MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 55193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014334	CAAA	2	8	828231	828238	75 %	0 %	0 %	25 %	301065919
16002	NC_014334	CCG	2	6	828366	828371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065920
16003	NC_014334	GGC	2	6	828380	828385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065920
16004	NC_014334	T	6	6	828386	828391	0 %	100 %	0 %	0 %	301065920
16005	NC_014334	ACA	2	6	828395	828400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065920
16006	NC_014334	CAA	2	6	828458	828463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065920
16007	NC_014334	ACGGCA	2	12	828464	828475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065920
16008	NC_014334	ACAG	2	8	828515	828522	50 %	0 %	25 %	25 %	301065920
16009	NC_014334	GTG	2	6	828546	828551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065920
16010	NC_014334	CCGG	2	8	828612	828619	0 %	0 %	50 %	50 %	301065920
16011	NC_014334	TTAA	2	8	828684	828691	50 %	50 %	0 %	0 %	301065920
16012	NC_014334	TTG	2	6	828789	828794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065920
16013	NC_014334	CGT	2	6	828918	828923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065920
16014	NC_014334	ATG	2	6	828993	828998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065920
16015	NC_014334	TCA	2	6	829025	829030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065920
16016	NC_014334	TGAT	2	8	829165	829172	25 %	50 %	25 %	0 %	301065920
16017	NC_014334	CAC	2	6	829180	829185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065920
16018	NC_014334	GCG	2	6	829209	829214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065920
16019	NC_014334	GCA	2	6	829229	829234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065920
16020	NC_014334	GCC	2	6	829242	829247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_014334	TCT	2	6	829424	829429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065921
16022	NC_014334	GCA	2	6	829516	829521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065921
16023	NC_014334	GTT	2	6	829578	829583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065921
16024	NC_014334	CGCGG	2	10	829717	829726	0 %	0 %	60 %	40 %	301065921
16025	NC_014334	GTG	2	6	829769	829774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065921
16026	NC_014334	AAT	2	6	829809	829814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065921
16027	NC_014334	GCT	2	6	829816	829821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065921
16028	NC_014334	T	6	6	829905	829910	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
16029	NC_014334	TAT	2	6	829925	829930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065921
16030	NC_014334	CG	4	8	830003	830010	0 %	0 %	50 %	50 %	301065921
16031	NC_014334	CAGG	2	8	830012	830019	25 %	0 %	50 %	25 %	301065921
16032	NC_014334	T	6	6	830077	830082	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
16033	NC_014334	AGT	2	6	830087	830092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065921
16034	NC_014334	CCG	2	6	830179	830184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065921
16035	NC_014334	TGA	2	6	830212	830217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065921
16036	NC_014334	T	6	6	830247	830252	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
16037	NC_014334	GTG	2	6	830281	830286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065921
16038	NC_014334	TG	3	6	830305	830310	0 %	50 %	50 %	0 %	301065921
16039	NC_014334	AAGT	2	8	830323	830330	50 %	25 %	25 %	0 %	301065921
16040	NC_014334	T	6	6	830342	830347	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
16041	NC_014334	CG	3	6	830451	830456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_014334	AAAG	2	8	830465	830472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_014334	GCA	2	6	830500	830505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_014334	A	6	6	830505	830510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_014334	CGTGG	2	10	830551	830560	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16046	NC_014334	AGC	2	6	830625	830630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065922
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16050	NC_014334	CCG	2	6	830740	830745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065922
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16052	NC_014334	CCAA	2	8	830777	830784	50 %	0 %	0 %	50 %	301065922
16053	NC_014334	AAC	2	6	830838	830843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065922
16054	NC_014334	GCA	2	6	830860	830865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065922
16055	NC_014334	TCA	2	6	830887	830892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065922
16056	NC_014334	TGA	2	6	831029	831034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065922
16057	NC_014334	CT	3	6	831067	831072	0 %	50 %	0 %	50 %	301065922
16058	NC_014334	CCA	2	6	831100	831105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065922
16059	NC_014334	CGA	2	6	831335	831340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065923
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16061	NC_014334	TCA	2	6	831362	831367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065923
16062	NC_014334	TTGCC	2	10	831397	831406	0 %	40 %	20 %	40 %	301065923
16063	NC_014334	AGAA	2	8	831460	831467	75 %	0 %	25 %	0 %	301065923
16064	NC_014334	AG	3	6	831610	831615	50 %	0 %	50 %	0 %	301065923
