MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_014334	TGA	2	6	2356209	2356214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45502	NC_014334	GAA	2	6	2356239	2356244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45503	NC_014334	CT	3	6	2356247	2356252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45504	NC_014334	AGC	2	6	2356266	2356271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45505	NC_014334	CAT	2	6	2356289	2356294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45506	NC_014334	GCT	2	6	2356311	2356316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45507	NC_014334	GCCAA	2	10	2356363	2356372	40 %	0 %	20 %	40 %	301067437
45508	NC_014334	TTC	2	6	2356456	2356461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067437
45509	NC_014334	ACT	2	6	2356485	2356490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067437
45510	NC_014334	CAA	2	6	2356505	2356510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067437
45511	NC_014334	CAG	2	6	2356520	2356525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45512	NC_014334	AGC	2	6	2356569	2356574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45513	NC_014334	GCT	2	6	2356582	2356587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45514	NC_014334	AGC	2	6	2356617	2356622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45515	NC_014334	GCT	2	6	2356630	2356635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45516	NC_014334	AGC	2	6	2356665	2356670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45517	NC_014334	GCT	2	6	2356678	2356683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45518	NC_014334	AGC	2	6	2356713	2356718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45519	NC_014334	GCT	2	6	2356726	2356731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45520	NC_014334	AGC	2	6	2356761	2356766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45521	NC_014334	TGC	2	6	2356773	2356778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45522	NC_014334	GCA	2	6	2356810	2356815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45523	NC_014334	GCT	2	6	2356822	2356827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45524	NC_014334	AGC	2	6	2356857	2356862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45525	NC_014334	TGC	2	6	2356869	2356874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45526	NC_014334	GCA	2	6	2356906	2356911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45527	NC_014334	GCA	2	6	2356954	2356959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
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45530	NC_014334	GCA	2	6	2357068	2357073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45531	NC_014334	TTG	2	6	2357097	2357102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067437
45532	NC_014334	CTT	2	6	2357150	2357155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067437
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45535	NC_014334	T	6	6	2357273	2357278	0 %	100 %	0 %	0 %	301067437
45536	NC_014334	TGT	3	9	2357291	2357299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067437
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45544	NC_014334	CAT	2	6	2357763	2357768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067437
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45548	NC_014334	CAT	2	6	2357873	2357878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067437
45549	NC_014334	CCAT	2	8	2357896	2357903	25 %	25 %	0 %	50 %	301067437
45550	NC_014334	AAC	2	6	2357991	2357996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067437
45551	NC_014334	GACT	2	8	2358112	2358119	25 %	25 %	25 %	25 %	301067437
45552	NC_014334	TGC	2	6	2358156	2358161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
45553	NC_014334	TGC	2	6	2358171	2358176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
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45555	NC_014334	GCT	2	6	2358226	2358231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067437
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45560	NC_014334	TGCC	2	8	2358342	2358349	0 %	25 %	25 %	50 %	301067437
45561	NC_014334	TGA	2	6	2358369	2358374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067437
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45573	NC_014334	TA	4	8	2358813	2358820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45574	NC_014334	TTA	2	6	2358822	2358827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45575	NC_014334	TAT	2	6	2358832	2358837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45581	NC_014334	TTTGC	2	10	2359478	2359487	0 %	60 %	20 %	20 %	301067438
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45585	NC_014334	TTG	2	6	2359672	2359677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067438
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45587	NC_014334	CT	3	6	2359746	2359751	0 %	50 %	0 %	50 %	301067438
45588	NC_014334	CAG	2	6	2359850	2359855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067438
45589	NC_014334	CAT	2	6	2359862	2359867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067438
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45592	NC_014334	AT	3	6	2359918	2359923	50 %	50 %	0 %	0 %	301067438
45593	NC_014334	CTT	4	12	2359973	2359984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067438
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45597	NC_014334	A	6	6	2360210	2360215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45598	NC_014334	CTG	2	6	2360221	2360226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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45600	NC_014334	CTG	2	6	2360436	2360441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067439
45601	NC_014334	TTC	2	6	2360444	2360449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067439
45602	NC_014334	TGA	2	6	2360472	2360477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067439
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45606	NC_014334	ACAA	2	8	2360692	2360699	75 %	0 %	0 %	25 %	301067439
45607	NC_014334	TTG	2	6	2360714	2360719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45608	NC_014334	CTGGA	2	10	2360731	2360740	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45609	NC_014334	GAT	2	6	2360757	2360762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45610	NC_014334	TTC	2	6	2360848	2360853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45611	NC_014334	T	6	6	2360867	2360872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45612	NC_014334	TCAGT	2	10	2360940	2360949	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45613	NC_014334	A	6	6	2361092	2361097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45614	NC_014334	TAA	2	6	2361098	2361103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45615	NC_014334	TTGT	2	8	2361130	2361137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45616	NC_014334	TGT	2	6	2361155	2361160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45618	NC_014334	ATT	2	6	2361207	2361212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45631	NC_014334	TGT	2	6	2361640	2361645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45739	NC_014334	CCA	2	6	2366901	2366906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067445
45740	NC_014334	GAT	2	6	2366979	2366984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067445
45741	NC_014334	GCT	2	6	2366994	2366999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067445
45742	NC_014334	CAT	2	6	2367036	2367041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067445
45743	NC_014334	GCA	2	6	2367089	2367094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067445
45744	NC_014334	GCA	2	6	2367110	2367115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067445
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45750	NC_014334	TA	3	6	2367343	2367348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45751	NC_014334	T	6	6	2367359	2367364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45752	NC_014334	A	6	6	2367391	2367396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45753	NC_014334	TGT	2	6	2367404	2367409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45756	NC_014334	ATT	2	6	2367517	2367522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45757	NC_014334	A	6	6	2367548	2367553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45758	NC_014334	CAAG	2	8	2367614	2367621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45759	NC_014334	TGAT	2	8	2367636	2367643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45760	NC_014334	GGA	2	6	2367655	2367660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45846	NC_014334	T	6	6	2372369	2372374	0 %	100 %	0 %	0 %	301067451
45847	NC_014334	TCGG	2	8	2372420	2372427	0 %	25 %	50 %	25 %	301067452
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