182175
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63745	NC_014554	ATG	2	6	3240536	3240541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182175
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63747	NC_014554	GTG	2	6	3240570	3240575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182175
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63752	NC_014554	TAC	2	6	3240853	3240858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182175
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63757	NC_014554	AGTA	2	8	3241090	3241097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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63772	NC_014554	CCAATT	2	12	3241570	3241581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182177
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63797	NC_014554	ATA	2	6	3242639	3242644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63817	NC_014554	GTT	3	9	3243527	3243535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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63819	NC_014554	A	6	6	3243576	3243581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63823	NC_014554	CTA	2	6	3243676	3243681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63844	NC_014554	ATCTT	2	10	3244725	3244734	20 %	60 %	0 %	20 %	308182179
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63976	NC_014554	CGT	2	6	3251089	3251094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182183
63977	NC_014554	GCC	2	6	3251135	3251140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182183
63978	NC_014554	TTA	2	6	3251219	3251224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
63979	NC_014554	TTA	2	6	3251243	3251248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
63980	NC_014554	TTA	2	6	3251264	3251269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182183
63981	NC_014554	GTT	2	6	3251321	3251326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182183
63982	NC_014554	GCC	2	6	3251337	3251342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182183
63983	NC_014554	CTT	2	6	3251449	3251454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182183
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63987	NC_014554	TCGA	2	8	3251543	3251550	25 %	25 %	25 %	25 %	308182183
63988	NC_014554	GTC	2	6	3251564	3251569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182183
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63991	NC_014554	TAA	3	9	3251665	3251673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182183
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63993	NC_014554	TTGC	2	8	3251709	3251716	0 %	50 %	25 %	25 %	308182183
63994	NC_014554	CAAAA	2	10	3251770	3251779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63995	NC_014554	CTA	2	6	3251787	3251792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63996	NC_014554	ACC	2	6	3251827	3251832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63997	NC_014554	CAC	2	6	3251855	3251860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182184
63998	NC_014554	TCA	2	6	3251977	3251982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63999	NC_014554	ACTG	2	8	3251999	3252006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64000	NC_014554	CTC	2	6	3252015	3252020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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