MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_014554	GC	3	6	2852399	2852404	0 %	0 %	50 %	50 %	308181839
56002	NC_014554	AATT	2	8	2852426	2852433	50 %	50 %	0 %	0 %	308181839
56003	NC_014554	GTT	2	6	2852438	2852443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181839
56004	NC_014554	C	6	6	2852498	2852503	0 %	0 %	0 %	100 %	308181839
56005	NC_014554	CTG	2	6	2852510	2852515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181839
56006	NC_014554	TAA	2	6	2852541	2852546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181839
56007	NC_014554	TCC	2	6	2852610	2852615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56008	NC_014554	GTTAA	2	10	2852616	2852625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56009	NC_014554	TAT	2	6	2852652	2852657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56010	NC_014554	ATAA	2	8	2852695	2852702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56011	NC_014554	TCAT	2	8	2852720	2852727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56012	NC_014554	AGTAA	2	10	2852728	2852737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56013	NC_014554	ATT	2	6	2852827	2852832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181840
56014	NC_014554	TTA	2	6	2852888	2852893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181840
56015	NC_014554	GCT	2	6	2852895	2852900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181840
56016	NC_014554	TCT	2	6	2852908	2852913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181840
56017	NC_014554	TAC	2	6	2852938	2852943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181840
56018	NC_014554	CCA	2	6	2852948	2852953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181840
56019	NC_014554	ATA	2	6	2853010	2853015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181840
56020	NC_014554	TGA	2	6	2853122	2853127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181840
56021	NC_014554	GACA	2	8	2853132	2853139	50 %	0 %	25 %	25 %	308181840
56022	NC_014554	ACC	2	6	2853202	2853207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181840
56023	NC_014554	ACC	3	9	2853232	2853240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181840
56024	NC_014554	CTTGTC	2	12	2853282	2853293	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	308181840
56025	NC_014554	AT	3	6	2853299	2853304	50 %	50 %	0 %	0 %	308181840
56026	NC_014554	ACA	2	6	2853377	2853382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181840
56027	NC_014554	ACCA	2	8	2853393	2853400	50 %	0 %	0 %	50 %	308181840
56028	NC_014554	A	6	6	2853502	2853507	100 %	0 %	0 %	0 %	308181840
56029	NC_014554	TCA	2	6	2853581	2853586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181840
56030	NC_014554	TGAA	2	8	2853740	2853747	50 %	25 %	25 %	0 %	308181841
56031	NC_014554	TGT	2	6	2853749	2853754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181841
56032	NC_014554	TAA	2	6	2853757	2853762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181841
56033	NC_014554	CAG	2	6	2853774	2853779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181841
56034	NC_014554	ATC	2	6	2853910	2853915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181841
56035	NC_014554	AAAT	2	8	2853955	2853962	75 %	25 %	0 %	0 %	308181841
56036	NC_014554	TAAC	2	8	2853980	2853987	50 %	25 %	0 %	25 %	308181841
56037	NC_014554	ATT	2	6	2854013	2854018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181841
56038	NC_014554	ATTT	2	8	2854023	2854030	25 %	75 %	0 %	0 %	308181841
56039	NC_014554	TTC	2	6	2854084	2854089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181841
56040	NC_014554	CTTT	2	8	2854215	2854222	0 %	75 %	0 %	25 %	308181841
56041	NC_014554	CAA	2	6	2854326	2854331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181841
56042	NC_014554	TTC	3	9	2854333	2854341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181841
56043	NC_014554	GCC	2	6	2854381	2854386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181841
56044	NC_014554	GAT	2	6	2854446	2854451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181841
56045	NC_014554	AAT	2	6	2854689	2854694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181841
56046	NC_014554	CGTA	2	8	2854695	2854702	25 %	25 %	25 %	25 %	308181841
56047	NC_014554	CAT	2	6	2854707	2854712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181841
56048	NC_014554	ATG	2	6	2854733	2854738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181841
56049	NC_014554	TAG	2	6	2854758	2854763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181841
56050	NC_014554	TTG	2	6	2854822	2854827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181841
56051	NC_014554	AACCC	2	10	2854884	2854893	40 %	0 %	0 %	60 %	308181841
56052	NC_014554	ACTTGT	2	12	2854910	2854921	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	308181841
56053	NC_014554	TTG	2	6	2854969	2854974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181841
56054	NC_014554	TCA	2	6	2855033	2855038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181841
56055	NC_014554	GAT	2	6	2855054	2855059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181841
56056	NC_014554	TTCTT	2	10	2855154	2855163	0 %	80 %	0 %	20 %	308181841
56057	NC_014554	TCAATA	2	12	2855216	2855227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	308181841
56058	NC_014554	CGT	2	6	2855363	2855368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181841
56059	NC_014554	CGTTG	2	10	2855487	2855496	0 %	40 %	40 %	20 %	308181841
