MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 64050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_014554	CTC	2	6	2699799	2699804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	308181699
53002	NC_014554	GAC	2	6	2699852	2699857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181699
53003	NC_014554	CAC	2	6	2699943	2699948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181699
53004	NC_014554	TGG	2	6	2700122	2700127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181699
53005	NC_014554	AGT	2	6	2700143	2700148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181699
53006	NC_014554	ACA	2	6	2700196	2700201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181699
53007	NC_014554	GTG	2	6	2700223	2700228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181699
53008	NC_014554	TCA	2	6	2700230	2700235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181699
53009	NC_014554	CTT	2	6	2700241	2700246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53010	NC_014554	TG	3	6	2700257	2700262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53011	NC_014554	TGG	2	6	2700352	2700357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53012	NC_014554	TAA	2	6	2700360	2700365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53013	NC_014554	CAT	2	6	2700401	2700406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53014	NC_014554	TTA	2	6	2700421	2700426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53015	NC_014554	TGAC	2	8	2700494	2700501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53016	NC_014554	AAT	2	6	2700525	2700530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53017	NC_014554	A	6	6	2700540	2700545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53018	NC_014554	TAA	2	6	2700555	2700560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53019	NC_014554	CGG	2	6	2700599	2700604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53020	NC_014554	ATA	2	6	2700646	2700651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53021	NC_014554	GCA	2	6	2700659	2700664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53022	NC_014554	TAA	2	6	2700726	2700731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53023	NC_014554	CTA	2	6	2700785	2700790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53024	NC_014554	ACA	2	6	2700848	2700853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53025	NC_014554	GGT	2	6	2700870	2700875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53026	NC_014554	CA	3	6	2700876	2700881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53027	NC_014554	GAT	2	6	2700891	2700896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53028	NC_014554	ATG	2	6	2700982	2700987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53029	NC_014554	ACA	2	6	2701031	2701036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53030	NC_014554	CTG	2	6	2701076	2701081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53031	NC_014554	ACC	2	6	2701090	2701095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53032	NC_014554	TCA	2	6	2701096	2701101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53033	NC_014554	TAA	2	6	2701197	2701202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53034	NC_014554	TTA	3	9	2701216	2701224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53035	NC_014554	ATT	2	6	2701225	2701230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53036	NC_014554	A	6	6	2701234	2701239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_014554	ACCA	2	8	2701389	2701396	50 %	0 %	0 %	50 %	308181700
53038	NC_014554	GCA	2	6	2701400	2701405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53039	NC_014554	TCG	2	6	2701413	2701418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53040	NC_014554	ACTG	2	8	2701441	2701448	25 %	25 %	25 %	25 %	308181700
53041	NC_014554	TGTT	2	8	2701472	2701479	0 %	75 %	25 %	0 %	308181700
53042	NC_014554	GT	3	6	2701578	2701583	0 %	50 %	50 %	0 %	308181700
53043	NC_014554	GTG	2	6	2701769	2701774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181700
53044	NC_014554	ACT	2	6	2701792	2701797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181700
53045	NC_014554	TCG	2	6	2701820	2701825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53046	NC_014554	GTAA	2	8	2701831	2701838	50 %	25 %	25 %	0 %	308181700
53047	NC_014554	GCTT	2	8	2701880	2701887	0 %	50 %	25 %	25 %	308181700
53048	NC_014554	CGA	2	6	2701899	2701904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53049	NC_014554	T	6	6	2701981	2701986	0 %	100 %	0 %	0 %	308181700
53050	NC_014554	GTGACG	2	12	2702042	2702053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	308181700
53051	NC_014554	CGT	3	9	2702113	2702121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53052	NC_014554	TAC	2	6	2702136	2702141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181700
53053	NC_014554	TCG	2	6	2702175	2702180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53054	NC_014554	CGTCTG	2	12	2702335	2702346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53055	NC_014554	GAA	2	6	2702351	2702356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181700
53056	NC_014554	TAG	2	6	2702388	2702393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181700
53057	NC_014554	ATA	2	6	2702447	2702452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181700
53058	NC_014554	CGTCAT	2	12	2702503	2702514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181700
53059	NC_014554	GTC	2	6	2702525	2702530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53060	NC_014554	TAC	2	6	2702613	2702618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181700
53061	NC_014554	ACC	2	6	2702629	2702634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181700
53062	NC_014554	AGC	2	6	2702650	2702655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53063	NC_014554	CGTC	2	8	2702667	2702674	0 %	25 %	25 %	50 %	308181700
53064	NC_014554	GCA	2	6	2702712	2702717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181700
