MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_014334	GGA	2	6	2282398	2282403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067349
44003	NC_014334	GACAA	2	10	2282450	2282459	60 %	0 %	20 %	20 %	301067349
44004	NC_014334	GCG	2	6	2282473	2282478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067349
44005	NC_014334	GTT	2	6	2282483	2282488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067349
44006	NC_014334	A	7	7	2282523	2282529	100 %	0 %	0 %	0 %	301067349
44007	NC_014334	AC	3	6	2282565	2282570	50 %	0 %	0 %	50 %	301067349
44008	NC_014334	TTG	2	6	2282609	2282614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44009	NC_014334	T	6	6	2282637	2282642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44010	NC_014334	A	6	6	2282710	2282715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44011	NC_014334	TCC	2	6	2282716	2282721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44012	NC_014334	GT	3	6	2282799	2282804	0 %	50 %	50 %	0 %	301067350
44013	NC_014334	GTGC	2	8	2282810	2282817	0 %	25 %	50 %	25 %	301067350
44014	NC_014334	ATG	2	6	2282854	2282859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067350
44015	NC_014334	GATC	2	8	2282873	2282880	25 %	25 %	25 %	25 %	301067350
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44017	NC_014334	AGCCA	2	10	2282919	2282928	40 %	0 %	20 %	40 %	301067350
44018	NC_014334	GCT	2	6	2282968	2282973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067350
44019	NC_014334	GAT	2	6	2283018	2283023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067350
44020	NC_014334	ACC	2	6	2283081	2283086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067350
44021	NC_014334	GCC	2	6	2283099	2283104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067350
44022	NC_014334	GC	3	6	2283145	2283150	0 %	0 %	50 %	50 %	301067350
44023	NC_014334	CGA	2	6	2283214	2283219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067350
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44026	NC_014334	TCT	2	6	2283349	2283354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067350
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44028	NC_014334	CTT	2	6	2283411	2283416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067350
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44032	NC_014334	GATG	2	8	2283513	2283520	25 %	25 %	50 %	0 %	301067350
44033	NC_014334	GCA	2	6	2283613	2283618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067350
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44037	NC_014334	CGA	2	6	2283773	2283778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067350
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44040	NC_014334	TTTCT	2	10	2283852	2283861	0 %	80 %	0 %	20 %	301067350
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44043	NC_014334	AGTA	2	8	2283960	2283967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44044	NC_014334	T	6	6	2283983	2283988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44045	NC_014334	A	7	7	2284020	2284026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44046	NC_014334	TC	3	6	2284046	2284051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44047	NC_014334	T	6	6	2284093	2284098	0 %	100 %	0 %	0 %	301067351
44048	NC_014334	TTTC	2	8	2284161	2284168	0 %	75 %	0 %	25 %	301067351
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44052	NC_014334	ATGCC	2	10	2284338	2284347	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44053	NC_014334	A	6	6	2284380	2284385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44054	NC_014334	TTC	2	6	2284447	2284452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067352
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44056	NC_014334	T	6	6	2284483	2284488	0 %	100 %	0 %	0 %	301067352
44057	NC_014334	TTC	2	6	2284517	2284522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067352
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44068	NC_014334	TTA	2	6	2284976	2284981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44069	NC_014334	AAG	2	6	2285017	2285022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44087	NC_014334	ACG	2	6	2286000	2286005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067356
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44099	NC_014334	CAT	2	6	2286384	2286389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067356
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44103	NC_014334	ATT	2	6	2286463	2286468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067356
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44105	NC_014334	TCA	2	6	2286494	2286499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067356
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44107	NC_014334	CGC	2	6	2286625	2286630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067356
44108	NC_014334	TGA	2	6	2286677	2286682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067356
44109	NC_014334	TTGG	2	8	2286699	2286706	0 %	50 %	50 %	0 %	301067356
44110	NC_014334	GAT	2	6	2286708	2286713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067356
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44114	NC_014334	TGGC	2	8	2286884	2286891	0 %	25 %	50 %	25 %	301067356
44115	NC_014334	TCCT	2	8	2286906	2286913	0 %	50 %	0 %	50 %	301067356
44116	NC_014334	TTG	2	6	2286919	2286924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067356
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44119	NC_014334	TG	3	6	2287163	2287168	0 %	50 %	50 %	0 %	301067357
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44237	NC_014334	CG	3	6	2292974	2292979	0 %	0 %	50 %	50 %	301067362
44238	NC_014334	AAC	2	6	2292999	2293004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067362
