MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61001	NC_014554	TCA	2	6	3105326	3105331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182064
61002	NC_014554	TCT	2	6	3105368	3105373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182064
61003	NC_014554	TCA	2	6	3105545	3105550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182064
61004	NC_014554	GCA	2	6	3105578	3105583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182064
61005	NC_014554	ATC	2	6	3105607	3105612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182064
61006	NC_014554	CAA	2	6	3105637	3105642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182064
61007	NC_014554	TCT	2	6	3105690	3105695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182064
61008	NC_014554	GCTT	2	8	3105716	3105723	0 %	50 %	25 %	25 %	308182064
61009	NC_014554	T	6	6	3105743	3105748	0 %	100 %	0 %	0 %	308182064
61010	NC_014554	ATC	2	6	3105782	3105787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182064
61011	NC_014554	CAT	2	6	3105799	3105804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61012	NC_014554	AAT	2	6	3105869	3105874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182065
61013	NC_014554	CTT	2	6	3106043	3106048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182065
61014	NC_014554	TTG	2	6	3106090	3106095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182065
61015	NC_014554	AGC	2	6	3106231	3106236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182065
61016	NC_014554	GGTT	2	8	3106330	3106337	0 %	50 %	50 %	0 %	308182065
61017	NC_014554	GTT	2	6	3106343	3106348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182065
61018	NC_014554	TGCT	2	8	3106354	3106361	0 %	50 %	25 %	25 %	308182065
61019	NC_014554	GCAT	2	8	3106416	3106423	25 %	25 %	25 %	25 %	308182065
61020	NC_014554	GTAA	2	8	3106548	3106555	50 %	25 %	25 %	0 %	308182065
61021	NC_014554	GCC	2	6	3106594	3106599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182065
61022	NC_014554	GCC	2	6	3106625	3106630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182065
61023	NC_014554	TTGTT	2	10	3106710	3106719	0 %	80 %	20 %	0 %	308182065
61024	NC_014554	GCA	2	6	3106769	3106774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182065
61025	NC_014554	GCC	2	6	3106796	3106801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182065
61026	NC_014554	TCA	2	6	3106853	3106858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182065
61027	NC_014554	GCTT	2	8	3106877	3106884	0 %	50 %	25 %	25 %	308182065
61028	NC_014554	TTC	2	6	3106921	3106926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182065
61029	NC_014554	TGC	2	6	3106943	3106948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182065
61030	NC_014554	GCT	2	6	3107048	3107053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182065
61031	NC_014554	TCAA	2	8	3107138	3107145	50 %	25 %	0 %	25 %	308182065
61032	NC_014554	T	6	6	3107165	3107170	0 %	100 %	0 %	0 %	308182065
61033	NC_014554	ACC	2	6	3107219	3107224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182065
61034	NC_014554	TGC	2	6	3107228	3107233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182065
61035	NC_014554	TTCC	2	8	3107379	3107386	0 %	50 %	0 %	50 %	308182065
61036	NC_014554	CAA	2	6	3107427	3107432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182065
61037	NC_014554	GCCATT	2	12	3107477	3107488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308182065
61038	NC_014554	AGT	2	6	3107524	3107529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182065
61039	NC_014554	ATC	2	6	3107605	3107610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182065
61040	NC_014554	CAT	2	6	3107619	3107624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182065
61041	NC_014554	TA	3	6	3107646	3107651	50 %	50 %	0 %	0 %	308182065
61042	NC_014554	TCA	2	6	3107852	3107857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182065
61043	NC_014554	CCT	2	6	3107880	3107885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61044	NC_014554	GCC	2	6	3107911	3107916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182066
61045	NC_014554	TCAG	2	8	3107959	3107966	25 %	25 %	25 %	25 %	308182066
61046	NC_014554	CTT	2	6	3108035	3108040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182066
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61049	NC_014554	ATC	2	6	3108150	3108155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182066
61050	NC_014554	TAA	2	6	3108204	3108209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182066
61051	NC_014554	CTT	2	6	3108254	3108259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182066
61052	NC_014554	CTT	2	6	3108287	3108292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182066
61053	NC_014554	CAC	2	6	3108309	3108314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182066
61054	NC_014554	ATC	2	6	3108355	3108360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182066
61055	NC_014554	TGT	2	6	3108474	3108479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182066
61056	NC_014554	CTA	2	6	3108488	3108493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182066
