MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42503	NC_014334	GTA	2	6	2205701	2205706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067277
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42600	NC_014334	TAT	2	6	2210376	2210381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42601	NC_014334	AATA	2	8	2210427	2210434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42602	NC_014334	GAA	2	6	2210477	2210482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067278
42603	NC_014334	A	7	7	2210481	2210487	100 %	0 %	0 %	0 %	301067278
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42614	NC_014334	A	6	6	2211113	2211118	100 %	0 %	0 %	0 %	301067278
42615	NC_014334	TTA	2	6	2211166	2211171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067278
42616	NC_014334	CAT	2	6	2211263	2211268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067278
42617	NC_014334	TCAG	2	8	2211280	2211287	25 %	25 %	25 %	25 %	301067278
42618	NC_014334	GAA	2	6	2211293	2211298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067278
42619	NC_014334	AAG	2	6	2211351	2211356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067278
42620	NC_014334	A	7	7	2211475	2211481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42621	NC_014334	CAC	2	6	2211503	2211508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42622	NC_014334	GTT	2	6	2211582	2211587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067279
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42624	NC_014334	CCTT	2	8	2211620	2211627	0 %	50 %	0 %	50 %	301067279
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42629	NC_014334	CAG	2	6	2211792	2211797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067279
42630	NC_014334	TCGA	2	8	2211833	2211840	25 %	25 %	25 %	25 %	301067279
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42632	NC_014334	CATCTA	2	12	2211897	2211908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067279
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42635	NC_014334	TTA	2	6	2211931	2211936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42647	NC_014334	T	7	7	2212464	2212470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42648	NC_014334	A	7	7	2212505	2212511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42649	NC_014334	ACC	2	6	2212554	2212559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42650	NC_014334	GGCC	2	8	2212679	2212686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42651	NC_014334	T	6	6	2212729	2212734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42652	NC_014334	ATTA	2	8	2212847	2212854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42653	NC_014334	GCA	2	6	2212919	2212924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067281
42654	NC_014334	ATTT	2	8	2212988	2212995	25 %	75 %	0 %	0 %	301067281
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42672	NC_014334	A	7	7	2214117	2214123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42673	NC_014334	T	7	7	2214146	2214152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42674	NC_014334	TAAAT	2	10	2214159	2214168	60 %	40 %	0 %	0 %	301067282
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42703	NC_014334	A	6	6	2215598	2215603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42706	NC_014334	AGG	2	6	2215756	2215761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42707	NC_014334	A	7	7	2215774	2215780	100 %	0 %	0 %	0 %	301067284
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42726	NC_014334	GGTC	2	8	2216833	2216840	0 %	25 %	50 %	25 %	301067284
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42730	NC_014334	A	6	6	2216989	2216994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42731	NC_014334	T	6	6	2217033	2217038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42732	NC_014334	GC	3	6	2217059	2217064	0 %	0 %	50 %	50 %	301067285
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42734	NC_014334	CCG	2	6	2217140	2217145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067285
42735	NC_014334	ACCA	2	8	2217184	2217191	50 %	0 %	0 %	50 %	301067285
42736	NC_014334	CTG	2	6	2217219	2217224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067285
42737	NC_014334	CAT	2	6	2217273	2217278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067285
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42759	NC_014334	AATT	2	8	2218490	2218497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42760	NC_014334	TAA	2	6	2218508	2218513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42762	NC_014334	A	7	7	2218557	2218563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42763	NC_014334	AGTG	2	8	2218571	2218578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42764	NC_014334	TGCT	2	8	2218687	2218694	0 %	50 %	25 %	25 %	301067286
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42788	NC_014334	CCT	2	6	2219830	2219835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42793	NC_014334	GCG	2	6	2220053	2220058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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42842	NC_014334	ATC	2	6	2222428	2222433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067288
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42846	NC_014334	TGC	2	6	2222688	2222693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067288
42847	NC_014334	T	6	6	2222696	2222701	0 %	100 %	0 %	0 %	301067288
42848	NC_014334	TCT	2	6	2222732	2222737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067288
42849	NC_014334	CCA	2	6	2222786	2222791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42850	NC_014334	ATG	2	6	2222844	2222849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42851	NC_014334	GTT	2	6	2222852	2222857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42852	NC_014334	GCT	2	6	2223034	2223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067289
42853	NC_014334	AGA	2	6	2223063	2223068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067289
42854	NC_014334	ATTG	2	8	2223069	2223076	25 %	50 %	25 %	0 %	301067289
42855	NC_014334	AGC	2	6	2223144	2223149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
42856	NC_014334	CTT	2	6	2223264	2223269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067289
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42860	NC_014334	GCA	3	9	2223454	2223462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
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42863	NC_014334	GTGGC	2	10	2223594	2223603	0 %	20 %	60 %	20 %	301067289
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42871	NC_014334	CGG	2	6	2223918	2223923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067289
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42907	NC_014334	T	6	6	2226411	2226416	0 %	100 %	0 %	0 %	301067294
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42954	NC_014334	CAT	2	6	2229510	2229515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067296
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42968	NC_014334	AAT	2	6	2230324	2230329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067297
42969	NC_014334	CTT	2	6	2230407	2230412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067297
42970	NC_014334	GTG	2	6	2230422	2230427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067297
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42972	NC_014334	AAC	2	6	2230486	2230491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067297
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42979	NC_014334	A	6	6	2230823	2230828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42980	NC_014334	AAAT	2	8	2230899	2230906	75 %	25 %	0 %	0 %	301067298
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42989	NC_014334	TTCA	2	8	2231281	2231288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42990	NC_014334	AAT	2	6	2231295	2231300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42991	NC_014334	AAC	2	6	2231435	2231440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42992	NC_014334	TGT	2	6	2231465	2231470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42993	NC_014334	CAAT	2	8	2231535	2231542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42994	NC_014334	A	6	6	2231558	2231563	100 %	0 %	0 %	0 %	301067300
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42999	NC_014334	TAT	2	6	2231672	2231677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067300
43000	NC_014334	CTAGCA	2	12	2231699	2231710	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301067300

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