44239	NC_014334	GTT	2	6	2293026	2293031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067362
44240	NC_014334	GGT	2	6	2293032	2293037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067362
44241	NC_014334	GC	3	6	2293172	2293177	0 %	0 %	50 %	50 %	301067362
44242	NC_014334	GCT	2	6	2293222	2293227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067362
44243	NC_014334	ACG	2	6	2293245	2293250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067362
44244	NC_014334	ATG	2	6	2293258	2293263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067362
44245	NC_014334	TCGCCG	2	12	2293274	2293285	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	301067362
44246	NC_014334	GCAG	2	8	2293302	2293309	25 %	0 %	50 %	25 %	301067362
44247	NC_014334	GAT	2	6	2293326	2293331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067362
44248	NC_014334	CTT	2	6	2293407	2293412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067363
44249	NC_014334	ACC	2	6	2293422	2293427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067363
44250	NC_014334	TCA	2	6	2293430	2293435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067363
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44253	NC_014334	GCA	2	6	2293487	2293492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067363
44254	NC_014334	CAA	2	6	2293547	2293552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067363
44255	NC_014334	TCAA	2	8	2293606	2293613	50 %	25 %	0 %	25 %	301067363
44256	NC_014334	GCA	2	6	2293628	2293633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067363
44257	NC_014334	GTC	2	6	2293702	2293707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067363
44258	NC_014334	CTTG	2	8	2293716	2293723	0 %	50 %	25 %	25 %	301067363
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44260	NC_014334	CTG	2	6	2293925	2293930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067363
44261	NC_014334	T	6	6	2293940	2293945	0 %	100 %	0 %	0 %	301067363
44262	NC_014334	TCT	2	6	2293958	2293963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067363
44263	NC_014334	CAA	2	6	2294016	2294021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067363
44264	NC_014334	TCA	2	6	2294120	2294125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067363
44265	NC_014334	ATTG	2	8	2294234	2294241	25 %	50 %	25 %	0 %	301067363
44266	NC_014334	GATT	2	8	2294257	2294264	25 %	50 %	25 %	0 %	301067363
44267	NC_014334	GCT	2	6	2294479	2294484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067363
44268	NC_014334	ACC	2	6	2294538	2294543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067363
44269	NC_014334	CGT	2	6	2294589	2294594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067363
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44271	NC_014334	CGC	3	9	2294655	2294663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067363
44272	NC_014334	GT	3	6	2294676	2294681	0 %	50 %	50 %	0 %	301067363
44273	NC_014334	GTA	2	6	2294876	2294881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067363
44274	NC_014334	T	6	6	2294926	2294931	0 %	100 %	0 %	0 %	301067363
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44280	NC_014334	GTCGG	2	10	2295117	2295126	0 %	20 %	60 %	20 %	301067364
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44283	NC_014334	TTTC	2	8	2295217	2295224	0 %	75 %	0 %	25 %	301067364
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44285	NC_014334	T	6	6	2295310	2295315	0 %	100 %	0 %	0 %	301067364
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44290	NC_014334	TAG	2	6	2295506	2295511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067365
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44292	NC_014334	CAG	2	6	2295771	2295776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067365
44293	NC_014334	ACC	2	6	2295790	2295795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067365
44294	NC_014334	GTCTT	2	10	2295901	2295910	0 %	60 %	20 %	20 %	301067365
44295	NC_014334	TTGGC	2	10	2295940	2295949	0 %	40 %	40 %	20 %	301067365
44296	NC_014334	GT	3	6	2295989	2295994	0 %	50 %	50 %	0 %	301067365
44297	NC_014334	GTG	2	6	2296231	2296236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067365
44298	NC_014334	TC	3	6	2296297	2296302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44299	NC_014334	T	6	6	2296350	2296355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44300	NC_014334	GGT	2	6	2296367	2296372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44301	NC_014334	TTC	2	6	2296402	2296407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067366
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44304	NC_014334	ATC	2	6	2296489	2296494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067366
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44307	NC_014334	TTTC	2	8	2296763	2296770	0 %	75 %	0 %	25 %	301067366
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44319	NC_014334	TCA	2	6	2297685	2297690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067367
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44338	NC_014334	CTT	2	6	2298982	2298987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067367
44339	NC_014334	CAGT	2	8	2298996	2299003	25 %	25 %	25 %	25 %	301067367
44340	NC_014334	ATG	2	6	2299072	2299077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067367
44341	NC_014334	ACC	2	6	2299158	2299163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067367
44342	NC_014334	GGA	2	6	2299177	2299182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067367
44343	NC_014334	AGAAA	2	10	2299202	2299211	80 %	0 %	20 %	0 %	301067367
44344	NC_014334	TGAT	2	8	2299344	2299351	25 %	50 %	25 %	0 %	301067367
44345	NC_014334	TCT	2	6	2299392	2299397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067367
