MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_014554	ATGA	2	8	3055336	3055343	50 %	25 %	25 %	0 %	308182028
60002	NC_014554	CG	3	6	3055415	3055420	0 %	0 %	50 %	50 %	308182028
60003	NC_014554	CAA	2	6	3055461	3055466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182028
60004	NC_014554	CAAC	2	8	3055488	3055495	50 %	0 %	0 %	50 %	308182028
60005	NC_014554	CAC	2	6	3055527	3055532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182028
60006	NC_014554	CTAAAA	2	12	3055533	3055544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	308182028
60007	NC_014554	TCC	2	6	3055558	3055563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60008	NC_014554	TTA	2	6	3055613	3055618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182029
60009	NC_014554	CGT	2	6	3055663	3055668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182029
60010	NC_014554	CCA	2	6	3055752	3055757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182029
60011	NC_014554	GTT	2	6	3055795	3055800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182029
60012	NC_014554	ATC	2	6	3055904	3055909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182029
60013	NC_014554	TCA	2	6	3055986	3055991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182029
60014	NC_014554	GTTA	2	8	3056024	3056031	25 %	50 %	25 %	0 %	308182029
60015	NC_014554	CTT	2	6	3056080	3056085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182029
60016	NC_014554	GCG	2	6	3056096	3056101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182029
60017	NC_014554	GTT	2	6	3056162	3056167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182029
60018	NC_014554	GTT	2	6	3056288	3056293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182029
60019	NC_014554	TAA	2	6	3056372	3056377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182029
60020	NC_014554	GAT	3	9	3056391	3056399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182029
60021	NC_014554	CAT	2	6	3056483	3056488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182029
60022	NC_014554	TTA	2	6	3056814	3056819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60023	NC_014554	T	7	7	3056835	3056841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60024	NC_014554	TTG	2	6	3056844	3056849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60025	NC_014554	TTC	2	6	3056921	3056926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60026	NC_014554	CGTTGT	2	12	3056935	3056946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60027	NC_014554	AGT	2	6	3056948	3056953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60028	NC_014554	TGT	2	6	3056954	3056959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60029	NC_014554	TTTA	2	8	3057031	3057038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60030	NC_014554	ATT	2	6	3057139	3057144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182030
60031	NC_014554	CAG	2	6	3057154	3057159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60032	NC_014554	TCA	2	6	3057181	3057186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182030
60033	NC_014554	TCG	2	6	3057374	3057379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60034	NC_014554	TCAA	2	8	3057394	3057401	50 %	25 %	0 %	25 %	308182030
60035	NC_014554	ACA	2	6	3057439	3057444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182030
60036	NC_014554	CGA	2	6	3057476	3057481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60037	NC_014554	TAT	2	6	3057500	3057505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182030
60038	NC_014554	AGA	2	6	3057524	3057529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182030
60039	NC_014554	ATTTG	2	10	3057596	3057605	20 %	60 %	20 %	0 %	308182030
60040	NC_014554	CTG	2	6	3057664	3057669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60041	NC_014554	GTG	2	6	3057796	3057801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182030
60042	NC_014554	ACT	2	6	3057813	3057818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182030
60043	NC_014554	CAC	2	6	3057955	3057960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182030
60044	NC_014554	GTC	2	6	3058023	3058028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60045	NC_014554	CAA	2	6	3058085	3058090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182030
60046	NC_014554	GAT	2	6	3058161	3058166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182030
60047	NC_014554	GC	3	6	3058169	3058174	0 %	0 %	50 %	50 %	308182030
60048	NC_014554	AAC	2	6	3058290	3058295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182030
60049	NC_014554	CTT	2	6	3058339	3058344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182030
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60051	NC_014554	ACC	2	6	3058423	3058428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308182030
60052	NC_014554	T	6	6	3058438	3058443	0 %	100 %	0 %	0 %	308182030
60053	NC_014554	GAT	2	6	3058512	3058517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182030
60054	NC_014554	CA	3	6	3058548	3058553	50 %	0 %	0 %	50 %	308182030
60055	NC_014554	CCAA	2	8	3058638	3058645	50 %	0 %	0 %	50 %	308182030
60056	NC_014554	AT	3	6	3058664	3058669	50 %	50 %	0 %	0 %	308182030
60057	NC_014554	CGA	2	6	3058832	3058837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182030
60058	NC_014554	ATT	2	6	3058921	3058926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182030
60059	NC_014554	AAT	2	6	3058939	3058944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182030
60060	NC_014554	TCG	2	6	3059039	3059044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182031
60061	NC_014554	GGCG	2	8	3059090	3059097	0 %	0 %	75 %	25 %	308182031
60062	NC_014554	GAC	2	6	3059197	3059202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182031
60063	NC_014554	CAG	2	6	3059342	3059347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182031
60064	NC_014554	CATGCA	2	12	3059568	3059579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	308182031
60065	NC_014554	CAA	2	6	3059606	3059611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182031
60066	NC_014554	ACA	2	6	3059633	3059638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182031
60067	NC_014554	CCG	2	6	3059702	3059707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182031
