MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_014334	ACT	2	6	2434341	2434346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47002	NC_014334	GAA	2	6	2434355	2434360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47003	NC_014334	CTT	2	6	2434398	2434403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47004	NC_014334	CCA	2	6	2434411	2434416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47005	NC_014334	TGC	2	6	2434464	2434469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47006	NC_014334	TCGCAG	2	12	2434503	2434514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47007	NC_014334	ACCTGC	2	12	2434517	2434528	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47008	NC_014334	CACTTC	2	12	2434590	2434601	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47009	NC_014334	ATC	2	6	2434617	2434622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47010	NC_014334	TC	3	6	2434621	2434626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47011	NC_014334	ATCTC	2	10	2434657	2434666	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47012	NC_014334	G	6	6	2434669	2434674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47013	NC_014334	GGC	2	6	2434737	2434742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47014	NC_014334	CTC	2	6	2434796	2434801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47015	NC_014334	ACG	2	6	2434845	2434850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47016	NC_014334	ACC	2	6	2435040	2435045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47017	NC_014334	AGG	2	6	2435176	2435181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47018	NC_014334	GTA	2	6	2435264	2435269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47019	NC_014334	CCA	2	6	2435272	2435277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47020	NC_014334	CCTA	2	8	2435316	2435323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47021	NC_014334	TC	3	6	2435436	2435441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47022	NC_014334	GCC	2	6	2435533	2435538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47023	NC_014334	CAT	2	6	2435624	2435629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47024	NC_014334	GTT	2	6	2435667	2435672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47025	NC_014334	CTT	2	6	2435712	2435717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47026	NC_014334	TCGC	2	8	2435760	2435767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47027	NC_014334	CTC	2	6	2435783	2435788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47028	NC_014334	CTA	2	6	2435870	2435875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47029	NC_014334	TGC	2	6	2435938	2435943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47030	NC_014334	CCT	2	6	2435979	2435984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47031	NC_014334	GGA	2	6	2436087	2436092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47032	NC_014334	TAT	2	6	2436266	2436271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47033	NC_014334	TGG	2	6	2436337	2436342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47034	NC_014334	ATCC	2	8	2436565	2436572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47035	NC_014334	GA	3	6	2436600	2436605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47036	NC_014334	ACAT	2	8	2436670	2436677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47037	NC_014334	TCC	2	6	2436686	2436691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47038	NC_014334	GT	3	6	2436693	2436698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47039	NC_014334	CAC	2	6	2436701	2436706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47040	NC_014334	GCAA	2	8	2436818	2436825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47041	NC_014334	TCC	2	6	2437004	2437009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47042	NC_014334	CCG	2	6	2437036	2437041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47043	NC_014334	AAGC	2	8	2437172	2437179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47044	NC_014334	TCGC	2	8	2437204	2437211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47045	NC_014334	CTA	2	6	2437214	2437219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47046	NC_014334	TTTC	2	8	2437232	2437239	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47047	NC_014334	GCC	2	6	2437280	2437285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47048	NC_014334	CTTA	2	8	2437363	2437370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47049	NC_014334	ATGCG	2	10	2437482	2437491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47050	NC_014334	TCG	2	6	2437593	2437598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47051	NC_014334	GGA	2	6	2437620	2437625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47052	NC_014334	CCT	2	6	2437646	2437651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47053	NC_014334	GTT	2	6	2437698	2437703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47054	NC_014334	AGG	2	6	2437888	2437893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47055	NC_014334	GCTC	2	8	2437966	2437973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47056	NC_014334	GT	3	6	2438032	2438037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47057	NC_014334	CCAT	2	8	2438185	2438192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47058	NC_014334	GT	3	6	2438201	2438206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47059	NC_014334	ATG	2	6	2438226	2438231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47060	NC_014334	TCC	2	6	2438252	2438257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47061	NC_014334	CACGA	2	10	2438351	2438360	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47062	NC_014334	GAC	2	6	2438364	2438369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47063	NC_014334	CAC	2	6	2438377	2438382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47064	NC_014334	TC	3	6	2438414	2438419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47065	NC_014334	TTC	2	6	2438452	2438457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47066	NC_014334	CAGAC	2	10	2438685	2438694	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47067	NC_014334	GCC	2	6	2438696	2438701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47068	NC_014334	TTC	2	6	2438715	2438720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47069	NC_014334	AT	3	6	2438722	2438727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47070	NC_014334	A	6	6	2438837	2438842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47072	NC_014334	ACA	2	6	2438957	2438962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47073	NC_014334	TTC	2	6	2438979	2438984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47074	NC_014334	CAA	2	6	2438987	2438992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47075	NC_014334	CTT	2	6	2439015	2439020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47076	NC_014334	CTG	2	6	2439074	2439079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47078	NC_014334	CGC	2	6	2439190	2439195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47079	NC_014334	TCCA	2	8	2439199	2439206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47080	NC_014334	ATC	2	6	2439372	2439377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47081	NC_014334	CGC	2	6	2439412	2439417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47082	NC_014334	TGT	2	6	2439482	2439487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47083	NC_014334	GAC	2	6	2439584	2439589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47084	NC_014334	AT	3	6	2439610	2439615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47085	NC_014334	CAAT	2	8	2439625	2439632	50 %	25 %	0 %	25 %	301067517
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47091	NC_014334	TGG	2	6	2439808	2439813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47092	NC_014334	A	6	6	2439835	2439840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47093	NC_014334	GCC	2	6	2439842	2439847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47094	NC_014334	ATGG	2	8	2439909	2439916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47095	NC_014334	TCAG	2	8	2439921	2439928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47096	NC_014334	ACC	2	6	2439962	2439967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47097	NC_014334	GGC	2	6	2439972	2439977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47098	NC_014334	CTGC	2	8	2440051	2440058	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47099	NC_014334	CCA	2	6	2440125	2440130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47100	NC_014334	CAA	2	6	2440150	2440155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47101	NC_014334	TTC	2	6	2440173	2440178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47105	NC_014334	ATA	2	6	2440269	2440274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47106	NC_014334	CAT	2	6	2440306	2440311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47107	NC_014334	CAT	2	6	2440333	2440338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47108	NC_014334	GTCTT	2	10	2440371	2440380	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47109	NC_014334	GCA	2	6	2440476	2440481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47110	NC_014334	GGC	2	6	2440531	2440536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47111	NC_014334	GCC	2	6	2440627	2440632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47112	NC_014334	TGA	2	6	2440700	2440705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47115	NC_014334	CCGG	2	8	2441158	2441165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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47118	NC_014334	CGC	2	6	2441312	2441317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47119	NC_014334	TCAT	2	8	2441330	2441337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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47121	NC_014334	TGA	3	9	2441402	2441410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47122	NC_014334	GT	3	6	2441483	2441488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47123	NC_014334	GC	3	6	2441532	2441537	0 %	0 %	50 %	50 %	301067518
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47349	NC_014334	AATG	2	8	2452438	2452445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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