MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
63001	NC_014554	GAC	2	6	3203606	3203611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182143
63002	NC_014554	TCA	2	6	3203636	3203641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182143
63003	NC_014554	GAT	2	6	3203653	3203658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182143
63004	NC_014554	CCG	2	6	3203705	3203710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182143
63005	NC_014554	TGT	2	6	3203737	3203742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182143
63006	NC_014554	TCA	3	9	3203776	3203784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182143
63007	NC_014554	TGAT	2	8	3203902	3203909	25 %	50 %	25 %	0 %	308182143
63008	NC_014554	GTT	2	6	3203933	3203938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182143
63009	NC_014554	CCA	2	6	3203965	3203970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182143
63010	NC_014554	CAA	2	6	3203987	3203992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182143
63011	NC_014554	AAT	2	6	3204010	3204015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182143
63012	NC_014554	TTG	2	6	3204216	3204221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182143
63013	NC_014554	CAT	2	6	3204284	3204289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182143
63014	NC_014554	GTT	2	6	3204319	3204324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182143
63015	NC_014554	AAC	2	6	3204330	3204335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182143
63016	NC_014554	ATG	2	6	3204346	3204351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182143
63017	NC_014554	TA	3	6	3204356	3204361	50 %	50 %	0 %	0 %	308182143
63018	NC_014554	ACC	2	6	3204449	3204454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182144
63019	NC_014554	ATC	2	6	3204508	3204513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182144
63020	NC_014554	AAT	2	6	3204555	3204560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182144
63021	NC_014554	GCTAA	2	10	3204667	3204676	40 %	20 %	20 %	20 %	308182144
63022	NC_014554	ATA	2	6	3204700	3204705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182144
63023	NC_014554	TGAA	2	8	3204709	3204716	50 %	25 %	25 %	0 %	308182144
63024	NC_014554	CCCCTA	2	12	3204773	3204784	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	308182144
63025	NC_014554	AAC	2	6	3204787	3204792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182144
63026	NC_014554	TCCT	2	8	3204840	3204847	0 %	50 %	0 %	50 %	308182144
63027	NC_014554	CAAC	2	8	3204929	3204936	50 %	0 %	0 %	50 %	308182144
63028	NC_014554	ATT	2	6	3204970	3204975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182144
63029	NC_014554	AAAT	2	8	3204980	3204987	75 %	25 %	0 %	0 %	308182144
63030	NC_014554	TCC	2	6	3205033	3205038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308182144
63031	NC_014554	ATCT	2	8	3205047	3205054	25 %	50 %	0 %	25 %	308182144
63032	NC_014554	CATT	2	8	3205071	3205078	25 %	50 %	0 %	25 %	308182144
63033	NC_014554	ATA	2	6	3205080	3205085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63034	NC_014554	ACC	2	6	3205138	3205143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182145
63035	NC_014554	TAA	2	6	3205217	3205222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182145
63036	NC_014554	TTG	2	6	3205260	3205265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182145
63037	NC_014554	CCG	2	6	3205337	3205342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182145
63038	NC_014554	CCA	2	6	3205377	3205382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182145
63039	NC_014554	TGG	2	6	3205390	3205395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182145
63040	NC_014554	GGC	2	6	3205404	3205409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182145
63041	NC_014554	ATTG	2	8	3205437	3205444	25 %	50 %	25 %	0 %	308182145
63042	NC_014554	CAT	2	6	3205556	3205561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182145
63043	NC_014554	TCG	2	6	3205817	3205822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182145
63044	NC_014554	CGC	2	6	3205886	3205891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182145
63045	NC_014554	TTC	2	6	3205941	3205946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182145
63046	NC_014554	GCT	2	6	3205949	3205954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182145
63047	NC_014554	ACTGT	2	10	3205959	3205968	20 %	40 %	20 %	20 %	308182145
63048	NC_014554	TCT	2	6	3205975	3205980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182145
63049	NC_014554	A	6	6	3206011	3206016	100 %	0 %	0 %	0 %	308182145
63050	NC_014554	TTCAT	2	10	3206041	3206050	20 %	60 %	0 %	20 %	308182145
63051	NC_014554	TCA	2	6	3206165	3206170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182145
63052	NC_014554	CGT	2	6	3206185	3206190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182145
63053	NC_014554	T	6	6	3206224	3206229	0 %	100 %	0 %	0 %	308182145
63054	NC_014554	CATA	2	8	3206341	3206348	50 %	25 %	0 %	25 %	308182145
63055	NC_014554	CG	3	6	3206354	3206359	0 %	0 %	50 %	50 %	308182145
63056	NC_014554	TCA	2	6	3206404	3206409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182145
63057	NC_014554	CCA	2	6	3206706	3206711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182145
63058	NC_014554	TGC	2	6	3206723	3206728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182145
63059	NC_014554	TGTA	2	8	3206762	3206769	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63060	NC_014554	AAG	2	6	3206839	3206844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182146
63061	NC_014554	CGT	2	6	3206846	3206851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182146
63062	NC_014554	TCT	2	6	3206912	3206917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182146
63063	NC_014554	TTG	2	6	3206921	3206926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182146
63064	NC_014554	TACT	2	8	3206965	3206972	25 %	50 %	0 %	25 %	308182146
63065	NC_014554	TGC	2	6	3207036	3207041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182146
63066	NC_014554	CTT	2	6	3207075	3207080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182146
63067	NC_014554	ATC	2	6	3207082	3207087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182146
63068	NC_014554	TTA	2	6	3207124	3207129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182146
