MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014334	GCA	2	6	177057	177062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065307
3502	NC_014334	T	7	7	177077	177083	0 %	100 %	0 %	0 %	301065307
3503	NC_014334	T	7	7	177145	177151	0 %	100 %	0 %	0 %	301065307
3504	NC_014334	TGA	2	6	177190	177195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3505	NC_014334	ACC	2	6	177209	177214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065307
3506	NC_014334	ATG	2	6	177328	177333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3507	NC_014334	TGG	2	6	177385	177390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065307
3508	NC_014334	TGA	2	6	177401	177406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3509	NC_014334	TGA	2	6	177416	177421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3510	NC_014334	T	6	6	177515	177520	0 %	100 %	0 %	0 %	301065307
3511	NC_014334	TTG	2	6	177574	177579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065307
3512	NC_014334	ATT	2	6	177688	177693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065307
3513	NC_014334	TAT	2	6	177710	177715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065307
3514	NC_014334	ATT	2	6	177720	177725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065307
3515	NC_014334	GGA	2	6	177731	177736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065307
3516	NC_014334	TTCA	2	8	177777	177784	25 %	50 %	0 %	25 %	301065307
3517	NC_014334	CAA	2	6	177851	177856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065307
3518	NC_014334	TGAT	2	8	177862	177869	25 %	50 %	25 %	0 %	301065307
3519	NC_014334	TGA	2	6	177902	177907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3520	NC_014334	CTT	2	6	177926	177931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065307
3521	NC_014334	CGGT	2	8	177981	177988	0 %	25 %	50 %	25 %	301065307
3522	NC_014334	ACA	2	6	178117	178122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065307
3523	NC_014334	ATT	2	6	178125	178130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065307
3524	NC_014334	CCG	2	6	178266	178271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065307
3525	NC_014334	AGA	2	6	178277	178282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065307
3526	NC_014334	GAA	2	6	178299	178304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065307
3527	NC_014334	CTG	2	6	178305	178310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065307
3528	NC_014334	ATG	2	6	178346	178351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065307
3529	NC_014334	GAGGC	2	10	178477	178486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3530	NC_014334	TTTC	2	8	178531	178538	0 %	75 %	0 %	25 %	301065308
3531	NC_014334	TGG	2	6	178580	178585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3532	NC_014334	TTA	2	6	178604	178609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065308
3533	NC_014334	GCT	2	6	178616	178621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065308
3534	NC_014334	TC	3	6	178652	178657	0 %	50 %	0 %	50 %	301065308
3535	NC_014334	GCA	2	6	178677	178682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065308
3536	NC_014334	GTG	2	6	178789	178794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3537	NC_014334	TAT	3	9	178804	178812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065308
3538	NC_014334	TGG	2	6	178856	178861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3539	NC_014334	GGC	2	6	178886	178891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065308
3540	NC_014334	CG	3	6	178965	178970	0 %	0 %	50 %	50 %	301065308
3541	NC_014334	CGG	2	6	178995	179000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065308
3542	NC_014334	TTC	2	6	179009	179014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065308
3543	NC_014334	GGT	2	6	179021	179026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3544	NC_014334	TGG	2	6	179060	179065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3545	NC_014334	ATTATC	2	12	179084	179095	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	301065308
3546	NC_014334	T	6	6	179101	179106	0 %	100 %	0 %	0 %	301065308
3547	NC_014334	ATT	3	9	179132	179140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065308
3548	NC_014334	ATC	2	6	179213	179218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065308
3549	NC_014334	ATT	2	6	179228	179233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065308
3550	NC_014334	ATT	2	6	179240	179245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065308
3551	NC_014334	GTTG	2	8	179282	179289	0 %	50 %	50 %	0 %	301065308
3552	NC_014334	CGA	2	6	179291	179296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065308
3553	NC_014334	TGG	2	6	179321	179326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065308
3554	NC_014334	TGT	2	6	179341	179346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065308
3555	NC_014334	CTT	2	6	179411	179416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065308
3556	NC_014334	CCAA	2	8	179447	179454	50 %	0 %	0 %	50 %	301065308
3557	NC_014334	CAC	2	6	179478	179483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_014334	A	7	7	179493	179499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014334	T	6	6	179516	179521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014334	CTA	2	6	179575	179580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065309
3561	NC_014334	AGCG	2	8	179644	179651	25 %	0 %	50 %	25 %	301065309
3562	NC_014334	CAAT	2	8	179671	179678	50 %	25 %	0 %	25 %	301065309
3563	NC_014334	AAG	2	6	179751	179756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065309
3564	NC_014334	GTC	2	6	179765	179770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065309
3565	NC_014334	GTAAG	2	10	179789	179798	40 %	20 %	40 %	0 %	301065309
3566	NC_014334	TGA	2	6	179858	179863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065309
