MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_014334	ATG	2	6	934066	934071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066014
18002	NC_014334	GGT	2	6	934076	934081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066014
18003	NC_014334	GCC	2	6	934160	934165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066014
18004	NC_014334	CAT	2	6	934221	934226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066014
18005	NC_014334	TTG	2	6	934263	934268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066014
18006	NC_014334	TGC	2	6	934340	934345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066014
18007	NC_014334	TGC	2	6	934349	934354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066014
18008	NC_014334	CGG	2	6	934367	934372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066014
18009	NC_014334	A	8	8	934404	934411	100 %	0 %	0 %	0 %	301066014
18010	NC_014334	GGC	2	6	934412	934417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066014
18011	NC_014334	TGAT	2	8	934420	934427	25 %	50 %	25 %	0 %	301066014
18012	NC_014334	ATT	2	6	934443	934448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066014
18013	NC_014334	CTT	2	6	934487	934492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066014
18014	NC_014334	A	6	6	934531	934536	100 %	0 %	0 %	0 %	301066014
18015	NC_014334	AC	3	6	934619	934624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18016	NC_014334	ATG	2	6	934670	934675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_014334	CG	3	6	934787	934792	0 %	0 %	50 %	50 %	301066015
18018	NC_014334	GCA	2	6	934801	934806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066015
18019	NC_014334	GCT	2	6	934879	934884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066015
18020	NC_014334	AGGCA	2	10	934977	934986	40 %	0 %	40 %	20 %	301066015
18021	NC_014334	A	6	6	935003	935008	100 %	0 %	0 %	0 %	301066015
18022	NC_014334	ATT	2	6	935024	935029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066015
18023	NC_014334	GAAG	2	8	935052	935059	50 %	0 %	50 %	0 %	301066015
18024	NC_014334	TTCA	2	8	935084	935091	25 %	50 %	0 %	25 %	301066015
18025	NC_014334	GTG	2	6	935156	935161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066015
18026	NC_014334	GCTG	2	8	935241	935248	0 %	25 %	50 %	25 %	301066015
18027	NC_014334	ACC	2	6	935295	935300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066015
18028	NC_014334	TGC	2	6	935433	935438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066015
18029	NC_014334	CGG	2	6	935559	935564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066015
18030	NC_014334	ATT	2	6	935659	935664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066015
18031	NC_014334	A	6	6	935697	935702	100 %	0 %	0 %	0 %	301066016
18032	NC_014334	TGC	2	6	935776	935781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066016
18033	NC_014334	AGA	2	6	935936	935941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066016
18034	NC_014334	T	6	6	936014	936019	0 %	100 %	0 %	0 %	301066016
18035	NC_014334	TGA	2	6	936046	936051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066016
18036	NC_014334	AGCA	2	8	936148	936155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18037	NC_014334	T	6	6	936176	936181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_014334	TTTGG	2	10	936184	936193	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_014334	GTG	2	6	936198	936203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_014334	AGA	2	6	936432	936437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066017
18041	NC_014334	TTTG	2	8	936507	936514	0 %	75 %	25 %	0 %	301066017
18042	NC_014334	CTG	2	6	936523	936528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066017
18043	NC_014334	TTA	2	6	936593	936598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066017
18044	NC_014334	AGC	2	6	936668	936673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066017
18045	NC_014334	TTG	2	6	936733	936738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066017
18046	NC_014334	TTTG	2	8	936759	936766	0 %	75 %	25 %	0 %	301066017
18047	NC_014334	GCT	2	6	936858	936863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_014334	GTT	2	6	937018	937023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_014334	CGG	2	6	937140	937145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066018
18050	NC_014334	GAC	2	6	937216	937221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066018
18051	NC_014334	GAT	2	6	937231	937236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066018
18052	NC_014334	T	6	6	937243	937248	0 %	100 %	0 %	0 %	301066018
18053	NC_014334	AGA	2	6	937327	937332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066018
18054	NC_014334	ATT	2	6	937370	937375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066018
18055	NC_014334	ATGG	2	8	937432	937439	25 %	25 %	50 %	0 %	301066018
18056	NC_014334	TAAG	2	8	937485	937492	50 %	25 %	25 %	0 %	301066018
18057	NC_014334	CAG	2	6	937499	937504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066018
18058	NC_014334	TGGC	2	8	937602	937609	0 %	25 %	50 %	25 %	301066018
18059	NC_014334	ATC	2	6	937686	937691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066018
18060	NC_014334	AGC	2	6	937833	937838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066018
18061	NC_014334	CAA	2	6	937934	937939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066018
