MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014334	CTT	3	9	2514202	2514210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067585
48502	NC_014334	GTC	2	6	2514296	2514301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067585
48503	NC_014334	CCAAG	2	10	2514313	2514322	40 %	0 %	20 %	40 %	301067585
48504	NC_014334	TCA	2	6	2514352	2514357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067585
48505	NC_014334	T	6	6	2514428	2514433	0 %	100 %	0 %	0 %	301067585
48506	NC_014334	TCG	2	6	2514468	2514473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067585
48507	NC_014334	GCC	2	6	2514567	2514572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067585
48508	NC_014334	TTG	2	6	2514648	2514653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067585
48509	NC_014334	TCT	2	6	2514726	2514731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067585
48510	NC_014334	CAT	2	6	2514745	2514750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067585
48511	NC_014334	GC	3	6	2514765	2514770	0 %	0 %	50 %	50 %	301067585
48512	NC_014334	CAA	2	6	2514808	2514813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067585
48513	NC_014334	AGCC	2	8	2514873	2514880	25 %	0 %	25 %	50 %	301067585
48514	NC_014334	AAT	2	6	2514926	2514931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067585
48515	NC_014334	CAAT	2	8	2514970	2514977	50 %	25 %	0 %	25 %	301067585
48516	NC_014334	TGGC	2	8	2514985	2514992	0 %	25 %	50 %	25 %	301067585
48517	NC_014334	CAAA	2	8	2515003	2515010	75 %	0 %	0 %	25 %	301067585
48518	NC_014334	AAC	2	6	2515076	2515081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067585
48519	NC_014334	TCGGA	2	10	2515087	2515096	20 %	20 %	40 %	20 %	301067585
48520	NC_014334	ATA	2	6	2515223	2515228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067585
48521	NC_014334	CAA	2	6	2515232	2515237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067585
48522	NC_014334	AAG	2	6	2515263	2515268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067585
48523	NC_014334	CCG	2	6	2515317	2515322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067585
48524	NC_014334	CCAG	2	8	2515400	2515407	25 %	0 %	25 %	50 %	301067585
48525	NC_014334	TGA	2	6	2515438	2515443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067585
48526	NC_014334	GCCAT	2	10	2515551	2515560	20 %	20 %	20 %	40 %	301067585
48527	NC_014334	TCG	2	6	2515623	2515628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067585
48528	NC_014334	GAA	2	6	2515640	2515645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067585
48529	NC_014334	CGT	2	6	2515648	2515653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067585
48530	NC_014334	CTG	2	6	2515687	2515692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067585
48531	NC_014334	GTG	2	6	2515698	2515703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067585
48532	NC_014334	TAA	2	6	2515737	2515742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067585
48533	NC_014334	GTT	2	6	2515749	2515754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067585
48534	NC_014334	TTGC	2	8	2515770	2515777	0 %	50 %	25 %	25 %	301067585
48535	NC_014334	TGC	2	6	2515868	2515873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067586
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48538	NC_014334	GCG	2	6	2515996	2516001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067586
48539	NC_014334	TCA	2	6	2516010	2516015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067586
48540	NC_014334	ATC	2	6	2516183	2516188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067586
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48542	NC_014334	GCC	2	6	2516220	2516225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067586
48543	NC_014334	GTTC	2	8	2516253	2516260	0 %	50 %	25 %	25 %	301067586
48544	NC_014334	TGT	2	6	2516313	2516318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067586
48545	NC_014334	ATC	2	6	2516358	2516363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067586
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48548	NC_014334	TCT	2	6	2516520	2516525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067586
48549	NC_014334	GAC	2	6	2516532	2516537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067586
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48551	NC_014334	GTC	2	6	2516591	2516596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067586
48552	NC_014334	AAT	2	6	2516608	2516613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067586
48553	NC_014334	CGA	2	6	2516618	2516623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067586
48554	NC_014334	GCG	2	6	2516650	2516655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067586
48555	NC_014334	TAA	2	6	2516688	2516693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067586
48556	NC_014334	CTT	2	6	2516722	2516727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067586
