MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_014334	ATC	2	6	988137	988142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066079
19002	NC_014334	TAT	2	6	988220	988225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066079
19003	NC_014334	TGA	2	6	988226	988231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066079
19004	NC_014334	ACA	2	6	988294	988299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066079
19005	NC_014334	TTG	2	6	988302	988307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066079
19006	NC_014334	GAT	2	6	988440	988445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066079
19007	NC_014334	ACT	2	6	988481	988486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066079
19008	NC_014334	AGC	2	6	988544	988549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066079
19009	NC_014334	CAAG	2	8	988550	988557	50 %	0 %	25 %	25 %	301066079
19010	NC_014334	GAC	2	6	988632	988637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066079
19011	NC_014334	CCA	2	6	988659	988664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066079
19012	NC_014334	AGA	2	6	988745	988750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066079
19013	NC_014334	CATT	2	8	988773	988780	25 %	50 %	0 %	25 %	301066079
19014	NC_014334	GTG	2	6	988840	988845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066079
19015	NC_014334	CGTG	2	8	988949	988956	0 %	25 %	50 %	25 %	301066079
19016	NC_014334	TGA	2	6	989078	989083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066079
19017	NC_014334	AAC	2	6	989139	989144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066079
19018	NC_014334	TAA	2	6	989165	989170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066079
19019	NC_014334	TGA	2	6	989227	989232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066079
19020	NC_014334	TAC	2	6	989336	989341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066080
19021	NC_014334	TGG	2	6	989371	989376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066080
19022	NC_014334	TCA	3	9	989435	989443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066080
19023	NC_014334	CAA	2	6	989448	989453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066080
19024	NC_014334	ACACA	2	10	989487	989496	60 %	0 %	0 %	40 %	301066081
19025	NC_014334	ACA	2	6	989508	989513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066081
19026	NC_014334	CGG	2	6	989607	989612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066081
19027	NC_014334	CTT	2	6	989678	989683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066081
19028	NC_014334	GCT	2	6	989735	989740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066081
19029	NC_014334	TGG	2	6	989832	989837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066081
19030	NC_014334	CA	3	6	989941	989946	50 %	0 %	0 %	50 %	301066081
19031	NC_014334	CGC	2	6	989967	989972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066081
19032	NC_014334	TTC	2	6	990032	990037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066081
19033	NC_014334	CAA	2	6	990073	990078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066081
19034	NC_014334	GTG	2	6	990138	990143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066081
19035	NC_014334	CAT	2	6	990160	990165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066081
19036	NC_014334	GATG	2	8	990382	990389	25 %	25 %	50 %	0 %	301066081
19037	NC_014334	CCA	2	6	990536	990541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066081
19038	NC_014334	CAT	2	6	990559	990564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066081
19039	NC_014334	AC	3	6	990579	990584	50 %	0 %	0 %	50 %	301066081
19040	NC_014334	AAC	2	6	990590	990595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066081
19041	NC_014334	GCC	2	6	990690	990695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066082
19042	NC_014334	GAC	2	6	990711	990716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19043	NC_014334	AGT	2	6	990764	990769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066082
19044	NC_014334	CAAG	2	8	990781	990788	50 %	0 %	25 %	25 %	301066082
19045	NC_014334	AAG	2	6	990805	990810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066082
19046	NC_014334	CGCA	2	8	990820	990827	25 %	0 %	25 %	50 %	301066082
19047	NC_014334	GAT	2	6	990927	990932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066082
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19049	NC_014334	TGC	2	6	991037	991042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19050	NC_014334	GAC	2	6	991068	991073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19051	NC_014334	CAAG	2	8	991097	991104	50 %	0 %	25 %	25 %	301066082
19052	NC_014334	AGA	2	6	991208	991213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066082
19053	NC_014334	ACC	2	6	991229	991234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066082
19054	NC_014334	A	6	6	991270	991275	100 %	0 %	0 %	0 %	301066082
19055	NC_014334	TAT	2	6	991277	991282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066082