18062	NC_014334	TGA	2	6	937951	937956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066018
18063	NC_014334	GGT	2	6	938000	938005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066019
18064	NC_014334	T	6	6	938101	938106	0 %	100 %	0 %	0 %	301066019
18065	NC_014334	GAC	2	6	938193	938198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066019
18066	NC_014334	AGA	2	6	938252	938257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066019
18067	NC_014334	TGG	2	6	938350	938355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066019
18068	NC_014334	AGC	2	6	938379	938384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066019
18069	NC_014334	CCG	2	6	938436	938441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066019
18070	NC_014334	ACG	2	6	938649	938654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066019
18071	NC_014334	TTG	2	6	938688	938693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066019
18072	NC_014334	ATC	2	6	938838	938843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066019
18073	NC_014334	CACT	2	8	938848	938855	25 %	25 %	0 %	50 %	301066019
18074	NC_014334	GAT	2	6	938942	938947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066019
18075	NC_014334	CGC	2	6	938966	938971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066019
18076	NC_014334	GTC	2	6	939102	939107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066019
18077	NC_014334	CTTT	2	8	939124	939131	0 %	75 %	0 %	25 %	301066019
18078	NC_014334	CAAT	2	8	939186	939193	50 %	25 %	0 %	25 %	301066019
18079	NC_014334	CCT	2	6	939199	939204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066019
18080	NC_014334	A	6	6	939237	939242	100 %	0 %	0 %	0 %	301066019
18081	NC_014334	CAG	2	6	939320	939325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_014334	GC	3	6	939333	939338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18083	NC_014334	TCA	2	6	939399	939404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066020
18084	NC_014334	GGC	2	6	939514	939519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066020
18085	NC_014334	GAT	2	6	939537	939542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066020
18086	NC_014334	TGAATG	2	12	939764	939775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066020
18087	NC_014334	TAA	2	6	939804	939809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066020
18088	NC_014334	GAC	2	6	939844	939849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066020
18089	NC_014334	AT	3	6	940012	940017	50 %	50 %	0 %	0 %	301066021
18090	NC_014334	GCT	2	6	940032	940037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066021
18091	NC_014334	AGT	2	6	940043	940048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066021
18092	NC_014334	TTA	2	6	940066	940071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066021
18093	NC_014334	CCA	2	6	940095	940100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066021
18094	NC_014334	TTC	2	6	940182	940187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066021
18095	NC_014334	CGC	2	6	940262	940267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066021
18096	NC_014334	CAC	2	6	940358	940363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066021
18097	NC_014334	TCA	2	6	940385	940390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066021
18098	NC_014334	CCCAT	2	10	940450	940459	20 %	20 %	0 %	60 %	301066021
18099	NC_014334	TGA	2	6	940537	940542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066021
18100	NC_014334	GCCT	2	8	940569	940576	0 %	25 %	25 %	50 %	301066021
18101	NC_014334	T	7	7	940641	940647	0 %	100 %	0 %	0 %	301066021
18102	NC_014334	TCA	2	6	940688	940693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066021
18103	NC_014334	CTA	2	6	940730	940735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18104	NC_014334	GAT	2	6	940745	940750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18105	NC_014334	ATTCA	2	10	940874	940883	40 %	40 %	0 %	20 %	301066022
18106	NC_014334	TAG	2	6	940969	940974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18107	NC_014334	TGT	2	6	940994	940999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066023
18108	NC_014334	ATG	2	6	941034	941039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066023
18109	NC_014334	ATG	2	6	941041	941046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066023
18110	NC_014334	TGA	2	6	941138	941143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066023
18111	NC_014334	TGG	2	6	941207	941212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066023
18112	NC_014334	TTGA	2	8	941298	941305	25 %	50 %	25 %	0 %	301066023
18113	NC_014334	AGC	2	6	941315	941320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066023
18114	NC_014334	TGC	2	6	941351	941356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066023
18115	NC_014334	GGC	2	6	941376	941381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066023
18116	NC_014334	TCA	2	6	941428	941433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066023
18117	NC_014334	GTT	2	6	941514	941519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066023
18118	NC_014334	GTC	2	6	941535	941540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066023
18119	NC_014334	GGC	2	6	941618	941623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066023
18120	NC_014334	AAC	2	6	941626	941631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066023
