MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_014334	CAT	3	9	2332032	2332040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067409
45002	NC_014334	TGG	2	6	2332079	2332084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067409
45003	NC_014334	TTTG	2	8	2332109	2332116	0 %	75 %	25 %	0 %	301067409
45004	NC_014334	TG	3	6	2332115	2332120	0 %	50 %	50 %	0 %	301067409
45005	NC_014334	CAA	2	6	2332183	2332188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067409
45006	NC_014334	T	6	6	2332267	2332272	0 %	100 %	0 %	0 %	301067409
45007	NC_014334	GCA	2	6	2332278	2332283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067409
45008	NC_014334	GGCATC	2	12	2332298	2332309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301067409
45009	NC_014334	TCA	2	6	2332434	2332439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45010	NC_014334	CAAC	2	8	2332454	2332461	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45011	NC_014334	AAC	2	6	2332508	2332513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45012	NC_014334	GGATC	2	10	2332638	2332647	20 %	20 %	40 %	20 %	301067410
45013	NC_014334	ACC	2	6	2332666	2332671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067410
45014	NC_014334	CGA	2	6	2332679	2332684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067410
45015	NC_014334	ATG	2	6	2332718	2332723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067410
45016	NC_014334	ATC	2	6	2332735	2332740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067410
45017	NC_014334	TGCT	2	8	2332748	2332755	0 %	50 %	25 %	25 %	301067410
45018	NC_014334	GGTT	2	8	2332829	2332836	0 %	50 %	50 %	0 %	301067410
45019	NC_014334	GCC	2	6	2332874	2332879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067410
45020	NC_014334	TCA	2	6	2332934	2332939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067410
45021	NC_014334	GC	3	6	2333090	2333095	0 %	0 %	50 %	50 %	301067410
45022	NC_014334	A	6	6	2333143	2333148	100 %	0 %	0 %	0 %	301067410
45023	NC_014334	GCC	2	6	2333151	2333156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067410
45024	NC_014334	CGC	2	6	2333157	2333162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067410
45025	NC_014334	CTT	2	6	2333176	2333181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067410
45026	NC_014334	CATA	2	8	2333214	2333221	50 %	25 %	0 %	25 %	301067410
45027	NC_014334	CAG	2	6	2333230	2333235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067410
45028	NC_014334	ACA	2	6	2333253	2333258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067410
45029	NC_014334	TGGC	2	8	2333259	2333266	0 %	25 %	50 %	25 %	301067410
45030	NC_014334	TAA	2	6	2333272	2333277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067410
45031	NC_014334	TCT	2	6	2333297	2333302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067410
45032	NC_014334	CCATC	2	10	2333310	2333319	20 %	20 %	0 %	60 %	301067410
45033	NC_014334	A	6	6	2333408	2333413	100 %	0 %	0 %	0 %	301067411
45034	NC_014334	GAT	2	6	2333434	2333439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067411
45035	NC_014334	ATT	2	6	2333477	2333482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067411
45036	NC_014334	CAAA	2	8	2333597	2333604	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45037	NC_014334	ATG	2	6	2333747	2333752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067412
45038	NC_014334	GAT	2	6	2333781	2333786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067412
45039	NC_014334	GAA	2	6	2333791	2333796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067412
45040	NC_014334	TCA	2	6	2333985	2333990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067412
45041	NC_014334	AAT	2	6	2334070	2334075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067412
45042	NC_014334	AACC	2	8	2334082	2334089	50 %	0 %	0 %	50 %	301067412
45043	NC_014334	ATG	2	6	2334131	2334136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067412
45044	NC_014334	TGG	2	6	2334162	2334167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067412
45045	NC_014334	GAA	2	6	2334260	2334265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067412
45046	NC_014334	GAA	2	6	2334289	2334294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067412
45047	NC_014334	CAC	2	6	2334312	2334317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067412
45048	NC_014334	AGCA	2	8	2334347	2334354	50 %	0 %	25 %	25 %	301067412
45049	NC_014334	AAC	2	6	2334358	2334363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
45050	NC_014334	CAT	2	6	2334423	2334428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067412
45051	NC_014334	AAT	2	6	2334508	2334513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067412
45052	NC_014334	GAAT	2	8	2334582	2334589	50 %	25 %	25 %	0 %	301067412
45053	NC_014334	TCGGA	2	10	2334612	2334621	20 %	20 %	40 %	20 %	301067412
45054	NC_014334	CAA	3	9	2334669	2334677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
45055	NC_014334	CAG	3	9	2334712	2334720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067412
45056	NC_014334	AAC	2	6	2334773	2334778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
45057	NC_014334	GCA	2	6	2334794	2334799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067412
45058	NC_014334	TCAG	2	8	2334839	2334846	25 %	25 %	25 %	25 %	301067412
45059	NC_014334	CTT	2	6	2334868	2334873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067412
45060	NC_014334	AGTA	2	8	2334989	2334996	50 %	25 %	25 %	0 %	301067412
45061	NC_014334	CAAC	2	8	2335059	2335066	50 %	0 %	0 %	50 %	301067412