44346	NC_014334	GAA	2	6	2299434	2299439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067367
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44348	NC_014334	GCT	2	6	2299502	2299507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
44349	NC_014334	TG	3	6	2299618	2299623	0 %	50 %	50 %	0 %	301067367
44350	NC_014334	CTGT	2	8	2299632	2299639	0 %	50 %	25 %	25 %	301067367
44351	NC_014334	T	6	6	2299750	2299755	0 %	100 %	0 %	0 %	301067367
44352	NC_014334	TCATAT	2	12	2299791	2299802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	301067367
44353	NC_014334	ATTT	2	8	2299832	2299839	25 %	75 %	0 %	0 %	301067367
44354	NC_014334	CAA	2	6	2299888	2299893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067367
44355	NC_014334	CTG	2	6	2299955	2299960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
44356	NC_014334	CCG	2	6	2299996	2300001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067367
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44358	NC_014334	TGC	2	6	2300105	2300110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
44359	NC_014334	GGAT	2	8	2300186	2300193	25 %	25 %	50 %	0 %	301067367
44360	NC_014334	CTT	2	6	2300315	2300320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067367
44361	NC_014334	CCT	2	6	2300334	2300339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44362	NC_014334	TC	3	6	2300356	2300361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44363	NC_014334	TTC	2	6	2300362	2300367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44364	NC_014334	ACT	2	6	2300571	2300576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44365	NC_014334	TTAT	2	8	2300583	2300590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44366	NC_014334	TGA	2	6	2300612	2300617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067368
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44421	NC_014334	CATC	2	8	2303859	2303866	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44422	NC_014334	A	6	6	2303930	2303935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44423	NC_014334	CAA	2	6	2303960	2303965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44442	NC_014334	A	7	7	2304933	2304939	100 %	0 %	0 %	0 %	301067372
44443	NC_014334	CAA	2	6	2305016	2305021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067372
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44455	NC_014334	ATA	2	6	2305328	2305333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067373
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44460	NC_014334	TCGTT	2	10	2305481	2305490	0 %	60 %	20 %	20 %	301067373
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44466	NC_014334	A	6	6	2305713	2305718	100 %	0 %	0 %	0 %	301067373
44467	NC_014334	TAT	2	6	2305724	2305729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067373
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44469	NC_014334	CGG	2	6	2305760	2305765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067373
44470	NC_014334	TTGGC	2	10	2305799	2305808	0 %	40 %	40 %	20 %	301067373
44471	NC_014334	TTG	2	6	2305811	2305816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067373
44472	NC_014334	TGC	3	9	2305832	2305840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067373
44473	NC_014334	CCTGA	2	10	2305880	2305889	20 %	20 %	20 %	40 %	301067373
44474	NC_014334	AAC	2	6	2305950	2305955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067374
44475	NC_014334	CAA	2	6	2305973	2305978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067374
44476	NC_014334	CTA	2	6	2306087	2306092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067374
44477	NC_014334	CGG	2	6	2306163	2306168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067374
44478	NC_014334	TGCC	2	8	2306196	2306203	0 %	25 %	25 %	50 %	301067374
44479	NC_014334	CATC	2	8	2306250	2306257	25 %	25 %	0 %	50 %	301067374
44480	NC_014334	CAA	2	6	2306371	2306376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067374
44481	NC_014334	TCT	2	6	2306381	2306386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067374
44482	NC_014334	ATC	2	6	2306426	2306431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067374
44483	NC_014334	CTC	2	6	2306492	2306497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067374
44484	NC_014334	CTGG	2	8	2306537	2306544	0 %	25 %	50 %	25 %	301067374
44485	NC_014334	GCT	2	6	2306593	2306598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067374
44486	NC_014334	ACT	2	6	2306674	2306679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067374
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44488	NC_014334	A	6	6	2306724	2306729	100 %	0 %	0 %	0 %	301067374
44489	NC_014334	CTTG	2	8	2306733	2306740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44490	NC_014334	GTC	2	6	2306760	2306765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44491	NC_014334	TTC	2	6	2306891	2306896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067375
44492	NC_014334	AAC	3	9	2306954	2306962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067375
44493	NC_014334	ATC	2	6	2306971	2306976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067375
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44495	NC_014334	TCC	2	6	2307056	2307061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44496	NC_014334	CGC	2	6	2307092	2307097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067376
44497	NC_014334	CG	3	6	2307101	2307106	0 %	0 %	50 %	50 %	301067376
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44499	NC_014334	CAC	2	6	2307233	2307238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067376
44500	NC_014334	A	6	6	2307265	2307270	100 %	0 %	0 %	0 %	301067376

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