16065	NC_014334	AAT	2	6	831654	831659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065923
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16068	NC_014334	CATC	2	8	831719	831726	25 %	25 %	0 %	50 %	301065923
16069	NC_014334	GTT	2	6	831729	831734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065923
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16074	NC_014334	T	6	6	832139	832144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_014334	A	7	7	832152	832158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_014334	CCA	2	6	832165	832170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16077	NC_014334	AGAC	2	8	832228	832235	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16078	NC_014334	ACTT	2	8	832242	832249	25 %	50 %	0 %	25 %	301065924
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16087	NC_014334	CTTCA	2	10	832898	832907	20 %	40 %	0 %	40 %	301065924
16088	NC_014334	CCTG	2	8	833028	833035	0 %	25 %	25 %	50 %	301065924
16089	NC_014334	TCA	2	6	833133	833138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065924
16090	NC_014334	AATG	2	8	833174	833181	50 %	25 %	25 %	0 %	301065924
16091	NC_014334	CCG	2	6	833241	833246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065924
16092	NC_014334	ATTTG	2	10	833305	833314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_014334	CAT	2	6	833458	833463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_014334	AACA	2	8	833507	833514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16095	NC_014334	GAT	2	6	833614	833619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065925
16096	NC_014334	GCAA	2	8	833635	833642	50 %	0 %	25 %	25 %	301065925
16097	NC_014334	CAG	2	6	833672	833677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065925
16098	NC_014334	GGCG	2	8	833716	833723	0 %	0 %	75 %	25 %	301065925
16099	NC_014334	GAT	2	6	833738	833743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065925
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16102	NC_014334	ATTT	2	8	833858	833865	25 %	75 %	0 %	0 %	301065925
16103	NC_014334	GAC	2	6	833899	833904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065925
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16105	NC_014334	A	7	7	833997	834003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_014334	TCT	2	6	834034	834039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_014334	T	7	7	834039	834045	0 %	100 %	0 %	0 %	301065926
16108	NC_014334	ATG	2	6	834049	834054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065926
16109	NC_014334	GC	3	6	834169	834174	0 %	0 %	50 %	50 %	301065926
16110	NC_014334	TCT	2	6	834277	834282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065926
16111	NC_014334	T	6	6	834352	834357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_014334	ACG	2	6	834359	834364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_014334	CATAG	2	10	834389	834398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16114	NC_014334	A	6	6	834428	834433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_014334	TCT	2	6	834547	834552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065927
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16118	NC_014334	TGG	2	6	834746	834751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065927
16119	NC_014334	ATT	2	6	834783	834788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065927
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16123	NC_014334	CAG	2	6	834845	834850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065927
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16243	NC_014334	TTG	2	6	841229	841234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065932
16244	NC_014334	GCA	2	6	841247	841252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065932
16245	NC_014334	CAT	2	6	841301	841306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065932
16246	NC_014334	ACC	2	6	841377	841382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065933
16247	NC_014334	ATT	2	6	841439	841444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065933
16248	NC_014334	AGC	2	6	841487	841492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065933
16249	NC_014334	GAT	2	6	841593	841598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065933
16250	NC_014334	AGC	2	6	841628	841633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065933
16251	NC_014334	CTT	2	6	841637	841642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065933
16252	NC_014334	ATT	2	6	841726	841731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065933
16253	NC_014334	GAT	3	9	841743	841751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065933
16254	NC_014334	GCG	2	6	841764	841769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065933
16255	NC_014334	GCA	2	6	841778	841783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065933
16256	NC_014334	GATCAG	2	12	841800	841811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065933
16257	NC_014334	TACT	2	8	841871	841878	25 %	50 %	0 %	25 %	301065933
16258	NC_014334	ATG	2	6	841887	841892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065933
16259	NC_014334	GTC	2	6	841905	841910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065933
16260	NC_014334	GCA	2	6	841947	841952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065933
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16272	NC_014334	TGA	2	6	842468	842473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065933