18121	NC_014334	CTT	2	6	941644	941649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066023
18122	NC_014334	GGTC	2	8	941653	941660	0 %	25 %	50 %	25 %	301066023
18123	NC_014334	TTG	2	6	941683	941688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066023
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18126	NC_014334	GTTTT	2	10	941943	941952	0 %	80 %	20 %	0 %	301066024
18127	NC_014334	T	6	6	942051	942056	0 %	100 %	0 %	0 %	301066024
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18162	NC_014334	TTAT	2	8	943786	943793	25 %	75 %	0 %	0 %	301066024
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18165	NC_014334	TTGG	2	8	944074	944081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18166	NC_014334	T	9	9	944169	944177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18167	NC_014334	T	6	6	944229	944234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18354	NC_014334	GC	3	6	954019	954024	0 %	0 %	50 %	50 %	301066035
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18362	NC_014334	TCA	2	6	954432	954437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066035
18363	NC_014334	CGGGA	2	10	954442	954451	20 %	0 %	60 %	20 %	301066035
18364	NC_014334	GAT	2	6	954685	954690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066036
18365	NC_014334	GCA	2	6	954696	954701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066036
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18367	NC_014334	AGC	2	6	954850	954855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066036
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18369	NC_014334	GTGC	2	8	954999	955006	0 %	25 %	50 %	25 %	301066036
18370	NC_014334	GAA	2	6	955044	955049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066036
18371	NC_014334	GCT	2	6	955100	955105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066036
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18375	NC_014334	GAT	2	6	955404	955409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066037
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18377	NC_014334	GAAT	2	8	955532	955539	50 %	25 %	25 %	0 %	301066037
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18386	NC_014334	CAA	2	6	955806	955811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066037
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18391	NC_014334	GTT	2	6	955936	955941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066037
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18393	NC_014334	GCT	2	6	955946	955951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066037
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18412	NC_014334	TTTG	2	8	957143	957150	0 %	75 %	25 %	0 %	301066038
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18420	NC_014334	GGA	2	6	957405	957410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18464	NC_014334	GAAA	2	8	959355	959362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18465	NC_014334	GAA	2	6	959367	959372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18466	NC_014334	GGC	2	6	959465	959470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066042
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18470	NC_014334	GCTT	2	8	959577	959584	0 %	50 %	25 %	25 %	301066042
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18477	NC_014334	GTTA	2	8	959950	959957	25 %	50 %	25 %	0 %	301066042
18478	NC_014334	GTC	2	6	960071	960076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066042
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18480	NC_014334	TGA	2	6	960136	960141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066042
18481	NC_014334	TTG	2	6	960153	960158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066042
18482	NC_014334	GTC	2	6	960227	960232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066042
18483	NC_014334	TA	3	6	960258	960263	50 %	50 %	0 %	0 %	301066042
18484	NC_014334	GGC	2	6	960356	960361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066042
18485	NC_014334	TTTG	2	8	960382	960389	0 %	75 %	25 %	0 %	301066042
18486	NC_014334	GAA	2	6	960445	960450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066042
18487	NC_014334	AAG	2	6	960458	960463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066042
18488	NC_014334	TTG	2	6	960638	960643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066042
18489	NC_014334	GCA	2	6	960726	960731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066042
18490	NC_014334	CTG	2	6	960743	960748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18491	NC_014334	T	7	7	960811	960817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18492	NC_014334	AT	3	6	960915	960920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18493	NC_014334	GCTTT	2	10	960983	960992	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18494	NC_014334	A	7	7	961006	961012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18495	NC_014334	TG	3	6	961059	961064	0 %	50 %	50 %	0 %	301066043
18496	NC_014334	TTAA	2	8	961190	961197	50 %	50 %	0 %	0 %	301066043
18497	NC_014334	GAA	2	6	961223	961228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066043
18498	NC_014334	GGC	2	6	961289	961294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066043
18499	NC_014334	AGC	2	6	961386	961391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066043
18500	NC_014334	GTT	3	9	961436	961444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066043

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