19056	NC_014334	AGA	2	6	991289	991294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066082
19057	NC_014334	CTG	2	6	991369	991374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19058	NC_014334	TCA	2	6	991396	991401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066082
19059	NC_014334	ATG	2	6	991402	991407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066082
19060	NC_014334	CAA	2	6	991502	991507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066082
19061	NC_014334	CCA	2	6	991519	991524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066082
19062	NC_014334	AGA	2	6	991631	991636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066082
19063	NC_014334	TTG	2	6	991651	991656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066082
19064	NC_014334	AAG	2	6	991677	991682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066082
19065	NC_014334	CACTGG	2	12	991763	991774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19066	NC_014334	GCAA	2	8	991927	991934	50 %	0 %	25 %	25 %	301066082
19067	NC_014334	ATC	3	9	992004	992012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066082
19068	NC_014334	CGT	2	6	992102	992107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19069	NC_014334	GCT	2	6	992142	992147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19070	NC_014334	AGC	2	6	992171	992176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19071	NC_014334	CAG	2	6	992182	992187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066082
19072	NC_014334	TA	3	6	992230	992235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_014334	AGA	2	6	992262	992267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066083
19074	NC_014334	AAAG	2	8	992271	992278	75 %	0 %	25 %	0 %	301066083
19075	NC_014334	GAT	2	6	992302	992307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066083
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19078	NC_014334	GAT	2	6	992392	992397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066083
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19082	NC_014334	TGAA	2	8	992550	992557	50 %	25 %	25 %	0 %	301066084
19083	NC_014334	TGT	2	6	992716	992721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066084
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19086	NC_014334	AATA	2	8	992855	992862	75 %	25 %	0 %	0 %	301066084
19087	NC_014334	GATT	2	8	992967	992974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_014334	T	7	7	993101	993107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19089	NC_014334	GA	3	6	993115	993120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19090	NC_014334	CAA	2	6	993215	993220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066085
19091	NC_014334	GAAC	2	8	993243	993250	50 %	0 %	25 %	25 %	301066085
19092	NC_014334	CAA	2	6	993555	993560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066087
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19098	NC_014334	AGT	2	6	993843	993848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_014334	ATA	2	6	993857	993862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_014334	GCC	2	6	993868	993873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19101	NC_014334	TGC	2	6	993977	993982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19105	NC_014334	GCCA	2	8	994123	994130	25 %	0 %	25 %	50 %	301066088
19106	NC_014334	GGC	2	6	994146	994151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19107	NC_014334	CTA	2	6	994156	994161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_014334	GACCC	2	10	994220	994229	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19109	NC_014334	TTA	2	6	994262	994267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_014334	AGC	2	6	994268	994273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19111	NC_014334	TGA	2	6	994321	994326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_014334	GAGCC	2	10	994329	994338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19113	NC_014334	ATGC	2	8	994519	994526	25 %	25 %	25 %	25 %	301066089
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19115	NC_014334	TCA	2	6	994567	994572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066089
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19119	NC_014334	ATG	2	6	994815	994820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066089
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19121	NC_014334	A	6	6	994871	994876	100 %	0 %	0 %	0 %	301066089
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19239	NC_014334	CGC	2	6	1000326	1000331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066097
19240	NC_014334	TGA	2	6	1000397	1000402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066097
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19242	NC_014334	CGATTT	2	12	1000446	1000457	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301066097
19243	NC_014334	CG	3	6	1000476	1000481	0 %	0 %	50 %	50 %	301066097
19244	NC_014334	TGA	2	6	1000518	1000523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066097
19245	NC_014334	ATG	2	6	1000583	1000588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066097