45062	NC_014334	TTC	2	6	2335141	2335146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067412
45063	NC_014334	CTT	2	6	2335192	2335197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067412
45064	NC_014334	ATC	2	6	2335201	2335206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067412
45065	NC_014334	A	6	6	2335235	2335240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45066	NC_014334	AT	3	6	2335312	2335317	50 %	50 %	0 %	0 %	301067413
45067	NC_014334	AAT	2	6	2335336	2335341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067413
45068	NC_014334	TA	3	6	2335551	2335556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45069	NC_014334	CAA	2	6	2335562	2335567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45070	NC_014334	A	6	6	2335566	2335571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45071	NC_014334	TAT	2	6	2335576	2335581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45072	NC_014334	CATG	2	8	2335594	2335601	25 %	25 %	25 %	25 %	301067414
45073	NC_014334	GAA	2	6	2335602	2335607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
45074	NC_014334	ACC	2	6	2335622	2335627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067414
45075	NC_014334	CA	3	6	2335636	2335641	50 %	0 %	0 %	50 %	301067414
45076	NC_014334	GCA	2	6	2335655	2335660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45077	NC_014334	GTCCC	2	10	2335671	2335680	0 %	20 %	20 %	60 %	301067414
45078	NC_014334	AGA	2	6	2335700	2335705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
45079	NC_014334	ATC	2	6	2335800	2335805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45080	NC_014334	ATC	2	6	2335884	2335889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45081	NC_014334	ATC	2	6	2335896	2335901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45082	NC_014334	CTA	2	6	2335904	2335909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45083	NC_014334	A	6	6	2335939	2335944	100 %	0 %	0 %	0 %	301067414
45084	NC_014334	GTC	2	6	2336031	2336036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45085	NC_014334	TTGATA	2	12	2336080	2336091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	301067414
45086	NC_014334	AGG	2	6	2336104	2336109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067414
45087	NC_014334	TCA	2	6	2336137	2336142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45088	NC_014334	ACC	2	6	2336145	2336150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067414
45089	NC_014334	TGG	2	6	2336219	2336224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067414
45090	NC_014334	GGCATC	2	12	2336229	2336240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45091	NC_014334	GAT	2	6	2336318	2336323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067414
45092	NC_014334	CAT	2	6	2336363	2336368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45093	NC_014334	TGT	2	6	2336383	2336388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067414
45094	NC_014334	GTC	2	6	2336454	2336459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45095	NC_014334	GCCA	2	8	2336480	2336487	25 %	0 %	25 %	50 %	301067414
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45097	NC_014334	GCT	2	6	2336562	2336567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45098	NC_014334	ACC	2	6	2336640	2336645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067414
45099	NC_014334	GCAA	2	8	2336657	2336664	50 %	0 %	25 %	25 %	301067414
45100	NC_014334	TGAT	2	8	2336725	2336732	25 %	50 %	25 %	0 %	301067414
45101	NC_014334	ACTG	2	8	2336762	2336769	25 %	25 %	25 %	25 %	301067414
45102	NC_014334	AAG	2	6	2336803	2336808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
45103	NC_014334	CTA	2	6	2336861	2336866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45104	NC_014334	CAA	2	6	2336924	2336929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067414
45105	NC_014334	TGTT	2	8	2336977	2336984	0 %	75 %	25 %	0 %	301067414
45106	NC_014334	TTC	2	6	2337004	2337009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067414
45107	NC_014334	TGC	2	6	2337017	2337022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45108	NC_014334	CCAG	2	8	2337064	2337071	25 %	0 %	25 %	50 %	301067414
45109	NC_014334	GAC	2	6	2337123	2337128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45110	NC_014334	CGC	2	6	2337199	2337204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067414
45111	NC_014334	TTA	2	6	2337214	2337219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067414
45112	NC_014334	ATC	2	6	2337274	2337279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
45113	NC_014334	A	6	6	2337303	2337308	100 %	0 %	0 %	0 %	301067414
45114	NC_014334	TGC	2	6	2337448	2337453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
45115	NC_014334	AAG	2	6	2337454	2337459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
45116	NC_014334	ATG	2	6	2337496	2337501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067414
45117	NC_014334	A	6	6	2337513	2337518	100 %	0 %	0 %	0 %	301067414
45118	NC_014334	GAT	2	6	2337591	2337596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067414
45119	NC_014334	GCG	2	6	2337632	2337637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067414
45120	NC_014334	CTG	2	6	2337672	2337677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
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45125	NC_014334	GAT	2	6	2337863	2337868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067414