56060	NC_014554	TATT	2	8	2855552	2855559	25 %	75 %	0 %	0 %	308181841
56061	NC_014554	AAT	2	6	2855590	2855595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181841
56062	NC_014554	ATT	2	6	2855632	2855637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181841
56063	NC_014554	TTC	2	6	2855705	2855710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181841
56064	NC_014554	AGC	2	6	2855755	2855760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181841
56065	NC_014554	A	6	6	2855838	2855843	100 %	0 %	0 %	0 %	308181841
56066	NC_014554	ATC	2	6	2855921	2855926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181841
56067	NC_014554	TTTG	2	8	2855943	2855950	0 %	75 %	25 %	0 %	308181841
56068	NC_014554	AAT	2	6	2855980	2855985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181841
56069	NC_014554	ATC	2	6	2856002	2856007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181841
56070	NC_014554	CAA	2	6	2856033	2856038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181841
56071	NC_014554	TTAA	2	8	2856053	2856060	50 %	50 %	0 %	0 %	308181841
56072	NC_014554	TGTC	2	8	2856118	2856125	0 %	50 %	25 %	25 %	308181841
56073	NC_014554	TTAATG	2	12	2856368	2856379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	308181842
56074	NC_014554	ATC	2	6	2856391	2856396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181842
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56077	NC_014554	CAG	2	6	2856585	2856590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181842
56078	NC_014554	AATT	2	8	2856613	2856620	50 %	50 %	0 %	0 %	308181842
56079	NC_014554	TCA	2	6	2856710	2856715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181842
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56081	NC_014554	TCG	2	6	2856738	2856743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181842
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56083	NC_014554	CCAT	2	8	2856834	2856841	25 %	25 %	0 %	50 %	308181842
56084	NC_014554	TTA	2	6	2856848	2856853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181842
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56086	NC_014554	ACA	2	6	2857034	2857039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181842
56087	NC_014554	ATA	2	6	2857049	2857054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181842
56088	NC_014554	CGG	2	6	2857185	2857190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181842
56089	NC_014554	CCAA	2	8	2857264	2857271	50 %	0 %	0 %	50 %	308181842
56090	NC_014554	AAC	2	6	2857387	2857392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181842
56091	NC_014554	AT	3	6	2857400	2857405	50 %	50 %	0 %	0 %	308181842
56092	NC_014554	TTC	2	6	2857448	2857453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181842
56093	NC_014554	ACTC	2	8	2857457	2857464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56094	NC_014554	TTC	2	6	2857470	2857475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56095	NC_014554	TTTA	2	8	2857487	2857494	25 %	75 %	0 %	0 %	308181843
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56098	NC_014554	T	6	6	2857610	2857615	0 %	100 %	0 %	0 %	308181843
56099	NC_014554	CAAT	2	8	2857625	2857632	50 %	25 %	0 %	25 %	308181843
56100	NC_014554	TGT	2	6	2857693	2857698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181843
56101	NC_014554	GCT	2	6	2857729	2857734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181843
56102	NC_014554	CGC	2	6	2857749	2857754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181843
56103	NC_014554	CTG	2	6	2857775	2857780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181843
56104	NC_014554	ATG	2	6	2857784	2857789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181843
56105	NC_014554	CAA	2	6	2857796	2857801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181843
56106	NC_014554	T	6	6	2857833	2857838	0 %	100 %	0 %	0 %	308181844
56107	NC_014554	T	6	6	2857967	2857972	0 %	100 %	0 %	0 %	308181844
56108	NC_014554	TAGCA	2	10	2857978	2857987	40 %	20 %	20 %	20 %	308181844
56109	NC_014554	TGGT	2	8	2858002	2858009	0 %	50 %	50 %	0 %	308181844
56110	NC_014554	TTG	2	6	2858037	2858042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181844
56111	NC_014554	GAAT	2	8	2858049	2858056	50 %	25 %	25 %	0 %	308181844
56112	NC_014554	CAG	2	6	2858061	2858066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181844
56113	NC_014554	CTT	2	6	2858130	2858135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181844
56114	NC_014554	A	7	7	2858252	2858258	100 %	0 %	0 %	0 %	308181844
56115	NC_014554	CTG	2	6	2858305	2858310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181845
56116	NC_014554	AAT	2	6	2858323	2858328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181845
56117	NC_014554	TTA	2	6	2858349	2858354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181845
56118	NC_014554	ATC	2	6	2858407	2858412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181845
56119	NC_014554	GTTG	2	8	2858513	2858520	0 %	50 %	50 %	0 %	308181845
56120	NC_014554	TGG	2	6	2858568	2858573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181845
56121	NC_014554	AGTT	2	8	2858647	2858654	25 %	50 %	25 %	0 %	308181845
56122	NC_014554	AAT	2	6	2858656	2858661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181845
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56125	NC_014554	TAA	2	6	2858713	2858718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181845
56126	NC_014554	GACT	2	8	2858808	2858815	25 %	25 %	25 %	25 %	308181845