19246	NC_014334	GTT	2	6	1000629	1000634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066097
19247	NC_014334	GCT	2	6	1000667	1000672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066097
19248	NC_014334	AATTA	2	10	1000756	1000765	60 %	40 %	0 %	0 %	301066097
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19250	NC_014334	AATT	2	8	1000870	1000877	50 %	50 %	0 %	0 %	301066097
19251	NC_014334	GTG	2	6	1000890	1000895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066097
19252	NC_014334	TG	3	6	1000915	1000920	0 %	50 %	50 %	0 %	301066097
19253	NC_014334	TCA	2	6	1000940	1000945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066097
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19256	NC_014334	T	7	7	1001109	1001115	0 %	100 %	0 %	0 %	301066097
19257	NC_014334	GCC	2	6	1001143	1001148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066097
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19260	NC_014334	AAGC	2	8	1001338	1001345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19261	NC_014334	A	7	7	1001366	1001372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19262	NC_014334	A	6	6	1001383	1001388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19263	NC_014334	TTGA	2	8	1001398	1001405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19264	NC_014334	CCG	2	6	1001443	1001448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066098
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19352	NC_014334	GCCAA	2	10	1005467	1005476	40 %	0 %	20 %	40 %	301066102
19353	NC_014334	TGA	2	6	1005540	1005545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
19354	NC_014334	ATC	2	6	1005590	1005595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066102
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19357	NC_014334	GAT	2	6	1005996	1006001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
19358	NC_014334	AGA	2	6	1006086	1006091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
19359	NC_014334	GATTC	2	10	1006112	1006121	20 %	40 %	20 %	20 %	301066102
19360	NC_014334	GAA	2	6	1006207	1006212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
19361	NC_014334	AAG	2	6	1006220	1006225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
19362	NC_014334	TGA	2	6	1006232	1006237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
19363	NC_014334	GCT	2	6	1006246	1006251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066102
19364	NC_014334	GAA	2	6	1006291	1006296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
19365	NC_014334	GCTTA	2	10	1006355	1006364	20 %	40 %	20 %	20 %	301066102
19366	NC_014334	GAA	2	6	1006465	1006470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
19367	NC_014334	TTG	2	6	1006483	1006488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066102
19368	NC_014334	TTA	2	6	1006529	1006534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066102
19369	NC_014334	GCT	2	6	1006576	1006581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066102
19370	NC_014334	A	6	6	1006583	1006588	100 %	0 %	0 %	0 %	301066102
19371	NC_014334	CAA	2	6	1006619	1006624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066102
19372	NC_014334	GTG	2	6	1006693	1006698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066102
19373	NC_014334	GAT	2	6	1006717	1006722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
19374	NC_014334	CAT	2	6	1006799	1006804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066102
19375	NC_014334	AGG	2	6	1006851	1006856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19376	NC_014334	GAA	2	6	1006896	1006901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066103
19377	NC_014334	GAG	2	6	1007028	1007033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066103
19378	NC_014334	AAG	2	6	1007071	1007076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066103
19379	NC_014334	TGT	2	6	1007128	1007133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066103
19380	NC_014334	T	6	6	1007146	1007151	0 %	100 %	0 %	0 %	301066103
19381	NC_014334	GTTGA	2	10	1007220	1007229	20 %	40 %	40 %	0 %	301066103
19382	NC_014334	GTG	2	6	1007293	1007298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066103
19383	NC_014334	AGC	2	6	1007365	1007370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
19384	NC_014334	GGC	2	6	1007411	1007416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066103
19385	NC_014334	GGC	2	6	1007451	1007456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066103
19386	NC_014334	GCT	2	6	1007523	1007528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066103
19387	NC_014334	GCA	2	6	1007588	1007593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
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19389	NC_014334	AAG	2	6	1007685	1007690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066103
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19391	NC_014334	GAA	2	6	1007826	1007831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066103
19392	NC_014334	TCAT	2	8	1007842	1007849	25 %	50 %	0 %	25 %	301066103