63069	NC_014554	CAT	2	6	3207132	3207137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182146
63070	NC_014554	AATG	2	8	3207147	3207154	50 %	25 %	25 %	0 %	308182146
63071	NC_014554	TGT	2	6	3207242	3207247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182146
63072	NC_014554	CTT	2	6	3207293	3207298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182146
63073	NC_014554	TCT	2	6	3207389	3207394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182146
63074	NC_014554	CCGC	2	8	3207397	3207404	0 %	0 %	25 %	75 %	308182146
63075	NC_014554	TG	3	6	3207490	3207495	0 %	50 %	50 %	0 %	308182146
63076	NC_014554	GCA	2	6	3207505	3207510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182146
63077	NC_014554	TCT	2	6	3207596	3207601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182146
63078	NC_014554	CAT	2	6	3207767	3207772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182146
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63080	NC_014554	TTG	2	6	3207919	3207924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182146
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63083	NC_014554	GTT	2	6	3208186	3208191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182146
63084	NC_014554	ACTA	2	8	3208263	3208270	50 %	25 %	0 %	25 %	308182146
63085	NC_014554	TTC	2	6	3208304	3208309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63086	NC_014554	T	6	6	3208323	3208328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63087	NC_014554	TTA	2	6	3208337	3208342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63088	NC_014554	CCA	2	6	3208401	3208406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182147
63089	NC_014554	GAA	2	6	3208436	3208441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182147
63090	NC_014554	CAA	3	9	3208471	3208479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182147
63091	NC_014554	GGC	2	6	3208514	3208519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182147
63092	NC_014554	TGA	2	6	3208582	3208587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182147
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63098	NC_014554	AACA	2	8	3208916	3208923	75 %	0 %	0 %	25 %	308182147
63099	NC_014554	GAA	2	6	3208949	3208954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182147
63100	NC_014554	AAAC	2	8	3209006	3209013	75 %	0 %	0 %	25 %	308182147
63101	NC_014554	CAA	2	6	3209029	3209034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182147
63102	NC_014554	TGA	2	6	3209073	3209078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182147
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63104	NC_014554	GATAA	2	10	3209172	3209181	60 %	20 %	20 %	0 %	308182147
63105	NC_014554	TGA	2	6	3209182	3209187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182147
63106	NC_014554	AGA	2	6	3209188	3209193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182147
63107	NC_014554	T	6	6	3209291	3209296	0 %	100 %	0 %	0 %	308182147
63108	NC_014554	AAT	2	6	3209322	3209327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182148
63109	NC_014554	ACC	2	6	3209352	3209357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182148
63110	NC_014554	ACAA	2	8	3209363	3209370	75 %	0 %	0 %	25 %	308182148
63111	NC_014554	CAG	2	6	3209407	3209412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182148
63112	NC_014554	GTC	3	9	3209436	3209444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182148
63113	NC_014554	CG	3	6	3209447	3209452	0 %	0 %	50 %	50 %	308182148
63114	NC_014554	TGA	2	6	3209498	3209503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182148
63115	NC_014554	C	6	6	3209546	3209551	0 %	0 %	0 %	100 %	308182148
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63117	NC_014554	ATTT	2	8	3209623	3209630	25 %	75 %	0 %	0 %	308182148
63118	NC_014554	CCAT	2	8	3209634	3209641	25 %	25 %	0 %	50 %	308182148
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63136	NC_014554	AACT	2	8	3210344	3210351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63137	NC_014554	AT	3	6	3210358	3210363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63138	NC_014554	TCA	2	6	3210380	3210385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63231	NC_014554	TCG	2	6	3215297	3215302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182151
63232	NC_014554	AGT	2	6	3215338	3215343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182151
63233	NC_014554	ACGAAG	2	12	3215366	3215377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	308182152
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63235	NC_014554	TGA	2	6	3215510	3215515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182152
63236	NC_014554	GGT	2	6	3215751	3215756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182152
63237	NC_014554	A	7	7	3215927	3215933	100 %	0 %	0 %	0 %	308182152
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63239	NC_014554	TGA	2	6	3216072	3216077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182152
63240	NC_014554	CAA	2	6	3216146	3216151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182152
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63262	NC_014554	GTC	2	6	3217049	3217054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182152
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63264	NC_014554	A	6	6	3217228	3217233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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63350	NC_014554	TAA	2	6	3220916	3220921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182156
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63470	NC_014554	TAA	2	6	3227379	3227384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63471	NC_014554	A	6	6	3227390	3227395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63472	NC_014554	AAT	2	6	3227409	3227414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182164
63473	NC_014554	TTTC	2	8	3227436	3227443	0 %	75 %	0 %	25 %	308182164
63474	NC_014554	AATT	2	8	3227444	3227451	50 %	50 %	0 %	0 %	308182164
63475	NC_014554	GTG	2	6	3227462	3227467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182164
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63499	NC_014554	TCC	2	6	3228420	3228425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63500	NC_014554	ATT	2	6	3228443	3228448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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