53065	NC_014554	AAC	2	6	2702844	2702849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181701
53066	NC_014554	CCA	2	6	2702856	2702861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181701
53067	NC_014554	TTG	2	6	2702903	2702908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181701
53068	NC_014554	CGG	2	6	2702955	2702960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	308181701
53069	NC_014554	CTGA	2	8	2702974	2702981	25 %	25 %	25 %	25 %	308181701
53070	NC_014554	TAA	2	6	2703016	2703021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181701
53071	NC_014554	ACC	2	6	2703032	2703037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181701
53072	NC_014554	CGGG	2	8	2703051	2703058	0 %	0 %	75 %	25 %	308181701
53073	NC_014554	AAT	2	6	2703059	2703064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181701
53074	NC_014554	GT	3	6	2703119	2703124	0 %	50 %	50 %	0 %	308181701
53075	NC_014554	GCC	2	6	2703126	2703131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181701
53076	NC_014554	CCA	2	6	2703182	2703187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	308181701
53077	NC_014554	CGC	3	9	2703234	2703242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181702
53078	NC_014554	AAT	2	6	2703281	2703286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181702
53079	NC_014554	GAATA	2	10	2703305	2703314	60 %	20 %	20 %	0 %	308181702
53080	NC_014554	TGA	2	6	2703382	2703387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181702
53081	NC_014554	GAT	2	6	2703412	2703417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181702
53082	NC_014554	TTC	2	6	2703522	2703527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181702
53083	NC_014554	TGA	2	6	2703541	2703546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181702
53084	NC_014554	CCG	2	6	2703658	2703663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181702
53085	NC_014554	TTGTGG	2	12	2703683	2703694	0 %	50 %	50 %	0 %	308181702
53086	NC_014554	CAG	2	6	2703703	2703708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181702
53087	NC_014554	GCTT	2	8	2703831	2703838	0 %	50 %	25 %	25 %	308181702
53088	NC_014554	AAG	2	6	2703940	2703945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181702
53089	NC_014554	TCG	2	6	2704054	2704059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181702
53090	NC_014554	ATT	2	6	2704127	2704132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	308181702
53091	NC_014554	GCTACT	2	12	2704187	2704198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	308181702
53092	NC_014554	GCT	2	6	2704226	2704231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181702
53093	NC_014554	AAT	2	6	2704281	2704286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181702
53094	NC_014554	TCT	2	6	2704291	2704296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	308181702
53095	NC_014554	TTG	2	6	2704353	2704358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181703
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53098	NC_014554	CTG	2	6	2704842	2704847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181703
53099	NC_014554	GCA	2	6	2704973	2704978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53100	NC_014554	CAA	2	6	2704983	2704988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53101	NC_014554	TAC	2	6	2704995	2705000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53102	NC_014554	TAA	3	9	2705005	2705013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53103	NC_014554	TAA	2	6	2705026	2705031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53104	NC_014554	TCA	2	6	2705096	2705101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53105	NC_014554	GGT	2	6	2705111	2705116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53106	NC_014554	CAA	2	6	2705123	2705128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53107	NC_014554	GATT	2	8	2705200	2705207	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_014554	AATT	2	8	2705208	2705215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53109	NC_014554	TTGG	2	8	2705251	2705258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_014554	TAA	2	6	2705272	2705277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_014554	CAA	2	6	2705381	2705386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53112	NC_014554	AATA	2	8	2705401	2705408	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53113	NC_014554	CAA	2	6	2705418	2705423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53114	NC_014554	GTA	2	6	2705434	2705439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53115	NC_014554	AATT	2	8	2705440	2705447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53116	NC_014554	TGC	2	6	2705470	2705475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53117	NC_014554	GGA	2	6	2705554	2705559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53118	NC_014554	ATA	2	6	2705632	2705637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_014554	CG	3	6	2705655	2705660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53120	NC_014554	TCC	2	6	2705677	2705682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53121	NC_014554	TTG	2	6	2705723	2705728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53122	NC_014554	ATTA	2	8	2705743	2705750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53123	NC_014554	TAA	2	6	2705786	2705791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181704
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53125	NC_014554	GCTG	2	8	2705863	2705870	0 %	25 %	50 %	25 %	308181704
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53147	NC_014554	AATTA	2	10	2707210	2707219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53356	NC_014554	AAC	2	6	2718497	2718502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53357	NC_014554	ACC	2	6	2718509	2718514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53358	NC_014554	ATC	2	6	2718522	2718527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53359	NC_014554	GAT	2	6	2718564	2718569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53360	NC_014554	GAT	2	6	2718651	2718656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	308181716