60068	NC_014554	ACGCA	2	10	3059720	3059729	40 %	0 %	20 %	40 %	308182031
60069	NC_014554	GAA	2	6	3059734	3059739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182031
60070	NC_014554	CATAT	2	10	3059831	3059840	40 %	40 %	0 %	20 %	308182031
60071	NC_014554	GAT	2	6	3059952	3059957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60072	NC_014554	TTTG	2	8	3060088	3060095	0 %	75 %	25 %	0 %	308182032
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60075	NC_014554	AACA	2	8	3060217	3060224	75 %	0 %	0 %	25 %	308182032
60076	NC_014554	CT	3	6	3060254	3060259	0 %	50 %	0 %	50 %	308182032
60077	NC_014554	AACT	2	8	3060283	3060290	50 %	25 %	0 %	25 %	308182032
60078	NC_014554	TGC	2	6	3060296	3060301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182032
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60084	NC_014554	ACA	2	6	3060812	3060817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308182032
60085	NC_014554	GGCT	2	8	3060821	3060828	0 %	25 %	50 %	25 %	308182032
60086	NC_014554	CCT	2	6	3061001	3061006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308182032
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60088	NC_014554	CAT	2	6	3061053	3061058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182032
60089	NC_014554	AACC	2	8	3061070	3061077	50 %	0 %	0 %	50 %	308182032
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60101	NC_014554	GGTTG	2	10	3061613	3061622	0 %	40 %	60 %	0 %	308182032
60102	NC_014554	CG	3	6	3061900	3061905	0 %	0 %	50 %	50 %	308182032
60103	NC_014554	AAT	2	6	3061906	3061911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182032
60104	NC_014554	CGG	2	6	3061914	3061919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308182032
60105	NC_014554	TAT	2	6	3061938	3061943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182032
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60107	NC_014554	GTT	2	6	3062154	3062159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308182032
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60110	NC_014554	CTC	2	6	3062284	3062289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60111	NC_014554	TCA	2	6	3062345	3062350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182033
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60114	NC_014554	ATC	2	6	3062431	3062436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182033
60115	NC_014554	AGCC	2	8	3062439	3062446	25 %	0 %	25 %	50 %	308182033
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60117	NC_014554	TG	3	6	3062489	3062494	0 %	50 %	50 %	0 %	308182033
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60225	NC_014554	TGA	2	6	3067939	3067944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182036
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60229	NC_014554	TA	5	10	3068216	3068225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60230	NC_014554	AT	3	6	3068235	3068240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60231	NC_014554	TTA	2	6	3068268	3068273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182037
60232	NC_014554	CGC	2	6	3068335	3068340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308182037
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60236	NC_014554	CGA	2	6	3068617	3068622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182037
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60471	NC_014554	AC	3	6	3079903	3079908	50 %	0 %	0 %	50 %	308182047
60472	NC_014554	ATC	2	6	3079982	3079987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182047
60473	NC_014554	TCA	2	6	3079994	3079999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182047
60474	NC_014554	T	6	6	3080061	3080066	0 %	100 %	0 %	0 %	308182047
60475	NC_014554	TGC	2	6	3080229	3080234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60476	NC_014554	TCT	2	6	3080249	3080254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182047
60477	NC_014554	CTG	2	6	3080312	3080317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60478	NC_014554	TGG	2	6	3080370	3080375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308182047
60479	NC_014554	TC	3	6	3080392	3080397	0 %	50 %	0 %	50 %	308182047
60480	NC_014554	TTA	2	6	3080404	3080409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182047
60481	NC_014554	TGA	2	6	3080654	3080659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182047
60482	NC_014554	AGC	2	6	3080679	3080684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60483	NC_014554	TAT	2	6	3080694	3080699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182047
60484	NC_014554	ATT	2	6	3080704	3080709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308182047
60485	NC_014554	TTC	2	6	3080734	3080739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308182047
60486	NC_014554	GCT	2	6	3080779	3080784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60487	NC_014554	AGC	2	6	3080802	3080807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60488	NC_014554	AGC	2	6	3080811	3080816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182047
60489	NC_014554	AAT	2	6	3080825	3080830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182047
60490	NC_014554	ACT	2	6	3080883	3080888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60491	NC_014554	CTG	2	6	3080978	3080983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60492	NC_014554	TAC	2	6	3081057	3081062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308182048
60493	NC_014554	AAG	2	6	3081134	3081139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308182048
60494	NC_014554	AGTC	2	8	3081147	3081154	25 %	25 %	25 %	25 %	308182048
60495	NC_014554	GCT	2	6	3081187	3081192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182048
60496	NC_014554	GCT	2	6	3081280	3081285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308182048
60497	NC_014554	ATG	2	6	3081434	3081439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308182048
60498	NC_014554	GCA	2	6	3081454	3081459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308182048
60499	NC_014554	A	6	6	3081503	3081508	100 %	0 %	0 %	0 %	308182048
60500	NC_014554	AAT	2	6	3081538	3081543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308182048

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