3567	NC_014334	TCC	2	6	179887	179892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_014334	CAG	2	6	179933	179938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014334	TTA	2	6	179949	179954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014334	ATG	2	6	179966	179971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014334	AAT	2	6	179979	179984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014334	TGA	2	6	180127	180132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065310
3573	NC_014334	ACA	2	6	180242	180247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065310
3574	NC_014334	CGAA	2	8	180269	180276	50 %	0 %	25 %	25 %	301065310
3575	NC_014334	CAG	2	6	180297	180302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065310
3576	NC_014334	TGA	2	6	180333	180338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065310
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3578	NC_014334	CAA	2	6	180406	180411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065310
3579	NC_014334	GCA	2	6	180415	180420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065310
3580	NC_014334	GCA	2	6	180450	180455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065310
3581	NC_014334	AGCG	2	8	180576	180583	25 %	0 %	50 %	25 %	301065310
3582	NC_014334	CG	3	6	180594	180599	0 %	0 %	50 %	50 %	301065310
3583	NC_014334	GGC	2	6	180725	180730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065310
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3587	NC_014334	TGGC	2	8	180875	180882	0 %	25 %	50 %	25 %	301065310
3588	NC_014334	CGG	2	6	180923	180928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065310
3589	NC_014334	GCGA	2	8	180941	180948	25 %	0 %	50 %	25 %	301065310
3590	NC_014334	CA	3	6	181045	181050	50 %	0 %	0 %	50 %	301065310
3591	NC_014334	AAAG	2	8	181114	181121	75 %	0 %	25 %	0 %	301065310
3592	NC_014334	CACAA	2	10	181223	181232	60 %	0 %	0 %	40 %	301065310
3593	NC_014334	ATC	2	6	181290	181295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065310
3594	NC_014334	ATG	2	6	181402	181407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065310
3595	NC_014334	AGG	2	6	181448	181453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014334	A	7	7	181454	181460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014334	GCAG	2	8	181487	181494	25 %	0 %	50 %	25 %	301065311
3598	NC_014334	AAG	2	6	181647	181652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065311
3599	NC_014334	GTTG	2	8	181690	181697	0 %	50 %	50 %	0 %	301065311
3600	NC_014334	CGG	2	6	181741	181746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065311
3601	NC_014334	TGA	2	6	181774	181779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065311
3602	NC_014334	TTG	2	6	181787	181792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065311
3603	NC_014334	GAT	2	6	181867	181872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065311
3604	NC_014334	GC	3	6	182022	182027	0 %	0 %	50 %	50 %	301065311
3605	NC_014334	AGA	2	6	182056	182061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065311
3606	NC_014334	GAT	2	6	182068	182073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065311
3607	NC_014334	AGGCTC	2	12	182086	182097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301065311
3608	NC_014334	GAA	2	6	182221	182226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065311
3609	NC_014334	AAC	2	6	182267	182272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065311
3610	NC_014334	ACCA	2	8	182602	182609	50 %	0 %	0 %	50 %	301065311
3611	NC_014334	GAA	2	6	182612	182617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065311
3612	NC_014334	TGA	2	6	182619	182624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065311
3613	NC_014334	A	6	6	182675	182680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014334	TC	3	6	182684	182689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_014334	T	6	6	182707	182712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014334	TCAA	2	8	182732	182739	50 %	25 %	0 %	25 %	301065312
3617	NC_014334	GGCACC	2	12	182945	182956	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	301065312
3618	NC_014334	A	6	6	182974	182979	100 %	0 %	0 %	0 %	301065312
3619	NC_014334	TGA	2	6	183217	183222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065312
3620	NC_014334	CCA	2	6	183241	183246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065312
3621	NC_014334	AGT	2	6	183277	183282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065312
3622	NC_014334	GACCA	2	10	183338	183347	40 %	0 %	20 %	40 %	301065312
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3624	NC_014334	AAAT	2	8	183542	183549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3748	NC_014334	GAGC	2	8	189996	190003	25 %	0 %	50 %	25 %	301065319
3749	NC_014334	GCC	2	6	190059	190064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065319
3750	NC_014334	CAC	2	6	190169	190174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065319
3751	NC_014334	GCA	2	6	190181	190186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065319
3752	NC_014334	CCA	2	6	190193	190198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065319
3753	NC_014334	TGT	2	6	190301	190306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065319
3754	NC_014334	CAT	2	6	190326	190331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065319
3755	NC_014334	CCGTC	2	10	190409	190418	0 %	20 %	20 %	60 %	301065319
3756	NC_014334	AAT	2	6	190532	190537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065319
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3760	NC_014334	GT	3	6	190682	190687	0 %	50 %	50 %	0 %	301065319
3761	NC_014334	TTGA	2	8	190725	190732	25 %	50 %	25 %	0 %	301065319
3762	NC_014334	ATTG	2	8	190766	190773	25 %	50 %	25 %	0 %	301065319
3763	NC_014334	TGGC	2	8	190789	190796	0 %	25 %	50 %	25 %	301065319
3764	NC_014334	ACC	2	6	190860	190865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065319
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3771	NC_014334	TTG	2	6	191133	191138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065319
3772	NC_014334	GCT	2	6	191158	191163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065319
3773	NC_014334	TCAA	2	8	191236	191243	50 %	25 %	0 %	25 %	301065319