48557	NC_014334	CTT	2	6	2516753	2516758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48558	NC_014334	ATG	2	6	2516763	2516768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48559	NC_014334	TAC	2	6	2516785	2516790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48560	NC_014334	AGAA	2	8	2516808	2516815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48561	NC_014334	GGT	2	6	2516849	2516854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48562	NC_014334	GAT	2	6	2516866	2516871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48563	NC_014334	GCTGT	2	10	2516898	2516907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48564	NC_014334	CAA	2	6	2516994	2516999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067587
48565	NC_014334	GCA	2	6	2517025	2517030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067587
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48567	NC_014334	ATT	2	6	2517042	2517047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067587
48568	NC_014334	TGC	2	6	2517082	2517087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067587
48569	NC_014334	GAT	2	6	2517090	2517095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067587
48570	NC_014334	CTG	2	6	2517102	2517107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067587
48571	NC_014334	TTC	2	6	2517111	2517116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067587
48572	NC_014334	CAT	2	6	2517195	2517200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067587
48573	NC_014334	GTC	2	6	2517250	2517255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067587
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48577	NC_014334	TGC	2	6	2517394	2517399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067587
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48580	NC_014334	CGT	2	6	2517642	2517647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067587
48581	NC_014334	CG	3	6	2517704	2517709	0 %	0 %	50 %	50 %	301067587
48582	NC_014334	GAT	2	6	2517722	2517727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067587
48583	NC_014334	ATC	2	6	2517754	2517759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067587
48584	NC_014334	TCT	2	6	2517785	2517790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067588
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48586	NC_014334	AAG	2	6	2517974	2517979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067588
48587	NC_014334	AC	3	6	2518020	2518025	50 %	0 %	0 %	50 %	301067588
48588	NC_014334	GATCA	2	10	2518036	2518045	40 %	20 %	20 %	20 %	301067588
48589	NC_014334	AAT	3	9	2518054	2518062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067588
48590	NC_014334	TTC	2	6	2518069	2518074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067588
48591	NC_014334	TGG	2	6	2518156	2518161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067588
48592	NC_014334	ATTA	2	8	2518171	2518178	50 %	50 %	0 %	0 %	301067588
48593	NC_014334	T	6	6	2518219	2518224	0 %	100 %	0 %	0 %	301067588
48594	NC_014334	CTTTG	2	10	2518239	2518248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48595	NC_014334	ATC	2	6	2518251	2518256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48596	NC_014334	TGA	2	6	2518298	2518303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48597	NC_014334	T	7	7	2518310	2518316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48598	NC_014334	T	6	6	2518384	2518389	0 %	100 %	0 %	0 %	301067589
48599	NC_014334	TGA	2	6	2518564	2518569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067589
48600	NC_014334	TGG	2	6	2518594	2518599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067589
48601	NC_014334	CAT	2	6	2518657	2518662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067589
48602	NC_014334	ATT	2	6	2518709	2518714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067589
48603	NC_014334	CACG	2	8	2518774	2518781	25 %	0 %	25 %	50 %	301067589
48604	NC_014334	AGTCCC	2	12	2518844	2518855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	301067589
48605	NC_014334	AAT	2	6	2518856	2518861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067589
48606	NC_014334	CAT	2	6	2519083	2519088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067589
48607	NC_014334	ACA	2	6	2519097	2519102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067589
48608	NC_014334	GCC	2	6	2519123	2519128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067589
48609	NC_014334	ATCA	2	8	2519180	2519187	50 %	25 %	0 %	25 %	301067589
48610	NC_014334	CCAATA	2	12	2519250	2519261	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	301067589
48611	NC_014334	A	6	6	2519284	2519289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48612	NC_014334	T	6	6	2519325	2519330	0 %	100 %	0 %	0 %	301067590
48613	NC_014334	AGC	2	6	2519379	2519384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067590
48614	NC_014334	CGG	2	6	2519414	2519419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067590
48615	NC_014334	CAAAG	2	10	2519421	2519430	60 %	0 %	20 %	20 %	301067590
48616	NC_014334	CAA	2	6	2519443	2519448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067590
48617	NC_014334	GCT	2	6	2519469	2519474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067590
48618	NC_014334	GAA	2	6	2519675	2519680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067590
48619	NC_014334	TTCG	2	8	2519710	2519717	0 %	50 %	25 %	25 %	301067590
