MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014334	AAT	3	9	880136	880144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065968
17002	NC_014334	ATG	2	6	880154	880159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065968
17003	NC_014334	GCA	2	6	880201	880206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065968
17004	NC_014334	CA	3	6	880205	880210	50 %	0 %	0 %	50 %	301065968
17005	NC_014334	AGTT	2	8	880221	880228	25 %	50 %	25 %	0 %	301065968
17006	NC_014334	AGC	2	6	880230	880235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065968
17007	NC_014334	TTA	2	6	880241	880246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065968
17008	NC_014334	GCG	2	6	880298	880303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065968
17009	NC_014334	CTG	2	6	880328	880333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
17010	NC_014334	GATT	2	8	880360	880367	25 %	50 %	25 %	0 %	301065968
17011	NC_014334	AAG	2	6	880416	880421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065968
17012	NC_014334	ATT	2	6	880481	880486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065968
17013	NC_014334	ATTT	2	8	880563	880570	25 %	75 %	0 %	0 %	301065968
17014	NC_014334	T	6	6	880576	880581	0 %	100 %	0 %	0 %	301065968
17015	NC_014334	GCT	2	6	880631	880636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
17016	NC_014334	CTG	2	6	880668	880673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
17017	NC_014334	CGG	2	6	880680	880685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065968
17018	NC_014334	T	6	6	880709	880714	0 %	100 %	0 %	0 %	301065968
17019	NC_014334	ACTT	2	8	880733	880740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17020	NC_014334	GAG	2	6	880806	880811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17021	NC_014334	GGT	2	6	880924	880929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065969
17022	NC_014334	CTG	2	6	880967	880972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065969
17023	NC_014334	CAAC	2	8	880985	880992	50 %	0 %	0 %	50 %	301065969
17024	NC_014334	CGG	2	6	881060	881065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065969
17025	NC_014334	GGC	2	6	881243	881248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065969
17026	NC_014334	CAG	2	6	881252	881257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065969
17027	NC_014334	TGA	2	6	881280	881285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065969
17028	NC_014334	ATC	2	6	881286	881291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065969
17029	NC_014334	ATT	2	6	881297	881302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065969
17030	NC_014334	CCG	2	6	881332	881337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065969
17031	NC_014334	CAT	2	6	881350	881355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065969
17032	NC_014334	CAAG	2	8	881380	881387	50 %	0 %	25 %	25 %	301065969
17033	NC_014334	AAGC	2	8	881429	881436	50 %	0 %	25 %	25 %	301065969
17034	NC_014334	GC	3	6	881539	881544	0 %	0 %	50 %	50 %	301065970
17035	NC_014334	TGC	2	6	881574	881579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065970
17036	NC_014334	TCGGC	2	10	881614	881623	0 %	20 %	40 %	40 %	301065970
17037	NC_014334	ATA	2	6	881639	881644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065970
17038	NC_014334	CGG	2	6	881655	881660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065970
17039	NC_014334	GTTT	2	8	881667	881674	0 %	75 %	25 %	0 %	301065970
17040	NC_014334	A	6	6	881713	881718	100 %	0 %	0 %	0 %	301065970
17041	NC_014334	CAA	2	6	881749	881754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065970
17042	NC_014334	AACC	2	8	881785	881792	50 %	0 %	0 %	50 %	301065970
17043	NC_014334	GGC	2	6	881861	881866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065970
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17045	NC_014334	GATTT	2	10	881902	881911	20 %	60 %	20 %	0 %	301065970
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17047	NC_014334	CGT	2	6	881964	881969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065970
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17050	NC_014334	GAA	2	6	882054	882059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065970
17051	NC_014334	GAA	2	6	882111	882116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065970
17052	NC_014334	CAG	2	6	882148	882153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065970
17053	NC_014334	AG	3	6	882152	882157	50 %	0 %	50 %	0 %	301065970
17054	NC_014334	TGAA	2	8	882158	882165	50 %	25 %	25 %	0 %	301065970
17055	NC_014334	GTG	2	6	882235	882240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065970
17056	NC_014334	TTGGT	2	10	882251	882260	0 %	60 %	40 %	0 %	301065970
17057	NC_014334	TTGC	2	8	882418	882425	0 %	50 %	25 %	25 %	301065970
17058	NC_014334	TGAAT	2	10	882456	882465	40 %	40 %	20 %	0 %	301065970
17059	NC_014334	TGG	2	6	882517	882522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065970
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17080	NC_014334	GGT	2	6	883943	883948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_014334	AATTT	2	10	883960	883969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17086	NC_014334	TCG	3	9	884362	884370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065971
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17093	NC_014334	TTTG	2	8	884748	884755	0 %	75 %	25 %	0 %	301065972
17094	NC_014334	GAAT	2	8	884825	884832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_014334	AGG	2	6	884855	884860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17096	NC_014334	GAT	2	6	884867	884872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065973
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17098	NC_014334	ACCA	2	8	884914	884921	50 %	0 %	0 %	50 %	301065973
17099	NC_014334	AAGA	2	8	884976	884983	75 %	0 %	25 %	0 %	301065973
17100	NC_014334	TTG	2	6	884991	884996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065973
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17116	NC_014334	AGCG	2	8	885652	885659	25 %	0 %	50 %	25 %	301065973
17117	NC_014334	TGC	2	6	885671	885676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065973
17118	NC_014334	AAAC	2	8	885713	885720	75 %	0 %	0 %	25 %	301065973
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17120	NC_014334	ATG	2	6	885768	885773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065973
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17122	NC_014334	ACC	2	6	885842	885847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065973
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17484	NC_014334	TGATCG	2	12	905812	905823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301065990
17485	NC_014334	ACA	2	6	905846	905851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065990
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17488	NC_014334	T	7	7	906159	906165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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