61057	NC_014554	TAT	2	6	3108573	3108578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61058	NC_014554	ATT	2	6	3108591	3108596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61059	NC_014554	AGT	2	6	3108600	3108605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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61061	NC_014554	TAA	2	6	3108710	3108715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182067
61062	NC_014554	GCT	2	6	3108793	3108798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182067
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61064	NC_014554	CAA	2	6	3108849	3108854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182067
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61067	NC_014554	TGC	2	6	3108915	3108920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182067
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61100	NC_014554	CTT	2	6	3110068	3110073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182068
61101	NC_014554	ATCA	2	8	3110078	3110085	50 %	25 %	0 %	25 %	308182068
61102	NC_014554	CAA	2	6	3110149	3110154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182068
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61117	NC_014554	TTGC	2	8	3110710	3110717	0 %	50 %	25 %	25 %	308182069
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61120	NC_014554	CAA	2	6	3110862	3110867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61121	NC_014554	T	6	6	3110918	3110923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61122	NC_014554	GGA	2	6	3110940	3110945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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61353	NC_014554	TCT	2	6	3120498	3120503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182077
61354	NC_014554	CCATAA	2	12	3120511	3120522	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	308182077
61355	NC_014554	GAA	2	6	3120545	3120550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182077
61356	NC_014554	TTA	2	6	3120623	3120628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182077
61357	NC_014554	CAT	2	6	3120695	3120700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182077
61358	NC_014554	AAT	2	6	3120780	3120785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61359	NC_014554	ATT	2	6	3120845	3120850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182078
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61361	NC_014554	CA	3	6	3120908	3120913	50 %	0 %	0 %	50 %	308182078
61362	NC_014554	AT	3	6	3121000	3121005	50 %	50 %	0 %	0 %	308182078
61363	NC_014554	GAC	2	6	3121028	3121033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182078
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61368	NC_014554	AAG	2	6	3121248	3121253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61369	NC_014554	AAT	3	9	3121297	3121305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61409	NC_014554	T	6	6	3123412	3123417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61410	NC_014554	TTA	2	6	3123432	3123437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182081
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61424	NC_014554	GCT	2	6	3124206	3124211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182082
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61468	NC_014554	TTG	2	6	3126402	3126407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182083
61469	NC_014554	AGG	2	6	3126473	3126478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	308182083
61470	NC_014554	TTGA	2	8	3126512	3126519	25 %	50 %	25 %	0 %	308182083
61471	NC_014554	TTAA	2	8	3126601	3126608	50 %	50 %	0 %	0 %	308182083
61472	NC_014554	AAT	2	6	3126651	3126656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182083
61473	NC_014554	GCC	2	6	3126686	3126691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182083
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61481	NC_014554	ATC	2	6	3126961	3126966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182083
61482	NC_014554	CGA	2	6	3126970	3126975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182083
61483	NC_014554	GCA	2	6	3127006	3127011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182083
61484	NC_014554	CTG	2	6	3127034	3127039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182083
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61489	NC_014554	TCC	2	6	3127206	3127211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61490	NC_014554	TAA	2	6	3127228	3127233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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61492	NC_014554	TTA	2	6	3127289	3127294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61493	NC_014554	AAC	2	6	3127329	3127334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61494	NC_014554	AT	3	6	3127344	3127349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61495	NC_014554	T	6	6	3127374	3127379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61496	NC_014554	ATT	2	6	3127390	3127395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61497	NC_014554	CTA	2	6	3127420	3127425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61498	NC_014554	A	7	7	3127440	3127446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61499	NC_014554	GCT	2	6	3127558	3127563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182084
61500	NC_014554	CAA	2	6	3127568	3127573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182084

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