MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_014334	ACT	2	6	2156945	2156950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41502	NC_014334	GTAT	2	8	2156960	2156967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41503	NC_014334	TCTT	2	8	2157009	2157016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41504	NC_014334	T	6	6	2157015	2157020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41505	NC_014334	TAA	2	6	2157160	2157165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41506	NC_014334	A	7	7	2157273	2157279	100 %	0 %	0 %	0 %	301067227
41507	NC_014334	TCAT	2	8	2157310	2157317	25 %	50 %	0 %	25 %	301067227
41508	NC_014334	GCG	2	6	2157319	2157324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067227
41509	NC_014334	TGGT	2	8	2157326	2157333	0 %	50 %	50 %	0 %	301067227
41510	NC_014334	GTC	2	6	2157337	2157342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067227
41511	NC_014334	CGG	2	6	2157353	2157358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067227
41512	NC_014334	CAT	2	6	2157446	2157451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067227
41513	NC_014334	TCG	2	6	2157496	2157501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067227
41514	NC_014334	ATCA	2	8	2157511	2157518	50 %	25 %	0 %	25 %	301067227
41515	NC_014334	GCT	2	6	2157557	2157562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067227
41516	NC_014334	CGC	2	6	2157584	2157589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067227
41517	NC_014334	AGC	2	6	2157604	2157609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067227
41518	NC_014334	GAT	2	6	2157618	2157623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067227
41519	NC_014334	TGA	2	6	2157632	2157637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067227
41520	NC_014334	A	7	7	2157796	2157802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41521	NC_014334	T	6	6	2157823	2157828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41522	NC_014334	CATT	2	8	2157833	2157840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41523	NC_014334	CAGA	2	8	2157867	2157874	50 %	0 %	25 %	25 %	301067228
41524	NC_014334	CTG	2	6	2157879	2157884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41525	NC_014334	GCA	2	6	2157935	2157940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41526	NC_014334	AGC	2	6	2158033	2158038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41527	NC_014334	GTTG	2	8	2158124	2158131	0 %	50 %	50 %	0 %	301067228
41528	NC_014334	GTC	2	6	2158133	2158138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41529	NC_014334	CTGG	2	8	2158155	2158162	0 %	25 %	50 %	25 %	301067228
41530	NC_014334	CTG	2	6	2158171	2158176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41531	NC_014334	TTG	3	9	2158183	2158191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41532	NC_014334	TTG	2	6	2158198	2158203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41533	NC_014334	CTGC	2	8	2158209	2158216	0 %	25 %	25 %	50 %	301067228
41534	NC_014334	CTGTTG	2	12	2158222	2158233	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	301067228
41535	NC_014334	TTG	2	6	2158237	2158242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41536	NC_014334	TTG	2	6	2158252	2158257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41537	NC_014334	TGT	2	6	2158259	2158264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41538	NC_014334	TTG	2	6	2158276	2158281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41539	NC_014334	CAG	2	6	2158290	2158295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41540	NC_014334	TGT	3	9	2158298	2158306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41541	NC_014334	CAG	3	9	2158329	2158337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41542	NC_014334	GCA	2	6	2158364	2158369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41543	NC_014334	GCA	2	6	2158379	2158384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41544	NC_014334	GCG	2	6	2158391	2158396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067228
41545	NC_014334	GCT	2	6	2158403	2158408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41546	NC_014334	AGC	3	9	2158429	2158437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41547	NC_014334	TGC	2	6	2158444	2158449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41548	NC_014334	AGC	2	6	2158480	2158485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41549	NC_014334	CTG	2	6	2158555	2158560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41550	NC_014334	T	6	6	2158636	2158641	0 %	100 %	0 %	0 %	301067228
41551	NC_014334	TTG	2	6	2158690	2158695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067228
41552	NC_014334	CAC	2	6	2158728	2158733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067228
41553	NC_014334	TTC	2	6	2158799	2158804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067228
41554	NC_014334	AGC	2	6	2158807	2158812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41555	NC_014334	CTTGG	2	10	2158823	2158832	0 %	40 %	40 %	20 %	301067228
41556	NC_014334	CTG	2	6	2158857	2158862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067228
41557	NC_014334	AAT	2	6	2158865	2158870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067228
41558	NC_014334	TCC	2	6	2158902	2158907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41559	NC_014334	TG	3	6	2158914	2158919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41560	NC_014334	TAAC	2	8	2158926	2158933	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41561	NC_014334	TG	3	6	2158975	2158980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41562	NC_014334	GCC	2	6	2159129	2159134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067229
41563	NC_014334	CTG	2	6	2159190	2159195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
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41565	NC_014334	CTG	2	6	2159449	2159454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