3774	NC_014334	T	6	6	191264	191269	0 %	100 %	0 %	0 %	301065319
3775	NC_014334	TTC	2	6	191340	191345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065319
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3777	NC_014334	AGTTG	2	10	191422	191431	20 %	40 %	40 %	0 %	301065319
3778	NC_014334	AAGG	2	8	191505	191512	50 %	0 %	50 %	0 %	301065319
3779	NC_014334	TTG	2	6	191517	191522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065319
3780	NC_014334	TTG	2	6	191530	191535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065319
3781	NC_014334	CGC	2	6	191730	191735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065319
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3785	NC_014334	GCCA	2	8	192257	192264	25 %	0 %	25 %	50 %	301065319
3786	NC_014334	TGA	2	6	192268	192273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065319
3787	NC_014334	GACT	2	8	192396	192403	25 %	25 %	25 %	25 %	301065319
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3798	NC_014334	CCT	2	6	193087	193092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3799	NC_014334	GAT	2	6	193128	193133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3800	NC_014334	GAA	2	6	193136	193141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3801	NC_014334	A	6	6	193167	193172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3802	NC_014334	GTG	2	6	193190	193195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3803	NC_014334	T	7	7	193234	193240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3804	NC_014334	TCA	2	6	193242	193247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3805	NC_014334	A	6	6	193287	193292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3806	NC_014334	CGG	2	6	193328	193333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3807	NC_014334	ACC	2	6	193399	193404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065321
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3822	NC_014334	ATCG	2	8	194187	194194	25 %	25 %	25 %	25 %	301065321
3823	NC_014334	A	7	7	194245	194251	100 %	0 %	0 %	0 %	301065321
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3831	NC_014334	A	7	7	194838	194844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3832	NC_014334	TAAC	2	8	194852	194859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3833	NC_014334	GCAG	2	8	194887	194894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3834	NC_014334	AAT	2	6	194932	194937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3835	NC_014334	CAG	2	6	194940	194945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3836	NC_014334	TGACAA	2	12	195019	195030	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3837	NC_014334	AGTC	2	8	195056	195063	25 %	25 %	25 %	25 %	301065322
3838	NC_014334	TTG	2	6	195073	195078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065322
3839	NC_014334	CAT	2	6	195086	195091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065322
3840	NC_014334	ACG	2	6	195106	195111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065322
3841	NC_014334	TCA	2	6	195115	195120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065322
3842	NC_014334	GCG	3	9	195142	195150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065322
3843	NC_014334	CCT	2	6	195204	195209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3844	NC_014334	TCA	2	6	195234	195239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3845	NC_014334	AGC	2	6	195284	195289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3846	NC_014334	T	6	6	195351	195356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3847	NC_014334	T	6	6	195402	195407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3848	NC_014334	GCT	2	6	195576	195581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065323
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3850	NC_014334	GT	3	6	195791	195796	0 %	50 %	50 %	0 %	301065323
3851	NC_014334	AAG	2	6	195806	195811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065323
3852	NC_014334	GAA	2	6	195816	195821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065323
3853	NC_014334	TCCA	2	8	195886	195893	25 %	25 %	0 %	50 %	301065323
3854	NC_014334	CGG	2	6	195965	195970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065323
3855	NC_014334	TGAAAC	2	12	195987	195998	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301065323
3856	NC_014334	CAT	2	6	196013	196018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065323
3857	NC_014334	CCAAC	2	10	196097	196106	40 %	0 %	0 %	60 %	301065323
3858	NC_014334	TTC	2	6	196171	196176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065323
3859	NC_014334	GAT	2	6	196186	196191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065323
3860	NC_014334	ATT	2	6	196309	196314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065323
3861	NC_014334	TTCC	2	8	196374	196381	0 %	50 %	0 %	50 %	301065323
3862	NC_014334	GATTCC	2	12	196392	196403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301065323
3863	NC_014334	GGCT	2	8	196444	196451	0 %	25 %	50 %	25 %	301065323
3864	NC_014334	ATC	2	6	196460	196465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065323
3865	NC_014334	GCC	2	6	196518	196523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065323
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3867	NC_014334	GCT	2	6	196543	196548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065323
3868	NC_014334	ACA	2	6	196619	196624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065323
3869	NC_014334	ATT	2	6	196834	196839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065323
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3871	NC_014334	GTC	2	6	196939	196944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065323
3872	NC_014334	CTCA	2	8	196954	196961	25 %	25 %	0 %	50 %	301065323
3873	NC_014334	GAA	2	6	196990	196995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065323
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3875	NC_014334	CAG	2	6	197050	197055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065323
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