MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20005	NC_014334	TCA	2	6	1039759	1039764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066135
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20008	NC_014334	ATT	2	6	1039924	1039929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066135
20009	NC_014334	TGT	2	6	1040119	1040124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066135
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20358	NC_014334	ACG	2	6	1057188	1057193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066151
20359	NC_014334	TGT	2	6	1057196	1057201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066151
20360	NC_014334	ATG	2	6	1057241	1057246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066151
20361	NC_014334	CAA	2	6	1057252	1057257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066151
20362	NC_014334	TGA	2	6	1057290	1057295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066151
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20365	NC_014334	GAT	2	6	1057456	1057461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066151
20366	NC_014334	ACG	2	6	1057474	1057479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066151
20367	NC_014334	AAT	2	6	1057525	1057530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066151
20368	NC_014334	GTT	3	9	1057567	1057575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066151
20369	NC_014334	A	7	7	1057586	1057592	100 %	0 %	0 %	0 %	301066151
20370	NC_014334	ACGCA	2	10	1057601	1057610	40 %	0 %	20 %	40 %	301066151
20371	NC_014334	TGA	2	6	1057646	1057651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066151
20372	NC_014334	TTA	2	6	1057735	1057740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066151
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20380	NC_014334	GAAA	2	8	1058237	1058244	75 %	0 %	25 %	0 %	301066151
20381	NC_014334	TGT	2	6	1058289	1058294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066151
20382	NC_014334	CAT	2	6	1058340	1058345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066151
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20384	NC_014334	GCTGA	2	10	1058566	1058575	20 %	20 %	40 %	20 %	301066151
20385	NC_014334	CTG	2	6	1058588	1058593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066151
20386	NC_014334	AGG	2	6	1058615	1058620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066151
20387	NC_014334	A	9	9	1058635	1058643	100 %	0 %	0 %	0 %	301066151
20388	NC_014334	TCAT	2	8	1058655	1058662	25 %	50 %	0 %	25 %	301066152
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20391	NC_014334	T	7	7	1058805	1058811	0 %	100 %	0 %	0 %	301066152
20392	NC_014334	TGA	3	9	1058836	1058844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066152
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20394	NC_014334	AT	3	6	1058919	1058924	50 %	50 %	0 %	0 %	301066152
20395	NC_014334	T	7	7	1058995	1059001	0 %	100 %	0 %	0 %	301066152
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20400	NC_014334	GAT	2	6	1059290	1059295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066152
20401	NC_014334	GCG	2	6	1059400	1059405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066152
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20415	NC_014334	TCGT	2	8	1060256	1060263	0 %	50 %	25 %	25 %	301066153
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20422	NC_014334	ATG	2	6	1060661	1060666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066153
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20425	NC_014334	GT	3	6	1060784	1060789	0 %	50 %	50 %	0 %	301066153
20426	NC_014334	CAG	2	6	1060806	1060811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066153
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20430	NC_014334	CAT	3	9	1061092	1061100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066153
20431	NC_014334	TAAG	2	8	1061104	1061111	50 %	25 %	25 %	0 %	301066153
20432	NC_014334	T	6	6	1061125	1061130	0 %	100 %	0 %	0 %	301066153
20433	NC_014334	GGC	2	6	1061131	1061136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066153
20434	NC_014334	GCC	2	6	1061263	1061268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066153
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20436	NC_014334	ATA	2	6	1061410	1061415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066153
20437	NC_014334	GAC	2	6	1061437	1061442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066153
20438	NC_014334	TCG	2	6	1061450	1061455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066153
20439	NC_014334	CAGC	2	8	1061523	1061530	25 %	0 %	25 %	50 %	301066153
20440	NC_014334	CCAC	2	8	1061582	1061589	25 %	0 %	0 %	75 %	301066153
20441	NC_014334	T	6	6	1061613	1061618	0 %	100 %	0 %	0 %	301066153
20442	NC_014334	TGT	2	6	1061631	1061636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066153
20443	NC_014334	TCC	2	6	1061639	1061644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20444	NC_014334	TGC	2	6	1061673	1061678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20446	NC_014334	TAGT	2	8	1061720	1061727	25 %	50 %	25 %	0 %	301066154
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20448	NC_014334	AAT	2	6	1061797	1061802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066154
20449	NC_014334	AGT	2	6	1061864	1061869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
20450	NC_014334	CAT	2	6	1061874	1061879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066154
20451	NC_014334	TCG	2	6	1061955	1061960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066154
20452	NC_014334	CCA	2	6	1061972	1061977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066154
20453	NC_014334	GCAC	2	8	1061984	1061991	25 %	0 %	25 %	50 %	301066154
20454	NC_014334	CAA	2	6	1062009	1062014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066154
20455	NC_014334	TGA	2	6	1062066	1062071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
20456	NC_014334	CTT	2	6	1062093	1062098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066154
20457	NC_014334	GTA	2	6	1062172	1062177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
20458	NC_014334	TTGC	2	8	1062214	1062221	0 %	50 %	25 %	25 %	301066154
20459	NC_014334	CTGAA	2	10	1062232	1062241	40 %	20 %	20 %	20 %	301066154
20460	NC_014334	GAT	2	6	1062249	1062254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
20461	NC_014334	GTA	2	6	1062265	1062270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
20462	NC_014334	GAA	2	6	1062279	1062284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066154
20463	NC_014334	TGC	2	6	1062299	1062304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066154
20464	NC_014334	GGT	2	6	1062347	1062352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066154
20465	NC_014334	T	6	6	1062409	1062414	0 %	100 %	0 %	0 %	301066154
20466	NC_014334	GAC	2	6	1062511	1062516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066154
20467	NC_014334	T	6	6	1062532	1062537	0 %	100 %	0 %	0 %	301066154
20468	NC_014334	TCGT	2	8	1062569	1062576	0 %	50 %	25 %	25 %	301066155
20469	NC_014334	GCC	2	6	1062590	1062595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066155
20470	NC_014334	GTT	2	6	1062629	1062634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066155
20471	NC_014334	TGG	2	6	1062649	1062654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066155
20472	NC_014334	A	6	6	1062658	1062663	100 %	0 %	0 %	0 %	301066155
20473	NC_014334	GCAG	2	8	1062664	1062671	25 %	0 %	50 %	25 %	301066155
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20477	NC_014334	TAT	2	6	1062822	1062827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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