MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_014334	ACC	2	6	2488550	2488555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067561
48003	NC_014334	AAT	2	6	2488637	2488642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067561
48004	NC_014334	TGGC	2	8	2488677	2488684	0 %	25 %	50 %	25 %	301067561
48005	NC_014334	GCC	2	6	2488688	2488693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067561
48006	NC_014334	CGG	2	6	2488702	2488707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067561
48007	NC_014334	TA	3	6	2488770	2488775	50 %	50 %	0 %	0 %	301067561
48008	NC_014334	GATTGC	2	12	2488813	2488824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301067561
48009	NC_014334	GCA	2	6	2488867	2488872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48010	NC_014334	TCA	2	6	2488979	2488984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067562
48011	NC_014334	CTT	2	6	2489142	2489147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067562
48012	NC_014334	ATT	2	6	2489149	2489154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067562
48013	NC_014334	CTG	2	6	2489170	2489175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067562
48014	NC_014334	AAG	2	6	2489234	2489239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067562
48015	NC_014334	TAA	2	6	2489287	2489292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067562
48016	NC_014334	ATC	2	6	2489302	2489307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48017	NC_014334	AAT	2	6	2489382	2489387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48018	NC_014334	GCTT	2	8	2489399	2489406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48019	NC_014334	TAG	2	6	2489433	2489438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48020	NC_014334	TTG	2	6	2489488	2489493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067563
48021	NC_014334	CCAAAA	2	12	2489526	2489537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067563
48022	NC_014334	CTTGC	2	10	2489548	2489557	0 %	40 %	20 %	40 %	301067563
48023	NC_014334	CGG	2	6	2489732	2489737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067563
48024	NC_014334	ATG	2	6	2489747	2489752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067563
48025	NC_014334	ATC	2	6	2489764	2489769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067563
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48028	NC_014334	TCA	2	6	2489894	2489899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067563
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48030	NC_014334	ATC	2	6	2490052	2490057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067563
48031	NC_014334	CCA	2	6	2490083	2490088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067563
48032	NC_014334	TTC	2	6	2490119	2490124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067563
48033	NC_014334	CATCT	2	10	2490148	2490157	20 %	40 %	0 %	40 %	301067563
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48039	NC_014334	TAA	2	6	2490340	2490345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067563
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48043	NC_014334	CGT	2	6	2490537	2490542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067563
48044	NC_014334	TTGC	2	8	2490689	2490696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48045	NC_014334	AAT	2	6	2490748	2490753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48046	NC_014334	CAA	2	6	2490859	2490864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48047	NC_014334	CCT	2	6	2490882	2490887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48048	NC_014334	CAT	2	6	2490890	2490895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48049	NC_014334	CTT	2	6	2490928	2490933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48050	NC_014334	TGTAA	2	10	2491003	2491012	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48051	NC_014334	AAT	2	6	2491127	2491132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48052	NC_014334	CCTTCG	2	12	2491143	2491154	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48053	NC_014334	TGC	2	6	2491289	2491294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48054	NC_014334	ATC	2	6	2491322	2491327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48055	NC_014334	CGTC	2	8	2491360	2491367	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48056	NC_014334	GCT	2	6	2491416	2491421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48057	NC_014334	ATCAGC	2	12	2491436	2491447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48058	NC_014334	TCA	2	6	2491560	2491565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48059	NC_014334	TCA	2	6	2491707	2491712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48060	NC_014334	CTC	2	6	2491717	2491722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48061	NC_014334	TCG	2	6	2491747	2491752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48062	NC_014334	CCT	2	6	2491872	2491877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48063	NC_014334	TTC	2	6	2491889	2491894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48066	NC_014334	TG	3	6	2492067	2492072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48067	NC_014334	ATT	2	6	2492113	2492118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48068	NC_014334	TA	3	6	2492184	2492189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48069	NC_014334	ATT	2	6	2492212	2492217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48070	NC_014334	T	7	7	2492266	2492272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48071	NC_014334	ATTT	2	8	2492274	2492281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48072	NC_014334	GGA	2	6	2492288	2492293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48101	NC_014334	A	6	6	2493522	2493527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48102	NC_014334	ATC	2	6	2493578	2493583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48103	NC_014334	ATCTA	2	10	2493607	2493616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48104	NC_014334	AATG	2	8	2493665	2493672	50 %	25 %	25 %	0 %	301067565
48105	NC_014334	GCTT	2	8	2493687	2493694	0 %	50 %	25 %	25 %	301067565
48106	NC_014334	TTTCG	2	10	2493735	2493744	0 %	60 %	20 %	20 %	301067565