53361	NC_014554	CAT	2	6	2718709	2718714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181716
53362	NC_014554	AAT	2	6	2718829	2718834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181716
53363	NC_014554	CATCT	2	10	2718853	2718862	20 %	40 %	0 %	40 %	308181716
53364	NC_014554	TCG	2	6	2718960	2718965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181716
53365	NC_014554	CAA	2	6	2719026	2719031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	308181716
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53368	NC_014554	GTC	2	6	2719280	2719285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181716
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53370	NC_014554	CTG	2	6	2719317	2719322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181716
53371	NC_014554	CAT	2	6	2719324	2719329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181716
53372	NC_014554	TCA	2	6	2719427	2719432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181716
53373	NC_014554	ATC	2	6	2719522	2719527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181716
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53377	NC_014554	AATC	2	8	2719785	2719792	50 %	25 %	0 %	25 %	308181716
53378	NC_014554	GAC	2	6	2719834	2719839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	308181716
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53382	NC_014554	ATC	2	6	2720056	2720061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181716
53383	NC_014554	ATA	2	6	2720074	2720079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181716
53384	NC_014554	CGC	2	6	2720107	2720112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	308181716
53385	NC_014554	T	6	6	2720121	2720126	0 %	100 %	0 %	0 %	308181716
53386	NC_014554	GTC	2	6	2720171	2720176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181716
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53393	NC_014554	TTA	2	6	2720549	2720554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53394	NC_014554	AAAT	2	8	2720818	2720825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53395	NC_014554	A	7	7	2720884	2720890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53396	NC_014554	ATT	2	6	2720924	2720929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53397	NC_014554	TAA	2	6	2721188	2721193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	308181717
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53400	NC_014554	CGT	2	6	2721476	2721481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181717
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53407	NC_014554	GCTGA	2	10	2721843	2721852	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53408	NC_014554	TCA	2	6	2721986	2721991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53409	NC_014554	ATA	2	6	2722039	2722044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53410	NC_014554	ATTC	2	8	2722067	2722074	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53411	NC_014554	TTG	2	6	2722248	2722253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53413	NC_014554	ACA	2	6	2722307	2722312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53414	NC_014554	CATG	2	8	2722370	2722377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53415	NC_014554	GTT	3	9	2722406	2722414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53417	NC_014554	CAA	2	6	2722485	2722490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53420	NC_014554	AGC	2	6	2722570	2722575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53421	NC_014554	GTC	2	6	2722612	2722617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53422	NC_014554	ACCA	2	8	2722659	2722666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53423	NC_014554	CGA	2	6	2722742	2722747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53424	NC_014554	AAT	2	6	2722780	2722785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53425	NC_014554	CCA	2	6	2722809	2722814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53426	NC_014554	CAC	2	6	2722824	2722829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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53428	NC_014554	TGC	2	6	2722848	2722853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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53430	NC_014554	ACC	2	6	2722900	2722905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53431	NC_014554	AACA	2	8	2722959	2722966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53432	NC_014554	TCA	2	6	2723000	2723005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53450	NC_014554	AGAT	2	8	2724019	2724026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53451	NC_014554	TAAAAA	2	12	2724035	2724046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53459	NC_014554	GTCC	2	8	2724493	2724500	0 %	25 %	25 %	50 %	308181719
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53464	NC_014554	GTT	2	6	2725063	2725068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	308181720
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53472	NC_014554	ACTG	2	8	2725638	2725645	25 %	25 %	25 %	25 %	308181720
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53474	NC_014554	GAA	2	6	2725695	2725700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	308181720
53475	NC_014554	GGT	2	6	2725717	2725722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	308181720
53476	NC_014554	TCG	2	6	2725733	2725738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	308181720
53477	NC_014554	TCA	2	6	2725819	2725824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	308181720
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53492	NC_014554	CA	3	6	2726622	2726627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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