48620	NC_014334	TGA	3	9	2519733	2519741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067590
48621	NC_014334	GCG	2	6	2519833	2519838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067590
48622	NC_014334	GCC	2	6	2519902	2519907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067590
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48628	NC_014334	ACA	2	6	2520245	2520250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067591
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48637	NC_014334	CCT	2	6	2520710	2520715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48638	NC_014334	CGTT	2	8	2520795	2520802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48639	NC_014334	ATG	2	6	2520834	2520839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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48641	NC_014334	TAACA	2	10	2520944	2520953	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48642	NC_014334	GGT	2	6	2520998	2521003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067592
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48655	NC_014334	CTG	2	6	2521643	2521648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067593
48656	NC_014334	TTTG	2	8	2521655	2521662	0 %	75 %	25 %	0 %	301067593
48657	NC_014334	CAA	2	6	2521727	2521732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067593
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48665	NC_014334	GGA	2	6	2522293	2522298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48676	NC_014334	CTT	2	6	2522879	2522884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48702	NC_014334	GCA	2	6	2524019	2524024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067597
48703	NC_014334	T	6	6	2524050	2524055	0 %	100 %	0 %	0 %	301067597
48704	NC_014334	CAG	2	6	2524059	2524064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067597
48705	NC_014334	TTG	2	6	2524080	2524085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067597
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48709	NC_014334	ATCC	2	8	2524196	2524203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48710	NC_014334	ATGACC	2	12	2524256	2524267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48711	NC_014334	GGCT	2	8	2524311	2524318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48712	NC_014334	GCT	2	6	2524352	2524357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48713	NC_014334	GC	3	6	2524453	2524458	0 %	0 %	50 %	50 %	301067598
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48716	NC_014334	T	6	6	2524681	2524686	0 %	100 %	0 %	0 %	301067598
48717	NC_014334	CGT	2	6	2524692	2524697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067598
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48720	NC_014334	TGA	2	6	2524981	2524986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067598
48721	NC_014334	TGA	2	6	2525032	2525037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067598
48722	NC_014334	TTC	2	6	2525052	2525057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067598
48723	NC_014334	CTTGG	2	10	2525084	2525093	0 %	40 %	40 %	20 %	301067598
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48725	NC_014334	TGC	2	6	2525189	2525194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067598
48726	NC_014334	ATG	2	6	2525336	2525341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067598
48727	NC_014334	TCC	2	6	2525357	2525362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067599
48728	NC_014334	TGCA	2	8	2525395	2525402	25 %	25 %	25 %	25 %	301067599
48729	NC_014334	CAT	2	6	2525415	2525420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
48730	NC_014334	TGA	2	6	2525586	2525591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067599
48731	NC_014334	CAG	2	6	2525626	2525631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067599
48732	NC_014334	CGG	2	6	2525639	2525644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067599
48733	NC_014334	TCA	2	6	2525658	2525663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067599
48734	NC_014334	CAG	2	6	2525667	2525672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067599
48735	NC_014334	AGT	2	6	2525709	2525714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067599
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48846	NC_014334	GCCA	2	8	2531913	2531920	25 %	0 %	25 %	50 %	301067603
48847	NC_014334	GC	3	6	2531993	2531998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48848	NC_014334	GC	3	6	2532114	2532119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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48850	NC_014334	GCA	2	6	2532263	2532268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48955	NC_014334	CACC	2	8	2537024	2537031	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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48957	NC_014334	TG	3	6	2537129	2537134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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48964	NC_014334	ATG	2	6	2537658	2537663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067610
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