19393	NC_014334	ATT	2	6	1008021	1008026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066103
19394	NC_014334	CGA	2	6	1008128	1008133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
19395	NC_014334	AGC	2	6	1008184	1008189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
19396	NC_014334	TAA	2	6	1008350	1008355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066103
19397	NC_014334	CAA	2	6	1008371	1008376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066103
19398	NC_014334	TTGGG	2	10	1008409	1008418	0 %	40 %	60 %	0 %	301066103
19399	NC_014334	GCC	2	6	1008441	1008446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066103
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19402	NC_014334	GACC	2	8	1008631	1008638	25 %	0 %	25 %	50 %	301066103
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19404	NC_014334	AGC	2	6	1008727	1008732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
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19408	NC_014334	GCTG	2	8	1008923	1008930	0 %	25 %	50 %	25 %	301066104
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19422	NC_014334	GCA	2	6	1009340	1009345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066104
19423	NC_014334	GTC	2	6	1009524	1009529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066104
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19430	NC_014334	AT	3	6	1009904	1009909	50 %	50 %	0 %	0 %	301066104
19431	NC_014334	GCAA	2	8	1009920	1009927	50 %	0 %	25 %	25 %	301066104
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19433	NC_014334	CCAG	2	8	1010179	1010186	25 %	0 %	25 %	50 %	301066105
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19441	NC_014334	GCT	2	6	1010562	1010567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066106
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19451	NC_014334	AC	3	6	1011118	1011123	50 %	0 %	0 %	50 %	301066106
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19460	NC_014334	TGC	2	6	1011797	1011802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066106
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19464	NC_014334	GTTGA	2	10	1011892	1011901	20 %	40 %	40 %	0 %	301066107
19465	NC_014334	CAT	2	6	1012032	1012037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066107
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19468	NC_014334	GAA	2	6	1012239	1012244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066107
19469	NC_014334	AGA	2	6	1012338	1012343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066107
19470	NC_014334	GCTTAT	2	12	1012345	1012356	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301066107
19471	NC_014334	GTTCA	2	10	1012378	1012387	20 %	40 %	20 %	20 %	301066107
19472	NC_014334	GAA	2	6	1012411	1012416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066107
19473	NC_014334	GAA	2	6	1012537	1012542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066107
19474	NC_014334	GCA	2	6	1012548	1012553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066107
19475	NC_014334	GCG	2	6	1012568	1012573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066107
19476	NC_014334	AAGG	2	8	1012639	1012646	50 %	0 %	50 %	0 %	301066107
19477	NC_014334	GAT	2	6	1012651	1012656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066107
19478	NC_014334	CCA	2	6	1012684	1012689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066107
19479	NC_014334	GAC	2	6	1012714	1012719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066107
19480	NC_014334	CAG	2	6	1012745	1012750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066107
19481	NC_014334	ATG	2	6	1012793	1012798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066107
19482	NC_014334	TTC	2	6	1012834	1012839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066107
19483	NC_014334	CAAG	2	8	1012869	1012876	50 %	0 %	25 %	25 %	301066107
19484	NC_014334	GGCA	2	8	1012965	1012972	25 %	0 %	50 %	25 %	301066107
19485	NC_014334	ATT	2	6	1013119	1013124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066107
19486	NC_014334	ATA	2	6	1013138	1013143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066107
19487	NC_014334	AAAC	2	8	1013215	1013222	75 %	0 %	0 %	25 %	301066107
19488	NC_014334	ATA	2	6	1013318	1013323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19489	NC_014334	TGT	2	6	1013349	1013354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19490	NC_014334	GCA	2	6	1013400	1013405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19491	NC_014334	CAG	2	6	1013517	1013522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066108
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19495	NC_014334	GCT	2	6	1013751	1013756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066109
19496	NC_014334	A	6	6	1013805	1013810	100 %	0 %	0 %	0 %	301066109
19497	NC_014334	ATT	2	6	1013826	1013831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066109
19498	NC_014334	CAG	2	6	1013833	1013838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066109
19499	NC_014334	CG	3	6	1013855	1013860	0 %	0 %	50 %	50 %	301066109
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