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56132	NC_014554	AGTGC	2	10	2859048	2859057	20 %	20 %	40 %	20 %	308181845
56133	NC_014554	TAA	2	6	2859244	2859249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181845
56134	NC_014554	TCGT	2	8	2859294	2859301	0 %	50 %	25 %	25 %	308181845
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56145	NC_014554	TAT	2	6	2859951	2859956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181845
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56149	NC_014554	ATT	2	6	2860257	2860262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56150	NC_014554	TTA	2	6	2860307	2860312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56151	NC_014554	AATT	2	8	2860433	2860440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56152	NC_014554	ATCA	2	8	2860451	2860458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56153	NC_014554	A	6	6	2860460	2860465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56154	NC_014554	GCT	2	6	2860495	2860500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56155	NC_014554	TTCAA	2	10	2860590	2860599	40 %	40 %	0 %	20 %	308181846
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56159	NC_014554	T	7	7	2860899	2860905	0 %	100 %	0 %	0 %	308181846
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56161	NC_014554	ATTA	2	8	2861112	2861119	50 %	50 %	0 %	0 %	308181847
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56168	NC_014554	ATT	2	6	2861639	2861644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181847
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56178	NC_014554	GCC	2	6	2862081	2862086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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56225	NC_014554	GTT	2	6	2864226	2864231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181848
56226	NC_014554	GTT	2	6	2864254	2864259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56227	NC_014554	TAA	2	6	2864270	2864275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56228	NC_014554	ATCC	2	8	2864282	2864289	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56229	NC_014554	CTAA	2	8	2864312	2864319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56230	NC_014554	CTTT	2	8	2864348	2864355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56231	NC_014554	ATA	3	9	2864363	2864371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56232	NC_014554	GCC	2	6	2864372	2864377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56233	NC_014554	ATTAA	2	10	2864404	2864413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56234	NC_014554	CGT	2	6	2864515	2864520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181849
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56236	NC_014554	GTGC	2	8	2864550	2864557	0 %	25 %	50 %	25 %	308181849
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56238	NC_014554	GTT	2	6	2864604	2864609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181849
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56255	NC_014554	A	7	7	2865170	2865176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56256	NC_014554	TTA	2	6	2865227	2865232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181850
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56264	NC_014554	CAA	2	6	2865645	2865650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56265	NC_014554	CAAT	2	8	2865805	2865812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56266	NC_014554	G	6	6	2865915	2865920	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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56275	NC_014554	ATT	2	6	2866291	2866296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56343	NC_014554	ATA	2	6	2869774	2869779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56344	NC_014554	TA	3	6	2869801	2869806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56345	NC_014554	TAT	2	6	2869813	2869818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56346	NC_014554	A	7	7	2869839	2869845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56347	NC_014554	A	6	6	2869861	2869866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56348	NC_014554	A	6	6	2869880	2869885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56349	NC_014554	TAA	2	6	2869991	2869996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181855
56350	NC_014554	GGC	2	6	2870081	2870086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181855
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56352	NC_014554	GTG	2	6	2870125	2870130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181855
56353	NC_014554	TGA	2	6	2870142	2870147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181855
56354	NC_014554	ATT	2	6	2870178	2870183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181855
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56356	NC_014554	TCA	2	6	2870277	2870282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181856
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56464	NC_014554	AAAC	2	8	2875139	2875146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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56467	NC_014554	CTTCA	2	10	2875253	2875262	20 %	40 %	0 %	40 %	308181861
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56479	NC_014554	CGG	2	6	2876120	2876125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181862
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