MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46503	NC_014334	CAG	2	6	2405599	2405604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
46504	NC_014334	CAG	2	6	2405654	2405659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
46505	NC_014334	ATG	2	6	2405763	2405768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067503
46506	NC_014334	GAC	2	6	2405785	2405790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067503
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46508	NC_014334	CTG	2	6	2405899	2405904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067503
46509	NC_014334	CGAA	2	8	2405970	2405977	50 %	0 %	25 %	25 %	301067503
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46518	NC_014334	TG	3	6	2406549	2406554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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46520	NC_014334	TAT	2	6	2406567	2406572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46521	NC_014334	TAG	2	6	2406577	2406582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46546	NC_014334	A	7	7	2408098	2408104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46551	NC_014334	A	6	6	2408254	2408259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46552	NC_014334	CATT	2	8	2408269	2408276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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46618	NC_014334	GCA	2	6	2411412	2411417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067508
46619	NC_014334	TGGTGA	2	12	2411419	2411430	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	301067508
46620	NC_014334	GTTCCT	2	12	2411437	2411448	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	301067508
46621	NC_014334	TTG	2	6	2411607	2411612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067508
46622	NC_014334	CTC	2	6	2411629	2411634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46623	NC_014334	CTA	2	6	2411667	2411672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46624	NC_014334	TA	3	6	2411671	2411676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46625	NC_014334	ATA	2	6	2411690	2411695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46626	NC_014334	ATC	2	6	2411701	2411706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46634	NC_014334	GTTC	2	8	2412006	2412013	0 %	50 %	25 %	25 %	301067509
46635	NC_014334	GTTT	2	8	2412017	2412024	0 %	75 %	25 %	0 %	301067509
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46639	NC_014334	CGCT	2	8	2412200	2412207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46640	NC_014334	CTT	3	9	2412378	2412386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067510
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46646	NC_014334	CTT	3	9	2412693	2412701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067510
46647	NC_014334	TGT	2	6	2412704	2412709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067510
46648	NC_014334	TAG	2	6	2412782	2412787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067510
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46650	NC_014334	CAT	2	6	2412815	2412820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46652	NC_014334	T	6	6	2412850	2412855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46653	NC_014334	A	7	7	2412861	2412867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46654	NC_014334	AACGGC	2	12	2412878	2412889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46655	NC_014334	A	6	6	2412932	2412937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46656	NC_014334	AAAG	2	8	2412984	2412991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46657	NC_014334	CG	3	6	2413004	2413009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46658	NC_014334	GAG	2	6	2413080	2413085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46735	NC_014334	ATC	2	6	2418355	2418360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067511
46736	NC_014334	CTT	2	6	2418363	2418368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067511
46737	NC_014334	GATCG	2	10	2418376	2418385	20 %	20 %	40 %	20 %	301067511
46738	NC_014334	TGG	2	6	2418417	2418422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067511
46739	NC_014334	TCGGT	2	10	2418636	2418645	0 %	40 %	40 %	20 %	301067511
46740	NC_014334	TTG	2	6	2418662	2418667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067511
46741	NC_014334	GC	3	6	2418701	2418706	0 %	0 %	50 %	50 %	301067511
46742	NC_014334	AAC	2	6	2418718	2418723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067511
46743	NC_014334	AAAATC	2	12	2418751	2418762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	301067511
46744	NC_014334	TTG	2	6	2418766	2418771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067511
46745	NC_014334	GTTG	2	8	2418811	2418818	0 %	50 %	50 %	0 %	301067511
46746	NC_014334	TGCTG	2	10	2418830	2418839	0 %	40 %	40 %	20 %	301067511
46747	NC_014334	TGA	2	6	2418862	2418867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067511
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46750	NC_014334	AGA	2	6	2418919	2418924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067511
46751	NC_014334	TTC	2	6	2419124	2419129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067511
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46753	NC_014334	TGGTGT	2	12	2419156	2419167	0 %	50 %	50 %	0 %	301067511
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46756	NC_014334	TGG	2	6	2419204	2419209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067511
46757	NC_014334	AGA	2	6	2419218	2419223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067511
46758	NC_014334	ATT	2	6	2419234	2419239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067511
46759	NC_014334	GAC	2	6	2419360	2419365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067511
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46764	NC_014334	GT	3	6	2419845	2419850	0 %	50 %	50 %	0 %	301067511
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46785	NC_014334	TCC	2	6	2421720	2421725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46786	NC_014334	AT	4	8	2421862	2421869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46788	NC_014334	A	6	6	2421942	2421947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46789	NC_014334	TTA	2	6	2421965	2421970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46790	NC_014334	T	6	6	2422013	2422018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46791	NC_014334	ATC	2	6	2422027	2422032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46795	NC_014334	ATC	2	6	2422240	2422245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067512
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46806	NC_014334	A	6	6	2422703	2422708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46842	NC_014334	TG	3	6	2425482	2425487	0 %	50 %	50 %	0 %	301067513
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46850	NC_014334	GCT	2	6	2425992	2425997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067513
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46853	NC_014334	GGTC	2	8	2426272	2426279	0 %	25 %	50 %	25 %	301067513
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46968	NC_014334	ATCC	2	8	2432313	2432320	25 %	25 %	0 %	50 %	301067515
46969	NC_014334	CG	3	6	2432327	2432332	0 %	0 %	50 %	50 %	301067515
46970	NC_014334	GAC	2	6	2432414	2432419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067515
46971	NC_014334	TGC	2	6	2432424	2432429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067515
46972	NC_014334	TCT	2	6	2432447	2432452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067515
46973	NC_014334	TGC	2	6	2432508	2432513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067515
46974	NC_014334	CAAGC	2	10	2432535	2432544	40 %	0 %	20 %	40 %	301067515
46975	NC_014334	CAT	2	6	2432711	2432716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067515
46976	NC_014334	ATG	3	9	2432808	2432816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067515
46977	NC_014334	T	6	6	2432898	2432903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46978	NC_014334	TGA	2	6	2432910	2432915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46979	NC_014334	GGCG	2	8	2433053	2433060	0 %	0 %	75 %	25 %	301067516
46980	NC_014334	ATC	2	6	2433159	2433164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067516
46981	NC_014334	GCCACC	2	12	2433195	2433206	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	301067516
46982	NC_014334	CT	3	6	2433214	2433219	0 %	50 %	0 %	50 %	301067516
46983	NC_014334	ACG	2	6	2433291	2433296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067516
46984	NC_014334	CTT	2	6	2433329	2433334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067516
46985	NC_014334	ATG	2	6	2433364	2433369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067516
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46987	NC_014334	A	8	8	2433484	2433491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46988	NC_014334	CCA	2	6	2433626	2433631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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46990	NC_014334	TAG	2	6	2433701	2433706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46992	NC_014334	CAA	2	6	2433794	2433799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46993	NC_014334	TCA	2	6	2433831	2433836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46994	NC_014334	CCA	2	6	2433929	2433934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46995	NC_014334	ACT	2	6	2433960	2433965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46996	NC_014334	ATT	2	6	2433985	2433990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46997	NC_014334	A	6	6	2434003	2434008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46998	NC_014334	GGA	2	6	2434222	2434227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46999	NC_014334	TCC	2	6	2434288	2434293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47000	NC_014334	GCAG	2	8	2434323	2434330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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