41566	NC_014334	GGC	2	6	2159481	2159486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067229
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41571	NC_014334	CTTG	2	8	2159649	2159656	0 %	50 %	25 %	25 %	301067229
41572	NC_014334	TGC	2	6	2159702	2159707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
41573	NC_014334	GCC	2	6	2159745	2159750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067230
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41575	NC_014334	AAT	2	6	2159853	2159858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067230
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41577	NC_014334	CAT	2	6	2159944	2159949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
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41579	NC_014334	TGC	2	6	2160044	2160049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067230
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41581	NC_014334	ATC	2	6	2160095	2160100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
41582	NC_014334	CGA	2	6	2160165	2160170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067230
41583	NC_014334	ATA	2	6	2160179	2160184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067230
41584	NC_014334	CTT	2	6	2160238	2160243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067230
41585	NC_014334	CGC	2	6	2160271	2160276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067230
41586	NC_014334	TCA	2	6	2160331	2160336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
41587	NC_014334	GCG	2	6	2160370	2160375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067230
41588	NC_014334	TGC	2	6	2160455	2160460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067230
41589	NC_014334	GGAAT	2	10	2160617	2160626	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41590	NC_014334	T	6	6	2160692	2160697	0 %	100 %	0 %	0 %	301067231
41591	NC_014334	GTC	2	6	2160726	2160731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067231
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41594	NC_014334	TC	3	6	2160823	2160828	0 %	50 %	0 %	50 %	301067231
41595	NC_014334	GCTG	2	8	2160850	2160857	0 %	25 %	50 %	25 %	301067231
41596	NC_014334	TTGG	2	8	2160867	2160874	0 %	50 %	50 %	0 %	301067231
41597	NC_014334	AAC	2	6	2160883	2160888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067231
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41599	NC_014334	ATT	2	6	2160980	2160985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067231
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41601	NC_014334	GATT	2	8	2161036	2161043	25 %	50 %	25 %	0 %	301067231
41602	NC_014334	ATT	2	6	2161083	2161088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067231
41603	NC_014334	GCT	2	6	2161117	2161122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067231
41604	NC_014334	ATG	2	6	2161151	2161156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067231
41605	NC_014334	TCTGAG	2	12	2161207	2161218	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301067231
41606	NC_014334	ATG	2	6	2161254	2161259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067231
41607	NC_014334	CAT	2	6	2161309	2161314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067231
41608	NC_014334	TTGT	2	8	2161331	2161338	0 %	75 %	25 %	0 %	301067231
41609	NC_014334	CAC	3	9	2161348	2161356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067231
41610	NC_014334	AAG	2	6	2161362	2161367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067231
41611	NC_014334	GTT	2	6	2161409	2161414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067231
41612	NC_014334	GATAAG	2	12	2161424	2161435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	301067231
41613	NC_014334	CAAG	2	8	2161468	2161475	50 %	0 %	25 %	25 %	301067231
41614	NC_014334	CAT	2	6	2161519	2161524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067231
41615	NC_014334	TTG	2	6	2161590	2161595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067231
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41617	NC_014334	GAA	2	6	2161652	2161657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067231
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41619	NC_014334	TGA	2	6	2161696	2161701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067231
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41733	NC_014334	CAT	2	6	2167433	2167438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067238
41734	NC_014334	CTC	2	6	2167466	2167471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067238
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41847	NC_014334	CAT	2	6	2173951	2173956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067242
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41851	NC_014334	TAA	2	6	2174136	2174141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067242
41852	NC_014334	TA	3	6	2174161	2174166	50 %	50 %	0 %	0 %	301067242
41853	NC_014334	A	6	6	2174171	2174176	100 %	0 %	0 %	0 %	301067242
41854	NC_014334	TCA	2	6	2174269	2174274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067242
41855	NC_014334	T	7	7	2174284	2174290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41857	NC_014334	GC	3	6	2174307	2174312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41858	NC_014334	CGCTG	2	10	2174391	2174400	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41859	NC_014334	TGA	2	6	2174566	2174571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41863	NC_014334	TTAA	2	8	2174660	2174667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41864	NC_014334	ACA	2	6	2174711	2174716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41865	NC_014334	TTG	2	6	2174744	2174749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41866	NC_014334	CAT	2	6	2174769	2174774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067243
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