MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_014334	GAT	3	9	853999	854007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065944
16503	NC_014334	GTT	2	6	854017	854022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065944
16504	NC_014334	AAG	2	6	854060	854065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065944
16505	NC_014334	CTT	2	6	854097	854102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065944
16506	NC_014334	GCG	2	6	854148	854153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065944
16507	NC_014334	CGA	2	6	854181	854186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065944
16508	NC_014334	A	6	6	854205	854210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_014334	GAA	2	6	854233	854238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_014334	GAA	2	6	854317	854322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065945
16511	NC_014334	TGA	2	6	854367	854372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065945
16512	NC_014334	GCG	2	6	854420	854425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065945
16513	NC_014334	TTC	2	6	854528	854533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065945
16514	NC_014334	CAT	2	6	854544	854549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
16515	NC_014334	CCT	2	6	854616	854621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065945
16516	NC_014334	ATTC	2	8	854634	854641	25 %	50 %	0 %	25 %	301065945
16517	NC_014334	TGA	2	6	854684	854689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065945
16518	NC_014334	GCC	2	6	854694	854699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065945
16519	NC_014334	TCA	2	6	854738	854743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
16520	NC_014334	GAC	2	6	854818	854823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065945
16521	NC_014334	AAT	2	6	854848	854853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065945
16522	NC_014334	AAT	2	6	854916	854921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065945
16523	NC_014334	GAA	2	6	854929	854934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065945
16524	NC_014334	CAAG	2	8	854964	854971	50 %	0 %	25 %	25 %	301065945
16525	NC_014334	CAT	2	6	855013	855018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
16526	NC_014334	GGAAC	2	10	855028	855037	40 %	0 %	40 %	20 %	301065945
16527	NC_014334	TCA	2	6	855038	855043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
16528	NC_014334	GAG	2	6	855113	855118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065945
16529	NC_014334	ATA	2	6	855131	855136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065945
16530	NC_014334	GCG	2	6	855200	855205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065945
16531	NC_014334	GGTTG	2	10	855213	855222	0 %	40 %	60 %	0 %	301065945
16532	NC_014334	ACTG	2	8	855241	855248	25 %	25 %	25 %	25 %	301065945
16533	NC_014334	TG	3	6	855247	855252	0 %	50 %	50 %	0 %	301065945
16534	NC_014334	CA	3	6	855372	855377	50 %	0 %	0 %	50 %	301065945
16535	NC_014334	ATCA	2	8	855412	855419	50 %	25 %	0 %	25 %	301065945
16536	NC_014334	GGC	2	6	855429	855434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065945
16537	NC_014334	GGAC	2	8	855504	855511	25 %	0 %	50 %	25 %	301065945
16538	NC_014334	GCTT	2	8	855549	855556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16539	NC_014334	AGCAT	2	10	855575	855584	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16540	NC_014334	ATT	2	6	855643	855648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_014334	A	6	6	855675	855680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_014334	CGC	2	6	855687	855692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16543	NC_014334	T	6	6	855707	855712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_014334	TTA	2	6	855754	855759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_014334	GCAG	2	8	855804	855811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16546	NC_014334	GTT	2	6	855844	855849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_014334	TCG	2	6	855874	855879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16548	NC_014334	AG	3	6	855978	855983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_014334	CG	3	6	856041	856046	0 %	0 %	50 %	50 %	301065946
16550	NC_014334	GCA	2	6	856093	856098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065946
16551	NC_014334	TGA	2	6	856104	856109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
16552	NC_014334	AC	3	6	856124	856129	50 %	0 %	0 %	50 %	301065946
16553	NC_014334	TGA	2	6	856167	856172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
16554	NC_014334	ATT	2	6	856249	856254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065946
16555	NC_014334	CACT	2	8	856346	856353	25 %	25 %	0 %	50 %	301065946
16556	NC_014334	TGT	2	6	856368	856373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065946
16557	NC_014334	TGGCT	2	10	856432	856441	0 %	40 %	40 %	20 %	301065946
16558	NC_014334	TGA	2	6	856476	856481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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16561	NC_014334	TCG	2	6	856607	856612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065946
16562	NC_014334	TGAT	2	8	856631	856638	25 %	50 %	25 %	0 %	301065946
16563	NC_014334	GGC	2	6	856666	856671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065946
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16565	NC_014334	CAT	2	6	856855	856860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065946
16566	NC_014334	CAT	2	6	856887	856892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065946
16567	NC_014334	TTG	2	6	856937	856942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065946
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16569	NC_014334	CTT	2	6	857070	857075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065946
16570	NC_014334	AAG	2	6	857126	857131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
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16575	NC_014334	AAG	2	6	857390	857395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
16576	NC_014334	CGA	2	6	857441	857446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065946
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16579	NC_014334	TGA	2	6	857627	857632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
16580	NC_014334	GAT	3	9	857686	857694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
16581	NC_014334	GAT	2	6	857712	857717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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16589	NC_014334	AGC	2	6	858095	858100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065946
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16592	NC_014334	GAA	2	6	858277	858282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
16593	NC_014334	TGA	3	9	858297	858305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
16594	NC_014334	TAA	2	6	858355	858360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065946
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16596	NC_014334	GCC	2	6	858513	858518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065947
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16598	NC_014334	GGC	2	6	858633	858638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065947
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16600	NC_014334	CGAT	2	8	858681	858688	25 %	25 %	25 %	25 %	301065947
16601	NC_014334	TTA	2	6	858736	858741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065947
16602	NC_014334	GCA	2	6	858765	858770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065947
16603	NC_014334	AGA	3	9	858771	858779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065947
16604	NC_014334	CAA	2	6	858855	858860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065947
16605	NC_014334	GGC	2	6	858889	858894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065947
16606	NC_014334	GCT	2	6	859020	859025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065947
16607	NC_014334	AC	3	6	859119	859124	50 %	0 %	0 %	50 %	301065947
16608	NC_014334	GCG	2	6	859220	859225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065947
16609	NC_014334	CAA	2	6	859242	859247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065947
16610	NC_014334	GCGATG	2	12	859339	859350	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	301065947
16611	NC_014334	GAA	3	9	859375	859383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065947
16612	NC_014334	AAGGCC	2	12	859396	859407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065947
16613	NC_014334	ATC	2	6	859487	859492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065947
16614	NC_014334	GGCAAT	2	12	859510	859521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065947
16615	NC_014334	TCA	2	6	859550	859555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065947
16616	NC_014334	ATG	2	6	859752	859757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065948
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16618	NC_014334	CAA	2	6	859875	859880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065948
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16620	NC_014334	TGA	2	6	860080	860085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065948
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16982	NC_014334	TCA	2	6	879206	879211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065967
16983	NC_014334	GAG	2	6	879310	879315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065967
16984	NC_014334	TGA	2	6	879345	879350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065967
16985	NC_014334	CAA	2	6	879421	879426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065967
16986	NC_014334	CGA	2	6	879464	879469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065967
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16989	NC_014334	AGC	2	6	879567	879572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065967
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16991	NC_014334	GAT	2	6	879652	879657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065967
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