16273	NC_014334	GCC	2	6	842520	842525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065933
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16275	NC_014334	CCGG	2	8	842756	842763	0 %	0 %	50 %	50 %	301065934
16276	NC_014334	ATG	2	6	842808	842813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065934
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16280	NC_014334	T	7	7	842948	842954	0 %	100 %	0 %	0 %	301065934
16281	NC_014334	GAT	2	6	843014	843019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065934
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16285	NC_014334	TTG	2	6	843219	843224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065934
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16291	NC_014334	TTTGAT	2	12	843503	843514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	301065934
16292	NC_014334	GGT	2	6	843551	843556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065934
16293	NC_014334	GAT	2	6	843563	843568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065934
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16295	NC_014334	TAC	2	6	843677	843682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065934
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16300	NC_014334	TTG	2	6	843884	843889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065935
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16306	NC_014334	AAC	2	6	844170	844175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065935
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16309	NC_014334	GC	3	6	844328	844333	0 %	0 %	50 %	50 %	301065935
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16311	NC_014334	CTG	2	6	844478	844483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065935
16312	NC_014334	TGC	2	6	844542	844547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065935
16313	NC_014334	TGGC	2	8	844581	844588	0 %	25 %	50 %	25 %	301065935
16314	NC_014334	A	6	6	844658	844663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16315	NC_014334	TGA	2	6	844739	844744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065936
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16326	NC_014334	TCG	2	6	845169	845174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065936
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16343	NC_014334	GTG	2	6	846162	846167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065937
16344	NC_014334	TCA	2	6	846193	846198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065937
16345	NC_014334	ATA	2	6	846199	846204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065937
16346	NC_014334	CAGG	2	8	846220	846227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16347	NC_014334	CTGCGA	2	12	846302	846313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16348	NC_014334	TGGG	2	8	846356	846363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16349	NC_014334	CCA	2	6	846369	846374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16350	NC_014334	CAG	2	6	846411	846416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16351	NC_014334	CAA	2	6	846446	846451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16352	NC_014334	T	7	7	846513	846519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16353	NC_014334	A	6	6	846543	846548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16354	NC_014334	ATT	2	6	846588	846593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065938
16355	NC_014334	CAG	2	6	846664	846669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065938
16356	NC_014334	GGT	2	6	846695	846700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065938
16357	NC_014334	GAG	2	6	846723	846728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065938
16358	NC_014334	GAT	2	6	846795	846800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065938
16359	NC_014334	GC	4	8	846876	846883	0 %	0 %	50 %	50 %	301065938
16360	NC_014334	CAG	2	6	846891	846896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065938
16361	NC_014334	TAA	2	6	846911	846916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065938
16362	NC_014334	GCA	2	6	847001	847006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065938
16363	NC_014334	ACC	2	6	847028	847033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065938
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16480	NC_014334	GTT	2	6	852894	852899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16484	NC_014334	GCC	2	6	853022	853027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16485	NC_014334	AGC	2	6	853034	853039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16486	NC_014334	GTT	2	6	853047	853052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065943
16487	NC_014334	TGC	2	6	853158	853163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065943
16488	NC_014334	ATG	2	6	853217	853222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065943
16489	NC_014334	TCG	2	6	853320	853325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065943
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16497	NC_014334	CCAA	2	8	853580	853587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16498	NC_014334	TTA	2	6	853603	853608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16499	NC_014334	TTC	2	6	853723	853728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065944
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