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48113	NC_014334	CAG	2	6	2494098	2494103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48114	NC_014334	CAAT	2	8	2494137	2494144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48115	NC_014334	ATG	2	6	2494227	2494232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48116	NC_014334	TAAA	2	8	2494237	2494244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48117	NC_014334	A	6	6	2494242	2494247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48118	NC_014334	T	6	6	2494272	2494277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48120	NC_014334	ATG	2	6	2494340	2494345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067566
48121	NC_014334	AGTC	2	8	2494419	2494426	25 %	25 %	25 %	25 %	301067566
48122	NC_014334	ACA	2	6	2494427	2494432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067566
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48128	NC_014334	TCA	2	6	2494623	2494628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067566
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48132	NC_014334	CAA	2	6	2494902	2494907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067566
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48140	NC_014334	A	7	7	2495322	2495328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48166	NC_014334	CAA	2	6	2496834	2496839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48238	NC_014334	TGT	2	6	2499943	2499948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067571
48239	NC_014334	CAT	2	6	2499967	2499972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067571
48240	NC_014334	TCA	2	6	2500014	2500019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067571
48241	NC_014334	CGC	2	6	2500027	2500032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067571
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48243	NC_014334	TTG	2	6	2500085	2500090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067571
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48248	NC_014334	CGA	2	6	2500350	2500355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067571
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48252	NC_014334	CCA	2	6	2500482	2500487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067571
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48255	NC_014334	A	6	6	2500592	2500597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48256	NC_014334	T	6	6	2500631	2500636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48257	NC_014334	TAA	2	6	2500649	2500654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067572
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48265	NC_014334	CCAG	2	8	2501017	2501024	25 %	0 %	25 %	50 %	301067572
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48292	NC_014334	TCT	2	6	2502676	2502681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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48342	NC_014334	GT	3	6	2505290	2505295	0 %	50 %	50 %	0 %	301067577
48343	NC_014334	CTTT	2	8	2505323	2505330	0 %	75 %	0 %	25 %	301067578
48344	NC_014334	T	6	6	2505378	2505383	0 %	100 %	0 %	0 %	301067578
48345	NC_014334	GCA	2	6	2505385	2505390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067578
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48348	NC_014334	GTTT	2	8	2505577	2505584	0 %	75 %	25 %	0 %	301067578
48349	NC_014334	CTT	2	6	2505689	2505694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067578
48350	NC_014334	CAA	2	6	2505722	2505727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067578
48351	NC_014334	A	7	7	2505747	2505753	100 %	0 %	0 %	0 %	301067578
48352	NC_014334	GCT	2	6	2505754	2505759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067578
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48354	NC_014334	TAT	2	6	2505908	2505913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48471	NC_014334	TTG	2	6	2512352	2512357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067584
48472	NC_014334	CAA	2	6	2512409	2512414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067584
48473	NC_014334	A	6	6	2512425	2512430	100 %	0 %	0 %	0 %	301067584
48474	NC_014334	T	6	6	2512459	2512464	0 %	100 %	0 %	0 %	301067584
48475	NC_014334	ATC	2	6	2512488	2512493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067584
48476	NC_014334	AAAC	2	8	2512539	2512546	75 %	0 %	0 %	25 %	301067584
48477	NC_014334	CAA	2	6	2512565	2512570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067584
48478	NC_014334	CTC	2	6	2512673	2512678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067584
48479	NC_014334	CAA	2	6	2512724	2512729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067584
48480	NC_014334	TTC	2	6	2512752	2512757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067584
48481	NC_014334	ATGT	2	8	2512769	2512776	25 %	50 %	25 %	0 %	301067584
48482	NC_014334	CCTG	2	8	2512819	2512826	0 %	25 %	25 %	50 %	301067584
48483	NC_014334	CAACGA	2	12	2512864	2512875	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	301067584
48484	NC_014334	ATG	2	6	2512893	2512898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067584
48485	NC_014334	GCCTT	2	10	2512971	2512980	0 %	40 %	20 %	40 %	301067584
48486	NC_014334	TCA	2	6	2513013	2513018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067584
48487	NC_014334	GTT	2	6	2513120	2513125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067584
48488	NC_014334	GGC	2	6	2513312	2513317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067584
48489	NC_014334	A	6	6	2513325	2513330	100 %	0 %	0 %	0 %	301067584
48490	NC_014334	CG	3	6	2513342	2513347	0 %	0 %	50 %	50 %	301067584
48491	NC_014334	AACC	2	8	2513382	2513389	50 %	0 %	0 %	50 %	301067584
48492	NC_014334	ATTT	2	8	2513586	2513593	25 %	75 %	0 %	0 %	301067584
48493	NC_014334	GCGCAA	2	12	2513597	2513608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067584
48494	NC_014334	A	6	6	2513642	2513647	100 %	0 %	0 %	0 %	301067584
48495	NC_014334	A	6	6	2513750	2513755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48496	NC_014334	AACC	2	8	2513800	2513807	50 %	0 %	0 %	50 %	301067585
48497	NC_014334	ACA	3	9	2513878	2513886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067585
48498	NC_014334	CAA	2	6	2514041	2514046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067585
48499	NC_014334	T	6	6	2514142	2514147	0 %	100 %	0 %	0 %	301067585
48500	NC_014334	GTG	2	6	2514165	2514170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067585

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