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45128	NC_014334	ACG	2	6	2337972	2337977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067414
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45130	NC_014334	CAT	2	6	2338094	2338099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
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45132	NC_014334	T	6	6	2338334	2338339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45133	NC_014334	TAAG	2	8	2338372	2338379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45134	NC_014334	T	6	6	2338464	2338469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45135	NC_014334	ATT	2	6	2338532	2338537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45136	NC_014334	ATC	2	6	2338568	2338573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45137	NC_014334	AGA	2	6	2338598	2338603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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45147	NC_014334	TC	3	6	2339019	2339024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45148	NC_014334	TTC	2	6	2339145	2339150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067416
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45202	NC_014334	GAG	2	6	2342310	2342315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45210	NC_014334	AAG	2	6	2342521	2342526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45211	NC_014334	TGC	2	6	2342528	2342533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45212	NC_014334	AT	5	10	2342575	2342584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45213	NC_014334	AT	3	6	2342590	2342595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45214	NC_014334	GCA	2	6	2342645	2342650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067419
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45216	NC_014334	ATGG	2	8	2342714	2342721	25 %	25 %	50 %	0 %	301067419
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45218	NC_014334	A	6	6	2342841	2342846	100 %	0 %	0 %	0 %	301067419
45219	NC_014334	TAT	2	6	2342920	2342925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067419
45220	NC_014334	CTG	2	6	2343156	2343161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067419
45221	NC_014334	GTT	2	6	2343167	2343172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067419
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45223	NC_014334	GCT	2	6	2343198	2343203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067419
45224	NC_014334	TGA	2	6	2343269	2343274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067419
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45226	NC_014334	GTT	2	6	2343467	2343472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067420
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45228	NC_014334	TTG	2	6	2343488	2343493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067420
45229	NC_014334	GGGT	2	8	2343522	2343529	0 %	25 %	75 %	0 %	301067420
45230	NC_014334	GAT	2	6	2343551	2343556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067420
45231	NC_014334	ATC	2	6	2343563	2343568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067420
45232	NC_014334	ATGCT	2	10	2343579	2343588	20 %	40 %	20 %	20 %	301067420
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45234	NC_014334	CAA	2	6	2343637	2343642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45472	NC_014334	GAA	2	6	2355073	2355078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067434
45473	NC_014334	AAAGA	2	10	2355127	2355136	80 %	0 %	20 %	0 %	301067434
45474	NC_014334	AGCCA	2	10	2355160	2355169	40 %	0 %	20 %	40 %	301067434
45475	NC_014334	TCG	2	6	2355179	2355184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067434
45476	NC_014334	A	6	6	2355299	2355304	100 %	0 %	0 %	0 %	301067434
45477	NC_014334	ACAAA	2	10	2355320	2355329	80 %	0 %	0 %	20 %	301067434
45478	NC_014334	TC	3	6	2355334	2355339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45479	NC_014334	A	7	7	2355351	2355357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45480	NC_014334	CT	3	6	2355399	2355404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45481	NC_014334	A	6	6	2355415	2355420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45482	NC_014334	CTG	2	6	2355429	2355434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45483	NC_014334	AAC	2	6	2355551	2355556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45484	NC_014334	GCA	2	6	2355622	2355627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067435
45485	NC_014334	GAA	3	9	2355643	2355651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067435
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45488	NC_014334	TTGA	2	8	2355723	2355730	25 %	50 %	25 %	0 %	301067435
45489	NC_014334	T	6	6	2355775	2355780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45490	NC_014334	ACC	2	6	2355814	2355819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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45492	NC_014334	CTC	2	6	2355834	2355839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45493	NC_014334	GGT	2	6	2355842	2355847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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45496	NC_014334	T	7	7	2355929	2355935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45497	NC_014334	ACC	2	6	2355946	2355951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45498	NC_014334	TGC	2	6	2355974	2355979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45499	NC_014334	TCAAC	2	10	2356007	2356016	40 %	20 %	0 %	40 %	301067436
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